SARS-CoV-2 spike protein is continuously evolving, leading to new variants. While mutations in the receptor-binding domain (RBD) enhance binding to the ACE2 receptor and evade neutralizing antibodies, the function of mutations in the N-terminal domain (NTD) remains poorly understood. Using two independent methods, surface plasmon resonance (SPR) and cryo-EM, we show that NTD mutations increase the population of spike protein with the RBD in the "up" conformational state. SPR association and dissociation kinetics of spike binding to ACE2 and antibodies, analyzed using a coupled equilibrium mode
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting protein variant effects is a key challenge in preparing for pathogenic viral strains, understanding mutation-linked diseases, and designing new proteins. Protein sequence-structure-function relationships are difficult to model due to complex allosteric and epistatic effects. To investigate efficient modeling strategies, we trained supervised machine learning (ML) models with deep mutational scanning (DMS) libraries of SARS-CoV-2 receptor binding domain (RBD) sequences labeled with angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) binding affinity. These models demonstrate superior performance
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic has been driven by the emergence and spread of SARS-CoV-2 variants that confer a selective advantage over previously circulating strains. Estimating these selective advantages typically involves analyzing a large number of positive test samples through genomic sequencing. In this study, we present Covvfit, a statistical model and software package for estimating the fitness advantages of multiple competing variants using sequencing data derived from wastewater samples from different locations. We use our model to reconstruct the dynamics of variant competition across succe
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ongoing evolution of SARS-CoV-2 has generated variants with increased transmissibility and immune evasion, primarily driven by mutations in the receptor-binding domain (RBD). Recent Omicron sublineages, including JN.1, have multiple spike substitutions, including L455S, which is associated with antibody evasion and persists in descendant and currently circulating lineages. While live virus neutralization assays (VNTs) remain the gold standard for evaluating immune responses, their biosafety requirements and technical complexity limit large scale application, prompting an increased reliance
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The surface spike (S) protein of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a key target for the development of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) vaccines. Nevertheless, the mutations in the S protein, particularly in its receptor-binding domain region, have resulted in a reduced or complete loss of immunogenicity and/or protective efficacy in early vaccines against the Omicron variant and subvariants. Accordingly, continuous efforts are required to develop effective vaccines against multiple Omicron subvariants to reduce current and future threats. In this study, we des
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The COVID-19 pandemic has caused significant global mortality. Despite declining infection rates, new variants of SARS-CoV-2 continue to emerge, necessitating new prevention strategies.
OBJECTIVE: This study aimed to evaluate the effect of four over-the-counter (OTC) antiseptic mouthwash/gargling solutions in the U.S., compared with a distilled water control, on SARS-CoV-2 viral load across multiple oral and oropharyngeal sample types.
METHODS: This pilot single-center randomized controlled clinical trial enrolled adults in the San Francisco Bay Area, California, who tested posit
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saponin C (also known as DT-13) is the dominant ingredient extracted from the tuber of Liriope muscari (Decne.) L. H. Bailey, which exhibits multiple pharmacological activities, including anti-tumor, anti-thrombotic, cardioprotective and anti-inflammatory effects. However, its antiviral potential remains unexplored. This study aimed to investigate the inhibitory activity and underlying mechanisms of Saponin C against both influenza A virus (IAV) and SARS-CoV-2. In vitro experiments demonstrated that Saponin C dose-dependently inhibited IAV replication in MDCK and A549 cells. Time-of-addition a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omicron SARS-CoV-2 has diversified into multiple sub-lineages, complicating assessment of their intrinsic phenotypes due to background population immunity. We compare replication and biological characteristics of variants from BA.1 to JN.1 using human bronchial and lung explants, airway organoids, colon cells, and proximal intestinal enteroids. XBB.1.5 and EG.5.1 achieve higher replication titres in respiratory tissues than BA.2.86 and JN.1, indicating enhanced respiratory fitness. EG.5.1 displays dual cell-entry pathways and greater replication in alveolar epithelial cells, supporting increas
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Опубликованное исправлениеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 infection remains a global health threat, yet its pathogenic mechanisms are incompletely understood. Here, we show that viral nucleocapsid protein (NP) is detectable in the serum of patients with SARS-CoV-2 infection independently of viral RNA. Using virus-like particle (VLP) systems and in vitro infection models, we demonstrate that NP is secreted in a vesicle-free form via type I unconventional protein secretion (UPS) pathway. This process is regulated by NP phosphorylation and oligomerization, coordinated by viral structural proteins, and dependent on membrane components includin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Maoto () is a traditional Japanese Kampo formula composed of four crude drugs-Ephedrae Herba, Armeniacae Semen, Cinnamomi Cortex, and Glycyrrhizae Radix-and has been used to treat febrile viral illnesses. Among these, Ephedrae Herba has been associated with antiviral activity in previous studies. However, little is known about the effects of Ephedrae Herba on viral infection, spike (S) protein-mediated syncytium formation (cell-cell fusion), and viral enzymes, or the specific metabolites underlying these activities. In this study, we focused on Ephedrae Herba and comparatively ev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circadian rhythms, driven by 24-h molecular oscillators, or "clocks", widely tune physiology to the daily rhythms of light and dark to enhance organismal fitness. In mammals, the cellular immune response is tightly regulated by these rhythms such that immunometabolic output is coordinated across the day, consolidating macrophage physiology into temporally distinct phases that determine the macrophage response to stimuli. Importantly, key proteins in the macrophage response to viral infection have been found to be under circadian control, and time of day of adjuvant application is known to affe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While Chile achieved one of the world's highest and most equitable SARS-CoV-2 vaccination coverages during the pandemic, less is known about the post-pandemic stage. This study examines within-country geospatial disparities in COVID-19 vaccination uptake and their socio-demographic determinants in two urban areas of Chile. A population-based survey conducted in May 2024 collected individual data on vaccination status and socio-demographic characteristics. These were georeferenced and linked to census information at the household block level. Spatial analyses explored clustering and correlation
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) evolution reduces the efficacy of prophylactic vaccines and monoclonal antibody (mAb) therapies. To evaluate potency and breadth, receptor binding domain (RBD)-targeting neutralizing mAbs were identified from patient B cells using an Omicron KP3.1.1 Spike (S) protein bait. MAbs exhibiting the greatest neutralization potency (1332D4 and 1332E5) and binding breadth (1324A10 and 1316C10) were evaluated in greater detail. Cryo-electron microscopy (Cryo-EM) studies revealed 1332D4 and 1332E5 target RBD residue segments 439-446 and 498-506
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current respiratory vaccines face two major obstacles: limited breadth of protection and insufficient induction of mucosal immunity. Here, we present a neonatal Fc receptor (FcRn)-targeted mucosal delivery strategy integrating computational antigen design to address both challenges. Using severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) as a model virus, we employed Epigraph to generate T cell epitope-optimized consensus sequences for the receptor-binding domain (RBD) and incorporated them into a modified human IgG1 Fc framework engineered for enhanced FcRn binding, yielding a sing
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A CsPbBr3@SiO2-Aushell nanoprobe enables trimodal (colorimetric/fluorescent/photothermal) lateral flow immunochromatographic assay for SARS-CoV-2 IgG detection. This multi-signal approach offers environmental adaptability and internal cross-verification, with the photothermal mode achieving the highest sensitivity (LOD: 0.4 ng mL-1). The work presents a robust strategy for sensitive point-of-care testing.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study investigates age-related immune differences during two SARS-CoV-2 epidemic phases and evaluates the neutralizing responses to the wild-type (WT) strain and XBB.1.5 following natural infection and vaccination.
METHODS: Throat swab and serum samples were collected from confirmed COVID-19 patients and contemporaneous healthy controls across different age groups during the B.1.1 and XBB epidemic peaks in Hebei Province, China. Serum immunoglobulin M (IgM) and immunoglobulin G (IgG) antibodies, viral load, key cytokines and variant-specific neutralizing capacity against WT a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the COVID-19 pandemic is no longer considered an emergency, the ongoing spread of the virus poses a persistent threat to public health. COVID-19 poses a challenge to the system due to the risk of saturation and the associated economic burden. To assess changes in the anti-SARS-CoV-2 antibody profile, we analyzed nine batches of intravenous immunoglobulin (IVIG) prepared from plasma samples collected between November 2020 and June 2023. Antibody changes against SARS-CoV-2 spike, nucleocapsid, and membrane proteins, and neutralizing antibodies were measured. Antibody titers against wild
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic epidemiology has transformed the way public health scientists detect, monitor, and respond to infectious disease threats such as SARS-CoV-2 on a global scale. Early in the COVID-19 pandemic, vast inequities in whole-genome sequence data availability between high- and low-income countries were highlighted, but the persistence of these disparities five years into a global pandemic has not been quantified. Also, while it is generally known that genomic surveillance of SARS-CoV-2 largely declined following the end of the COVID-19 public health emergency, this has not been formally measured
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal antibodies (mAbs) are an emerging class of therapeutics for the prevention and treatment of viral infections. Recent advances in mRNA/lipid nanoparticle (LNP) technology provide a promising new modality for the production of mAbs in vivo, potentially bypassing the need for recombinant manufacturing of mAb proteins. In this study, we compared traditional infusion of protein-based neutralizing mAbs targeting severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) or influenza viruses to mRNA/LNP-based production of mAbs in treated mice. High serum concentrations of mAbs were achi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.