Shuttle vectors carrying the supF suppressor tRNA gene were originally developed for mutagenesis experiments in primate and human cells. Since then, the supF gene has been used as a mutation reporter in other mammalian cells, yeast, Escherichia coli, and transgenic mice. The widespread use of the vector for studies of many DNA reactive agents has produced a large database of mutation spectra. These provide primary information on the kinds and distribution of mutations provoked by many agents and, in many instances, allow comparisons between related agents or the same agent in different cell ba
Сравнительное исследованиеСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mutations in X chromosome-linked diseases are frequently heterogeneous, and yet only a small fraction can be detected by Southern analysis. We therefore adapted the chemical cleavage method of Cotton et al. [Cotton, R. G. H., Rodrigues, N. R. & Campbell, R. D. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 4397-4401] and the polymerase chain reaction to rapidly scan for point mutations in X chromosome-linked ornithine transcarbamoylase (carbamoyl-phosphate: L-ornithine carbamoyltransferase, EC 2.1.3.3.) deficiency. This simple heteroduplex mapping method identified different mismatch sites in polym
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in mitochondrial DNA (mtDNA) have been linked to a variety of metabolic, neurological and muscular diseases which can present at any time throughout life. MtDNA is replicated by DNA polymerase gamma (Pol γ), twinkle helicase and mitochondrial single-stranded binding protein (mtSSB). The Pol γ holoenzyme is a heterotrimer consisting of the p140 catalytic subunit and a p55 homodimeric accessory subunit encoded by the nuclear genes POLG and POLG2, respectively. The accessory subunits enhance DNA binding and promote processive DNA synthesis of the holoenzyme. Mutations in either POLG or
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defects in the gene encoding human Poleta result in xeroderma pigmentosum variant (XP-V), an inherited cancer-prone syndrome. Poleta catalyzes efficient and accurate translesion DNA synthesis (TLS) past UV-induced lesions. In addition to Poleta, human cells have multiple TLS polymerases such as Poliota, Polkappa, Polzeta and REV1. REV1 physically interacts with other TLS polymerases, but the physiological relevance of the interaction remains unclear. Here we developed an antibody that detects the endogenous REV1 protein and found that human cells contain about 60,000 of REV1 molecules per cell
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several arenaviruses are responsible for causing viral hemorrhagic fevers (VHF) in humans. Lassa virus (LASV), the causative agent of Lassa fever, is a biosafety level 4 (BSL4) pathogen that requires handling in BSL4 facilities. In contrast, the Pichinde arenavirus (PICV) is a BSL2 pathogen that can cause hemorrhagic fever-like symptoms in guinea pigs that resemble those observed in human Lassa fever. Comparative sequence analysis of the avirulent P2 strain of PICV and the virulent P18 strain shows a high degree of sequence homology in the bisegmented genome between the two strains despite the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An effective detection system for TBEV-RNA sequences using a RT-PCR technique has been developed. In our system, specific oligonucleotide primers corresponding to the 5'-terminal noncoding region were successfully used to identify TBEV sequences in ticks. To prove the specificity of the PCR products, Southern blot hybridization with an internal digoxigenin-labelled probe was carried out. In this paper, we present some potential applications of this technique. The primers were used to identify 21 TBEV strains isolated in different years, in different geographic regions and from different source
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Attempts to assess human placental GH variant (hGH-V) and chorionic somatomammotropin (hCS) RNA in choriocarcinoma cell lines have been hampered by low levels of expression and limited sensitivity of RNA blotting analysis. We examined human choriocarcinoma BeWo, JAR, and JEG-3 cell lines as well as samples of complete hydatidiform moles for expression of members of the human GH (hGH) gene family using reverse transcriptase-polymerase chain reaction. A single and common set of primers was designed and used to detect products of the hGH/hCS genes as well as distinguish processed RNA from any con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In response to environmental cues, bacteria alter gene expression by switching σ factor(s) that recognize a specific set of promoters. This 'σ-cycle', in which σ binds to RNA polymerase (RNAP) to initiate transcription and is released during transcription elongation, is thought to be an essential step for σ-switching. Studies in Escherichia coli provide evidence that σ70 is stochastically released from the elongation complex. This 'σ-cycle' became a general model for all σ factors of all bacteria. Here, using three distinct groups of σ factors in Mycobacterium tuberculosis, we show that althou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In bacteria, RNA polymerase (RNAP) often pauses during the early stages of transcription initiation. The structural basis for these transient pauses remains unclear. Here, we present cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of the paused initiation complex (PIC) and initiation complex (IC) of Mycobacterium tuberculosis (Mtb), which include the RNAP core enzyme, the ECF σ factor σE, transcription factor CarD, promoter DNA, and nascent RNA. Our structures with pre-melted scaffolds reveal an intermediate at the 6-7 nt stage compatible with a paused-like intermediate, associated with steric h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 2008 it was revealed that C6/36 cells challenged with Dengue virus serotype 2 (DENV-2 strain NGC) show cytopathic effects (CPE) but can recover via 2-day serial passaging leading to morphologically normal cell cultures despite persistent infection with DENV-2. In 2009 it was hypothesized that ability to accommodate DENV-2 was dependent on host reverse-transcriptase (HRT) activity. This was proven in 2016 using the RT inhibitor azidothymidine (AZT, a nucleoside analogue and antiretroviral drug) to treat C6/36 cells challenged with DENV-1. Here these results are confirmed using a different RT
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in rpoB, a gene that encodes the bacterial RNA polymerase (RNAP) beta-subunit, can cause high-level resistance to rifampicin. Approximately 95% of rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates harbour mutations in an 81-base pair rpoB region referred to as the rifampicin-resistance-determining region (rpoB/RRDR). Also, rifampicin-resistant M. tuberculosis clinical isolates carry multiple mutations in RNAP genes (i.e., rpoA, rpoB, rpoC, rpoD), particularly rpoA and rpoC, which encode the alpha- (α2) and beta'- (β') subunits, respectively. Such secondary mutations o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study highlights the impact of specific rifampicin-resistance-conferring mutations on the host immune response to Mycobacterium tuberculosis (Mtb), the causative agent of tuberculosis (TB). Clinical reports have previously suggested that multi-drug-resistant) TB patients exhibit altered peripheral immune responses as compared with their drug-sensitive TB counterparts. The murine model of infection with Mtb strains carrying drug-resistance-conferring mutations recapitulated these findings and allowed us to mechanistically interrogate the pathways responsible for driving the divergent immun
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Russian invasion of Ukraine forced migration for safety, protection, and assistance. Poland is the primary sheltering country for Ukrainian refugees, providing support including medical care, which resulted in the rapid ∼15% increase in the number of followed-up people with human immunodeficiency virus (HIV) (PWH) in the country. Here, we present the national experience on HIV care provided for refugees from Ukraine.
METHODS: Clinical, antiretroviral, immunological, and virologic data from 955 Ukrainian PWH entering care in Poland since February 2022 were analyzed. The dataset
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human endogenous retroviruses (HERVs) comprise nearly 8% of the human genome and are derived from ancient integrations of retroviruses into the germline. The biology of HERVs is poorly defined, but there is accumulating evidence supporting pathological roles in diverse diseases, such as cancer, autoimmune, and neurodegenerative diseases. Functional proteins are produced by HERV-encoded genes, including reverse transcriptases (RTs), which could be a contributor to the pathology attributed to aberrant HERV-K expression. To facilitate the discovery and development of HERV-K RT potent and selectiv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to increasing rates of antimicrobial resistance (AMR) in Neisseria gonorrhoeae, alternative treatments should be considered. To assess rifampicin's potential as a gonorrhea treatment, we used rpoB mutations to estimate rifampicin resistance in Austrian N. gonorrhoeae isolates. We found 30% of resistant isolates clustering in three main phylogenomic branches. Rifampicin resistance was associated with resistance to other antibiotics. Therefore, rifampicin cannot be recommended as an alternative gonorrhea treatment in Austria, even in combination therapy. IMPORTANCE Gonorrhea, caused by Neiss
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatitis B virus (HBV) infection is one of the main leading causes of hepatocellular carcinoma (HCC) worldwide. However, it remains uncertain how the reverse-transcriptase (rt) gene contributes to HCC progression.
METHODS: We enrolled a total of 307 patients with chronic hepatitis B (CHB) and 237 with HBV-related HCC from 13 medical centers. Sequence features comprised multidimensional attributes of rt nucleic acid and rt/s amino acid sequences. Machine-learning models were used to establish HCC predictive algorithms. Model performances were tested in the training and independent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The obligate intracellular bacterial pathogen Chlamydia trachomatis has a unique developmental cycle consisting of two contrasting cellular forms. Whereas the primary Chlamydia sigma factor, σ66, is involved in the expression of the majority of chlamydial genes throughout the developmental cycle, expression of several late genes requires the alternative sigma factor, σ28 In prior work, we identified GrgA as a Chlamydia-specific transcription factor that activates σ66-dependent transcription by binding DNA and interacting with a nonconserved region (NCR) of σ66 Here, we extend these findings by
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
My laboratory investigations have been driven by an abiding interest in understanding the consequences of genetic rearrangement in evolution and disease, and in using viruses to elucidate fundamental mechanisms in biology. Starting with bacteriophages and moving to the retroviruses, my use of the tools of genetics, molecular biology, biochemistry, and biophysics has spanned more than half a century-from the time when DNA structure was just discovered to the present day of big data and epigenetics. Both riding and contributing to the successive waves of technology, my laboratory has elucidated
БиографияИсторическая статьяСтатьяPortraitПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) infection has been associated with Guillain-Barre syndrome in adults and microcephaly in infants. The existence of insufficient structural data in most of the protein databases hinders the synthesis of anti-ZIKV pharmaceutics. In this work, we attempted to model the catalytic domain of the ZIKV RNA polymerase (RdRpC) along with a detailed assessment of conserved aspartates in ZIKV RdRpC palm domain as potential drug targets. The conserved and catalytically active aspartate residues present in the predicted RdRpC protein were virtually screened against a ZINC database for inhi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to rifampicin (RIF) is a broad subject covering not just the mechanism of clinical resistance, nearly always due to a genetic change in the β subunit of bacterial RNA polymerase (RNAP), but also how studies of resistant polymerases have helped us understand the structure of the enzyme, the intricacies of the transcription process and its role in complex physiological pathways. This review can only scratch the surface of these phenomena. The identification, in strains of Escherichia coli, of the positions within β of the mutations determining resistance is discussed in some detail, a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования