A comparative genetic study was undertaken on the testicular tissue of Drosophila with N-alpha-acetoxymethol-N-METHYLNITROSAMINE (AcODMN) an … othe compounds and this was more pronounced with the parent amine, which was in accordance with the DNA methylation mechanism. In contrast, the yield of the specific rDNA deletions was not markedly enhanced with the increased metabolic activity in the early germ cells, especially with the acetoxy derivative. The induction of these deletions could not, therefore, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex direct and indirect relationships between multiple variables, termed higher order interactions (HOIs), are characteristics of all natural systems. Traditional differential and network analyses fail to account for the omic datasets richness and miss HOIs. We investigated peripheral blood DNA methylation data from Kabuki syndrome type 1 (KS1) and control individuals, identified 2,002 differentially methylated points (DMPs), and inferred 17 differentially methylated regions, which represent only 189 DMPs. We applied hypergraph models to measure HOIs on all the CpGs and revealed difference…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dementia with Lewy bodies (DLB) is a common form of dementia with known genetic and environmental interactions. However, the underlying epigenetic mechanisms which reflect these gene-environment interactions are poorly studied. Herein, we measure genome-wide DNA methylation profiles of post-mortem brain tissue (Broadmann area 7) from 15 pathologically confirmed DLB brains and compare them with 16 cognitively normal controls using Illumina MethylationEPIC arrays. We identify 17 significantly differentially methylated CpGs (DMCs) and 17 differentially methylated regions (DMRs) between the groups…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dendritic cells (DCs) direct CD4(+) T-cell differentiation into diverse helper (Th) subsets that are required for protection against varied infections. However, the mechanisms used by DCs to promote Th2 responses, which are important both for immunity to helminth infection and in allergic disease, are currently poorly understood. We demonstrate a key role for the protein methyl-CpG-binding domain-2 (Mbd2), which links DNA methylation to repressive chromatin structure, in regulating expression of a range of genes that are associated with optimal DC activation and function. In the absence of Mbd…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Excision repair of ultraviolet damage in the DNA of normal and xeroderma pigmentosum (Groups C, D, and variant) cells was inactivated by exposure of cells to methyl methanesulfonate immediately before irradiation independent of the presence of 0 to 10% fetal calf serum. The inactivation could be represented by a semilog relationship between the amount of repair and methyl methanesulfonate concentration up to approximately 5 mM. The inactivation can be considered to occur as the result of alkylation of a large (about 10(6) daltons) repair enzyme complex, and the dose required to reduce repair t
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many attempts have been made to simplify tissue fixation and processing prior to hematoxylin and eosin (H&E) staining, immunohistochemistry (IHC) and genomic DNA extraction. The acetone-methyl benzoate-xylene (AMeX) method, is gaining popularity as an alternative to aqueous formaldehyde fixation followed by alcohol dehydration. We have assessed the efficacy of AMeX for the quality of extracted genomic DNA in addition to H&E and IHC in biopsy specimens of human oral mucosal lesions of size not more than 1 cm. H&E staining showed similar results when AMeX method was compared with conventional fi
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integration of human immunodeficiency virus type 1 DNA into the infected cell genome is one of the key steps of the viral replication cycle. Therefore viral enzyme integrase, which realizes the integration, is of interest as a target for new antiviral drugs. Conjugates of 11-mer single stranded oligonucleotides with hydrophobic molecules are shown to be efficient integrase inhibitors since they induce dissociation of the integrase-viral DNA complex. The effect of the oligonucleotide length and structure as well as the structure of hydrophobic molecules on the conjugate inhibitory activity has
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A paper/poly(methyl methacrylate) (PMMA) hybrid CD-like microfluidic SpinChip integrated with DNA probe-functionalized graphene oxide (GO) nanosensors was developed for multiplex quantitative LAMP detection (mqLAMP). This approach can simply and effectively address a major challenging problem of multiplexing in current LAMP methods.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA mismatch repair (MMR) stabilizes the cellular genome. Mice defective in the MMR gene PMS2 are susceptible to spontaneous thymic lymphoma and sarcomas. To determine the sensitivity of PMS2 knockout mice to environmental carcinogens and the protective effect of O6-methylguanine DNA methyltransferase (MGMT), heterozygous PMS2 knockout mice and human MGMT (hMGMT) transgenic mice were mated and the PMS2-/- and PMS2+/+ with or without hMGMT offspring were treated at 5 weeks of age with 50 mg/kg N-methyl-N-nitrosourea (MNU). MNU produces carcinogenic O6-methylguanine (O6-meG) adducts, resulting i
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lynch syndrome (LS) is a hereditary cancer predisposition syndrome caused by germline mutation of DNA mismatch repair (MMR) genes, most notably associated with colorectal cancer. Although LS patients face high risk of CRC, risk can vary even among those with the same pathogenic MMR germline mutations. We suggest a functional assay platform for assessing mutation risk using patient-derived organoid (PDOs). We measured organoid response to the cytotoxic effects of a methylating agent, N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine (MNNG) based on DNA damage-induced apoptosis. When normal (non-LS) colon or
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to study the biological activities of transitional metal complexes based on 4-acyl pyrazolone derivatives, two Mn complexes [Mn(HLa)(La)]·(CH3CN)1.5·H2O (1) and [Mn2(Lb)2(μ-EtO)2(EtOH)2] (2) (H2La = N-(1-phenyl-3-methyl-4-benzoyl-5-pyrazolone)-2-thiophenecarboxylic acid hydrazide, H2Lb = N-(1-phenyl-3-methyl-4-propenylidene-5-pyrazolone)-2-thiophenecarboxylic acid hydrazide) have been synthesized and characterized. Single crystal X-ray diffraction analysis indicated that 1 is a mononuclear complex and 2 exhibits a dinuclear centrosymmetric structure. Binding of the complexes with Herr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: In an attempt to analyze more profoundly aberrant DNA hypomethylation in epithelial ovarian cancer (EOC), we applied a novel genome-based approach which includes expression profiling following pharmacologic stimulation of DNA methylation with the methyl donor S-adenosyl-l-methionine (SAM).
METHODS: Four different EOC cell lines (OVCAR3, SKOV3, TOV21 and TOV112) were treated with SAM, and gene expression profiling was performed in SAM-treated and control EOC cells. Genes, downregulated upon SAM treatment were considered as potentially hypomethylated in EOC. DNA hypomethylation was i…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Collectively known as one-carbon metabolism (OCM), both the folate and methionine cycles are highly regulated to meet cellular demands. These cycles are key in the production and recycling of methyl groups to be used in many essential cellular processes such as the production of nucleotides, as well as S-adenosyl-l-methionine (SAM) the global methyl donor for DNA, RNA, and post translational modifications. Within the folate cycle, 5,10-methylenetetrahydrofolate is the main species through which methyl groups enter OCM. Therefore, 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR), which reduces
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microsatellite loci are usually considered to be neutral co-dominant and Mendelian markers. We undertook to study the inheritance of five microsatellite loci in the European Lyme disease vector, the tick Ixodes ricinus. Only two loci appeared fully Mendelian while the three others displayed non-Mendelian patterns that highly frequent null alleles could not fully explain. At one locus, IR27, some phenomenon seems to hinder the PCR amplification of one allele, depending on its origin (maternal imprinting) and/or its size (short allele dominance). DNA methylation, which appeared to be a possible …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Experimental intoxication models are used to study the more common sporadic form of Parkinson's disease (PD). 1-Methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine (MPTP) animal models of PD provide a valuable and predictive tool to probe the molecular mechanisms of dopamine neuronal cell death in PD. MPTP is a powerful neurotoxin that induces neuronal degeneration in the substantia nigra pars compacta and produces PD-like symptoms in several mammalian species tested, a feat not yet accomplished in genetically engineered mice expressing human genetic mutations. The mechanisms of MPTP-induced neurotox
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humans are unavoidably exposed to numerous different mutagenic DNA alkylating agents (AAs), but their role in the initiation of cancers is uncertain, in part due to difficulties in assessing human exposure. To address this, we have developed a screening method that measures promutagenic O6-alkylguanines (O6-AlkGs) in DNA and applied it to human DNA samples. The method exploits the ability of the Schizosaccharomyces pombe alkyltransferase-like protein (Atl1) to recognise and bind to a wide range of O6-AlkGs in DNA. We established an Atl1-based slot-blot (ASB) assay and validated it using calf t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic passes through the placenta and accumulates in the neuroepithelium of embryo, whereby inducing congenital malformations such as neur … inhibited not only the SA-induced cell apoptosis by up-regulating Bcl-2 level, but also the global DNA methylation by increasing the expressions of DNMT1 and DNMT3a. However, less significant difference was found between the embryos co-treated with SA and CHO (50 μg/μL) and the ones treated with SA alone. Taken together, these findings suggest that low dose CHO …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parathyroid tumors are common endocrine neoplasias associated with primary hyperparathyroidism. Although numerous studies have studied the subject, the predictive value of gene biomarkers nevertheless remains low.
METHODS: In this study, we performed genomic analysis of abnormal DNA methylation in parathyroid tumors. After data preprocessing, differentially methylated genes were extracted from patients with parathyroid tumors by using t-tests.
RESULTS: After refinement of the basic differential methylation, 28241 unique CpGs (634 genes) were identified to be methylated. The methy…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic imprinting is an epigenetic phenomenon restricting gene expression in a manner dependent on parent of origin. Imprinted gene products are critical regulators of growth and development, and imprinting disorders are associated with both genetic and epigenetic mutations, including disruption of DNA methylation within the imprinting control regions (ICRs) of these genes. It was recently reported that some patients with imprinting disorders have a more generalised imprinting defect, with hypomethylation at a range of maternally methylated ICRs. We report a cohort of 149 patients with a clin…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) poses a formidable challenge in the field of oncology because of its pronounced resistance to traditional therapeutic approaches. N6-methyladenosine (m6A) modification is a prevalent posttranscriptional modification that significantly influences cellular processes by modulating gene expression. However, the role of m6A in the regulation of the DNA damage response (DDR) in GBM cells remains unclear. Through integrated bioinformatics and functional studies, we identified the m6A reader YTHDF3 as a central regulator of the DDR in GBM, and the elevated expression levels of YTHDF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.