The Chinese bahaba (Bahaba taipingensis) is a critically endangered species found in the coastal waters of the South China Sea and East Chin … ollagen synthesis, otolith development) and will assist future investigations into the conservation genomics of B. taipingensis.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: KRAS mutations (KRASm)represent the most common oncogenic drivers in non-small cell lung cancer (NSCLC). However, molecular features and clinical implications of the less common, codon 13 mutations (KRAS G13X) remain poorly characterized. We conducted a retrospective study to characterize KRAS G13X-positive NSCLC.
METHODS: We reviewed patients' charts with KRASm NSCLC treated at University of Iowa Health Care. Based on intent of therapy, patients were assigned to curative-intent (CI) or palliative-intent (PI) cohorts. Clinicopathologic data, co-mutation profiles, and outcomes were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer genomic data sharing is a core pillar of precision oncology, underpinning reproducibility, scalability, and equity. The ability to discover, access, integrate, interpret, and reuse cancer 'omics data is a key determinant of precision oncology's value and benefit at scale. This work has been conducted as part of The Lancet Oncology Commission on Cancer Genomics and Precision Oncology to examine the practical data architecture required to support cancer genomics in research, clinical care, and health-system learning. We conclude that without robust data stewardship, including effective da…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in the copy number of large genomic regions, termed copy number variations (CNVs), contribute to important phenotypes. CNVs are read … falciparum genome readily accumulates CNVs that facilitate rapid adaptation. We employed low-input genomics and specialized computational tools to evaluate the impact of sub-lethal stress on the de novo CNV rate. We observed a significant increase in genome-wide de novo CNVs following treatment with an antimalarial compound that inhibits replication. De n …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prokaryotes carry phage defence systems in 'defence islands' as immunity mechanisms; however, which systems are endogenously active against specific phages is often not known. Here we identify a single gene in a defence island that is necessary for a Pseudomonas aeruginosa cystic fibrosis isolate to block phages from the Pbunavirus family, which are commonly used as therapeutics. The causal defence system, here named END nucleases, has a Type IIS restriction endonuclease-like domain fused to a catalytically inactive endonuclease III (iEndoIII), which normally recognizes non-canonical bases to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoglobulin A nephropathy (IgAN), the most common primary glomerular disease and a leading cause of end-stage kidney disease (ESKD), is associated with cardiovascular and metabolic abnormalities. To explore these genetic overlaps, we integrated large-scale GWAS data from IgAN, 21 pan-vascular diseases (PVDs), 13 metabolic traits, 11 immune cell phenotypes, and established IgAN risk factors. Cross-trait analyses (LDSC, GNOVA, SUPERGNOVA) revealed significant genetic correlations between IgAN and multiple PVDs, including coronary artery disease, heart failure, stroke, aortic aneurysm, and var
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Fontan-associated liver disease (FALD) could lead to liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC). The prognosis of FALD patients is worse when HCC develops. Therefore, a better understanding of the mechanisms of FALD hepatocarcinogenesis is critical. We investigated the genomic and transcriptomic signatures of FALD HCC.
APPROACH AND RESULTS: Ten patients with FALD HCCs, 2 patients with non-Fontan congenital heart surgery (CHS) HCC, and 1 patient with FALD focal nodular hyperplasia (FNH) were enrolled. Whole-genome sequencing and transcriptome sequencing were perfor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracranial aneurysms (IAs) represent a significant and potentially life-threatening category of disease, and there is currently a lack of effective treatment options aimed at preventing the progression of the disease. Accordingly, this study is dedicated to exploring and identifying effective drug targets that can help in the prevention of both the formation and rupture of IAs, along with a detailed examination of the underlying potential mechanisms involved in these processes. The data related to IAs for this research was obtained from the ISGC Biobank and UK Biobank. Then, we investigated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dysglycemia is a complex metabolic disorder governed by the interplay between environmental exposures and genetic factors, yet the precise molecular mechanisms driving these gene-environment (G×E) interactions remains poorly understood. Here, we characterized the population-level landscape and molecular causality underlying the interactions between cadmium (Cd), a widespread environmental toxicant, and genetic susceptibility loci in dysglycemia. By conducting a Genome-wide Environmental Interaction (GWEI) study within a sub-cohort of the China National Human Biomonitoring (CNHBM) cohort (N = 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid growth of genomic sequencing demands fast, accurate, and scalable analysis methods. In viral genomic classification, expanding labeled reference collections can make supervised models costly to update and dependent on fixed label sets, motivating retrieval-based genomic classification as a simpler, more flexible alternative. We present a unified benchmark of supervised and retrieval-based methods for viral genomic sequence classification across three viral classification tasks: hepatitis C virus (HCV) genotyping, COVID-19 discrimination, and human papillomavirus (HPV) genotyping. We
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modern large-scale genetic association analyses of imaging and omics data reveal unprecedented details of the genetic architecture of complex traits. Such analyses involve scanning thousands of phenotypes using linear mixed model-based genome-wide association study tools to control for sample relatedness. However, current LMM tools are not designed for such scale, creating a computational burden that hinders discovery. We propose TorchGWAS2, a cost-effective solution that overcomes the bottleneck using a deterministic variance-correction algorithm for LMMs, making it well-suited for GPU accele
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposable elements (TEs) are major components of plant genomes and drivers of structural and functional diversification. In Prunus specie … riminatory power across Prunus germplasm. Integration of high-resolution TE mapping with functional genomics and epigenetic profiling promises deeper understanding of TE-mediated regulatory networks and their potential exploitation for crop improvement.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Enterobacter genus contains 23 species that include common nosocomial pathogens capable of causing a wide variety of infections. We obta … the abundance of known T6SS-associated proteins and the presence of T6SS, we proposed a comparative genomics model to evaluate the correlation between unknown T6SS-associated ortholog proteins and T6SSs. Among the homologous groups most strongly associated with T6SS, we potentially identified several effectors. It is conceivable that our methodology could …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Biliary atresia (BA) is the leading cause of pediatric liver transplantation worldwide. However, the genetic background remains unclear in most patients. In this genome-wide association study (GWAS), we aimed to identify genetic loci that contribute to susceptibility to BA.
METHODS: We recruited 189 BA patients (85 males and 104 females) and 558 non-BA controls (275 males and 283 females) for this GWAS analysis using the Axiom Genome-Wide TWB 2.0 Array with 686,463 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The MassARRAY Sequenom analysis was then applied to validate the identified t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic retinopathy (DR) and Alzheimer disease (AD) share metabolic and vascular dysfunctions, but the extent to which they reflect overlapping genetic susceptibility and neurovascular-metabolic regulatory pathways remains unclear. We combined multi-omics analyses with population-based data to examine the genetic convergence, cellular pathways, and longitudinal association between DR and AD.
METHODS: We performed a two-sample Mendelian randomisation (MR) to estimate the association between genetically predicted DR liability and AD risk. We used Bayesian colocalisation analysis to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mangrove ecosystem serves as a vital coastal ecotone, providing essential ecological services, such as water purification, shoreline protection, and biodiversity maintenance. Fungal pathogens threaten mangrove health and contribute to ecosystem degradation, but the molecular mechanisms underlying disease resistance in mangroves remain poorly explored. Introdustion: Thaumatin-like proteins (TLPs), belonging to the pathogenesis-related-5 (PR-5) family, play a crucial role in antifungal defense in plants.
METHOD AND RESULTS: In this study, we identified 23 TLP family members in t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hibernation profoundly alters host-pathogen dynamics by suppressing metabolism and immune function, posing unique challenges for infection control. In this study, we examined how genomic variation modulates infection and physiological traits in temperate bats during hibernation. We combined infection screening, haematology, blood biochemistry, and whole-genome sequencing across five vespertilionid species, identifying over 170,000 single nucleotide variants (SNVs) and assessing their associations with 23 health-related variables. Using the phylogenetically informed treeWAS framework, we detect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Burkholderia genus of Gram-negative bacteria are known for their extensive metabolic capabilities, their relatively plastic genomes, their high intrinsic resistance to antibiotics, and their ability to cause various diseases in humans, animals, and plants. Burkholderia gladioli is one such species, that is an opportunistic pathogen in people, causing sometimes fatal pneumonia, or in plants, causing onion bulb rot, mushroom soft rot, or rice panicle blight. Therapies that utilize bacterial viruses (bacteriophages, or phages) to counter or control pathogenic bacteria are a promising alternat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования