Tomato is an important vegetable crop worldwide with diverse uses. However, long-term domestication and modern breeding have narrowed the genetic basis of mainstream cultivars, leading to high genetic similarity among varieties. Therefore, developing practical molecular markers through genomic approaches has become an important way to effectively identify and utilize germplasm resources and overcome current breeding bottlenecks. This study aimed to screen high-quality single-nucleotide polymorphism (SNP) loci, develop reliable competitive allele-specific PCR (KASP) markers for genotyping tomat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aspergillus flavus causes severs postharvest spoilage and aflatoxins contamination of agricultural commodities, posing major threats to food safety and human health and underscoring the need for safe, effective biocontrol strategies. This study aimed to identify an antagonistic endophytic bacterium against A. flavus and to integrate whole-genome mining, metabolomics, and mechanistic assays to elucidate the molecular basis of its antifungal activity.
METHODS: An endophytic isolate was identified as Bacillus velezensis 802. Its crude extract was evaluated in vitro, and SEM, CLSM, an
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kandelia obovata and Kandelia candel, two sister mangrove species within the genus Kandelia (Rhizophoraceae), exhibit pronounced differences in cold tolerance. However, the genetic basis underlying this adaptive divergence remains unclear. In this study, we assembled a high-quality, chromosome-level genome of K. candel (~225 Mb) to facilitate comparative genomic analysis with K. obovata. Functional enrichment revealed that expanded gene families in K. candel and contracted families in K. obovata were both significantly associated with transcription factor (TF) activity, highlighting TFs as pot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postbiotics derived from lactic acid bacteria (LAB) have attracted growing interest as stable and potentially safer alternatives to probiotics for use in foods and health-related products. Comprehensive safety evaluation remains essential before their broader application. In this study, we assessed the safety profiles of RHT3201, a postbiotic preparation derived from Lacticaseibacillus rhamnosus IDCC 3201, through genomic, genotoxic, acute oral, and subchronic oral toxicity studies. Whole-genome analysis showed that IDCC 3201 lacks antimicrobial resistance genes and exhibits no hemolytic activ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The β-ketoacyl-CoA synthase (KCS) family is responsible for synthesizing very-long-chain fatty acids (VLCFAs), which are precursors of cuticular waxes and plant responses to environmental stimuli. However, knowledge of this family in sunflower (Helianthus annuus L.) remain limited.
RESULTS: In this study, 26 KCS family members were identified in the sunflower genome, which were unevenly distributed over 16 of the 17 chromosomes. The HaKCS proteins were divided into eight subclasses based on their phylogenetic analysis: α, β, γ, δ, ζ, ε, η, and θ. Promoter analysis indicated that H
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the last decade, there has been substantial growth in our understanding of the molecular drivers for thyroid tumors with the advent of next generation sequencing. Importantly, these drivers correlate with histopathologic features and clinical behavior. Briefly, RAS/RAS-like alterations result in modest activation of the MAPK pathway and produce follicular-patterned neoplasms, including follicular adenomas and follicular carcinomas, as well as non-invasive follicular thyroid neoplasm with papillary-like nuclear features and follicular subtype of papillary thyroid carcinoma (PTC). In contra
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The escalating prevalence of antimicrobial resistance in food-related pathogens constitutes a critical challenge to global public health and food safety. To elucidate the mechanisms underlying the high erythromycin resistance rate observed in our previous surveillance of Staphylococcus in retail foods, we conducted a comprehensive genomic investigation of msrA-positive Staphylococcus from a nationwide retail food collection in China. We identified 102 msrA-positive isolates, all of which exhibited a multidrug-resistant (MDR) phenotype, with a significantly higher prevalence in aquatic products
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drought and salinity limit soybean yield. Despite their role in the SnRK1 energy-sensing complex, a systematic study of FCS-Like Zinc Finger (FLZ) proteins in soybean has not been reported. We performed a genome-wide identification of the GmFLZ gene family, identifying 40 members distributed across 18 of the 20 soybean chromosomes. Phylogenetic analysis of 87 FLZ proteins from Glycine max, Arabidopsis thaliana, and Oryza sativa revealed four major evolutionary clades, suggesting that diversification predates the separation of monocots and dicots. Structural analysis identified ten conserved mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seed longevity and vigor are critical factors for sustainable crop production, particularly in environments prone to stress, where consistent germination and seedling establishment are crucial. This study investigates the genetic architecture underlying seed longevity and vigor traits in pearl millet (Pennisetum glaucum [L.] R. Br.) through genome-wide association studies (GWAS). The GWAS panel comprising 201 inbred lines representing B and R lines was phenotyped under both control and accelerated aging (AA) conditions for 27 seed longevity and seedling vigor traits and their relative measures
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drought stress exacerbated by climate change severely impairs the growth and quality of horticultural crops. Grapevine (Vitis vinifera L.) is an economically vital fruit species, and exploring stress-tolerant genes lays a foundation for its genetic improvement and sustainable cultivation. BiP proteins serve as pivotal endoplasmic reticulum (ER) molecular chaperones and participate widely in plant abiotic stress acclimation, yet the genomic features and drought-associated functions of grapevine BiP family genes remain largely unclear. In this study, three VvBiP members were identified genome-wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Targeted therapy prolongs the lives of men with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) but mCRPC is ultimately lethal. DNA copy gains that amplify the Androgen Receptor (AR) gene locus are a key driver of resistance to targeted therapy in mCRPC. Our group has recently shown that extra-chromosomal DNA (ecDNA) frequently drives this amplification. We hypothesized that ecDNA and other complex structural variants (cSVs) also affect other established drivers of therapy resistance in mCRPC and continue to evolve over time. To test this hypothesis, we reconstructed cSV pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate genomic stratification is essential for guiding therapeutic decisions in myelofibrosis (MF), particularly regarding allogeneic stem cell transplant. Conventional chromosome banding analysis (CBA), however, has limited resolution and provides an informative karyotype in only about half of patients with MF. In a prospective series of 107 patients with primary or secondary MF, we compared optical genome mapping (OGM) plus targeted next-generation sequencing with CBA. OGM generated interpretable cytogenetic data for every sample, whereas CBA succeeded in fewer than half. In addition, OGM
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to Vemurafenib (VEM), a targeted BRAFV600E inhibitor, was examined in the metastatic paratetraploid (XX, abnormal Y chromosome) melanoma cell line, SkMel28. During the first week of treatment, pERK suppression coincided with transcriptomic and phenotypic changes related to senescence, autophagy/mitophagy, neuro-melanogenesis, and cell co-alignment. By the second week, MAPK-ERK signalling was restored, coinciding with surmounting the G1/S checkpoint, G2M checkpoint delay, mitotic slippage (MS), and downregulation of senescence and melanogenesis. The dynamics of melanogenesis and MS w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold stress limits alfalfa (Medicago sativa) growth and persistence, but public transcriptomic datasets differ widely in genotype, tissue, treatment duration, and experimental design. We integrated RNA-seq data from ten independent BioProjects using a common processing workflow while retaining project-specific structures. A recurrent contrast-level DEG-derived pool of 4,354 genes was ranked by random forest using expression profiles from 240 samples. The original model showed strong internal discrimination (OOB ROC-AUC = 0.937), whereas fully nested leave-one-BioProject-out validation yielded
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human sex development is a highly regulated process guiding undifferentiated gonads toward a testicular or ovarian fate. Disruptions in this pathway result in disorders of sexual development (DSD), characterized by atypical chromosomal, gonadal, or anatomical sex. These conditions usually appear as ambiguous genitalia at birth or as atypical pubertal development during adolescence. Different etiologic, phenotypic, and genotypic factors can cause DSD. Advances in next-generation sequencing (NGS) have significantly accelerated the identification of genetic variants through targeted p
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Growth hormone (GH) therapy has been widely applied to improve height outcomes in pediatric patients experiencing growth hormone deficiency (GHD), idiopathic short stature (ISS), Turner syndrome (TS), and small-for-gestational-age (SGA). This study aimed to evaluate long-term growth outcomes of recombinant human GH therapy across various indications in Korean pediatric patients. METHODS: We conducted a retrospective analysis utilizing 10-year longitudinal clinical data from the LG Growth Study (LGS), a multicenter, observational registry in Korea. Annual changes in height standard d
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The marine anemone Radianthus magnifica harbors symbiotic microbes with promising biomedical potential, yet their diversity and therapeutic properties remain underexplored. This study aimed to characterize a symbiotic bacterium isolated from R. magnifica collected from Samalona Island, Indonesia, and to evaluate its multi-therapeutic potential.
METHODS: Strain AZMABM HM27 was characterized using whole-genome sequencing, functional annotation, biosynthetic gene cluster prediction, molecular docking, and in vitro bioactivity assays.
RESULTS: Phylogenetic and genome-based analyses c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carotenoid cleavage oxygenases (CCOs) are non-heme iron-dependent enzymes that catalyze the oxidative cleavage of carotenoids and play important roles in the biosynthesis of apocarotenoids involved in plant growth, development, and stress responses. However, a comprehensive genome-wide characterization of the CCO gene family in barley (Hordeum vulgare L.) has not been reported.
METHODS AND RESULTS: In this study, a genome-wide analysis was performed to identify and characterize CCO genes in barley using comparative genomics and bioinformatics approaches. A total of 11 HvCCO genes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elcysma westwoodi is a major pest of cherry trees (Rosaceae), which contain high levels of cyanogenic glucosides that release toxic hydrogen cyanide upon tissue damage. To investigate the genomic basis of host-plant cyanogenic glucoside detoxification and the evolution of chemical defence genes, we generated a PacBio HiFi-based genome assembly of E. westwoodi. The final assembly spans 460.62 Mb with high contiguity (contig N50 > 15 Mb) and near-complete recovery of conserved genes (99.6% BUSCO completeness). We predicted 19,502 protein coding genes, with annotation completeness reaching 95.2%
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cracking is a major cause of concrete deterioration because it allows water and aggressive ions to penetrate the material and accelerate structural damage. Microbially induced calcite precipitation (MICP) has emerged as a promising strategy for crack repair because selected bacteria can precipitate calcium carbonate and thereby seal damaged regions. In this study, we characterized strain ITBMC36, a calcite-precipitating bacterium isolated from a limestone-rich environment in Vietnam, and evaluated its potential for MICP-based crack repair. Strain ITBMC36 produced 26.73 ± 0.81 g/L of mineral pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования