INTRODUCTION: Measuring DNA methylation levels at cg05575921 can improve prediction of lung cancer (LC) risk in a screening eligible population. However, these findings were based on a limited number of largely White study participants, with a history of heavy smoking (>30 pack years [PY]) and the cg05575921 based-metric was not directly compared to existing standards for LC prediction.] METHOD: We determined cg05575921 methylation levels in a nested case and control cohort featuring 1156 LC cases and 3039 controls, matched for age, sex, race and self-reported smoking status (current and forme
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation plays a key role in mediating the anti-aging effects of glucose-lowering drugs. This study aims to systematically explore the potential anti-aging effects of target genes of FDA-approved glucose-lowering drugs and the underlying epigenetic mediators.
METHODS: We conducted a two-sample Mendelian randomization (MR) study to investigate the putative causal relationships between the gene expression levels of glucose-lowering drug targets and 10 aging-related phenotypes, followed by a two-step MR to estimate the mediation effect of DNA methylation. Drug candidates were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The intrauterine environment exerts lasting impacts on fetal growth and development, with potential long-term effects on later health. We examined whether placental DNA methylation at HSD11B2 and IGF2-two key regulators of the intrauterine environment-is associated with fetal growth among participants in the Cebu Longitudinal Health and Nutrition Survey (CLHNS).
METHODS: We analyzed DNA methylation in placental samples from 19 births in the CLHNS using the Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip. Focusing on CpG sites within HSD11B2 and the IGF2/H19 imprinting control regio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We hypothesized that a dynamic surveillance strategy guided by circulating tumor DNA (ctDNA) methylation would increase the rate of curative-intent therapy for recurrence in patients with nonmetastatic colorectal cancer (CRC) after curative resection.
METHODS: The FIND trial (ClinicalTrials.gov identifier: NCT05904665) is a prospective, multicenter, randomized, phase III study. Patients with nonmetastatic CRC were randomly assigned to ctDNA-guided surveillance or standard computed tomography (CT)-based monitoring. In the ctDNA-guided group, a positive ctDNA result triggered immediate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Children with intellectual disability are more likely to experience chronic and neuropathic pain, which remains frequently under-recognized due to limitations in self-reporting and objective assessment tools. Epigenetic mechanisms, particularly DNA methylation, are believed to influence pain perception. This study investigates the differences in methylation patterns between children with intellectual disability and their age- and sex-matched neurotypical controls.
METHODS: A cross-sectional study was carried out from March 2022 to July 2023 at the IRCCS Burlo Garofolo in Trieste,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cognitive reserve (CR) reflects variability in cognitive adaptability that modifies the impact of Alzheimer's disease (AD) pathology on cognition. However, blood-based biomarkers of CR have not been established in prodromal AD. We operationalized CR as memory reserve, defined by the attenuation of the cerebrospinal fluid (CSF) phosphorylated tau threonine 181 (pTau181)-memory association and aimed to identify blood DNA methylation (DNAm) loci involved in memory reserve.
METHODS: We studied 92 amyloid-positive participants with mild cognitive impairment (MCI) from the Alzheimer's
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cocaine self-administration induces neurobiological adaptations in brain circuits involved in encoding reward-associated context. The dorsal hippocampus, particularly the dorsal dentate gyrus, plays a critical role in the precise encoding of spatial and contextual information. We hypothesized that the dentate gyrus is uniquely positioned to undergo epigenomic and transcriptomic changes because of the convergence of the contextual features of reward and cocaine-enhanced dopamine and norepinephrine signals during volitional drug-taking. We report that cocaine self-administration produces signifi
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bronchopulmonary dysplasia (BPD) is the most common respiratory disease in preterm infants born at less than 28 weeks gestation. Most existing clinical prediction models for BPD show limited accuracy in predicting BPD development when validated using external data, stressing the need for novel biomarkers to identify at-risk infants for early and effective interventions. We leveraged existing frozen umbilical cord blood samples from the Northwestern University Cord Blood Biobank (NUCord) to perform parallel transcriptional and DNA methylation profiling in a pilot study. Chorioamnionitis-associa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most common type of thyroid malignancy and is generally associated with a favorable prognosis. However, a subset of these tumors exhibits more aggressive behavior, underscoring the need for refined molecular and immunohistochemical characterization to improve diagnostic precision and prognostic stratification. Given the shared embryologic origin of the thyroid gland and gastrointestinal tract from the endoderm, intestinal differentiation markers (CDX2 and SATB2) and alterations in DNA mismatch repair (MMR) pathways, including MLH1 promoter methylation,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Folate is an essential nutrient that supports the formation of S-adenosyl methionine (SAM) in the pathway of one carbon metabolism. Dietary folate intake has been shown to affect the SAM-dependent methylation of diverse substrates, including DNA and inorganic arsenic (iAs). The methylation of iAs by arsenic methyltransferase (AS3MT) plays a key role iAs detoxification in both humans and mice. Our recent studies using wild-type C57BL/6N mice showed that preconception exposure to iAs resulted in heritable changes in DNA methylation in paternal sperm and differential expression of genes in tissue
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tau protein undergoes a broad range of post-translational modifications in the brain, influencing its structure, solubility, and propensity to aggregate. This chapter presents an integrated methodological framework for characterizing tau methylation and evaluating its impact on tau biology. We describe procedures for isolating soluble and filamentous tau from post-mortem human brain tissue while preserving modifications for proteomic analysis. These approaches support precise mapping of methylation sites alongside other co-occurring modifications. To model methylation under controlled conditio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human papillomavirus (HPV) associated cervical cancer is the most prevalent gynaecological malignancy among women globally. Promoter hypermethylation of targeted genes may serve as a novel biomarker to monitor HPV infection dynamics which are likely to progress to HPV related cancers.
METHODS: Cervical smear of representative 180 (90 persistent and 90 transient) HPV cases were included in the study from follow samples of eight North-Eastern states of India during June 2022 to September 2024. HPV positive DNA was detected using nested PCR and subsequently all nested PCR positive sa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV persistence is facilitated by immune evasion strategies that reshape host immune responses. As the Interferon Gamma (IFNG) gene encodes a key immunoregulatory cytokine whose transcriptional competence is governed by promoter CpG methylation, we hypothesized that HIV plasma RNA would track with epigenetic remodeling at the IFNG promoter, altering IFNG mRNA transcription. DNA methylation at the IFNG promoter was quantified by bisulfite sequencing in PBMCs from people with HIV (PWH) with high (n = 16; >5000 copies/µL), medium (n = 18; 500 to 4999 copies/µL), or undetectable (n = 18; ≤50 copie
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate-specific antigen (PSA) screening lacks specificity, particularly within the 4-10 ng/mL diagnostic gray zone, leading to unnecessary prostate biopsies and overtreatment. Here, we developed and validated a streamlined urine DNA methylation assay for non-invasive prostate cancer (PCa) detection and biopsy decision-making. Tissue-based Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing (MeDIP-seq) was integrated with large-scale public methylome cohorts to identify PCa-specific hypermethylated regions. Candidate markers were further refined by targeted bisulfite sequencing (TBS) and translated
СтатьяМногоцентровое исследованиеВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple sclerosis (MS) is a chronic central nervous system inflammatory disease of autoimmune aetiology. The disease is mostly considered due to a complex interaction between different genetic and environmental factors. DNA methylation is an epigenetic mechanism that can influence gene expression and has the potential to mediate the effects of environmental factors on MS. This study aimed to identify MS risk methylation haplotypes (meplotypes) and their associated genes by integrating epigenome-wide meplotype association analysis with gene optimisation. We conducted the first epigenome-wide m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastrointestinal (GI) cancers are among the most prevalent and lethal malignancies worldwide. Early, non-invasive detection is essential for timely intervention and improved survival. To address this clinical need, we developed GutSeer, a blood-based assay combining DNA methylation and fragmentomics for multi-GI cancer detection.
METHODS: Genome-wide methylome profiling identified 1,656 markers specific to five major GI cancers and their tissue origins. Based on these findings, we designed GutSeer, a targeted bisulfite sequencing panel, which was trained and validated using plasma
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorene-9-bisphenol (BHPF), a widely recognized alternative to bisphenol A (BPA), has been increasingly used in a wide range of industries. However, despite numerous studies, the direct mechanism underlying its male reproductive toxicity remains poorly understood. Here, a BHPF-exposed mouse model was established to evaluate the effect of BHPF on male fertility. The results showed that BHPF exposure induced reproductive dysfunction, including testis damage, spermatogenesis impairment, steroid hormone disruption and sperm quality degradation. Mechanistically, over 90,000 differentially methylat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global production and use of polybrominated diphenyl ethers, including 2,2',4,4'-tetrabromodiphenyl ether (BDE-47), have been substantially curtailed in recent decades. However, BDE-47 remains ubiquitously detectable in environmental matrices and human tissues worldwide. In this study, we investigated whether prenatal exposure to BDE-47 disrupts sperm function and DNA methylation in rat offspring. Pregnant rats were treated with BDE-47 from gestational day 0 to parturition. Sperm count, motility, morphology, mitochondrial membrane potential (MMP), reactive oxygen species (ROS) production,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Acute Myeloid Leukemia (AML) cells communicate with surrounding normal cells, including hematopoietic stem progenitor cells (HSPCs), in the bone marrow, and modify their fate supporting tumor growth. This communication can be mediated by Extracellular Vesicles (EVs), small vectors carrying a range of tumor molecular information. One of the hallmarks of AML is the aberrant DNA methylation. It is not known if and how AML cells can modify the epigenomic profile of healthy HSPCs. Here, we investigated the DNA methylation profile of HSPCs after exposure to AML derived-EVs.
METHODS: C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenetic modifications such as DNA methylation play a crucial role in the regulation of gene expression in inflammatory diseases, including periodontitis. While previous studies have examined methylation changes during active disease or shortly after treatment, little is known about the epigenetic landscape of periodontal tissues that have remained clinically stable over the long term after Supportive Periodontal Therapy (SPT).
METHODS: We collected gingival tissue samples from 40 individuals, including 20 with a history of periodontitis currently under long-term SPT and 20 peri
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования