Diagnostic tests for respiratory viral infections use traditionally either nasopharyngeal washes or swabs. Sputum is representative of the lower respiratory tract but is used rarely for viral testing. The aim of this study was to compare the detection rates of respiratory viruses from nasopharyngeal swabs and sputum using a multiplex real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Adults who were admitted or presented to the clinics of Gil Medical Center with acute respiratory symptoms were recruited from 1 November 2012 to 31 March 2013. Paired specimens of nasopharyngeal
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To examine the effects of l-carbocisteine on airway infection with respiratory syncytial (RS) virus, human tracheal epithelial cells were pretreated with l-carbocisteine and infected with RS virus. Viral titer, virus RNA, and pro-inflammatory cytokine secretion, including interleukin (IL)-1 and IL-6, increased with time after infection. l-carbocisteine reduced the viral titer in the supernatant fluids, the amount of RS virus RNA, RS virus infection susceptibility, and the concentration of pro-inflammatory cytokines induced by virus infection. l-carbocisteine reduced the expression of intercell
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatic fever (RF) classically occurs after group A Streptococcus (GAS) pharyngitis in children aged over 5 years in developing countries. The present report describes the bacterial and host determinants in non-related toddlers who developed RF diagnostic criteria after toxic shock syndrome (TSS).
METHODS AND RESULTS: A 13-month-old boy and a 14-month-old girl presented GAS TSS. After several weeks, multiple subcutaneous nodules as well as migratory polyarthritis or monoarthritis developed in both children, fulfilling Jones criteria of RF. The relevance of the Jones criteria for
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the regression of coexisting mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphomas in the duodenal bulb and gastric corpus brought about by Helicobacter pylori eradication. During an endoscopic examination, multiple polyps in the duodenal bulb were observed in a 62-year-old woman. The pathology of the duodenal polyps was low-grade B-cell MALT lymphoma. Gastric MALT lymphoma was also detected in biopsies of rough mucosa from the gastric corpus. Southern blot analysis showed rearranged bands of DNA immunoglobulin heavy chain J portion (IgH-J) in both lesions, but the positions of these ba
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila is the causative agent of the lung malady Legionnaires' disease, it modulates host function to create a niche termed the Legionella-containing vacuole (LCV) that permits intracellular L. pneumophila replication. One important aspect of such modulation is the co-option of the host ubiquitin network with a panel of effector proteins. Here, using recombinantly expressed and purified proteins, analytic ultracentrifugation, structural analysis, and computational modeling, along with deubiquitinase (DUB), and bacterial infection assays, we found that the bacterial defective in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A balanced gut microbiota contributes to health, but the mechanisms maintaining homeostasis remain elusive. Microbiota assembly during infancy is governed by competition between species and by environmental factors, termed habitat filters, that determine the range of successful traits within the microbial community. These habitat filters include the diet, host-derived resources, and microbiota-derived metabolites, such as short-chain fatty acids. Once the microbiota has matured, competition and habitat filtering prevent engraftment of new microbes, thereby providing protection against opportun
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An outbreak of Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP) occurred among heart transplant recipients (HTR) at the outpatient clinic of a university hospital, from March to September 2015. Clinical, therapeutic, biological, and molecular data were analyzed to determine its origin and control the outbreak.
METHODS: Clinical and biological data regarding all HTR followed in the outpatient clinic were collected. PCP diagnosis was based on microscopy and real-time polymerase chain reaction (PCR). Investigations were performed by building a transmission map, completed by genotyping Pneumocy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacteriocin producer Streptococcus salivarius K12 is used as a probiotic targeting the oral cavity, so our study aimed to assess whether its dispersal and persistence could be monitored using real-time quantitative polymerase chain reaction. To this end, we designed polymerase chain reaction primers and a hybridization probe specifically targeting salA, which encodes for the prepropeptide of salivaricin A. Using a single individual as our subject, we administered four lozenges of K12 Throat Guard per day over 3 days, then measured salA gene levels for 16 different oral sites at six differe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Six cases were studied to further clarify clinicopathological findings of Epstein-Barr virus (EBV)-related lymph node lesions showing autoimmune disease-like clinicopathological findings (EBVAID) in middle-aged and elderly patients. The patients, four males and two females, ranged in age from 53 to 74 years, with a median age of 62 years. Clinically, they were characterized by systemic lymphadenopathy, "B"symptoms, polyclonal hypergammaglobulinemia, elevated serum lactate dehydrogenase and a transient presence of various autoantibodies, as well as an infrequent presence of atypical lymphocytos
Клинический случайСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human African trypanosomiasis (HAT) is a fatal vector-borne disease caused by Trypanosoma brucei. Although HAT incidence has declined, meeting WHO's elimination targets remain difficult, particularly due to limited diagnostic sensitivity for low-parasite load-infections. Arboviruses such as dengue (DENV 1-4), chikungunya (CHIKV), and yellow fever (YFV) virus, present with nonspecific febrile symptoms similar to HAT and are underdiagnosed in Sub-Saharan Africa. Due to this overlap in symptoms and a suspected geographical overlap of vectors and pathogens in the Democratic Republic of
СтатьяНаблюдательное исследованиеВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Talaromycosis caused by Talaromyces marneffei is a life-threatening mycosis in patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). The gold-standard diagnostic method relies on time-consuming cultures, which delay treatment and increase mortality. In this study, we developed a rapid and sensitive droplet digital PCR (ddPCR) assay targeting the internal transcribed spacer (ITS) gene for detecting T. marneffei and compared its performance with blood culture and quantitative PCR (qPCR) assays. The ddPCR assay had a detection limit of one copy/reaction, making it 10-fold more sensitive than q
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Broadly neutralizing antibodies (bnAbs) can protect against HIV infection but have not been induced by human vaccination. A key barrier to bnAb induction is vaccine priming of rare bnAb-precursor B cells. In a randomized, double-blind, placebo-controlled phase 1 clinical trial, the HIV vaccine-priming candidate eOD-GT8 60mer adjuvanted with AS01B had a favorable safety profile and induced VRC01-class bnAb precursors in 97% of vaccine recipients with median frequencies reaching 0.1% among immunoglobulin G B cells in blood. bnAb precursors shared properties with bnAbs and gained somatic hypermut
Клиническое исследование I фазыСтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Optimal sensitivity to detect low Pneumocystis loads is of importance to take individual and collective measures to avoid evolution towards Pneumocystis pneumonia and outbreaks in immunocompromised patients. This study compares two qPCR procedures, a new automated RTqPCR using the GeneLEAD VIII extractor/thermocycler (GLVIII; ∼2.2 h workflow) and a previously validated in-house qPCR assays (IH; ∼5 h workflow) both targeting mtSSU and mtLSU for detecting P. jirovecii in 213 respiratory samples. GLVIII was found to be more sensitive than IH, detecting eight more specimens. Bland-Altm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sandfly fever Toscana virus (TOSV, genus Phlebovirus, family Phenuiviridae) is endemic in Mediterranean countries. In Spain, phylogenetic studies of TOSV strains demonstrated that a genotype, different from the Italian, was circulating. This update reports 107 cases of TOSV neurological infection detected in Andalusia from 1988 to 2020, by viral culture, serology and/or RT-PCR. Most cases were located in Granada province, a hyperendemic region. TOSV neurological infection may be underdiagnosed since few laboratories include this virus in their portfolio. This work presents a reliable autom
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Globally, noroviruses are recognized as an important cause of acute gastroenteritis (AGE), but data from low and middle-income countries are limited.
AIMS: To examine the epidemiology and strain diversity of norovirus infections among children hospitalized for AGE in Bangladesh.
METHODS: We implemented active surveillance of children <5 years of age hospitalized with AGE at 8 geographically dispersed tertiary care hospitals in Bangladesh from July 2012 to June 2016. We tested random samples of AGE cases stratified by site and age group for norovirus by real-time RT-PCR. Noro-posi
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral encephalitis is common in childhood. It is an acute brain parenchymal inflammation caused by a variety of viral infection, and enterovirus accounts for the majority. Due to atypical clinical manifestations, pathogenic testing is important for assisting clinical diagnosis. The purpose of this study was to evaluate the performance of the multiplex PCR assay compared with quantitative real-time PCR for enterovirus detection.
METHODS: A prospective case-control study was performed involving 103 pediatric patients suspected for viral encephalitis and cerebrospinal fluid (CSF) sam
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE AND METHOD: We developed and evaluated five novel real-time RT-PCR assays targeting conserved regions in the 5'-untranslated region (5'-UTR), envelope (E'), non-structural protein 2A (NS2A), NS5 and 3'-UTR of the ZIKV genome.
RESULTS: The ZIKV-5'-UTR assay exhibited the lowest in vitro limit of detection (5-10 RNA copies/reaction and 3.0 × 10-1 plaque-forming units/ml). Compared to the modified version of a widely adopted RT-PCR assay targeting the ZIKV-E gene, the ZIKV-5'-UTR assay showed better sensitivity in human clinical specimens, and representative mouse specimens, including
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many biting midges of the genus Culicoides Latreille, 1809 (Diptera: Ceratopogonidae) are competent vectors of a diverse number of pathogens. The identification of their feeding behaviour and of vector-host associations is essential for understanding their transmission capacity. By applying two different nested polymerase chain reaction (PCR) assays, of which one targeted the avian cyt b gene and the other targeted the COI gene of a wide range of vertebrates, we identified the blood hosts of six biting midge species including Culicoides circumscriptus, Culicoides festivipennis, Culicoides punc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sindbis virus (SINV) is a mosquito-borne alphavirus found in Eurasia, Africa, and Oceania. Clinical SINV infection is characterized by febrile rash and arthritis and sometimes prolonged arthralgia and myalgia. The pathophysiological mechanisms of musculoskeletal and rheumatic disease caused by SINV are inadequately understood.
METHODS: We studied the muscle pathology of SINV infection ex vivo by examining a unique muscle biopsy obtained from a patient with chronic myalgia and arthralgia 6 months after acute SINV infection and assessed potential genetic predisposing factors by dete
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.