Age at onset of walking is an important early childhood milestone which is used clinically and in public health screening. In this genome-wide association study meta-analysis of age at onset of walking (N = 70,560 European-ancestry infants), we identified 11 independent genome-wide significant loci. SNP-based heritability was 24.13% (95% confidence intervals = 21.86-26.40) with ~11,900 variants accounting for about 90% of it, suggesting high polygenicity. One of these loci, in gene RBL2, co-localized with an expression quantitative trait locus (eQTL) in the brain. Age at onset of walking (in m…
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is a common complex disorder with a significant polygenic SNP heritability ([Formula: see text]). Here we utilise genome-wide association study (GWAS) summary statistics to study pleiotropy between blood proteins and migraine under the polygenic model. We estimate [Formula: see text] for 4625 blood protein GWASs and identify 325 unique proteins with a significant [Formula: see text] for use in subsequent genetic analyses. Pleiotropy analyses link 58 blood proteins to migraine risk at genome-wide, gene and/or single-nucleotide polymorphism levels-suggesting shared genetic influences or…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cannabis use is a heritable trait that has been associated with adverse mental health outcomes. In the largest genome-wide association study (GWAS) for lifetime cannabis use to date (N = 184,765), we identified eight genome-wide significant independent single nucleotide polymorphisms in six regions. All measured genetic variants combined explained 11% of the variance. Gene-based tests revealed 35 significant genes in 16 regions, and S-PrediXcan analyses showed that 21 genes had different expression levels for cannabis users versus nonusers. The strongest finding across the different analyses w…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genome-wide association (GWA) study of treatment outcomes (response and remission) of selective serotonin reuptake inhibitors (SSRIs) was conducted using 529 subjects with major depressive disorder. While no SNP associations reached the genome-wide level of significance, 14 SNPs of interest were identified for functional analysis. The rs11144870 SNP in the riboflavin kinase (RFK) gene on chromosome 9 was associated with 8-week treatment response (odds ratio (OR)=0.42, P=1.04 × 10⁻⁶). The rs915120 SNP in the G protein-coupled receptor kinase 5 (GRK5) gene on chromosome 10 was associated with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
South Asian populations remain underrepresented in cancer genomics, despite elevated risk for certain malignancies and distinct clinical profiles. This gap is especially pronounced for British Bangladeshi and Pakistani communities. We analyse data from 57,416 individuals of Bangladeshi and Pakistani ancestry in the UK-based Genes & Health cohort, integrating electronic health records, cancer registry data, and whole-exome sequencing (n = 43,462). Among them, 2,782 (4.8%) has cancer, with earlier onset across multiple types compared to national benchmarks. A phenome-wide case-control analysis i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polygenic risk scores (PGS) have the potential to support enhanced, risk-based screening for breast cancer. Previous studies for many diseases found that genome-wide PGS (GW-PGS) outperform PGS derived by applying hard GWAS significance thresholds. To support future breast cancer risk predictions, we compared the predictive performance of two existing PGS (including PGS313, a leading hard-thresholding PGS) and five newly developed GW-PGS (applying different methods to recent GWAS). We evaluated the performance of PGS Z-scores and of predicted 5-year absolute breast cancer risks based on age al
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Emerging studies have indicated associations between certain viruses (like Epstein-Barr, HIV, and hepatitis viruses) and periodo … een HAV exposure and periodontitis. Then, Mendelian Randomization (MR) analysis was conducted using Genome-Wide Association Study (GWAS) datasets from 23andMe and the Gene Lifestyle Interactions in Dental Endpoints (GLIDE) consortium. Various statistical methods were applied to assess the potential genetic causal relationship between HAV infection and periodontitis.
RESULTS: …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Copper-induced oxidative damage and mitochondrial dysfunction may exacerbate Parkinson's disease (PD) pathology. DNA methylation (DNAm) can serve as a biological mediator of environmental exposures.
OBJECTIVE: To investigate the impact of chronic, long-term copper exposure on genome-wide DNA methylation patterns in the blood of PD cases and community controls.
METHODS: We analyzed 806 blood samples (569 PD cases and 237 controls) from a population-based case-control study. Epigenome-wide association analysis (EWAS) was conducted to identify differentially methylated probes (DMPs)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer is the second most common cancer globally, with radiation therapy (RT) being a key treatment for clinically loca … d/or gastrointestinal late toxicity after 12 months of starting RT, whereas controls did not. An epigenome-wide association study of post-RT toxicities was performed using the Illumina MethylationEPIC BeadChip, adjusting for age and cell type composition. We constructed two methylation risk scores-one using differentially methylated positions (MRSsites) and another using diffe …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biological datasets often consist of thousands or millions of variables, e.g. genetic variants or biomarkers, and when sample sizes are large it is common to find many associated with an outcome of interest, for example, disease risk in a GWAS, at high levels of statistical significance, but with very small effects. The False Discovery Rate (FDR) is used to identify effects of interest based on ranking variables according to their statistical significance. Here, we develop a complementary measure to the FDR, the priorityFDR, that ranks variables by a combination of effect size and significance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The incidence of ulcerative colitis (UC) has increased globally. As a complex disease, the genetic predisposition for UC could be estimated by the polygenic risk score (PRS), which aggregates the effects of a large number of genetic variants in a single quantity and shows promise in identifying individuals at higher lifetime risk of UC. Here, based on a cohort of 2869 UC cases and 2900 controls with genotype array datasets, we used PRSice-2 to calculate PRS, and systematically analyzed factors that could affect the power of PRS, including GWAS summary statistics, population stratification, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggressive pituitary neuroendocrine tumors (PitNETs)/adenomas are characterized by progressive growth despite surgery and all standard medical therapies and radiotherapy. A subset will metastasize to the brain and/or distant locations and are termed metastatic PitNETs (pituitary carcinomas). Studies of potential prognostic markers have been limited due to the rarity of these tumors. A few recurrent somatic mutations have been identified, and epigenetic alterations and chromosomal rearrangements have not been explored in larger cohorts of aggressive and metastatic PitNETs. In this study, we per
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is an endocrine and metabolic disorder with high prevalence in women around the world. The identification of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) through genome-wide association studies has classified it as a polygenic disease. Most studies have independently evaluated the contribution of each SNP to the risk of PCOS. Few studies have assessed the effect of epistasis among the identified SNPs. Therefore, this exploratory study aimed to evaluate the interaction of 27 SNPs identified as risk candidates and their contribution to the pathogenesis of PCOS. The stu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Alcohol-associated hepatitis (AH) is a clinically severe, acute disease that afflicts only a fraction of patients with … ociation for AH at patalin-like phospholipase domain containing 3, as previously observed for AC in genome-wide association study, although with a much lower effect size. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of large effect size at inducible T cell costimulatory ligand ( ICOSLG ) (Chr 21) and TOX4/RAB2B (Chr 14) were also exome-wide significant. ICOSLG encodes a co-stimulato …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a complex multifactorial autoimmune disease affected by genetics and environmental factors. The rel … effect of spirits intake on RA. Instrumental variables (IVs) for spirits intake were screened from genome-wide association study (GWAS) datasets, including 69,949 individuals from the UK Biobank study, while summary statistics relating to RA were obtained from a GWAS meta-analysis of 417,256 participants. The primary inverse variance weighted (IVW) method and other supplement …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Observational studies have associated nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) with adverse pregnancy events, but findings show heterogeneity, leaving the causal direction and mediating pathways unclear. We aimed to investigate the causal relation between NAFLD and various pregnancy events, and to elucidate the underlying mediating pathways while determining the proportion of this correlation that is mediated through these pathways.
METHODS: A genome-wide association study involving over 6 million participants employing Mendelian randomization (MR) and mediation analysis was perfo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonsyndromic orofacial clefts (NSOFCs) represent a large proportion (70%-80%) of all OFCs. They can be broadly categorized into nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) and nonsyndromic cleft palate only (NSCPO). Although NSCL/P and NSCPO are considered etiologically distinct, recent evidence suggests the presence of shared genetic risks. Thus, we investigated the genetic overlap between NSCL/P and NSCPO using African genome-wide association study (GWAS) data on NSOFCs. These data consist of 814 NSCL/P, 205 NSCPO cases, and 2159 unrelated controls. We generated common singl…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuromyelitis optica spectrum disorder (NMOSD) is a severe central nervous system disease primarily characterized by optic neuritis and myelitis, which can result in vision loss and limb paralysis. Current treatment options are limited in their ability to prevent relapses and mitigate disease progression, underscoring the urgent need for new drug targets to develop more effective therapies. The objective of this study is to identify potential drug targets associated with a reduced risk of NMOSD attacks or relapses through Mendelian randomization (MR) analysis, thereby addressing the limitation
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic variation underly inter-individual variation in host immune responses to infectious diseases, and may affect susceptibility or the course of signs and symptoms.
METHODS: We performed genome-wide association studies in a prospective cohort of 1138 patients with physician-confirmed Lyme borreliosis (LB), the most common tick-borne disease in the Northern hemisphere caused by the bacterium Borrelia burgdorferi sensu lato. Genome-wide variants in LB patients-divided into a discovery and validation cohort-were compared to two healthy cohorts. Additionally, ex vivo monocyte-deri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between thyroid function and dyslipidemia has been well documented in observational studies. However, observational studies are prone to confounding, making it difficult to conduct causal inference. We performed a 2-sample bidirectional Mendelian randomization (MR) using summary statistics from large-scale genome-wide association studies of thyroid stimulating hormone (TSH), free T4 (FT4), and blood lipids. We chose the inverse variance-weighted (IVW) method for the main analysis, and consolidated results through various sensitivity analyses involving 6 different MR methods und
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.