DNA double-strand breaks (DSBs) represent the most cytotoxic DNA lesions, as-if mis- or unrepaired-they can cause cell death or lead to genome instability, which in turn can cause cancer. DSBs are repaired by two major pathways termed homologous recombination and non-homologous end-joining (NHEJ). NHEJ is responsible for repairing the vast majority of DSBs arising in human cells. Defects in NHEJ factors are also associated with microcephaly, primordial dwarfism and immune deficiencies. One of the key proteins important for mediating NHEJ is XRCC4. XRCC4 is a dimer, with the dimer interface med
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus G (EV-G) belongs to the family of Picornaviridae. Two types of recombinant porcine EV-Gs carrying papain-like cysteine protease (PLCP) gene of porcine torovirus, a virus in Coronaviridae, are reported. Type 1 recombinant EV-Gs are detected in pig feces in Japan, USA, and Belgium and carry the PLPC gene at the junction site of 2C/3A genes, while PLPC gene replaces the viral structural genes in type 2 recombinant EV-G detected in pig feces in a Chinese farm. We identified a novel type 2 recombinant EV-G carrying the PLCP gene with flanking sequences in place of the viral structural g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spatial and temporal regulation of actin polymerization is crucial for various cellular processes. Members of the Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP) family activate the Arp2/3-complex leading to actin polymerization. The yeast Saccharomyces cerevisiae contains only one WASP homolog, Las17, that requires additional factors for its regulation. Lsb1 and Lsb2/Pin3 are two yeast homologous proteins bearing an SH3 domain that were identified as Las17-binding proteins. Lsb2/Pin3 that promotes prion induction was suggested to link this prion formation to the actin cytoskeleton. However, the c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using recombinant human glycoprotein VI (GPVI), we evaluated the effect of N-linked glycosylation at the consensus site Asparagine92-Glycine-Serine94 (N92GS94) on binding of this platelet-specific receptor to its ligands, human type I collagen, collagen-related peptide (CRP), and the snake venom C-type lectin convulxin (CVX). In COS-7 cells transiently transfected with GPVI, deglycosylation with peptide-N-glycosidase F (PNGase F; specific for complex N-linked glycans) or tunicamycin decreases the molecular weight of GPVI and reduces transfected COS-7 cell binding to both CRP and CVX. In stably
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood-sucking organisms produce various anticoagulant proteins that prevent blood clotting in their prey. Even in well-studied species like Hirudo medicinalis, many such proteins remain unidentified. We previously described a novel cysteine-rich anticoagulant (CRA), a distant homolog of antistasin. Later, we discovered another, much larger homolog in the medicinal leech. Its amino acid sequence is also highly cysteine-rich. Analysis of cysteine patterns showed four antistasin-like domain motifs, with one of them strongly disrupted. Since both antistasin and CRA contain two such domains, the ne
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genetic screen designed to identify proteins that utilize the signal recognition particle (SRP) for targeting in Escherichia coli was used to screen a Neisseria gonorrhoeae plasmid library. Six plasmids were identified in this screen, and each is predicted to encode one or more putative cytoplasmic membrane (CM) proteins. One of these, pSLO7, has three open reading frames (ORFs), two of which have no similarity to known proteins in GenBank other than sequences from the closely related N. meningitidis. Further analyses showed that one of these, SLO7ORF3, encodes a protein that is dependent on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria gonorrhoeae (gonococcus [Ng]) is the causative organism of the sexually transmitted disease gonorrhoea, and no effective vaccine exists currently. In this study, the structure, biological properties, and vaccine potential of the Ng-adhesin complex protein (Ng-ACP) are presented. The crystal structure of recombinant Ng-ACP (rNg-ACP) protein was solved at 1.65 Å. Diversity and conservation of Ng-ACP were examined in different Neisseria species and gonococcal isolates (https://pubmlst.org/neisseria/ database) in silico, and protein expression among 50 gonococcal strains in the Centers f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homology modeling of NS3 helicase in Tick-borne encephalitis virus using known protein crystal structure was done. Its 3-D structure was evaluated and validated using PROCHECK comprising amino acid residues in favored region of Ramachandran plot. Helicase forms a large family of proteins which ubiquitously distributes in wide variety of organisms. It plays crucial role in transcription and replication of single-stranded viral RNA genomes. Consequently, NS3 represents an interesting target for the development of specific antiviral inhibitors. Several helicase inhibiting effective drugs and anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningococcal disease, caused by Neisseria meningitidis (Nm), is still one serious threatening infectious disease with high mortality. Vaccination is available for prevention and control of such disease. Based on the chemical structure of capsule polysaccharide, Nm strains were classified into 13 serogroups. Meningococcal polysaccharide vaccines and polysaccharide conjugated protein vaccine against serogroup A, C, W135 and Y were efficacious and have been widely used. Because of poor immunogenicity and the structurally homologous with neural cell, capsule polysaccharide of serogroup B Nm can n
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposable elements (TEs) are pervasive genomic components that propagate via self-encoded factors, yet the nature, regulation, and function of these factors remain largely unresolved. Here, we integrated extensive long- and short-read transcriptome data, regulatory network analyses, deep proteomics, and structural predictions to construct a comprehensive atlas of TE products in Arabidopsis. We show that TE expression is embedded within host regulatory circuits, with DNA methylation and transcription factors jointly shaping TE transcriptional activity. Proteomic analyses confirm the producti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospiral immunoglobulin-like (Lig) protein family is a surface-exposed protein from the pathogenic Leptospira. The Lig protein family has been identified as an essential virulence factor of L. interrogan. One of the family members, LigA, contains 13 homologous tandem repeats of bacterial Ig-like (Big) domains in its extracellular portion. It is crucial in binding with the host's Extracellular matrices (ECM) and complement factors. However, its vital role in the invasion and evasion of pathogenic Leptospira, structural details, and domain organization of the extracellular portion of this pro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A methodology is proposed to solve a difficult modeling problem related to the recently sequenced P39 protein. This sequence shares no similarity with any known 3D structure, but a fold is proposed by several threading tools. The difficulty in aligning the target sequence on one of the proposed template structures is overcome by combining the results of several available prediction methods and by refining a rational consensus between them. In silico validation of the obtained model and a preliminary cross-check with experimental features allow us to state that this borderline prediction is at
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dystrophin-glycoprotein complex (DGC) is composed of peripheral and integral membrane proteins at the muscle cell membrane that link the extracellular matrix with the intracellular cytoskeleton. While it is well established that genetic mutations that disrupt the structural integrity of the DGC result in numerous muscular dystrophies, the 3D structure of the complex has remained elusive. Two recent elegant cryoEM structures of the DGC illuminate its molecular architecture and reveal the unique structural placement of sarcospan (SSPN) within the complex. SSPN, a 25 kDa tetraspanin-like prot
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marburg virus disease (MVD) caused by the Marburg virus (MARV) generally appears with flu-like symptoms and leads to severe hemorrhagic fever. It spreads via direct contact with infected individuals or animals. Despite being considered to be less threatening in terms of appearances and the number of infected patients, the high fatality rate of this pathogenic virus is a major concern. Until now, no vaccine has been developed to combat this deadly virus. Therefore, vaccination for this virus is necessary to reduce its mortality. Our current investigation focuses on the design and formulation of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: CYP27B1 converts 25-hydroxyvitamin D3 to active 1,25-dihydroxyvitamin D3, playing a vital role in calcium homeostasis and bone growth. Vitamin D-dependent rickets type 1 (VDDR-1) is a rare autosomal recessive disorder caused by mutations in CYP27B1.
OBJECTIVE: The objective of the study was an enzymatic and structural analysis of mutations in a patient with calcipenic rickets. Design, Setting, Patient, and Intervention: Two siblings presented with calcipenic rickets and normal 1,25-dihydroxyvitamin D3 levels. CYP27B1 gene analysis showed compound heterozygous mutations confirming VDD
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Yersinia outer protein (Yop) M effector from the Yersinia pestis bacterium is well-known for being a critical virulence determinant; however, structural insight vis-à-vis its role in Y. pestis pathogenesis has been elusive. Here, we investigate the intact sequence of the YopM protein through our recently developed fold identification and homology modeling tools, and analyze the immune modulatory potential of its constituent domains. We identify a putative novel E3 ligase (NEL) domain towards the C-terminal tail of YopM and characterize its active site, to show that YopM could function as a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recruitment of the intracellular tyrosine kinase Syk to activated immune-response receptors is a critical early step in intracellular signaling. In mast cells, Syk specifically associates with doubly phosphorylated immunoreceptor tyrosine-based activation motifs (ITAMs) that are found within the IgE receptor. The mechanism by which Syk recognizes these motifs is not fully understood. Both Syk SH2 (Src homology 2) domains are required for high-affinity binding to these motifs, but the C-terminal SH2 domain (Syk-C) can function independently and can bind, in isolation, to the tyrosin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salt-bridge conservation has traditionally been evaluated at the primary sequence level, leaving the persistence of three-dimensional interaction sites across homologous families largely unexplored. In this study, we developed a systematic family-level structural framework to redefine salt-bridge conservation based on spatial interaction sites rather than residue identity by mapping salt bridges onto unified SCOP2-aligned domain coordinates. We classified these interactions into three categories: classically conserved (CLA), nonclassically conserved (NOCLA; i.e., charge compensation), and nonc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and Objective: Vibrio cholerae continues to emerge as a dangerous pathogen because of increasing resistance to a number of antibiotics. This paper provides a solution to emerging antibiotic resistance by introducing novel proteins as vaccine candidates against cholera. Materials and Methods: Vibrio cholerae genome versatility is a hurdle for developing a vaccine to combat diarrhoeal infection, so its core gene information was used to determine a potential vaccine candidate. Whole genome sequence data of more than 100 Vibrio cholerae strains were used simultaneously to get core genom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thrombomodulin (TM) is a type 1 receptor best known for its function as an anticoagulant cofactor for thrombin activation of protein C on the surface of vascular endothelial cells. In addition to its anticoagulant cofactor function, TM also regulates fibrinolysis, complement, and inflammatory pathways. TM is a multidomain receptor protein with a lectin-like domain at its N-terminus that has been shown to exhibit direct anti-inflammatory functions. This domain is followed by 6 epidermal growth factor-like domains that support the interaction of TM with thrombin. The interaction inhibits the pro
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования