Human adenovirus type 8 (HAdV-8) is a common agent of severe epidemic keratoconjunctivitis (EKC). Twenty-six strains were isolated from sporadic cases of EKC in the southern part of Japan between 1998 and 1999 and were identified as HAdV-8 by the neutralization method using type-specific antiserum against HAdV-8. A comparative analysis of different HAdV-8 genome types was performed using various molecular methods. Restriction enzyme analyses of genomic DNA were performed with BamHI, HindIII, PstI, SacI, SalI, and SmaI and identified 25 isolates as HAdV-8E and 1 isolate as HAdV-8J, a novel geno
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-I) is a human retrovirus that is etiologically linked to adult T-cell leukemia (ATL), an aggressive and fatal lymphoproliferative disease. The viral transactivator, Tax, is thought to play an important role during the initial stages of CD4+ T-cell immortalization by HTLV-1. Tax has been shown to activate transcription through CREB/ATF and NF-KB, and to alter numerous signaling pathways. These pleiotropic effects of Tax modify the expression of a wide array of cellular genes. Another viral protein encoded by HTLV-I, p30, has been shown to aff
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human herpesvirus 7 (HHV-7) is a recently isolated herpesvirus that has been shown to be related to human cytomegalovirus and human herpesvirus 6 and to be a member of the betaherpesvirus subgroup. Here we report the cloning, restriction endonuclease mapping and partial sequence analysis of HHV-7 strain JI DNA. Virus particles were obtained from the supernatant of infected SupT1 cells, the DNA isolated by proteinase K treatment-phenol extraction, and full-length viral DNA was purified and isolated on a pulsed-field gel. Aliquots of this highly purified material were treated in the following wa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acinetobacter baumannii has recently emerged as a significant global pathogen, with a surprisingly rapid acquisition of antibiotic resistance and spread within hospitals and health care institutions. This study examines the genomic content of three A. baumannii strains isolated from distinct body sites. Isolates from blood, peri-anal, and wound sources were examined in an attempt to identify genetic features that could be correlated to each isolation source.
RESULTS: Pulsed-field gel electrophoresis, multi-locus sequence typing and antibiotic resistance profiles demonstrated genot
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Size separation after UV-endonuclease digestion of DNA from UV-irradiated human cells using denaturing conditions fractionates the genome based on cyclobutane pyrimidine dimer content. We have examined the largest molecules available (50-80 kb; about 5% of the DNA) after fractionation and those of average size (5-15 kb) for content of some specific genes. We find that the largest molecules are not a representative sampling of the genome. Three contiguous genes located in a G+C-rich isochore (tyrosine hydroxylase, insulin, insulin-like growth factor II) have concentrations two to three times gr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: There are limited data on the prevalence and genetic diversity of herpes simplex virus type 1 (HSV-1) virulence genes in ocular isolates. Here, we sequenced 36 HSV-1 ocular isolates, collected by the Bascom Palmer Eye Institute, a university-based eye hospital, from three different ocular anatomical sites (conjunctiva, cornea, and eyelid) and carried out a genomic and phylogenetic analyses.
METHODS: The PacBio Sequel II long read platform was used for genome sequencing. Phylogenetic analysis and genomic analysis were performed to help better understand genetic variability among commo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advent of high-resolution and cost-effective genomics and bioinformatics tools and methods contributing to a large database of both human (HAdV) and simian (SAdV) adenoviruses, a genomics-based re-evaluation of their taxonomy is warranted. Interest in these particular adenoviruses is growing in part due to the applications of both in gene transfer protocols, including gene therapy and vaccines, as well in oncolytic protocols. In particular, the re-evaluation of SAdVs as appropriate vectors in humans is important as zoonosis precludes the assumption that human immune system may be naïv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenovirus type 14 (HAdV-B14p) was originally identified as an acute respiratory disease (ARD) pathogen in The Netherlands in 1955. For approximately fifty years, few sporadic infections were observed. In 2005, HAdV-B14p1, a genomic variant, re-emerged and was associated with several large ARD outbreaks across the U.S. and, subsequently, in Canada, the U.K., Ireland, and China. This strain was associated with an unusually higher fatality rate than previously reported for both this prototype and other HAdV types in general. In China, HAdV-B14 was first observed in 2010, when two unrelated
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We documented susceptibility in Dahl S rats to coronary atherosclerosis upon the transgenic expression of human cholesteryl ester transfer protein (hCETP) producing severe combined hyperlipidemia, as detected in Tg[hCETP]53 (Tg53) Dahl S rats. In other genetic backgrounds (i.e. Dahl R, spontaneously hypertensive rat strains) transgene expression does not lead to severe combined hyperlipidemia. This study aimed to identify genetic loci that modify the effect of hCETP on hypercholesterolemia observed in different genetic contexts.
METHODS: To identify quantitative trait loci (QTL) th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human metapneumovirus (HMPV), which belongs to the a family, has shown the emergence of the A2b2 clade as the dominant global genotype. Whether this represents true evolutionary selection or surveillance artefacts remains unclear. We analysed 315 complete HMPV genome sequences (1994-2024) from the Nextstrain database using sampling-corrected statistical approaches, including temporal homogeneity testing, rarefaction analysis, and entropy-based dynamics to examine non-random patterns in A2b2 emergence. Temporal homogeneity testing revealed strong directional evolution towards A2b2 dominance (Z
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human craniofacial morphology is a hallmark of our species' diversity and evolutionary history, shaped by adaptation, introgression, and global dispersal. Cranial globularization and chin emergence are well-documented morphological transformations whose genetic basis remains poorly understood, whereas Neandertal introgression is primarily documented through genomic evidence. How these evolutionary phenomena relate to craniofacial variation in present-day humans remains largely unresolved. Here, we leverage 3D craniofacial data from over 50,000 UK Biobank participants and employ a multivariate,
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gut microbiome comprises a diverse community of bacteria whose interactions with the host range from beneficial mutualism to opportunistic pathogenicity. These interactions are shaped by genomic plasticity and ecological pressures that influence whether microbes support host health, remain conditionally harmless, or contribute to disease. Understanding the mechanisms underlying these shifts is essential for clarifying the balance between cooperation and pathogenicity within the gut ecosystem. This review explores the genomic and evolutionary mechanisms that shape microbial adaptation
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To dissect parasite determinants of clinical disease severity in Plasmodium knowlesi, we performed the first integrative genome-wide association (GWAS), transcriptomic, and expression quantitative trait locus (eQTL) analysis from clinical malaria isolates. We identify distinct parasite programs associated with WHO-defined severe disease, characterized by transcriptional activation of stress-response and host-interaction pathways. In contrast, invasion-linked programs were more strongly associated with parasite burden, while immune-evasion pathways showed overlapping but distinct associations w
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The innate immune system is known for its ability to recognize cytosolic DNA as evidence of infection, but detailed studies of this process have been mostly limited to mice and cell lines. To investigate inflammasome responses in human primary cells, we used engineered viruses encoding the inflammasome reporter caspase-1CARD-EGFP. We show that released genomes of vaccinia virus and monkeypox virus trigger robust inflammasome assembly in human primary cells. To determine the involved inflammasome sensors, we generated nanobodies against AIM2. Three of them inhibit AIM2 inflammasome assembly by
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study used three complementary datasets to investigate the relationship between human Campylobacter infections in Estonia and potential sources. A targeted dataset of 15 C. jejuni genomes with overlapping sequence types from human cases and broiler chicken meat was analysed using genotyping and in silico antimicrobial resistance profiling, alongside 20 human isolates for source attribution. Additionally, 12,111 isolates were analysed to provide population-level context. The core genome multilocus sequence typing showed a high similarity (less than three allelic differences) between the hu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human listeriosis, caused by Listeria monocytogenes, is a serious food borne illness. Information from Pakistan on human listeriosis is sparse. This study reports the emergence and genomic characteristics of human L. monocytogenes cases from Pakistan between 2017 and 2023. L. monocytogenes cases were identified from our laboratory database in specimens submitted for culture and a commercially available multiplex PCR assay for cerebrospinal fluid from 2017 to 2023. Whole genome sequencing was performed on randomly selected isolates collected during 2022-2023. Frequency and geographi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Syrian hamster (Mesocricetus auratus) has shown promise as a human diseases model, recapitulating features of different human diseases including COVID-19. However, the landscape of its genome and transcriptome has not been systematically dissected, restricting its potential applications.
RESULTS: Here we provide a complete analysis of the genome and transcriptome of the Syrian hamster and found that its lineage diverged from that of the Chinese hamster (Cricetulus griseus) around 29.4 million years ago. 21,387 protein-coding genes were identified, with 90.03% of the 2.56G base
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance poses a significant threat to human health, and the human gut microbiota serves as a major reservoir of antibiotic resistance genes (ARGs). In this study, we analyzed 149,515 metagenome-assembled genomes (MAGs) from human gut microbiomes and revealed marked geographic variations in the global distribution of gut-associated ARGs. Asia exhibits the highest diversity of ARGs. At the phylum level, Pseudomonadota was identified as the predominant ARG host among pathogenic bacteria, with its pathogenic strains frequently exhibiting high levels of multidrug resistant strains har
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the past few decades, coronavirus outbreaks have been reported globally. To date, seven human coronaviruses have been identified, among which only SARS-CoV-2 has been extensively studied, resulting in the development of several approved antiviral drugs. To effectively combat both current and emerging coronaviruses, there is an urgent need for a comprehensive database that consolidates information on all known human coronaviruses and their potential antiviral compounds. In response, we present HCoVDB-a comprehensive database that integrates genomic data, viral proteins, and antiviral agent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования