BACKGROUND: Since the emergence of COVID-19, SARS-CoV-2 Omicron variants have demonstrated increased human adaptation. Alveolar and recruited macrophages play a critical role in severe lung inflammation following SARS-CoV-2 infection, yet the mechanisms of viral entry into these immune cells remain incompletely understood. METHODS: Co-IP MS /MS was used to screen for potential SARS-CoV2 receptors in macrophages. Molecular docking, real-time interaction cytometry, and viral infection assays were employed to validate receptor identification. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of bronchoalveo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal liver metastasis (CRLM) remains the primary cause of mortality in patients with colorectal cancer (CRC). Despite its … e the impact of SERPING1 on malignant epithelial phenotypes. Finally, Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and immune infiltration algorithms were utilized to delineate its distribution within the tumor microenvironment (TME).
RESULTS: SERPING1 was identified as a critical prognostic hub gene, with its elevated expression significantly correlating with …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intracerebral hemorrhage (ICH) lacks effective neuroprotective therapies. We integrated cell type–resolved genetic inference wit … s, and false discovery rate control. Experimental validation used mouse collagenase ICH single-cell RNA-seq at 24 h (n = 3 sham; n = 3 ICH) with Seurat integration, composition testing, Slingshot pseudotime, and CellChat. An independent mouse cohort underwent qRT–PCR for selected genes. RESULTS: The ICH meta-analysis showed acceptable genomic control, sup …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: SKYROCKET is a single-center, single-arm phase II study that evaluated whether the addition of stereotactic body radiotherapy (SBRT … survival (PFS) from the start of SBRT. Exploratory endpoints included single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) obtained from tumor biopsies at baseline (BL) and on-treatment (OT) and were further characterized as clinical benefit [CB; partial response or stable disease (SD) ≥ 6 months] and non-clinical benefit (NCB; progressive disease or SD < 6 months).
R …
СтатьяКлиническое исследование II фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Phenotypic switching of vascular smooth muscle cells (VSMCs) is a hallmark of coronary artery disease (CAD). How type 2 diabetes mellitus (T2DM), a major risk factor for cardiovascular complications, reshapes these VSMCs states remains poorly defined. METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), spatial transcriptomics, high-dimensional weighted gene coexpression network analysis (hdWGCNA), and cell‒cell interaction analysis were used to profile human arterial tissue from CAD patients with or without T2DM who underwent coronary artery bypass graft surgery. Spot-level cell-type …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heat stress severely limits crop yield and threatens global food security; it also significantly influences the growth and development of alfalfa. Although there have been some studies on heat stress at the organ and tissue levels, the heat stress response mechanisms on the cell type level still remain unclear in alfalfa. Here, single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) was performed on 61,835 high-quality leaf cells under control and heat-stressed conditions (1 and 48 h), revealing distinct transcriptional responses across 5 major cell types identified from 17 cell clusters. A total of 5,098 d…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis remains a leading cause of in-hospital mortality worldwide. In recognition of its substantial morbidity and mortality even with optimal treatment, the World Health Organization has declared sepsis a global health priority. The immunoregulatory mechanisms in sepsis are highly complex, and the immune status during the disease course is closely associated with both short- and long-term patient outcomes, making early recognition and intervention critical for survival. While single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has been widely applied to decipher innate immune responses in sepsis patients,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Tumor-associated macrophages (TAMs) are key components of the hepatocellular carcinoma (HCC) microenvironment, but their spatial heterogeneity remains incompletely characterized. We aimed to assess the biological and prognostic relevance of a BAG3-associated TAM program in HCC. Methods: Public single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets were analyzed to characterize TAM heterogeneity, and an integrated validation scRNA-seq dataset was used to assess reproducibility. Spatial transcriptomics was used to provide spatial context in a small treatment-exposed cohort. Pseudotime, regu…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) are essential immunosuppressive elements found within the tumor microenvironment (TME) and significantly influence the development of breast cancer (BC). Given their critical role in cancer progression, identifying MDSC-related genes is urgently needed to develop more effective treatment strategies for BC patients. The integration of bulk RNA-seq data from the TCGA-BC cohort alongside scRNA-seq data from the GSE176078 dataset was performed for identifying MDSC-related genes through bioinformatic analysis. Subsequently, the potential of the hub gene BASP…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) is linked to branched-chain amino acid (BCAA) dysmetabolism and … hepatocyte-specific Ip6k3 deletion or exercise intervention in mice. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), IP6K3 overexpression and knockdown, liquid chromatography-tandem mass spectrometry, and co-immunoprecipitation were used to explore the underlying mechanism by which IP6K3 regulates MASLD.
RESULTS: Hepatic IP6K3 was significantly upregulated in b …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a chronic, heterogeneous autoimmune disease influenced by various genetic and environmental factors, and recent advances have established type I interferons (IFN-I) as pivotal drivers. This study comprehensively characterises IFN-I risk gene signatures in SLE. The IFN-I-related genes were obtained from GSE185047, and then Mendelian randomisation analysis using data from the FinnGen cohort (705 SLE cases, 385 509 controls) was utilised as a discovery set to identify IFN-I related risk genes. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and external cohorts were u…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eriodictyol (EDT), a natural flavonoid abundant in citrus fruits, exhibits potent anti-inflammatory activity. However, its therapeutic potential and mechanisms of action in rheumatoid arthritis (RA) remain poorly understood. This study aimed to evaluate the anti-RA efficacy of EDT and elucidate the molecular mechanisms underlying its effects. A collagen-induced arthritis (CIA) rat model was established to assess the therapeutic efficacy of EDT. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed to identify the key cell clusters modulated by EDT. Consequently, EDT's effects on M1 macrophage p…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a common autoimmune skin disease with high morbidity and associated complications, characterized by epidermal hyper … ously applied to the back skin to induce the psoriasis disease model. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was employed to investigate changes in epidermal cell composition and gene expression profiles in mice subjected to different treatments. Multiple bioinformatics analyses were conducted to elucidate the biological role of S100A4 in psoriasis pathog …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) has advanced our understanding of the heterogeneity of synovial fibroblasts and their roles in tissue repair and osteoarthritis. Here, we compared the fibroblast responses to different types and duration of joint injury in mice.
DESIGN: Published scRNA-seq data of synovial fibroblasts from a model of joint surface injury (JSI, day 6) and two post-traumatic osteoarthritis models, destabilisation of the medial meniscus (DMM, day 7 and 2 months) and anterior cruciate ligament rupture (ACLR, day 7 and day 28), were integrated and analysed using cl…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine natural killer (uNK) cells are a tissue-resident lymphocyte population critical for pregnancy success. Although mouse models have demonstrated that uNK cell deficiency results in abnormal placentation and poor pregnancy outcomes, the generalizability of this knowledge to humans remains unclear. Here, we compared tissue samples collected from a cohort of human recipients of uterus transplant (UTx) at high risk for pregnancy complications with healthy controls using flow cytometry, immunofluorescence microscopy, and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq). Subsets of tissue-resident uNK c…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell engagers (TCEs) have recently transformed the therapeutic landscape of hematological malignancies, including relapsed or refractory (R/R) B-cell non-Hodgkin lymphoma (B-NHL). However, the variability in patient responses underscores the need for a deeper mechanistic understanding of the factors driving efficacy. Immune cell composition and T-cell functional states are emerging as critical determinants of immunotherapy outcomes. Recent advances in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) technologies have enabled high-resolution characterization of T-cell states, revealing a spectrum from …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) and psoriasis (PSO), while distinct systemic diseases, both affect the joint system and share similar inflam … arning (LASSO, random forest, artificial neural network), immune infiltration analysis, single-cell RNA-seq, molecular docking, molecular dynamics simulation, MM/PBSA binding free-energy calculation, RT-qPCR, CCK-8 assay, and in vivo validation using an ACLT+MMx mouse OA model.
RESULTS: WGCNA identified the OA-specific green module (r = 0.54) and the PSO …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischaemic stroke (IS) leads to tragic disability and high adult mortality, while there are limited therapeutic measures for it. Small extrac … y are crucial for the optimisation of BMSC-sEVs therapeutic effects. In this study, based on sEVs miRNA-seq and analysis of the RNA-seq datasets for ischaemic stroke patients' samples in the GEO database, we identified that miR-21 sharply drops in the ischaemic brain. By the bioengineered BMSCs with RVG-Lamp2b peptide and miR-21-5p overexpression plasmid, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neoadjuvant chemoimmunotherapy (NACI) improves outcomes in resectable lung squamous cell carcinoma (LUSC), yet response varies w … histopathological validation to explore correlations with pathological response, while single-cell RNA-seq (GSE207422) and CellChat were used to infer tumor-stromal crosstalk and explore underlying mechanisms.
RESULTS: The risk score independently stratified prognosis. Among three core genes, high MBNL2 expression was associated with higher TIDE scores, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene-environment interactions, leading to immune-brain cross-talk and neuroinflammation are increasingly recognised in neurodevelopmental di … gression during infection-related exacerbations or the chronic phase. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed on peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in two children and their respective age-, sex- matched controls, before and after 24 h of in vitro ibuprofen and/or paracetamol incubation. A total of 45,134 cells were included. At basel …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования