BACKGROUND: Pulmonary infection is a common and severe post-transplant complication in kidney transplant recipients (KTRs). Their long-term immunosuppression results in an extremely complex pathogen spectrum. Compared with conventional etiological detection methods, metagenomic next-generation sequencing (mNGS) enables rapid and broad-spectrum pathogen identification. However, compared with bronchoalveolar lavage fluid (BALF), research on the diagnostic value of sputum - used as a non-invasive sample - for pulmonary infections in KTRs remains limited.
METHODS: A retrospective study included 7
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Alterations to the respiratory microbiota may contribute to lung cancer progression. This study examined real-world data to characterize sputum microbiota alterations and to assess their association with oncogenomic changes and response to targeted therapies in patients with lung cancer.
METHOD: A total of 724 patients with lung cancer who underwent etiological examinations of their sputum were retrospectively included. Tumor tissues of 105 patients were analyzed using commercial next-generation sequencing (NGS) panels targeting 1021 genes for the initial screening stage. Amplifica
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) carries high mortality despite multimodal therapy, and improved biomarkers are needed to guide perioperative care. This study evaluated the prognostic significance of Kirsten rat sarcoma virus (KRAS)-mutant circulating tumor DNA (ctDNA) detected by next-generation sequencing (NGS) and digital droplet PCR (ddPCR) in localized PDAC.
EXPERIMENTAL DESIGN: In this prospective cohort study (2020-2024), patients with localized PDAC undergoing neoadjuvant chemotherapy (NAC) were enrolled across multiple sites within Northwestern Medicine. Blood samples
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To investigate the clinicopathological and molecular features of meningioma, and to analyze the characteristic molecular changes in high-grade meningioma (WHO grades 2-3). Methods: A total of 139 meningioma specimens from 134 patients treated at Xuanwu Hospital, Capital Medical University from 2015 to 2020 were collected, including 49, 62 and 28 samples of WHO grades 1, 2 and 3 meningiomas, respectively. Clinical data and pathological diagnoses were reviewed. Next-generation sequencing (NGS) was conducted to analyze the associations of molecular biomarkers with clinicopathological f
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute graft-versus-host disease (aGVHD) is a major cause of mortality following hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). Its pathogenesis is primarily driven by alloimmune T cells, which recognize host tissues as foreign. A deeper characterization of the T cell receptor (TCR) repertoires in patients with aGVHD could provide critical insights into the disease's mechanisms and identify potential predictive biomarkers.
METHODS: We employed next-generation sequencing to comprehensively profile the T cell receptor alpha (TRA) and beta (TRB) chains in HSCT recipients, comparing
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung abscess is a severe pulmonary infection usually caused by anaerobic or pyogenic bacteria. Mycoplasma pneumoniae (MP), a common cause of community-acquired pneumonia, is only rarely implicated in lung abscess formation. Available reports of MP-associated lung abscess have been largely confined to pediatric patients, and adult cases have not been clearly documented to date. CASE PRESENTATION: We report a 74-year-old male with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) who presented with chest pain, productive cough, and dyspnea. Chest CT revealed a cavitary lesion with an air-
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lung cancer is the most common malignancy in humans and the leading cause of cancer-related deaths worldwide. Nonsmall cell lung cancer (NSCLC), the primary histologic type, is categorized into lung adenocarcinoma (LUAD) and lung squamous cell carcinoma based on immunohistochemical thyroid transcription factor-1 and P40 status. LUAD is morphologically classified into five histological subtypes, based on physician experience, which can lead to confusion among pathologists and clinicians. Histological subtypes serve as crucial markers for lung cancer development and hold significant
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancers are often diagnosed on small biopsy formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) material. Despite judicious selection of diagnostic immunohistochemistry studies and the use of tissue conservation workflows, biopsy material can be limited in some cases, necessitating re-biopsy for the purpose of downstream predictive molecular marker testing. The aim of this study is to investigate the feasibility of an alternative method to re-biopsy: that of re-purposing material from diagnostic slides for molecular testing. Forty lung cancer biopsy specimens were selected. After digital archival of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancers with the Cancer Genome Atlas (TCGA) molecular profile of TP53-mutated, POLE-wild-type, and microsatellite-stable generally exhibit a high burden of copy number (CN) alterations and carry an increased risk for adverse outcomes, meriting maximal adjuvant therapy. In contrast, the prognosis associated with a TP53 mutation that coexists with a POLE mutation or microsatellite instability aligns with that of ultramutated or hypermutated cancers, respectively. In this study, we characterized a rare molecular subclass of endometrial cancers defined by TP53 mutation but low burden o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pulmonary arterial hypertension (PAH) involves progressive obstruction of small pulmonary vessels due to vascular remodeling. Although the genetic architecture of PAH is increasingly understood, it remains poorly characterized in Algeria due to limited studies and the absence of molecular diagnostic infrastructure.
OBJECTIVES: To identify pathogenic variants in BMPR2 and other PAH-related genes in Algerian patients, enabling targeted screening of high-risk individuals, refined classification of variants of uncertain significance (VUS), and early, personalized clinical management.
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND This report describes the case of an 81-year-old woman with a history of resected right-lung adenocarcinoma and presenting with a solitary nodule in the head of the pancreas, which demonstrated diagnostic challenges differentiating between metastasis of lung cancer versus primary pancreatic adenocarcinoma during the pathology workup. Differentiating between primary and metastasis in an isolated pancreatic lesion in a patient with a history of lung carcinoma is critical for patient treatment and management. Histology comparison, immunohistochemical characterization, and molecular stu
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: HIV pretreatment drug resistance (PDR) is an increasing global concern affecting transmitted resistance and first-line therapy effectiveness. Colombia lacks recent nationwide data on transmitted resistance. Although national guidelines recommend second-generation integrase strand transfer inhibitors (INSTIs) as preferred first-line options, efavirenz remains widely prescribed. This study estimated HIV PDR prevalence in Colombia to inform best practices for first-line antiretroviral therapy.
METHODS: We conducted a cross-sectional, nationally representative survey using next-genera
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Systematic evaluations of targeted next-generation sequencing (tNGS) for lower respiratory tract infections (LRTIs) remain limited. This study assesses tNGS diagnostic performance and clinical utility.
METHODS: We prospectively analyzed bronchoalveolar lavage fluid (BALF) from 1251 patients with LRTIs, comparing tNGS results against conventional culture and galactomannan (GM) testing.
RESULTS: tNGS achieved a significantly higher pathogen positivity rate than culture (95.6% vs 25.7%, p < 0.0001), with an agreement of 25.2%; stratified agreement was 50.9% for bacteria and 63.5% fo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Given the global resurgence of pertussis, this study aimed to systematically investigate the epidemiology, clinical features, and risk factors for severe illness of Bordetella pertussis infection among hospitalized children with acute respiratory infections in Guangxi, China, from 2021 to 2024.
METHODS: This retrospective study enrolled 10,153 children hospitalized with acute respiratory infections at a tertiary hospital in Guangxi, China (April 2021-December 2024). Clinical data were collected, and targeted next-generation sequencing (tNGS) was performed on respiratory specimens
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nontuberculous mycobacteria (NTM) are emerging global pathogens. This study aimed to analyze the clinical features, species distribution, and drug resistance profiles of NTM infections in a northern Chinese hospital. A retrospective cohort study included 1769 patients with suspected mycobacterial infection from August 2023 to July 2025. PCR melting curve analysis (PCR-MCA) was used for initial screening, with confirmation by targeted next-generation sequencing (tNGS). Confirmed cases were classified as localized or disseminated disease. Among 60 confirmed NTM cases, 48 were localized (mainly p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Eswatini, multidrug-resistant (MDR) Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains harbouring the rifampicin-resistance (RR) rpoB I491F mutation are missed by routine diagnostics, including GeneXpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra), line probe assays (LPA), and mycobacterium growth indicator tube (MGIT) phenotypic drug susceptibility testing (pDST). To address this diagnostic gap, Eswatini introduced targeted next-generation sequencing (tNGS) in 2019. We analysed 234 patient samples enrolled from June 2021 to December 2024 with isoniazid and/or rifampicin resistance detected by routine diagnostics, o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Rapid discrimination between Mycobacterium tuberculosis (MTB) and nontuberculous mycobacteria (NTM) remains clinically challenging, especially when conventional microbiological evidence is limited. Whether metagenomic next-generation sequencing (mNGS) can provide rapid species-level identification while simultaneously characterizing the respiratory microbiome remains to be systematically evaluated.
METHODS: Bronchoalveolar lavage fluid from 74 retrospectively enrolled patients with clinically diagnosed pulmonary mycobacterial disease (62 TB, 12 NTM-pulmonary disease (NTM-PD)) wa
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: C-ROS proto-oncogene 1 receptor tyrosine kinase (ROS1) gene fusion-positive non-small cell lung cancer (NSCLC) is a high-risk subtype of lung cancer, and the accurate identification of this specific subtype is critically important. This study systematically analyzes the concordance between the results of next-generation sequencing (NGS), immunohistochemistry (IHC), and fluorescence in situ hybridization (FISH) to validate the clinical value of IHC as an initial screening tool for ROS1 fusions.
METHODS: Patients with NSCLC diagnosed at Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sc
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial carcinoma is a biologically and clinically heterogeneous neoplasm, for which molecular classification now plays a central role in determining prognosis and guiding treatment. The aim of this study was to develop and apply an in-house multi-gene NGS panel to expand the molecular characterization of endometrial tumors beyond the markers required for surrogate classification. Seventy primary endometrial carcinomas were selected and analyzed by immunohistochemistry for p53, mismatch repair proteins, ARID1A, and PTEN, and by NGS on DNA extracted from FFPE samples using a panel comprisin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Minimal residual disease (MRD) monitoring has been demonstrated to important in predicting prognosis in acute myeloid leukemia (AML) receiving allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT), but the ideal time point and method remain unclear. Our study compared the prognostic value of multiparameter flow cytometry (MFC)-based and WT1 expression-based MRD a month before allo-HSCT [HSCT(-1 m)] and after allo-HSCT [HSCT(+ 1 m)], as well as next generation sequencing (NGS)-based MRD at HSCT(-1 m), HSCT(+ 1 m), 3 and 6 months after allo-HSCT [HSCT(+ 3 m) and HSCT(+ 6 m)] among 47 AM
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования