Multiple myeloma (MM) is driven by clonal plasma cell (cPC)-intrinsic factors and changes in the tumor microenvironment (TME). To investigate whether residual polyclonal PCs (pPCs) are disrupted, single-cell (sc) RNA sequencing (scRNA-seq) and sc B-cell receptor analysis were applied in a cohort of 46 samples with PC dyscrasias and 21 healthy donors (HDs). Of 234 789 PCs, 64 432 were genotypically identified as pPCs with frequencies decreasing over different disease stages, from 23.66% in monoclonal gammopathy of undetermined significance to 3.23% in MMs (P = .00012). Both cPCs and pPCs had a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in RELA, a key component of NF-κB signaling, are associated with dysregulated immune responses and inflammatory disord … ofiling was performed using mass cytometry time of flight (CyTOF) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and compared to controls.
RESULTS: We studied a 17-year-old male diagnosed with pan-enteric Crohn's disease (CD), perianal fistulas, chronic mucocutaneous candidiasis, and chronic lymphopenia. Sequencing identified a heterozygous missense variant …
СтатьяКлинический случайПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastroesophageal reflux disease (GERD) and asthma are commonly co-occurring conditions, with shared genetic factors identified. … ofiles in both healthy individuals and GERD patients using esophageal single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data.
RESULTS: We identified a significant genetic correlation between GERD and asthma ( rg = 0.37, P = 6.19 × 10 -38 ) and a significant causal effect of GERD on asthma [odds ratio (OR) = 1.22, P = 1.54 × 10 -5 ]. Cross-trait meta-analyses revea …
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Extrachromosomal circular DNA (eccDNA) plays significant roles in cancer progression and prognosis. However, it remains unclea … ith other omics datasets, and finally validated the function of eccDNA by in vitro transfection and RNA-seq.
RESULTS: We pioneered the profiling of urinary cell-free eccDNAs landscape in PCa and uncovered a high association between eccDNA generation and active chromatin status as well as gene transcription. Double strand breaks and R-loops, which prefere …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) ranks among the most prevalent malignancies, with prognosis heavily influenced by diagnostic stage. The role of PANoptosis in T cell-based immunotherapy has garnered growing attention recently. This study is aimed at establishing a T cell-specific PANoptosis signature (TSPS) to predict prognosis and immunotherapy response in patients with PCa.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from the GSE185344 dataset were used to identify T cell-specific genes. A comprehensive machine learning pipeline incorporating 10 distinct algorithms was employed to…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Although immune dysregulation is implicated in the pathogenesis of endometriosis (EMs), the specific role of prostate transmembrane protein androgen induced 1 (PMEPA1) in modulating the function of regulatory T cells (Tregs) remains inadequately understood. This study aimed to elucidate the regulatory mechanisms by which PMEPA1 influences the activity of Tregs, thereby facilitating the invasion of endometrial stromal cells (ESCs).
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed on matched ectopic ovarian lesions and eutopic endometria from 3 patients. Clinical specime…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Traumatic brain injury (TBI) is increasingly recognized as a systemic inflammatory disorder, with neutrophils playing a critical role in secondary injury. However, the phenotypic heterogeneity and clinical significance of neutrophil subsets in the early TBI immune landscape remain unclear, limiting their utility in nursing prognostic assessment and individualized care planning.
METHODS: We performed an integrated multi-omics analysis-combining single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), bulk transcriptomics, and proteomics-to dissect neutrophil diversity post-TBI. A distinct SLFN4+ ne…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Embryo implantation is a decisive process in pregnancy that highly relies on effective cell communication at the maternal-fetal interface. Embryo implantation failure is frequently caused by gram-negative bacterial infection, therefore, this study aimed to investigate the effect of Lipopolysaccharides (LPS)-induced inflammation on cellular composition, cell-cell interaction and key signaling pathways at the maternal-fetal interface using Single-cell RNA-Sequence (scRNA-Seq). LPS exposure significantly up-regulated the expression of pro-inflammatory cytokines, CCL-2, TNF-α, and IL-1β in materna…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disease characterised by immune dysregulation leading to inflammation and organ damage. Despite the rising global incidence of SLE, its aetiology remains unclear. We applied Mendelian randomisation (MR), multi-omics integration, machine learning (ML), and SHAP to identify key metabolites and genes associated with SLE, revealing the crucial role of the glutathione pathway. MR analysis was performed on 1400 serum metabolites, revealing significant enrichment in the glutathione metabolic pathway. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic kidney disease (CKD) is a global health concern, with renal fibrosis being a major pathological feature. Empagliflozin ( … min-to-creatinine ratio. Renal fibrosis was evaluated histologically. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed to analyze intercellular communication networks and identify alterations in ligand-receptor pairs and signaling pathways involved in fibrosis.
RESULTS: Empa treatment significantly improved kidney function and reduced renal interstit …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Estrogen deficiency-induced osteoporosis largely results from disrupted immune environment in bone marrow, yet the underlying cellular and molecular mechanisms remain incompletely understood. This study aimed to investigate how estrogen deficiency alters bone marrow cellular composition and signaling pathways, with a focus on the regulatory role of activator protein 1 (AP-1) and its impact on osteoclastogenesis.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed on bone marrow cells from sham-operated and ovariectomized (OVX) mice to map cell-type-specific changes. AP-1…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT), in which endothelial cells (ECs) lose their endothelial identity and acquire mesenchymal-like … , CD105, CD90). Differentiation states were evaluated using published single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data of EndMT-treated HUVECs and validated under lineage-specific culture environments. In vivo analysis was performed using scRNA-seq data from EC lineage reporter mice in atherosclerosis models. EndMT-treated HUVECs displayed an intermediate mese …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to investigate the role of natural killer (NK) cell and interferon (IFN) signaling in the peripheral circulation of anti-MDA5+ dermatomyositis (DM) patients, particularly in the context of interstitial lung disease (ILD) development.
METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from six newly diagnosed, active anti-MDA5+ DM patients (3 with ILD, 3 without ILD) were analyzed using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), focusing on NK cell features. The correlation between serum cytokine levels and ILD severity assessed by HRCT scores was further analyzed. F…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histopathologic diagnosis of thin, invasive cutaneous melanoma (CM) is only 34-62% accurate. Therefore, we sought to develop a transcriptomic biomarker to distinguish benign from malignant melanocytic neoplasms. We generated a targeted RNA-Sequencing dataset (TempO-Seq) of benign nevi (BN; n = 50) and CM (Breslow depth ≤ 1.0 mm; n = 51) and demonstrated enrichment of immune-related pathways among the 450 differentially expressed genes. Next, we trained a putative transcriptomic biomarker in two datasets, including BN and CM, and one dataset with CM in association with a nevus, macrodissected i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lymph nodes are crucial for perioperative immunotherapy but have to be completely resected in surgery. Trials evaluating the safety and necessity of omitting systemic mediastinal lymph node (mLN) dissection in non-small cell lung cancer (NSCLC) are still absent.
METHODS: cN0/N1 NSCLC patients who received neoadjuvant immunotherapy and radical surgery were retrospectively collected from three institutions. Restricted cubic spline regression and receiver operating characteristic curve were used to analyze the association between mLN dissection number and survival outcomes. Confoundi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptomeningeal disease (LMD) from solid tumors has a dismal prognosis, even following treatment with anti-PD-1 therapy. We perfo … ry endpoints included assessment of immune cells in the cerebrospinal fluid (CSF) using single-cell RNA-sequencing (scRNA-Seq) pre- and post-last treatment of Avelumab.
RESULTS: DLTs occurred in 2 patients, ie, adrenal insufficiency, hypothyroidism, and pneumonitis. Treatment-related toxicities occurred in 5 patients with grade 1/2 and 5 patients with gr …
СтатьяКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated encephalopathy (SAE) is a serious sepsis complication with high mortality. Animal models, including cecal ligation and puncture (CLP), lipopolysaccharide (LPS) injection, and peritoneal contamination and infection (PCI), are known to trigger distinct inflammatory responses with differential hippocampal impact. This study aimed to comprehensively compare the hippocampal transcriptomic profiles and validate key findings through independent experimentation. Transcriptomic datasets GSE253309 (CLP), GSE226120 (LPS), and GSE167610 (PCI) were retrieved from the GEO database. Bioinfo
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Rho-associated protein kinases (ROCKs) are a key regulator of T cell function, influencing a wide range of processes from acti … ssion profiles in the relevant immune functions were identified using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq).
RESULTS: The development of EAU was significantly attenuated and T cell activation and Th1 cell differentiation were significantly inhibited in mice with ripasudil (RIP-EAU) compared with mice with PBS (PBS-EAU), scRNA-seq using splenic T cells i …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-related lymphedema (CRL) is a common chronic complication following cancer treatment, characterized by impaired lymphatic … teraction (PPI) network analysis were employed to nominate hub genes. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data were used to localize candidate gene expression within immune and mesenchymal cell populations. The most promising biomarker was validated in clinical CRL tissues by Masson's trichrome staining and Western blotting, and Pearson correlation ana …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vitiligo is a common depigmentary disorder characterized by progressive melanocyte (MEL) loss. While T-cell activation is central to its pathogenesis, the role of macrophages remains poorly understood. This study characterizes macrophage heterogeneity and function in vitiligo using single-cell transcriptomic analysis and experimental validation.
METHODS: We analyzed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from healthy and vitiligo-affected skin to identify macrophage subpopulations. Computational analyses included cell subpopulation clustering, pseudotime trajectory inference,…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования