Successful application of cross-linking combined with mass spectrometry for structural proteomics demands specifically designed cross-linking reagents to address challenges in the detection and assignment of cross-links. A combination of affinity enrichment, isotopic coding, and cleavage of the cross-linker is beneficial for detection and identification of the peptide cross-links. Here we describe a novel cross-linker, cyanurbiotindipropionylsuccinimide (CBDPS), that allows affinity enrichment of cross-linker-containing peptides with avidin. Affinity enrichment eliminates interfering non-cross…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A block catiomer polyplex, showing a high stability in the extracellular medium and an efficient release of plasmid DNA (pDNA) in the intracellular compartment, was developed by controlling both the cationic charge and disulfide cross-linking densities of the backbone polycations. Poly(ethylene glycol)-poly(L-lysine) block copolymer (PEG-PLL) was thiolated using either of two thiolation reagents, N-succinimidyl 3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP) or 2-iminothiolane (Traut's reagent), to investigate the effects of both the charge and disulfide cross-linking densities on the properties of the p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have used bifunctional reagents to examine the subunit composition of the non-DNA-binding form of the rat and human glucocorticoid receptor. Treatment of intact cells and cell extracts with a reversible cross-linker, followed by electrophoretic analysis of immunoadsorbed receptor revealed that three proteins of apparent approximate molecular masses, 90, 53 and 14 kDa are associated with the receptor. The first of these was identified immunochemically as a 90-kDa heat-shock protein (hsp90). The complex isolated from HeLa cells contained 2.2 mol hsp90/mol steroid-binding subunit. Cross-linkin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of 10 bifunctional cross-linking agents and four monofunctional analogues was studied on isolated adipocytes. [125I]Insulin binding and degradation, basal and insulin-stimulated glucose oxidation, and 3-O-methyl glucose uptake were measured. Two cross-linkers, which possess succinimide ester residues (disuccinimidyl suberate and dithiobis(succinimidyl propionate)) and react selectively with amino groups, appeared to react relatively specifically with the insulin receptor. Both produced a slight stimulation of basal glucose transport and metabolism, a marked inhibition of insulin-sti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Affinity cross-linking of membrane bound 125I-interleukin-6 (IL-6) on several cell lines revealed a three-band pattern of IL-6-containing cross-linked complexes with molecular masses of 100, 120, and 150 kDa. To identify the membrane components that were associated with IL-6 in the three complexes, we employed the Denny-Jaffe reagent, a heterobifunctional, cleavable cross-linker that allows the transfer of 125I from the ligand to its receptor. Samples cross-linked with Denny-Jaffe reagent were analyzed by two-dimensional SDS-polyacrylamide gel electrophoresis in which the cross-linker was clea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A component of the stator of the yeast ATP synthase (subunit 4 or b) showed many cross-linked products with the homobifunctional reagent dithiobis[succinimidyl propionate], which reacts with the amino group of lysine residues. The positions in subunit 4 that were involved in the cross-linkings were determined by using cysteine-generated mutants constructed by site-directed mutagenesis of ATP4. Cross-linking experiments with the heterobifunctional reagent p-azidophenacyl bromide, which has a spacer arm of 9 A, were performed with mitochondria and crude Triton X-100 extracts containing the solub
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The organization of proteins in the chromatophore membrane, particularly of the reaction center and the light-harvesting polypeptide, was examined by the use of a hydrophobic and a hydrophilic cross-linking reagent, namely DSP (dithiobis-succinimidyl propionate) and glutaraldehyde. The linkage of proteins was studied by SDS polyacrylamide pore gradient electrophoresis. DSP was shown to link proteins within the core of the membrane. The subunit H of the reaction center is linked with DSP at a low concentration, either with itself or with other membrane proteins but not to the subunits M and L.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Corneal cross-linking (CXL) has emerged as an important therapeutic strategy for enhancing the biomechanical stability of corneal tissues. Originally introduced to slow or halt the progression of keratoconus (KC), its indications have expanded to include a variety of corneal ectatic and infectious disorders, alongside a growing interest in scleral reinforcement for progressive myopia. Recent advances in cross-linking technologies focused on optimizing reagent formulations, refining delivery strategies, and incorporating functional biomaterials such as nanoparticles, hydrogels, and microneedle-
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three different cleavable photoactivable heterobifunctional reagents have been synthesized and characterized by proton NMR, 13C NMR, mass spectroscopy, infrared spectroscopy, and thin-layer chromatography. They are the N-hydroxysuccinimide ester of 3-[(4-azidophenyl)dithio]-propionic acid, methyl 3-[(4-azidophenyl)dithio]propionimidate, and N-[(4-azidophenyl)thio]phthalimide. Concanavalin A was coupled with one of the reagents, the N-hydroxysuccinimide ester of 3-[(4-azidophenyl)dithio]propionic acid, and radioiodinated. The [125I]lectin derivative and [125I]lectin showed similar specific bind
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various strategies were proposed to toughen elastomers; however, they usually result in high hysteresis, particularly for those toughened by introducing sacrificial bonds. To overcome the trade-off relationship between toughness and hysteresis, here poly(benzyl acrylate) elastomers were synthesized using poly(γ-benzyl-l-glutamate)-based peptide cross-linkers. The α-helical peptide segments introduced into the polymeric network act like molecule-sized springs. They absorb energy when loaded but return it when unloading. Therefore, the peptide-cross-linked elastomer exhibits enhanced toughness a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To fully leverage the potential of lignin for capturing radioactive iodine, this study first involved cross-linking lignin using the nitrogen-rich cross-linking agent diethylenetriamine to obtain a modified product. Subsequently, we employed electrospinning technology to transform the modified product into a fibrous, thereby enhancing lignin's solvent stability and broadening its application scope. Notably, we introduced COF growth sites, para-phenylenediamine (Pa), into the spinning solution. Finally, the Pa-containing nanofibers were reacted with the COF growth ligand 1,3,5-tri(4-formylpheny
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The preparation of lignin-based adhesives from sustainable lignin sources has garnered increasing attention from many researchers in recent years. However, developing high-performance and environmentally friendly lignin-based adhesives through a simple and efficient approach remains a significant challenge. In this study, aminated corn stover lignin (ACSL) was prepared by aminating corn stover lignin (CSL) using glutaraldehyde and ethylenediamine. Subsequently, ACSL was covalently crosslinked with trimethylolpropane triglycidyl ether (TMPEG) through simple stirring at room temperature to fabri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Murine mammary tumor virus protein interactions in the intact virion structure were studied with the use of the cleavable cross-linking reagents dithiobis(succinimidyl propionate) and methyl 4-mercaptobutyrimidate hydrochloride. Cross-linked oligomeric complexes of murine mammary tumor virus proteins were analyzed by two-dimensional gel electrophoresis. Among the complexes most consistently formed were a heterodimer of the two glycoproteins gp36 and gp52, the homodimer of gp36, and the homotrimer of gp52. A very prominent oligomer formed at higher concentrations of dithiobis(succinimidyl propi…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plates for internal fixation fabricated from biodegradable polymers degrade via an autocatalytic route. When they are used in bone implants of significant size and thickness, hollowing of the implant may occur while the overall dimensions appear unchanged. We hypothesized that incorporation of a cross-linked polypropylene fumarate matrix into polylactide-co-glycolide bone plates may provide an internal molecular network which prevents implant collapse. Cross-linking reagents of varying hydrophilicity including N-vinylpyrrolidone (VP), hydroxyethylmethacrylate (HEMA), and ethyleneglycol dimetha…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vacuolar (H(+))-ATPases (or V-ATPases) are structurally related to the F(1)F(0) ATP synthases of mitochondria, chloroplasts and bacteria, being composed of a peripheral (V(1)) and an integral (V(0)) domain. To further investigate the arrangement of subunits in the V-ATPase complex, covalent cross-linking has been carried out on the V-ATPase from clathrin-coated vesicles using three different cross-linking reagents. Cross-linked products were identified by molecular weight and by Western blot analysis using polyclonal antibodies raised against individual V-ATPase subunits. In the intact V(1…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A convenient one-pot approach for the synthesis of aryl sulfides through the coupling of thiols with Grignard reagents in the presence of N-chlorosuccinimide is described. The sulfenylchlorides were formed when thiols were treated with N-chlorosuccinimide, and the resulting sulfenylchlorides were then directly reacted with Grignard reagents to provide aryl sulfides in good to excellent yields under mild reaction conditions. Functional groups including ester, fluoro, and chloro are tolerated by the reaction conditions employed. It is important to note that this method has a short reaction time
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Upon exposure to ionizing radiation, DNA undergoes a variety of modifications including the production of a covalent bond between the nucleobase thymine and aromatic amino acids. In this work, electrospray ionization-mass spectrometry(ESI-MS) was used to identify the gamma radiation-induced covalent cross-linking of model peptides (sequence YPPW and pYPPW) with the nucleobase thymine. Tandem electrospray ionization-mass spectrometry (ESI-MSn) was employed to investigate the cross-linking sites. The results showed that irrespective of whether tyrosine was phosphorylated or not, the nucleobase t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Calmodulin serves as a calcium-dependent regulator in many metabolic pathways and is known to bind with high affinity to various target prot … interacting regions within the complex involves conjugation of calmodulin and melittin with several cross-linking reagents possessing different specificities and spacer lengths, followed by enzymatic proteolysis of the cross-linked complex. The highly complex peptide mixtures were subsequently analyzed by nano-HPLC, which was online coupled to a FTICR mass spectrometer …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ricin A chain immunotoxins disulfide cross-linked with conventional, sterically unhindered reagents have unsatisfactorily short circulating life times in vivo. (Acetylthio)succinic anhydride, a thiolating reagent with partial steric hindrance of the sulfur atom, does not remedy this situation. Sulfosuccinimidyl N-[3-(acetylthio)-3-methylbutyryl]-beta- alaninate, a new cross-linker in which the carbon alpha to the sulfur is doubly methylated, creates disulfide bonds 2 orders of magnitude more resistant to reduction than unhindered disulfides. Nevertheless, this deactivated thiolating agent rapi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования