Emerging resistance to delamanid (DLM) and pretomanid (Pa) threatens drug-resistant tuberculosis (DR-TB) treatment outcomes. The lack of rapid molecular diagnostics, due to limited knowledge of resistance-conferring mutations, along with standardization challenges for critical concentrations (CC) in phenotypic drug susceptibility testing (pDST) hinder resistance detection. Here, we explore the correlation between minimum inhibitory concentrations (MICs) and genomic variants of DLM and Pa resistance in Mycobacterium tuberculosis (Mtb). Seventeen Mtb isolates phenotypically resistant to DLM dete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella remains a leading global foodborne pathogen, whereas low-water-activity foods are often underestimated as transmission vehicles. … ene, as well as various antibiotic resistance genes and heavy metal resistance operons. Comparative genomics revealed a conserved plasmid backbone and a distinctive resistance island. This study documents the first detection of an mcr-9.2-carrying Salmonella in low-water-activity foods in Beijing. Our findings demonstrate high genomic diversity, widespread …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ticks are blood-feeding arthropods with approximately 1000 species; however, only 24 species so far have a genome assembly. These genome assemblies are important resources to advance tick biology and control of tick-associated diseases. Generating tick genome assemblies has been challenging due to their small body size (low DNA input), DNA contamination (from microbiota and host bloodmeals), large genome size (on average 2.4 Gbp for hard ticks) and abundant transposable elements (at least 68% of the assembly for Ixodes species). Advances in sequencing technologies have driven an increasing num
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida solani is a member of the Wickerhamomyces clade of budding yeasts. We present the genome sequence of C. solani strain UCD2211 isolated from soil on the University College Dublin (UCD) campus in Ireland. This genome was 12.67 Mb and assembled into six chromosome-sized contigs plus a mitochondrial genome contig.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic imprinting, an epigenetic mechanism that governs parent-of-origin-specific gene expression, is essential for mammalian development, yet its role in late-stage development remains unclear due to the lethality of parthenogenetic (Pg) embryos. Here, we establish cell replacement with parthenogenote-derived cells (CReP), a blastocyst complementation strategy that enables survival and tissue-specific contribution of Pg-derived cells. By creating tissue-specific niches in recipient embryos, CReP allows targeted incorporation of Pg-derived cells into late-stage tissues. Brain-targeted CReP sh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: This study aimed to investigate the global genetic diversity, evolutionary relationships, and antimicrobial resistance (AMR) profiles of Klebsiella pneumoniae by performing a comprehensive pan-genome and phylogenetic analysis across worldwide isolates.
MATERIALS AND METHODS: A total of 72,057 K. pneumoniae genomes were retrieved from the NCBI database, from which 91 high-quality representative genomes each from a unique country were selected based on completeness, metadata availability, and sequence quality. Genomic assemblies were assessed using QUAST, annotated with PROKKA, and analyz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasma cell leukemia (PCL) is rare and aggressive. Plasma cells from patients with PCL were examined using next-generation sequencing (NGS). We compared NGS data from 18 patients with PCL (peripheral blood, n = 10; bone marrow, n = 8) and 1742 multiple myeloma (MM) samples. Mutations of TP53, CCND1, and KRAS were commonly observed in both diseases. Alterations in DIS3 (17% vs 1%), CCND2 (22% vs 15%), PIK3R1 (6% vs 0%), and MAP3K1 (6% vs 2%) were more common in PCL than in MM (P< .05). Translocations occurred in 11 (61.1%) patients with PCL; IGH::CCND1 and IGH::MYC were more frequent in PCL tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cereal breeding must deliver complex trait combinations under a changing climate, and CRISPR-Cas editing is presented as the technology that will accelerate this. Existing reviews document the editing toolkit thoroughly, yet few follow an edited allele through the steps separating an edited plant from a released cultivar. This review addresses that gap by treating genome editing as one module within a cereal breeding pipeline and asking, at each interface, whether integration has been demonstrated or only proposed. Evidence was selected against three criteria, namely, that the work was perform
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The necrotrophic predatory yeast Saccharomycopsis schoenii preys on diverse fungal species including multidrug-resistant Candida auris, maki … pies that are co-transcribed, bypassing conventional silencing mechanisms. Furthermore, comparative genomics highlights species-specific expansions in several gene classes; including, secreted aspartic proteases and adhesins, linked to its necrotrophic lifestyle. This improved reference genome provides a crucial resource for investigating the molecular bas …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Folsomia candida (Collembola: Isotomidae) is one of the most important indicator species for soil animal studies and is widely distributed w … ovide a high-quality genomic resource that enables future studies on soil arthropods and springtail genomics.
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine sapelovirus (PSV) is increasingly detected in swine enteric disease complexes, but its evolutionary dynamics and transmission patterns remain insufficiently characterized. In this study, we analyzed 327 fecal samples collected from diarrheic piglets between 2015 and 2022 and identified persistent PSV detection in northeastern China. Because PSV was detected in the context of mixed enteric viral infections in this dataset, our data do not establish PSV as an independent causative agent of diarrhea. Comparative whole-genome and evolutionary analyses of globally circulating PSV strains re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite remarkable progress towards measles elimination in Burundi, the country has seen a resurge in cases since 2019. Epidemiological investigations have been performed; however, it remained unclear if all measles cases involved in recent outbreaks were linked or caused by multiple independent events including introductions from other countries. Therefore, the objective of this study is to investigate the genetic diversity and evolution of measles virus (MeV) during the last large MeV outbreak in Burundi in 2024. The study was carried out on oropharyngeal swab samples collected from four nei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: East Asian Helicobacter pylori (H. pylori) strains are commonly classified as a single hspEAsia lineage characterized by elevated virulence. However, gastric cancer incidence varies markedly across China, suggesting that clinically relevant bacterial heterogeneity may exist within this framework. A systematic assessment of fine-scale population structure and its functional correlates in Chinese H. pylori remained limited.
METHODS: We analyzed whole-genome sequencing data from 1,243 H. pylori isolates collected from 20 provinces and regions across China, including 50 newly sequence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Candida infection has been implicated in the progression of Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC). Understanding the molecular pathways and gene interactions involved in this process could provide new insights into the mechanisms underlying OSCC development and identify potential therapeutic targets. This study utilizes bioinformatics tools to analyze the genes associated with Candida infection and its role in the possible progression of the disease.
OBJECTIVE: To investigate the gene networks, enriched biological pathways, and chromosomal loci implicated in the progression of OSCC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with pancreatic neuroendocrine tumours (PNETs) often have similar baseline clinical characteristics, including grade and molecular imaging phenotype, yet have highly variable responses to peptide receptor radionuclide therapy (PRRT). To identify genomic alterations and mutational patterns associated with PRRT treatment response and acquired somatic changes following PRRT exposure, whole genome or exome sequencing was applied to 40 PNET samples from 32 patients, including eight paired pre- or post-PRRT samples. The genomic profile of tumours reflected the known mutational landscape of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella is a globally distributed zoonotic pathogen with widespread environmental persistence; however, genomic characterization of environmental isolates from underrepresented regions remains limited. Current global data sets are predominantly populated with genomes from high-income countries, restricting our ability to resolve evolutionary trajectories, ecological adaptations, and emerging antimicrobial resistance (AMR). We performed a comparative genomic analysis of 1,399 high-quality Salmonella genomes, integrating 54 newly sequenced isolates from India (representing surface water and s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The whole genome amplification (WGA) allows new clinical applications with minimal genetic material, such as in the genetic diagnosis of Mendelian diseases in embryos before implantation (Preimplantation Genetic Test for Mendelian Abnormalities, PGT-M). This approach allows couples to avoid the transmission of Mendelian disease by undergoing assisted reproduction treatment through in vitro fertilization (IVF). First, Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidy (PGT-A) is used to identify chromosomal aneuploidies in IVF-generated embryos. Then, or in parallel, euploid embryos can be screened
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective genome packaging is a critical step for RNA viruses, which must distinguish genomic RNA from other abundant transcripts. For SARS-CoV-2, the cis-acting packaging signal is thought to be recognized by the nucleocapsid (N) protein, but its identity and mechanistic basis for selective recognition remain undefined. Here we identify the packaging signal within the nsp12 polymerase-coding region. CLIP-seq maps N-bound sites and, together with virus-like particle assays, pinpoints a conserved segment with strong packaging activity. An orthogonal defective-interfering RNA approach confirms i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The translational nature of genomics highlights the importance of developing a robust genomic data governance framework. To inform the development of such a framework for Australia, we conducted a scoping review to identify genomic data governance and management differences between research and clinical care.
METHODS: For this scoping review, four databases were searched and 9528 relevant articles published between January 2013 and October 2024 were identified. After screening, 43 empirical, legal and theoretical/commentary articles were included. The differences reported to aff…
Scoping ReviewСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования