This study used a two-sample Mendelian randomization (MR) method to explore the potential causal relationship between air quality, cholelithiasis, and its related risk factor, blood lipids. This study used MR in European and East Asian groups, utilizing publicly available genome-wide association study data. The main method was inverse-variance weighting, with additional quality checks including weighted median, MR-Egger, simple, and weighted models. The Cochran Q test assessed heterogeneity. MR-Egger regression and MR-PRESSO checked for gene pleiotropy, with sensitivity tests using leave-one-o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Delirium is a common yet underdiagnosed condition in elderly hospitalized patients. The lack of effective diagnostic and therapeutic methods can be attributed to the limited understanding of its pathophysiology. Delirium has recently been reported to be linked to neuroinflammation and epigenetic changes. The aim of this study was to validate the pathways in a larger cohort with a uniform type of surgery, while rigorously adjusting for potential covariates. This study primarily investigated DNA methylation (DNAm) changes before and after surgery in postoperative delirium (POD) among older adult
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc degeneration (IVDD) is a common degenerative spinal disorder and a major contributor to low back pain. Although aging is a key risk factor, the causal role of biological aging markers, such as telomere length (TL), in IVDD remains unclear. Moreover, the metabolic pathways underlying this association are largely unexplored. This study employed a 2-sample Mendelian randomization (MR) framework based on genome-wide association study summary data to investigate the causal effect of TL on IVDD risk. Genetic correlation between TL and IVDD was further evaluated using linkage dise…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intervertebral disc degeneration (IVDD) is a prevalent condition causing substantial pain, muscle weakness, and functional impairment; however, the efficacy of current treatments remains limited. Therefore, candidate therapeutic targets must urgently be prioritized to guide future mechanistic and translational research. This study aims to identify genetic factors associated with IVDD and explore the underlying mechanisms through the comprehensive integration of multi-omics data.
METHODS: We applied Mendelian randomization (MR) to prioritize candidate therapeutic genetic targets fo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Observational studies have demonstrated associations between plasma metabolites and sarcopenia/aging. This study aimed to investigate the genetically predicted associations between plasma metabolites and sarcopenia/aging traits and to discover the regulating genes. A Mendelian randomization (MR) study was performed using metabolomic data obtained from the Canadian Longitudinal Study on Aging cohort. Data of sarcopenia/aging traits were obtained from genome-wide association studies for frailty index, telomere length, left- and right-hand grip strength, adjusted appendicular lean mass, anterior
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Post-genome-wide association study (GWAS) interpretation of osteoarthritis (OA) increasingly requires integration with single-cell biology because many risk loci likely act through sterile inflammatory remodeling, regulatory and inflammatory chondrocyte states, and tissue-stress biology rather than through large disease-stage expression shifts. We therefore asked whether a published Transformer-based post-GWAS prioritization strategy could refine a multi-gene chr12 susceptibility locus into a tractable TCTN2-centered effector-gene hypothesis.
METHODS: Using combined hip and knee o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrative genetic approaches can combine Mendelian randomization, variant annotation, pathway-level interpretation, and exploratory cellular measurements to investigate complex disease mechanisms. However, the relationship between genetic liability to insulin medication use and osteoarthritis (OA) remains incompletely characterized GWAS summary statistics for insulin medication use were obtained from the UK Biobank insulin medication-use dataset. Insulin therapy-associated SNPs were selected using a suggestive significance threshold (p < 5 × 10-6) and clumped (r2 < 0.001, 10,000 kb). Two-sam
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extensive epidemiological and mechanistic studies have established links between specific infections and cancer, but the inherited host-genetic contribution to broader infection-cancer relationships remains incompletely characterized. Here, we integrated genome-wide association study summary statistics for multiple infectious diseases and cancers from European- and East Asian-ancestry populations and evaluated shared host genetic architecture across genome-wide and local genetic sharing, tissue- and cell-type enrichment, cross-trait locus discovery, functional gene prioritization, proteome-lev…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous observational studies have indicated a link between rheumatoid arthritis (RA) and airway hyperresponsiveness diseases (AHDs). However, the causality of this relationship remains uncertain. Our research aims to investigate the causal relationship between RA and AHDs. Using publicly available genome-wide association study summary statistics, we selected single nucleotide polymorphisms associated with RA (including overall RA, seropositive RA and seronegative RA), and AHDs (including asthma, bronchitis, allergic rhinitis and chronic obstructive pulmonary disease [COPD]) as instrumental v…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related macular degeneration (AMD) is a leading cause of vision loss worldwide. Genome-wide association studies (GWASs) of AMD have identified dozens of risk loci that may house disease targets. However, variants at these loci are largely noncoding, making it difficult to assess their function and whether they are causal. Here, we present a single-cell gene expression and chromatin accessibility atlas of human retinal pigment epithelium (RPE) and choroid to systematically analyze both coding and noncoding variants implicated in AMD. We employ HiChIP and activity-by-contact modeling to map
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Low back pain (LBP) is a prevalent chronic pain syndrome primarily driven by spinal degeneration, causing persistent disability and reduced quality of life. Despite available interventions, identifying novel therapeutic targets remains imperative for modifying disease progression. We performed Mendelian randomization analyses integrating plasma proteomics data (4657 proteins in 7213 Europeans) and FinnGen R12 LBP Genome-wide association study (17,615 cases/420,066 controls). Robustness was confirmed via Bayesian colocalization and Steiger directionality tests. Protein-protein interaction netwo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Crohn's disease (CD) is a chronic, idiopathic inflammatory bowel disease. Understanding the genetic and immunological basis of CD can lead to better therapeutic strategies.
METHODS: We employed publicly available datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database to identify instrumental variables through expression quantitative trait loci (eQTL) analysis and conducted two-sample Mendelian randomization (MR) analyses. Additionally, we investigated the functions and pathways of co-expressed genes using GO, KEGG, and GSEA analyses. The association between these genes and imm
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Neutrophil extracellular traps (NETs) participate in thrombosis, inflammation, and cardiovascular remodeling, yet whether NET-related genes (NRGs) are associated with atrial fibrillation (AF) risk across multiple molecular layers remains unclear. This study used a multiomics Mendelian randomization framework to prioritize NRGs supported by methylation, expression, and protein quantitative trait loci (QTL) data.
METHODS: Genome-wide significant cis instruments (P < 5 × 10-8) were obtained for 90 methylation QTLs (mQTLs), 100 expression QTLs (eQTLs), and 38 protein QTLs (pQTLs) ma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Given the high prevalence of periodontitis and potential for undetected primary hyperparathyroidism (pHPT) to exacerbate periodontal damage, managing pHPT in advanced periodontitis (stages III/IV) is critical. The causal link between pHPT and periodontitis remains unclear. This study aims to investigate the causal effect and mechanisms between hyperparathyroidism and periodontitis.
METHODS: A two-sample Mendelian randomization study used genome-wide association studies (GWAS) summary data to explore the causal link between hyperparathyroidism and periodontitis, employing single nucleoti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma pneumonia (MP), as a global infectious disease in sheep, seriously affects the production performance of sheep and economic benefits of sheep industry. However, current research on sheep resistance to MP remains limited. To address this gap and explore the potential epigenetic regulation of sheep MP resistant, this study employed high-throughput sequencing techniques (ATAC-Seq and CUT&Tag) to analyze epigenetic modifications in lung tissue from healthy and MP-affected sheep and reveal differential epigenetic landscapes associated with disease resistance. Integrating transcriptome an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) and gout are traditionally considered distinct diseases with differing pathogenic mechanisms, making t … inear serum urate (SUA)-gout associations within RA. Mendelian randomization (MR) analyses based on genome-wide association study (GWAS) data evaluated causal effects of overall RA, Seronegative RA (SNRA), and Seropositive RA (SPRA) on gout and SUA, with multiple testing controlled by Bonferroni correction. Transcriptomic analyses from the Gene Expression Omnibus (GEO) used di …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bidirectional two-sample Mendelian randomization (MR) was used to evaluate the potential causal effects of birth weight and uric acid levels (the exposures) and the development of gout (the outcome). Genetic instruments derived from aggregated genome-wide association study data of European ancestry were used to investigate the associations between birth weight (261,932 samples, 9,851,867 single-nucleotide polymorphisms [SNPs]), uric acid levels (110,347 samples, 4,865,122 SNPs), and gout (337,159 samples, including 4807 cases and 332,352 controls, 10,894,596 SNPs). The inverse variance weighti…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Epidemiological studies link autoimmune diseases (AIDs) to follicular lymphoma (FL) risk, but their shared genetic architecture and causal mechanisms remain unclear. Methods: A two-sample Mendelian randomization (MR) analysis was employed to assess causal relationships between 15 AIDs and FL. Pleiotropic loci were identified through the Pleiotropy Analysis under Composite Null (PLACO). Bayesian colocalization analysis, functional mapping, and Multi-marker Analysis of GenoMic Annotation were applied to fine-map shared genetic variants and identify their target genes. Summ
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Observational studies have associated vitamin D deficiency with sarcopenia and lifestyle; however, the causal link between them remains unclear. This study aimed to evaluate the causal relationship between 25-hydroxyvitamin D (25(OH)D) and sarcopenia and unhealthy lifestyle using Mendelian randomization (MR). We extracted pooled data on 25(OH)D from a genome-wide association study conducted on individuals of European ancestry. Sarcopenia outcomes were assessed using appendicular lean mass, low handgrip strength, and usual walking pace. Unhealthy lifestyle outcomes were assessed using able to w…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gill-related morbidity and mortality have become a major concern to the Atlantic salmon industry worldwide. Understanding the genetic mechanisms underlying susceptibility to gill diseases or lesions can help guide mitigation efforts. Genome-wide association analysis was conducted on gill scores from two large cohorts of Atlantic salmon populations, reared in Norway and Canada, that were phenotyped during amoebic gill disease (AGD) outbreaks and at harvest (referred to as idiopathic gill lesions (IGL)), respectively.
RESULTS: Whereas one novel quantitative trait locus (QTL) region
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.