Episignatures are popular tools for the diagnosis of rare neurodevelopmental disorders. They are commonly based on a set of differentially methylated CpGs used in combination with a support vector machine model. DNA methylation (DNAm) data often include missing values due to changes in data generation technology and batch effects. While many normalization methods exist for DNAm data, their impact on episignature performance have never been assessed. In addition, technologies to quantify DNAm evolve quickly and this may lead to poor transposition of existing episignatures generated on deprecate…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To reveal the complex etiology of gastroschisis through two independent cases.
CASES: Case 1 involves gastroschisis recurrence in a consanguineous marriage, and Case 2 concerns a fetus with gastroschisis whose mother had undergone gastroplasty. Methylation array was carried out in both cases (two fetuses with gastroschisis, their two mothers, one father from the consanguineous marriage), and in 16 controls (fetuses and their respective mothers).
CONCLUSION: The two cases presented different noninherited methylation profiles.
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: This systematic review aimed to summarize evidence reporting epigenetic and/or neuro-immuno-endocrine embedding of adverse child … f studies showed a positive association between ACEs and biomarkers of the immune system. Regarding DNA methylation 18 studies showed more methylation in participants exposed to ACEs. Two studies presented the effect of ACEs on telomere length and showed that exposure was associated with shorter telomere length. Conclusion: Overall the associations observed acros …
Поддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accumulating evidence suggests that epigenetic mechanisms may hold great potential in the field of pain. We systematically reviewed the lite … omyalgia, CRPS, neuropathies, or osteoarthritis. Research focussed on genome-wide and gene-specific DNA methylation, and miRNA expression. Bioinformatics analyses exploring miRNA-associated molecular pathways were also performed. Several genes already known for their role in pain (BDNF, HDAC4, PRKG1, IL-17, TNFRSF13B, etc.), and several miRNAs linked to inflammat …
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 45th Annual Meeting of the American Society of Hematology was held December 6-9, 2003, at the San Diego Convention Center in California. As with past meetings, there were exciting new developments, comprehensive educational programs, and phenomenal exhibits. There was also an ever increasing ASCLS presence at the meeting, as more hematology/hemostasis educators and researchers are finding their way to this very excellent scientific meeting. A group of us who attended the meeting would like to share with our colleagues who were unable to attend some of the new information in select areas, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-dependent restriction endonucleases are promising tools for analyzing eukaryotic DNA methylation patterns. However, quantitative assessment of their substrate specificity requires the determination of the kinetic parameters of enzymatic reactions. Here, we present a method for determining initial reaction rates based on fluorescent probes and real-time monitoring of changes in fluorescence intensity. Initial rates of methyl-dependent GlaI and BlsI restriction endonucleases were determined as the slope of the linear part of the kinetic curves, after which the Michaelis-Menten constants (…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl donor micronutrients might affect muscle strength via DNA methylation. We aimed to evaluate the combined relationship of dietary methyl donor micronutrients containing betaine, choline, methionine, vitamin B12, vitamin B6 and folate on muscle strength. This cross-sectional study was conducted on 267 subjects including 113 men and 154 women. Dietary intake of micronutrients was assessed utilising a validated 168-item semi-quantitative FFQ, and methyl donor micronutrient score (MDMS) was calculated. The muscle strength of the participants was measured using a digital handgrip dynamometer.…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Hepatopancreatobiliary (HPB) cancers, including pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), hepatocellular carcinoma … ments in early detection and prognostication have been shown for PDAC with KRAS, TP53, SMAD4, and cfDNA methylation panels, and for CCA with FGFR2, IDH1/2, and BAP1 mutations detected in bile-derived cfDNA. In HCC, alterations in TERT promoter, TP53, CTNNB1, along with methylation markers such as RASSF1A, APC, and GSTP1, have predicted early disease and recurrenc …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Preterm birth (PTB), a leading cause of neonatal morbidity and mortality, arises from complex maternal-fetal interactions with multifactorial origins. Emerging evidence suggests that epigenetic dysregulation may mediate these interactions. This study aimed to identify DNA methylation changes associated with PTB to uncover potential biomarkers and underlying mechanisms.
METHODS: We employed long-read sequencing to profile genome-wide DNA methylation followed by gene ontology and pathway enrichment analysis in matched maternal peripheral blood and neonatal cord blood from 15 prete…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meningiomas exhibit a complex biology that, despite notable successes in preclinical studies, contributes to the failures of pha … of fibrous tissue. All 3D models had similar copy number variation profiles, visually. Genome-wide DNA methylation level patterns were similar between pairs of 3D models and primary tumors. Correlation plots between CpG methylation levels showed high congruency between primary meningiomas and their corresponding 3D models for all samples (R > 0.95).
CONCLUSIONS …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly aggressive cancer type that urgently requires effective therapeutic strategi … ing mRNA expression. Reporter assays were used for detecting signal transduction pathways. Promoter DNA methylation was determined by sodium bisulfite treatment and methylation-specific PCR (MSP). The biological function and role of specific genes involved in drug effects were measured through gene overexpression.
RESULTS: Andrographolide treatment suppressed th …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a common inflammatory skin disease. Abnormal proliferation of keratinocytes is one of the psoriatic histopathologic … by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The wif-1 promoter methylation status was detected by DNA methylation-specific PCR (MSP). The transcriptional activities of wif-1 and β-catenin were discovered by a luciferase reporter gene system. Cell viability was determined by Cell Counting Kit-8 (CCK8) method. The cell cycle was detected by flow cytometry. The ap …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The etiology and pathology osteonecrosis of the femoral head (ONFH) are not completely clarified. As a cytokine participating in … cell proliferation and angiogenesis whereas inhibits osteogenesis. Epigenetic regulations including DNA methylation and histone modifications play important roles in mediating the effect of TNFα on osteogenic differentiation. We find an increased rate of CpG methylation in rat Runx2 promoter in TNFα-treated rMSCs, as well as significantly increased occupancy of H …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Severe acute malnutrition (SAM) in infants may present as one of two distinct syndromic forms: non-edematous (marasmus), with severe wasting and no nutritional edema; or edematous (kwashiorkor) with moderately severe wasting. These differences may be related to developmental changes prior to the exposure to SAM and phenotypic changes appear to persist into adulthood with differences between the two groups. We examined whether the different response to SAM and subsequent trajectories may be explained by developmentally-induced epigenetic differences.
METHODS: We extracted genomic D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation in blood may reflect adverse exposures accumulated over the lifetime and could therefore provide potential improvements in the prediction of cancer risk. A substantial body of research has shown associations between epigenetic aging and risk of disease, including cancer. Here we aimed to study epigenetic measures of aging and lifestyle-related factors in association with risk of breast cancer.
METHODS: Using data from four prospective case-control studies nested in three cohorts of European ancestry participants, including a total of 1,655 breast cancer cases, we c…
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hemihyperplasia and hemihypoplasia result in leg length discrepancy (LLD) by causing skeletal asymmetry. Beckwith-Wiedemann synd … equencing. We introduced a metric named as the methylation difference, defined as the difference in DNA methylation levels between DMR1 and DMR2. The correlation between the methylation difference and the predicted LLD at skeletal maturity, calculated using a multiplier method, was evaluated. Predicted LLD was standardized for stature. Ten patients (33%) showed e …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study sought to examine promoter methylation and expression of the identified sonic hedgehog (SHH) gene in terminal rectal t … fied differentially methylated gene SHH, and bisulfite genomic sequencing was performed to evaluate DNA methylation in the SHH promoter region.
RESULTS: The average methylation levels of the SHH promoter were significantly higher in ARMhi-int (0.850±0.030, P=0.0036) and ARMlo (0.540±0.053, P=0.0087) groups than in Cont. group (0.280±0.032). SHH mRNA expression l …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies were undertaken to examine the interaction of chloramphenicol and some of its analogs with DNA in an effort to elucidate the mechanism by which high levels of the drug cause inhibition of DNA synthesis. Chloramphenicol at concentrations of 1 mM and above was found to mediate the degradation of double-stranded DNA in the presence of copper and a reducing agent. Similarly, the L-threo steroisomer of chloramphenicol was equally potent at causing strand scissions in DNA. Nitroso-chloramphenicol, which inhibits DNA synthesis at much lower concentrations, also causes DNA damage at levels 100
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nutriture in utero is essential for fetal brain development through the regulation of neural stem cell proliferation, differentiation, and a … xpression. We conclude that an imbalance of folic acid and choline intake during gestation disrupts DNA methylation patterns affecting mechanisms of hypothalamic development, and thus elevates metabolic disease risk. Further investigation, including studies to determine translatability to humans, is required.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MeCP2 is a protein that selectively binds to methylated cytosines through its methyl-CpG-binding domain (MBD) and connects DNA methylation to transcriptional repression. Mutations in MECP2 gene, located in Xq28, have been reported as being the major cause of Rett syndrome and are also associated with some cases of X-linked mental retardation in both males and females. In this study, we present the first screening in the MECP2 gene in a Brazilian cohort of 239 unrelated males with idiopathic mental retardation. Eight sequence variations were observed in 10 patients: one novel putative pathogeni…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования