5-hydroxymethylcystosine (5hmC), is an intermediate product in the DNA demethylation pathway, but may act as a functional epigenetic modification. We have conducted the largest study of site-specific 5hmC in placenta to date using parallel bisulphite and oxidative bisulphite modification with array-based assessment. Incorporating parallel RNA-sequencing data allowed us to assess associations between 5hmC and gene expression, using expression quantitative trait hydroxymethylation (eQTHM) analysis. We identified ~ 47,000 loci with consistently elevated (systematic) 5hmC proportions. Systematic 5…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA N6-methyladenosine (m6A) demethylase AlkB homolog 5 (ALKBH5) plays a crucial role in regulating innate immunity. Lysine acylation, a widespread protein modification, influences protein function, but its impact on ALKBH5 during viral infections has not been well characterized. This study investigates the presence and regulatory mechanisms of a previously unidentified lysine acylation in ALKBH5 and its role in mediating m6A modifications to activate antiviral innate immune responses. We demonstrate that ALKBH5 undergoes lactylation, which is essential for an effective innate immune response
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progesterone synthesized in the placenta is essential for pregnancy maintenance. CYP11A1 is a key enzyme in progesterone synthesis, and its expression increases greatly during trophoblast syncytialization. However, the underlying mechanism remains elusive. Here, we demonstrated that passive demethylation of CYP11A1 promoter accounted for the upregulation of CYP11A1 expression during syncytialization with the participation of the transcription factor C/EBPα. We found that the methylation rate of a CpG locus in the CYP11A1 promoter was significantly reduced along with decreased DNA methyltransfe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pheochromocytoma (PHEO) and paraganglioma (PGL) (together PPGL) are tumors with poor outcomes that arise from neuroendocrine cells in the ad … east), succinate accumulation inhibits alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase enzymes leading to DNA demethylation. In the worm Caenorhabditis elegans, mutated SDH creates developmental abnormalities, metabolic rewiring, an energy deficit and oxygen hypersensitivity (the latter is also found in Drosophila melanogaster). In the zebrafish Danio rerio, sdhb mutants …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) is an important pathogen that can cause severe hospital- and community-acquired infections. To systematically investigate its methylation features, we determined the whole-genome sequences of 14 K. pneumoniae strains covering varying serotypes, multilocus sequence types, clonal groups, viscosity/virulence, and drug resistance. Their methylomes were further characterized using Pacific Biosciences single-molecule real-time and bisulfite technologies. We identified 15 methylation motifs [13 N6-methyladenine (6mA) and two 5-methylcytosine (5mC) motifs], among
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tet methylcytosine dioxygenase 2 (TET2) is one of the most frequently mutated genes in myelodysplastic syndrome (MDS). TET2 is known to involve a demethylation process, and the loss of TET2 is thought to cause DNA hypermethylation. Loss of TET2 function is known to be caused by genetic mutations and miRNA, such as miR-22. We analyzed 41 MDS patients receiving hypomethylating therapy (HMT) to assess whether TET2 mutation status and miR-22 expression status were associated with their clinical characteristics and treatment outcomes. Responsiveness to HMT was not affected by both TET2 mutation (od
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Methylation pattern of gene modification is essential for the differentiation of T regulatory cells (Tregs) and 5-Aza-2'-deoxycytidine is a common inhibitor of methylation. This study aimed to investigate the potential effects of Treg polarizing conditions and 5-Aza-2'-deoxycytidine treatment in the differentiation of naïve T cells during chronic hepatitis B virus (HBV) infection.
METHODS: The frequency of Tregs in peripheral blood was determined by flow cytometry from patients with chronic hepatitis B (CHB) (n = 51), liver cirrhosis (LC) (n = 47), hepatocellular carcinoma (HCC) (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic regulation is emerging as a key feature in the molecular characteristics of various human diseases. Epigenetic aberrations can occur from mutations in genes associated with epigenetic regulation, improper deposition, removal or reading of histone modifications, DNA methylation/demethylation and impaired non-coding RNA interactions in chromatin. Menin, the protein product of the gene causative for the multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) syndrome, interacts with chromatin-associated protein complexes and also regulates some non-coding RNAs, thus participating in epigenetic cont
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little information is available regarding mechanistic links between epigenetic modifications and autoimmune diseases. It seems plausible to surmise that aberrant gene expression and energy metabolism would disrupt immune tolerance, which could ultimately result in autoimmune responses. Metaboloepigenetics is an emerging paradigm that defines the interrelationships between metabolism and epigenetics. Epigenetic modifications, such as the methylation/demethylation of DNA and histone proteins and histone acetylation/deacetylation can be dynamically produced and eliminated by a group of enzymes th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PTPN6, a tyrosine phosphatase protein, plays a negative role in cell signal transduction and is negatively correlated with tumour formation and growth. However, epigenetic regulation mechanism of the PTPN6 gene in advanced chronic myeloid leukaemia (CML) remains unclear. This study investigated bone marrow or blood samples from 44 CML patients and 10 healthy volunteers. KCL22 and K562 cells were cultured and treated with demethylation drugs and histone deacetylase inhibitors. Real time quantitative polymerase chain reaction (qPCR), methylation-specific PCR, bisulfite sequencing PCR, Western bl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Latent Epstein-Bar virus genomes undergo epigenetic modifications which are dependent on the respective tissue type and cellular phenotype. These define distinct viral epigenotypes corresponding with latent viral gene expression profiles. Viral Latent Membrane Proteins 1 and 2A can induce cellular DNA methyltransferases, thereby influencing the methylation status of the viral and cellular genomes. Therefore, not only the viral genomes carry epigenetic modifications, but also the cellular genomes adopt major epigenetic alterations upon EBV infection. The distinct cellular epigenotypes of EBV-in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identification of tumor suppressor genes (TSGs) silenced by CpG methylation uncovers the molecular mechanism of tumorigenesis and potential tumor biomarkers. Loss of heterozygosity at 11q25 is common in multiple tumors including nasopharyngeal carcinoma (NPC). OPCML, located at 11q25, is one of the downregulated genes we identified through digital expression subtraction.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Semi-quantitative RT-PCR showed frequent OPCML silencing in NPC and other common tumors, with no homozygous deletion detected by multiplex differential DNA-PCR. Instead, promoter me
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Concurrent sensitization to peanut (PN) and tree nuts (TN), the most dangerous food allergies, is common. Current oral immunotherapy (OIT) is not fully satisfactory.
OBJECTIVE: To determine whether the herbal formula B-FAHF-2 (BF2) ameliorates PN/TN OIT adverse reactions and enhances persistence of a tolerant state.
METHODS: Concurrently sensitized PN-, walnut- (WN) and cashew (CSH)-allergic mice received 1-day PN/WN/CSH rush OIT plus 3 weeks of maintenance dosing, with or without 3 weeks prior and 3 weeks BF2 co-treatment. Anaphylactic symptom scores, core body temperatures, pla
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The relationship between hepatitis B surface antigen (HBsAg)-positive carrier status and liver cancer has been extensively studied. However, the epigenetic changes that occur during progression from HBsAg-positive carrier status or cirrhosis to liver cancer are unknown. The epigenetic modification of DNA hydroxymethylation is critical in tumor development. Further, 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) is an important base for DNA demethylation and epigenetic regulation. It is also involved in the assembly of chromosomes and the regulation of gene expression. However, the mechanism of act…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We developed an integrated multi-omics analysis in metastatic melanoma (MM) cohorts to associate DNA methylation profiles with tumor progression, survival, response to adjuvant immunotherapy, structure of the tumor immune microenvironment and transcriptional programs of immunity and melanoma differentiation.
METHODS: Lesions (n = 191) from a fully annotated, retrospective cohort of 165 AJCC 8th Stage III and IV melanoma patients (EPICA cohort) were characterized by reduced representation bisulfite sequencing, RNA sequencing, whole exome sequencing, quantitative immunohistochemistr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung adenocarcinoma (LUAD) is the most common subtype of non-small cell lung cancer (NSCLC), and epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation is its primary molecular driver event. Although the third-generation tyrosine kinase inhibitors (TKIs) Osimertinib has become the standard first-line therapy for such patients, the development of drug resistance severely limits long-term survival benefits. However, increasing evidence suggests that epigenetic remodeling is a crucial non-genetic mechanism contributing to resistance. Specifically, hypermethylation of DNA promoter regions ca
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Patients with primary biliary cholangitis (PBC) exhibit reduced AE2/SLC4A2 gene expression in the liver and peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). AE2 encodes a Cl-/HCO3 - exchanger involved in biliary bicarbonate secretion and intracellular pH regulation. Reduced AE2 expression in PBC may be pathogenic, as Ae2-knockout mice reproduce characteristic PBC features. Herein, we aimed to identify CpG-methylation abnormalities in AE2 promoter regions that might contribute to the reduced gene transcription in PBC livers and PBMCs.
METHODS: CpG-cytosine methylation rates were
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biotransformation of butylated hydroxyanisole (BHA), a possible carcinogenic food antioxidant, includes o-demethylation to 2-tert-butyl(1,4)hydroquinone (TBHQ) which can subsequently be oxidized to 2-tert-butyl(1,4)paraquinone (TBQ). In this study, we have examined the capacity of Cu, a nuclei- and DNA-associated transition metal, to mediate the oxidation of TBHQ. In phosphate buffered saline (PBS), autooxidation of TBHQ to TBQ was not detectable, while Cu(II) at micromolar concentrations strongly catalyzed the oxidation of TBHQ to TBQ. Oxidation of TBHQ by Cu(II) was accompanied by the ut
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In addition to its synthesis in the developing placenta, human CG or the isolated alpha- and beta-subunits are synthesized by a wide variety of both trophoblastic and nontrophoblastic tumor cell lines. The beta-subunit confers unique biological activity on the hormone and is encoded by a family of six genes or pseudogenes linked physically with beta LH at one locus on chromosome 19. Previous work has demonstrated that members of the beta CG family are not expressed to the same extent in first-trimester placenta. The factors allowing differential expression of the six nearly identical genes are
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antihistamine methapyrilene (MP) has been shown to be a potent hepatocarcinogen in rats. However, it has demonstrated little genotoxic activity in a wide variety of short-term tests. In this study, Fischer 344 rats were fed a carcinogenic dose of 0.1% methapyrilene in the diet for 10 weeks prior to sacrifice. S9 was prepared from the livers of the control, MP-treated and Aroclor-induced Fischer 344 rats. Each type of S9 was analyzed for mixed function oxidase activity, cytochrome P-450, and protein content. MP was then evaluated for mutagenicity in 6 strains of S. typhimurium (TA1535, TA15
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования