AIM OF THE STUDY: Tumor necrosis factor receptor-associated factors (TRAFs) are cytoplasmic adapter proteins that regulate immune cell signa … rs. Potential TRAF5-dependent immune cell mechanisms were explored by single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of 259,493 cells from 79 human plaques. Among all TRAFs, only TRAF5 was significantly downregulated in advanced lesions. Higher lesional TRAF5 expression independently predicted lower risk for MACE (HR 0.62; 95% CI 0.40-0.98). TRAF5 was lowest in f …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perfluorooctanoic acid (PFOA), a pervasive environmental pollutant, has been implicated in hepatic injury and metabolic dysfunct … tomic datasets (GSE66676, GSE89632, GSE164760) to identify hub genes. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis delineated cell type-specific expression patterns. Molecular docking and dynamics simulations assessed the binding stability between PFOA and core targets, which was further validated in vitro using an FFA-induced MASLD HepG2 cell model. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydatidiform mole (HM) is driven by aberrant trophoblast proliferation, disrupting embryonic development and leading to pregnancy loss with increased risk of malignant progression. Despite its clinical significance, the cellular and molecular heterogeneity of HM remains poorly characterized. To address this, we integrated single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq), single-nucleus transposase-accessible chromatin sequencing (snATAC-seq), and spatial transcriptomics to construct a cell-resolved atlas of androgenetic complete HM compared with gestational age-matched controls. The three major troph…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Interstitial lung disease (ILD) is a common but serious extra-articular manifestation of rheumatoid arthritis (RA). RA-associate … g mechanisms associated with RA-ILD and IPF development, we performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from five RA-ILD patients and five patients with IPF with a matched age and sex distribution.
RESULTS: A high-quality scRNA-seq dataset comprising 31,416 peripheral immune cells was generated. Overall …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Chronic rhinosinusitis with nasal polyps (CRSwNP) is a heterogeneous chronic inflammatory disease with unclear pathogenesis and a high recurrence rate. Inflammatory response-related genes (IRGs) play a key role in disease progression but remain to be further explored in CRSwNP.
METHODS: CRSwNP-related transcriptome datasets and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. IRGs were derived from the Molecular Signatures Database (MSigDB). Core genes were screened using weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Sjögren's disease (SjD) leads to severe dry eye disease (DED) via lacrimal gland inflammation and dysfunction, yet the specific pathogenic mechanisms remain unclear. In this study, we aimed to deeply identify the vulnerable lacrimal epithelial subclusters and elucidate the immune-epithelial cross-talk.
METHODS: We used MRL/lpr mice as a murine SjD model and integrated bioinformatic analysis of single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptome datasets. These findings were validated using immunofluorescence (IF), multiplex immunohistochemistry analysis (mIHC), Western b…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Humoral immunity targeting hepatitis B virus (HBV) surface antigen (HBsAg) is critical for viral clearance. However, the phenotypic, repertoire, and metabolic features of HBsAg-specific B cells in chronic hepatitis B (CHB) remain incompletely defined.
METHODS: HBsAg-specific B cells were enriched using oligonucleotide-tagged antigen probes and profiled by integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and single-cell B cell receptor sequencing (scBCR-seq) in HBeAg-positive CHB patients, convalescent individuals, and vaccinated healthy controls. Key findings were further evaluat…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Autoantibodies (ABs) against intracellular proteins, including glutamate-decarboxylase 65 (anti-GAD65), are incre … : We examined hippocampal neuropathology and performed exploratory single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) of hippocampal tissue from DBN- and GAD65-TLE patients, integrated with key clinical data from a large patient cohort.
RESULTS: Although the hippocampi of the two patient groups were neuropathologically virtually indistinguishable, exploratory snR …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) remains a formidable global health threat, yet rapid and accurate diagnostic biomarkers capturing host immune-metabolic dysregulation remain elusive. Here, we aimed to map the TB immune microenvironment and engineer a reliable, explainable diagnostic signature targeting the macrophage-associated immune-metabolic axis. Utilizing single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) as an exploratory discovery tool, we initially dissected the intercellular communication network in TB. We then deployed an exhaustive consensus machine learning framework, comprising 113 algorithm combinations, a…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neoadjuvant chemoimmunotherapy (NACI) has revolutionized head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) treatment. However, some patients still do not respond significantly, partly attributed to insufficient anti-tumor specific T-cells. Thus, identifying the underlying causes of impaired antitumor immunity has become an urgent priority to improve efficacy.
METHODS: To investigate the link between anti-tumor specific T cells and NACI efficacy in treating HNSCC, we employed multicolor immunohistochemistry (mIHC) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq). To gain deeper insights into…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the most common malignant renal tumor in children, the progression of Wilms' tumor is frequently driven by abnormal alternative splicing (AS), cell death imbalance, and an immunosuppressive microenvironment. However, the precise regulatory chain connecting these three critical elements remains largely unexplored. This study aimed to systematically construct and characterize an "AS-cell death-immunity" regulatory network in Wilms' tumor.
METHODS: We performed a comprehensive in silico analysis using matched paired Wilms' tumor and adjacent normal RNA-seq data from the GSE138869 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Depression affects approximately 30% of people with multiple sclerosis (MS) and worsens outcomes, yet its immunopathogenesis rem … -trait analysis of GWAS (MTAG). In addition, we performed exploratory single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from four MS patients (two with depression and two without) to characterize immune cell phenotypes and functions.
RESULTS: LDSC revealed a significant positive genetic correlation between MS and depres …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence indicates that coagulation-related molecular programs are associated with thrombosis, tumor progression, and molecular dys … sed to evaluate candidate genes associated with malignant phenotypes. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and cell-cell communication analyses were further performed to characterize cell-type-specific expression patterns and potential intercellular interactions. A total of 22 differentially expressed thrombosis-associated genes were identified, and a p …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis is regarded as a dysregulated immune response to infections. Recent study showed partially reversal of immunosuppression by trained immunity, which fosters an enhanced immune response towards a secondary challenge. However, the role of trained immunity in sepsis has not been fully understood.
METHODS: We profiled the characteristics of peripheral blood mononuclear cells from septic patients using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analyses. Murine double-hit models (pretreatment or post-treatment of β-glucan in septic mice) and murine monocyte/macrophage cell line RAW26…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC) is one of the most common malignant tumor worldwide. Metastasis is leading cases of cancer-related death of … tro and in vivo, including CCK8, colony formation, transwell and nude mice models. Mechanistically, RNA-seq, MeRIP-seq, MeRIP-qPCR, western blot, dot blot, co-IP, ChIP and IHC stainings were performed.
RESULTS: METTL1 and WDR4 were upregulated in GC patients. High expression of METTL1 and WDR4 were associated with poor prognosis. Silencing METTL1-WDR4 in …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic adenocarcinoma (PAAD) remains a highly aggressive cancer with limited treatment options and a poor prognosis. A lack of reliable biomarkers and insufficient understanding of tumor heterogeneity impede early PAAD detection and personalized treatment.
PURPOSE: This study aimed to construct a gene-based risk model and explore targeted approaches to overcome tumor drug resistance in PAAD.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) bioinformatics identified key driver genes, stratifying PAAD patients into two subtypes. A nine-gene risk model was constructed using Lasso…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDS: The mechanisms contributing to diabetic vasculopathy have not been fully understand.
METHODS: First, we identified differentia … (TF) regulatory networks and performed immune infiltration as well as single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analyses. Finally, animal studies were carried out to provide preliminary experimental validation.
RESULTS: One hundred thirty-nine DEGs were identified in the comparison between Type 2 diabetes mellitus (T2DM) and control (Con) arterial samples. …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Leptomeningeal metastasis (LM) is a serious complication of advanced non-small-cell lung cancer (NSCLC). Intrathecal administrat … s intrathecal therapies, treated with intrathecal nivolumab and IL-2. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed on cerebrospinal fluid (CSF) samples collected before and after treatment.
RESULTS: This is the first reported case of intrathecal nivolumab plus IL-2 in NSCLC with LM resistant to standard systemic and intrathecal therapies. The pat …
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Smoking is a significant global public health concern that has been shown to cause damage to testicular tissue and impair the entire process of spermatogenesis.
METHODS: A passive smoking mouse model was established to investigate the effects of cigarette smoke exposure. The study included measurements of body weight and testicular weight, pathological assessment of testicular damage, apoptosis experiments, and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to analyze transcriptomic changes. Additionally, differentially expressed genes were examined, along with gene ontology (GO) analysis…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose Recent studies have investigated intraperitoneal paclitaxel (IP PTX) combined with systemic chemotherapy for the treatment of gastri … Cancer Genome Atlas (TCGA) gastric cancer data and publicly available single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets. Spatial transcriptomic analysis of primary and peritoneal tumors from a non-responder was performed to validate candidate biomarkers. Results Nine patients with gastric cancer were enrolled; six in the response group and three in the non- …
СтатьяКлиническое исследование II фазыКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.