OBJECTIVE: Adaptive immune responses play a critical role in the pathogenesis of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). In this study, we investigated the functional mechanisms of T cell subtypes and assessed the causal links between CD4+ cytotoxic T cell-related genes and ALS risk.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with ALS and healthy controls (HC) was used to identify differentially expressed genes (DEGs) in CD4+ cytotoxic T cells. Comprehensive analyses of CD4+ cytotoxic T cells, including pseudotemporal trajectory, i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute Hepatitis B (AHB) remains a significant global health challenge, with complex interactions between metabolic and immune responses influencing disease progression. This study aimed to investigate the causal relationships between immune cell-mediated plasma metabolites and acute hepatitis B using Mendelian Randomization (MR) analysis.
METHODS: A two-sample MR analysis was conducted using genome-wide association study data from the FinnGen consortium (133 AHB cases and 451,214 controls) to examine relationships between 1,400 plasma metabolites and 731 immune cell phenotypes.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ulcerative colitis (UC), a chronic and nonspecific intestinal inflammatory disease, has seen a rising incidence rate worldwide year by year. Its pathogenesis remains incompletely understood. Lactylation modification is closely related to the generation of inflammation. Exploring the pathogenesis of UC from the perspective of lactylation is of great significance for the understanding and treatment of UC.
METHOD: Forty-six lactylation genes were retrieved from the literature and intersected with the eQTLGen whole blood cis-eQTL to screen 29 candidate genes. Taking UC (finngen_R12_UL
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: This study aimed to explore the relationship between heavy metal exposure and the occurrence of non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), an area with conflicting existing research and unexplored genetic implications.
METHODS: Data from 444 individuals working in metal industries and 767 people working in non-metal-related jobs were analyzed. Patients with viral hepatitis or alcoholism were excluded. The data included physical examination, biochemical data, and plasma concentrations of six different metals. We utilized the genomic database of the Taiwan Biobank to conduct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many genetic loci were identified as associated with neuropsychiatric disorders and neurodegenerative disorders by Genome-wide association studies (GWAS). How these loci impact these diseases is unclear. Advances in deep-learning approaches and multi-omics data have the potential to link GWAS findings with disease mechanisms. Here, we proposed the Multi-omics Graph Transformer Network (MOGT), a semi-supervised graph neural network that leverages graph representation learning to model biological networks derived from multi-omics data to predict disease-associated genes. MOGT outperforms the cur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein-based ageing clocks can be used to help identify individuals at high risk of death or morbidity. There is a lack of evidence in non-European populations on clocks derived from combining different proteomic platforms and their relationship with age-related traits, diseases and genetic architecture.
METHODS: The prospective China Kadoorie Biobank assayed proteins via Olink and SomaScan in ∼4000 individuals with a mean age of 58 years. We used organ-enriched plasma proteins identified from the Genotype-Tissue Expression Project and trained Light Gradient Boosting models on ch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Celiac Disease (CeD) is a serious, lifelong autoimmune condition. There remains a significant unmet medical need for effective pharmacological treatments for CeD.
METHODS: We utilized summary statistics for 2,888 druggable genes from the eQTLGen Consortium and the FinnGen Consortium for CeD. In our Mendelian Randomization (MR) analysis, we identified genes associated with CeD that had a false discovery rate (FDR) < 0.05 using the Inverse Variance Weighted (IVW) method. To enhance the reliability of the results, we validated them through colocalization analysis and Summary-data-b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coffee consumption has been previously reported to be linked to the incidence of thyroid cancer. However, the exact nature of the causal relationship between the 2 remains elusive. We conducted a 2-sample Mendelian randomization (MR) study to evaluate the relationship between coffee consumption and thyroid cancer incidence. We used 36 SNPs associated with coffee consumption obtained from genome-wide association study (GWAS) summary data (ieu-a-1082) involving 212,119 female UK Biobank subjects with White British ancestry. Thyroid cancer incidence was estimated using the public GWAS summary dat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In previous observational studies, an association has been found between the frequency of alcohol consumption, coffee intake, cheese consumption, and anxiety and the risk of gastroesophageal reflux disease (GERD). However, conflicting conclusions exist among these studies, and the causal relationship between these exposure factors and GERD remains unclear. Independent genetic variants associated with alcohol consumption frequency, coffee intake, cheese consumption, and anxiety at the genome-wide significance level were selected as instrumental variables. Summary-level data for GERD were derive
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION/OBJECTIVE: Neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease (AD), Lewy dody dementia (LBD), and Parkinson's disease (PD) are linked to changes in brain volume. However, causal evidence on how these diseases affect brain volume and whether metabolites mediate these causal effects remains limited.
METHODS: We applied mediation Mendelian randomization analysis using GWAS summary statistics. The inverse variance-weighted method was used to assess causal effects and identify potential metabolite mediators.
RESULTS: The MR analyses indicated that bilateral thalamus and putamen v
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidemiological studies suggested comorbidity between inflammatory bowel disease (IBD) and pancreatitis. However, little is known about their shared genetic architecture. Based on genome-wide association studies (GWAS), we utilized Mendelian randomization (MR) method to investigate the causal relationships between IBD (including ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD)) and pancreatitis (including acute pancreatitis (AP) and chronic pancreatitis (CP)). Cross-trait meta-analysis was performed to detect pleiotropic loci between them. The heritability enrichment analysis was conducted to
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite interest in the health effects of IgG N-glycosylation, the mediating role of IgG N-glycosylation in the effects of adiposity and tobacco use on cardiovascular diseases (CVDs) has not been systematically studied.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the causal effects of adiposity and tobacco use on CVDs and the potential mediating role of 23 traits of IgG N-glycosylation using Mendelian randomization (MR).
METHODS: Summary statistics from GWAS were used. Two-sample MR assessed the causal links between adiposity, tobacco use, and CVDs, while two-step MR examined whet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depressive disorder (DD), Alzheimer's disease (AD), and schizophrenia (SZ) are evolutionarily relevant traits that disrupt neural networks supporting affect and cognition. While genome-wide association studies have identified risk-related genes for these diseases, how the expression of these genes compare across species remains unclear. In this study, we examined the spatial and temporal expression of ~2000 disease-associated genes in human and rhesus macaque brains. Distinct cross-species signatures emerged. DD-linked genes showed broad cortical-subcortical expression in humans but were confi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly prevalent and fatal digestive system malignancy, challenging to treat due to its latent onset and non-specific symptoms in advanced stages. Somatic mutations play a crucial role in hepatocarcinogenesis, with nearly half of HCC patients carrying oncogenic driver mutations such as TP53, CTNNB1, or TERT. In parallel, germline susceptibility variants identified by genome-wide association studies (GWAS) — including loci near TERT, MBOAT7, TM6SF2, and PNPLA3 — reveal inherited predisposition that shapes the molecular landscape for HCC developmen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the cellular prion protein, PrPC, on the surface of neurons plays an important role in the pathogenesis of prion disease. We performed genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screens in prion-infectible cells of neuronal origin (CAD5) to identify regulators of cell surface PrPC expression. We identified and validated 46 positive and 21 negative regulators of cell surface PrPC expression in undifferentiated CAD5 cells. Pathway analysis of the screening dataset showed that genes involved in the glycophosphatidylinositol (GPI) anchor and N-glycosylation biosynthetic pathways were overrepre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depression and post-traumatic stress disorder (PTSD) are common psychiatric disorders following physical trauma. However, genetic evidence between these disorders is lacking. DNA methylation (DNAm) is implicated in the response to traumatic events and has been proposed as a promising therapeutic target. This study aimed to investigate the causal evidence of injury-associated DNAm and the subsequent onset of depression or PTSD. We performed co-methylation analysis of the whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) data from physical trauma patients who developed subsequent depression or PTSD. DNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is one of the most common cancers worldwide and carries substantial morbidity. Metformin, a widely used antidiabetic agent, shows promise for HNSCC prevention, but resistance arises in a subset of tumors. In a recent issue of Cancer Prevention Research, Hoang and colleagues use CRISPR screening to identify key mediators of metformin resistance, including AMPK and protein kinase A (PKA), and demonstrate that the cyclooxygenase 2-prostaglandin E2 axis acts upstream of PKA. Because this pathway is readily inhibited by common nonsteroidal anti-inflamma
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to evaluate the potential components and targets of Qingwen Baidu Decoction (QBD) for sepsis by integrating a comprehensive strategy of network pharmacology and Mendelian randomization (MR). Systematically search the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology, HERB, and Stitch databases for potential active ingredients and therapeutic targets of QBD. GeneCards, and DisGeNET databases were used to find the target of sepsis. We analyze the active ingredients and disease targets of drugs through network pharmacology, combined with pathway enrichment, protein-prote
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wheat (Triticum aestivum), a key global crop, faces rising drought stress that limits root growth and water uptake. Root meristem growth factors (RGFs) are small peptides that regulate root stem cell maintenance, meristem activity, and lateral root formation in model plants, yet the RGF gene family remains unexplored in wheat. Here, we performed a comprehensive genome-wide analysis of the TaRGF gene family, identifying 15 genes distributed across the A, B, and D subgenomes and classified into five homeologous groups (TaRGF1-TaRGF5), predominantly located on chromosomes 2 and 6. All TaRGFs cont
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Earlier examinations of how risk factors relate to endometriosis (EMT) have largely depended on observational designs, which arrived at conflicting conclusions. The present approach seeks to probe the causal association between 108 traits and EMT by means of Mendelian randomization (MR) analysis. MR analysis was applied to explore the connections between a range of traits and the development of EMT. Most of the data used in the genome-wide association studies of these characteristics came from the UK Biobank (UKBB), whereas the genome-wide association studies for EMT drew specifically on FinnG
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования