INTRODUCTION: Septic shock is a systemic inflammatory response syndrome associated with organ failures. Earlier clinical diagnosis would be of benefit to a decrease in the mortality rate. However, there is currently a lack of predictive biomarkers. The secretome is the set of proteins secreted by a cell, tissue, or organism at a given time and under certain conditions. The plasma secretome is easily accessible from biological fluids and represents a good opportunity to discover new biomarkers that can be studied with nontargeted "omic" strategies.
AIMS: To identify relevant deregulated protei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine growth hormone (bGH) transgenic mice mimic the clinical condition of acromegaly, having high circulating growth hormone (GH) levels. These mice are giant, have decreased adipose tissue (AT) mass, impaired glucose metabolism and a shortened lifespan. The detrimental effects of excess GH have been suggested, in part, to be a result of its depot-specific actions on AT. To investigate this relationship, we evaluated gene expression, biological mechanisms, cellular pathways and predicted microRNA (miRNA) in two AT depots (subcutaneous [Subq] and epididymal [Epi]) from bGH and littermate cont
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Pulmonary fibrosis (PF) is a representative pathological change in patients with pneumoconiosis; however, due to the absence of reliable and early biomarkers, microRNAs have recently emerged as potential candidates for identification. Objectives: The aim of our study was to discover the potential of PF-specific circulating microRNAs as early biomarkers among patients with pneumoconiosis. Methods: Four dust-exposed patients with PF and four matched healthy individuals (not exposed to dust) were recruited for the study. microRNA profiling was identified by micro-array and bioinformat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Tongue squamous cell carcinoma (TSCC) is a major type of oral cancers and has remained an intractable cancer over the past decades. The aim of this study was to identify differentially expressed genes (DEGs) during TSCC and reveal their potential mechanisms. MATERIAL AND METHODS The gene expression profiles of GSE13601 were downloaded from the GEO database. The GSE13601 dataset contains 57 samples, including 31 tongue SCC samples and 26 matched normal mucosa samples. Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway (KEGG) enrichment analyses were performed; Cyto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Information on design principles governing transcriptome changes upon transition from safe to hazardous drug concentrations or from tolerated to cytotoxic drug levels are important for the application of toxicogenomics data in developmental toxicology. Here, we tested the effect of eight concentrations of valproic acid (VPA; 25-1000 μM) in an assay that recapitulates the development of human embryonic stem cells to neuroectoderm. Cells were exposed to the drug during the entire differentiation process, and the number of differentially regulated genes increased continuously over the concentrati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Metastasis is one of the important reasons for the poor prognosis of hepatocellular carcinoma (HCC), abnormal glycosylation plays a pivotal role in HCC metastasis. The goal of this study was to screen and validate the transcriptional profiling of glycogenes associated with HCC metastasis.
METHODOLOGY: The differentially transcribed glycogenes were screened out by the Human Glycosylation RT2 Profiler PCR Array, and were identified by qRT-PCR in human HCC cell lines and their orthotopic xenograft tumors. Further analyses were performed with K-mean clustering, Gene Onto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular complexity of genetic diseases requires novel approaches to break it down into coherent biological modules. For this purpose, many disease network models have been created and analyzed. We highlight two of them, "the human diseases networks" (HDN) and "the orphan disease networks" (ODN). However, in these models, each single node represents one disease or an ambiguous group of diseases. In these cases, the notion of diseases as unique entities reduces the usefulness of network-based methods. We hypothesize that using the clinical features (pathophenotypes) to define pathophenotyp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleiotropy is a common phenomenon in the genetics of cancers, which is rarely systematically evaluated. A novel idea for identifying shared gene functional modules using biclustering was proposed in this paper to explore the common molecular mechanisms among cancers and the relationships between different types of cancers. Gene expression datasets for 20 cancers were obtained. And genes differentially expressing in at least two types of cancers were selected using both moderated t-statistic and fold change to construct a 10417 × 20 matrix (gene-cancer matrix). 22 gene clusters shared by cancer
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) is endemic worldwide and a major cause of acute liver disease in developing countries. However, the molecular mechanisms of liver pathology and clinical disease are not well understood for HEV infection. Open reading frame 3 (ORF3) of HEV encodes a small phosphoprotein, which is assumed to be involved in liver pathology and clinical disease. In this study, the interactions between the HEV ORF3 protein and human proteins were investigated using a stringent, high-throughput yeast two-hybrid (Y2H) analysis. Thirty two proteins were shown to interact with genotype 1 ORF3, 2
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The involvement of the placenta in the pathogenesis of preeclampsia and HELLP syndrome is well established, and placental lesions are also similar in these two syndromes. Here we aimed to examine the placental transcriptome and to identify candidate biomarkers in early-onset preeclampsia and HELLP syndrome.
METHODS: Placental specimens were obtained at C-sections from women with early-onset preeclampsia and HELLP syndrome, and from controls who delivered preterm or at term. After histopathological examination, fresh-frozen placental specimens were used for microarray profiling and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classifying the defects occurring at the cervical spine provides the basis for surgical treatment planning and therapy recommendation. This process requires evidence from patient records. Further, the degree of a defect needs to be encoded in a standardized from to facilitate data exchange and multimodal interoperability. In this paper, a concept for automatic defect classification based on information extracted from textual data of patient records is presented. In a retrospective study, the classifier is applied to clinical documents and the classification results are evaluated.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico2026eng
OBJECTIVE: Frataxin (FXN) is a mitochondrial protein involved in various cellular processes. To date, the role of FXN in the initiation and progression of colon adenocarcinoma (COAD) remains unclear. This study aimed to investigate FXN expression in COAD and its involvement in COAD initiation and progression.
METHODS: FXN expression in COAD was assessed via bioinformatics and immunohistochemistry (IHC) validation. The association between FXN expression and prognosis was evaluated using Kaplan‑Meier analysis and Cox regression analysis. Gene Ontology-Biological Process (GO-BP) enrichment analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukemia (AML) remains genetically and clinically heterogeneous, and current cytogenetic risk categories do not fully capture biologic diversity or therapeutic vulnerability. We investigated whether a simple THBS1/VEGFA transcriptional ratio could define molecularly distinct AML subsets with prognostic and therapeutic relevance. The ratio was calculated as log₂(TPM_THBS1 + 1) - log₂(TPM_VEGFA + 1) and evaluated in the TCGA-LAML cohort (n = 132), with validation in BeatAML and outcome-independent external validation in GSE37642. Associations with overall survival, cytogenetic risk
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) exhibits distinct immune microenvironments in early-stage (ES-LUAD), advanced-stage (AS-LUAD), and pneumonia (PNA). Tumor-derived exosomes facilitate intercellular communication and contribute to the development and progression of tumors.
OBJECTIVES: This study aims to comprehensively profile and compare the serum exosomal proteome across ESLUAD, AS-LUAD, and PNA patients, identify differentially expressed exosomal proteins (DEEPs) with potential as stage-specific diagnostic and prognostic biomarkers, and elucidate the biological pathways associated with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Respiratory syncytial virus A (RSVA) and respiratory syncytial virus B (RSVB) may induce distinct airway host responses. We compared them with influenza A virus (IAV) and human metapneumovirus (hMPV) in airway organ tissue equivalents (OTEs) and developed the Relaxed Magnitude Altitude Score with Hub-Centric Network Analysis framework (RMAS-HCNA).
METHODS: OTEs were infected with RSVA-GFP5 or RSVB-GFP3 at low multiplicity of infection and profiled at 24 and 72 h using the NanoString nCounter Host Response Panel. Previous IAV and hMPV profiles were integrated. Analyses included s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Saliva is a rich-bodily fluid with recognized clinical diagnosis roles. This research aimed to investigate the salivary proteomic signatures for MIH in children with distinct degrees of severity.
MATERIALS AND METHODS: In this cross-sectional study, 50 schoolers (8-13 years) were equally assigned into the following groups: G1 (Control group-Healthy first permanent molars), G2 (Mild MIH with white/creamy opacity and free of caries), G3 (Mild MIH with yellow/brown opacity and free of caries), G4 (Severe MIH with white/creamy, yellow/brown opacities including post-eruptive fracture an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Quantitative measures of autism spectrum disorder (ASD)-related traits can provide insight into trait presentation across the population. Previous studies have identified epigenomic variation associated with ASD diagnosis, but few have evaluated quantitative traits. We sought to identify DNA methylation patterns in child blood associated with Social Responsiveness Scale score, Second Edition (SRS).
METHODS: We conducted an epigenome-wide association study of SRS in child blood at approximately age 5 in the Study to Explore Early Development, a case-control study of ASD in the Unit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspartame, an artificial sweetener, has been implicated in the formation of kidney stones, although the underlying mechanisms remain poorly understood. This study aims to analyze the toxicity of aspartame on kidney stone development using network toxicology and molecular docking strategies. We used ChEMBL, SwissTargetPrediction, and STITCH databases to identify 145 unique targets of aspartame action, and GeneCards and OMIM databases to identify 776 unique targets related to kidney stones. Integration of these datasets revealed 19 common targets for aspartame-induced kidney stones. A Protein-Pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testicular size is an excellent proxy for selecting high-fertility rams. The hypothalamus-pituitary-gonadal (HPG) axis plays an important role in regulating reproductive capacity in vertebrates, while key genes and regulatory pathways within the HPG axis associated with testicular size remain largely unknown in sheep. This study comprehensively compared the transcriptomic profiles in the hypothalamus, pituitary and testis of rams after sexual maturity between the large-testis group (LTG, testicular weight = 454.29 ± 54.24 g) and the small-testis group (STG, testicular weight = 77.29 ± 10.76 g)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Growing evidence indicates that N7-methylguanosine (m7G) modification plays critical roles in epigenetic regulation. However, no data regarding m7G modification are currently available in Eimeria tenella, a highly virulent species causing coccidiosis in chickens.
METHODS: In the present study, we explore the distribution of internal messenger RNA (mRNA) m7G modification in sporulated and unsporulated oocysts of E. tenella as well as its potential biological functions during oocyst development using methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq) and mRNA sequencing (mRNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.