Cisplatin resistance presents a significant challenge in cancer therapy, emphasizing the necessity for identifying new regulatory elements that influence drug response. Recent research has revealed the importance of long noncoding RNAs (lncRNAs) in chemotherapy resistance, with LINC02381 identified as a potential regulatory factor. Through an in-depth bioinformatics analysis, we investigated the impact of LINC02381 on cisplatin resistance in ovarian cancer across various datasets. By conducting differential expression analysis, survival analysis, gene set enrichment analysis (GSEA), and constr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV (human immunodeficiency virus) presents a global health crisis, causing significant AIDS-related deaths and over one million new infections annually. The curbing of HIV is an intricate and continuously evolving domain, marked by numerous challenges, including drug resistance and the absence of a significant cure or vaccine because of its mutating ability and diverse antigens in its envelope, prompting research for functional cures and long-term remission strategies. The endeavor to devise an HIV vaccine capable of eliciting robust and broadly cross-reactive humoral and cellular immune resp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori is a gram-negative bacterium that persistently infects the human stomach, leading to peptic ulcers, gastritis, and an increased risk of gastric cancer. The extremophilic characteristics of this bacterium make it resistant to current drug treatments, and there are no licensed vaccines available against H. pylori. Computational approaches offer a viable alternative for designing antigenic, stable, and safe vaccines to control infections caused by this pathogen. In this study, we employed an immunoinformatic strategy to design a set of candidate multi-epitope subunit vaccines
СтатьяОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to explore biomarkers linked to the progression from non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) to hepatocellular carcinoma (HCC) and their therapeutic potential. Using bioinformatics, we identified key differentially expressed genes from various databases, focusing on genes related to NAFLD, non-alcoholic steatohepatitis, liver cirrhosis, and HCC. Among the upregulated genes, baculoviral IAP repeat containing 5 (BIRC5), cyclin B1 (CCNB1), cyclin-dependent kinase 1 (CDK1), and DNA topoisomerase II alpha (TOP2A) were found to be significant. In vivo and in vitro models of NAFLD a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simian Virus (SV) 40 is a DNA virus that remains dormant in the body but occasionally induces tumours in animals. Evidence indicates that SV40 could be crucial in developing certain human cancers. There is no commercial vaccine available against SV40. Our study uses a reverse vaccinology strategy to design a vaccine containing the viral Major capsid protein VP1 protein of the Simian virus's B and T-cell epitopes. Eleven MHC-I restricted, ten MHC-II restricted, and five B-cell specific epitopes were prioritised for the design of vaccine model, based on non-allergenicity as a crucial feature and
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chandipura virus (CHPV) is endemic in India, with frequent outbreaks reported. No approved medicines or vaccines exist for CHPV. We aimed to develop a multi-epitope vaccine for CHPV using immunoinformatics approaches. In this study, a multi-epitope vaccine construct was developed by combining 11 CTL epitopes, 2 HTL epitopes, and 1 linear B-cell epitope from glycoprotein (G) with 1 EAAAK linker, 10 AAY linkers, 2 GPGPG linkers, 1 KK linker, and adjuvant (RS-09 peptide). We predicted and optimized the vaccine's protein structure. Furthermore, the vaccine 3D structure was docked with Toll-like re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enzalutamide (Enz) is employed in the management of castration-resistant prostate cancer (CRPC). However, a substantial subset of patients may develop resistance to Enz, thereby reducing its therapeutic effectiveness. The underlying mechanisms contributing to the development of Enz resistance in PCa, whether arising from androgen deprivation or the burden of Enz treatment, remain inadequately understood. OPRK1 plays a key role in Enz resistance through ferroptosis inhibition, which is detected by the analysis of Gene Expression Omnibus (GEO) databases. Silencing OPRK1 via small interfering RNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TMBIM6, a transmembrane BAX inhibitor motif containing six proteins, is correlated with tumor progression and metastasis. While its correlation in several malignancies has been shown, its expression in prostate adenocarcinoma (PRAD) is unclear. In this work, we explored, using integrated bioinformatics, a novel ceRNA network of TMBIM6 involved in PRAD prognosis. According to TCGA and GEO datasets, we proposed a new TMBIM6/hsa-miR-222-3p/DHRS4-AS1 ceRNA axis associated with PRAD prognosis. The network was estimated by differential expression, correlation, and survival analysis. Co-expression an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PE is a serious form of pregnancy-related hypertension. Hypoxia can induce cellular dysfunction, adversely affecting both the infant and the mother. This study aims to investigate the relationship between HRGs and the diagnosis of PE, seeking to enhance our understanding of potential molecular mechanisms and offer new perspectives for the detection and treatment of the condition. A WGCNA network was established to identify key genes significantly associated with traits of PE. LASSO, SVM-RFE, and RF were utilized to identify feature genes. Calibration curves and DCA were employed to assess the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microtia is a congenital malformation characterized by underdevelopment of the external ear. While chondrocyte dysfunction has been implicated in microtia, the specific cellular abnormalities remain poorly understood. This study aimed to investigate mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes using single-cell RNA sequencing. Cartilage samples were obtained from patients with unilateral, non-syndromic microtia and healthy controls. Single-cell RNA sequencing was performed using the 10 × Genomics platform. Bioinformatic analyses including cell type identification, trajectory analysis, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial dysfunction is a well-recognized pathological feature of Duchenne Muscular Dystrophy (DMD). The potential regulatory role of mitochondria-related genes (MRGs) in DMD remains to be further explored.
METHODS: GEO datasets and MRGs were used to analysis mitochondrial scores and evaluate patients' immunological characteristics. Weighted gene co-expression network analysis, differentially expressed genes (DEGs) and MRGs were used to identify hub genes. A specific hub gene was selected, and the effects of this gene overexpression on a horse serum (HS) treated C2C12 cell in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Traditional Chinese medicine and food deer antler has been extensively used in bone regeneration, but its molecular mechanisms remain poorly understood. Preliminary investigations suggest deer antler contains bioactive compounds that influence osteogenic differentiation and immune microenvironments.
PURPOSE: To elucidate the molecular mechanisms of deer antler in promoting human mesenchymal stem cell (hMSC) osteogenic differentiation, focusing on JUN downregulation and immune microenvironment modulation using bioinformatics and molecular docking approaches.
METHODS: Chemical comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study explores the prognostic value of the CLEC4E gene in systemic lupus erythematosus (SLE) through bioinformatics analysis and evaluates its role in disease diagnosis and progression.
METHODS: Gene expression datasets related to SLE (GSE17755, GSE50772, and GSE61635) were obtained from the GEO (Gene Expression Omnibus) database. Intersection analysis was performed using the Jvenn tool with a screening threshold of |log2FC| > 1 and P< 0.05 to identify differentially expressed genes (DEGs). The resulting DEGs were then cross-referenced with immune-related genes in the GeneCard
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a heterogeneous autoimmune disorder, systemic lupus erythematosus (SLE) involves poorly characterized etiological mechanisms and disease pathways. While glycosylation's impact on immune homeostasis and disease pathogenesis has become a focal point in contemporary research, delineating the specific contribution of associated genes to SLE requires expanded investigation. This study uses bioinformatics methods to explore the potential diagnostic value of glycosylation-related differentially expressed genes (GRDEGs) in SLE and verify their differential expression in peripheral blood between pat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Primary Sjögren's disease (pSD) is a chronic autoimmune disease with significant heterogeneity. Pyroptosis, a highly inflammatory programmed cell death, plays a key role in autoimmune diseases, including pSD. However, the role and mechanisms of pyroptosis-related genes (PRGs) in pSD remain unclear.
METHODS: This study integrated bioinformatics approaches to analyse gene expression datasets from Gene Expression Omnibus. Differentially expressed genes were identified, followed by weighted gene co-expression network analysis and functional enrichment analysis. Multi-model machine lea
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gout is an inflammatory disorder triggered by the deposition of monosodium urate (MSU) crystals in joints and periarticular tissues. PANoptosis, a recently identified form of inflammatory cell death, remains uncharacterized in gout pathogenesis. This study aims to identify PANoptosis-related genes that may drive gout progression.
METHODS: Gout-related datasets, including the human cohort (GSE160170) and murine model (GSE190138), were retrieved from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) were screened using thresholds of |log2 fold change
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hashimoto's thyroiditis (HT) is the most common organ-specific autoimmune disease, and its etiology may be related to genetic, environmental, and epigenetic factors. However, its exact pathogenesis remains elusive.
METHODS: In this study, single-cell transcriptomic sequencing and bioinformatics analysis were performed on the thyroid tissues of six HT patients, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of four HT patients, and normal thyroid tissue of one healthy control. A panoramic single-cell atlas of HT was constructed to explore changes in the abundance of different cell subs
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trypanothione reductase (TryR) is a unique and key redox protein of Leishmania donovani, the causative agent of visceral Leishmaniasis. In this work, we have developed a promising multiepitope vaccine using TryR. Multiple epitopes from TryR were identified using different bioinformatics tools to stimulate both humoral and cellular immune responses. An adjuvant was also included to enhance the antigen presentation and immune activation. Using bioinformatics tools, immunodominant T-cell and B-cell epitopes of TryR were predicted, and based on the findings, a chimeric multi-epitope vaccine constr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) causes adult T-cell leukemia (ATL) and HTLV-1-associated myelopathy (HAM) after a long latent period in a fraction of infected individuals. These HTLV-1-infected cells typically have phenotypes similar to that of CD4+T cells, but the cell status is not well understood. To extract the inherent information of HTLV-1-infected CD4+ cells, we integratively analyzed the ATAC-seq and RNA-seq data of the infected cells. Compared to CD4+T cells from healthy donors, we found anomalous chromatin accessibility in HTLV-1infected CD4+ cells derived from ATL cases
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To discover microRNA (miRNA)-RNA transcript interactions dysregulated in brains from persons with HIV-associated neurocognitive disorder (HAND), we investigated RNA expression using machine learning tools.
DESIGN: Brain-derived host RNA transcript and miRNA expression was examined from persons with or without HAND using bioinformatics platforms.
METHODS: By combining next generation sequencing, droplet digital (dd)PCR quantitation of HIV-1 genomes, with bioinformatics and statistical tools, we investigated differential RNA expression in frontal cortex from persons without HIV [HIV
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования