Large biobank samples provide an opportunity to integrate broad phenotyping, familial records, and molecular genetics data to study complex traits and diseases. We introduce Pearson-Aitken Family Genetic Risk Scores (PA-FGRS), a method for estimating disease liability from patterns of diagnoses in extended, age-censored genealogical records. We then apply the method to study a paradigmatic complex disorder, major depressive disorder (MDD), using the iPSYCH2015 case-cohort study of 30,949 MDD cases, 39,655 random population controls, and more than 2 million relatives. We show that combining PA-…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidemiological studies demonstrated that adverse in utero environment was associated with increased risk of offspring high bloo … mapping method called mixture-adjusted intersect-union pleiotropy test. Furthermore, we conducted a genetic risk score (GRS)-based Mendelian randomization analysis in parent-offspring pairs (n = 6031) of the UK Biobank cohort, to assess the causal relation between maternal-specific GRS and blood pressure conditioning on fetal genotypes.
RESULTS: We found fetal-spec …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cardiovascular disease (CVD) prediction models for persons living with HIV (PLWH) depend on traditional CVD risk factors, but these underestimate true risk. We aimed to identify proteins and genetic variants and create proteo-genomic risk scores for CVD in PLWH.
METHODS: We analyzed genetic and protein data from participants involved in trials for PLWH. We used state-of-the-art statistical methods for data integration, identified correlated signatures, and developed a protein score (PS) and a genetic score (GS) to predict CVD. We conducted functional enrichment analysis to explore
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Familial dysbetalipoproteinemia (FD) is an autosomal recessive (rarely dominant) inherited disorder that is almost exclusively a … thin APOE; P < 0.0005 and rs964184 within ZPR1/APOA5/A4/C3/A1 gene cluster; P < 0.0001). Unweighted genetic risk scores - from these two SNPs (GRS2), and, also, additional 13 SNPs with P-value below 0.9 (GRS15) - were created as an additional tool to improve the risk estimation of FD development in subjects with the APOE2/E2 genotype. Both GRS2 and GRS15 were signif …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A genetic risk score (GRS) was developed for predicting fracture risk based on the prevalence of vertebral fractures in 441 Japanese females with osteoporosis. A total of 979 (858 nonsynonymous and 121 silent) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) located in 74 osteoporosis-susceptibility genes were genotyped and evaluated for their association with fracture prevalence. Four SNPs (protein kinase domain containing, cytoplasmic [PKDCC; rs4952590], CDK5-regulatory subunit-associated protein 1-like 1 [CDKAL1; rs4712556], wingless-type MMTV-integration site family member 16 [WNT16; rs2707466], and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Patients with inflammatory bowel disease (IBD) have a higher prevalence of various immune and non-immune comorbidities. Whether this reflects shared genetic susceptibility or is an effect of chronic inflammation remains unclear.
METHODS: We systematically assessed genetic risk underlying 20 IBD-comorbidity associations using polygenic risk scores (PRS) in 853 patients with IBD (542 Crohn's disease, 311 ulcerative colitis) and 4333 non-IBD controls from the Mass General Brigham Biobank. PRS were generated by clumping-and-thresholding approach in PLINK2.0 using largest avai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trainees in US Army basic combat training (BCT) frequently experience vitamin D deficiency and bone stress injuries. It remains unclear how genetic variation influences these outcomes, either through direct effects on skeletal adaptations to training or by increasing susceptibility to vitamin D insufficiency, which in turn affects skeletal adaptations and injury risk. This study investigated whether single-nucleotide polymorphisms (SNPs) or genetic risk scores (GRS) previously related to vitamin D and bone health were associated with tibial bone microarchitecture during BCT. A cohort of 2,550 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cardiovascular diseases (CVD) prediction models for persons living with HIV (PLWH) depend on traditional CVD risk factors, but these underestimate true risk. We aimed to identify proteins and genetic variants and create proteo-genomic risk scores for CVD in PLWH.
METHODS: We analyzed genetic and protein data from participants involved in trials for PLWH. We used state-of-the-art statistical methods for data integration, identified correlated signatures, and developed a protein score (PS) and a genetic score (GS) to predict CVD. We conducted functional enrichment analysis to explor
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood-based biomarkers offer strong potential to revolutionize diagnosis, trial enrolment and treatment monitoring in Alzheimer's disease (AD). However, further advances are needed before these biomarkers can achieve wider deployment beyond selective research studies and specialty memory clinics, including the development of frameworks for optimal interpretation of biomarker profiles. We hypothesized that integrating Alzheimer's disease genetic risk score (AD-GRS) data would enhance the diagnostic value of plasma AD biomarkers by better capturing extant disease heterogeneity. Analysing 962 ind…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoporosis is influenced by both genetic and environmental factors, yet the relative contribution of the exposome remains unclear. This study aimed to systematically identify non-genetic exposures related to osteoporosis and develop an exposome risk score (ERS) to evaluate individual osteoporosis susceptibility.
METHODS: We conducted an exposome-wide analysis of 477,792 UK Biobank participants to identify key exposures associated with osteoporosis. The selected exposures were combined into a weighted Meta-ERS and validated in the Scotland/Wales cohort. The Meta-ERS was further c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hippocampal atrophy is frequently observed in neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease (AD) or hippocampal sclerosis of aging (HS-aging). Volume loss in the hippocampus is described as prodromal stage of dementia and has been associated with AD polygenic risk score (PRS). CA1 and subiculum atrophy have been suggested to be a promising in vivo biomarker for HS-aging. Recent studies suggest that some loci associated with AD may be more related to other brain diseases concomitant with AD. We aimed to find which significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The polygenic risk score (PRS) aggregates the effects of numerous genetic variants associated with a condition across the human genome and may help to predict late-onset Alzheimer's disease (LOAD). Most of the current PRS studies on Alzheimer's disease (AD) have been conducted in Caucasian ancestry populations, while it is less studied in Chinese.
OBJECTIVE: To establish and examine the validity of Chinese PRS, and explore its racial heterogeneity.
DESIGN: We constructed a PRS using both discovery (N = 2012) and independent validation samples (N = 1008) from Chinese population. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Previous epidemiological studies had inconsistent results regarding the relationship between blood lead level (BLL) and adiposity. … Diseases and Risk Factors (ChiCTR-ECS-14005052, www.chictr.org.cn). We calculated the weighted BMI genetic risk score (GRS) based on 29 variants that were identified and validated in East Asians. BLL was measured by atomic absorption spectrometry.
MAIN OUTCOME MEASURE: BMI was calculated, and BMI ≥25 kg/m2 was defined as overweight.
RESULTS: Multivariable logisti …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Obesity remains an epidemic associated with significant health consequences. Endoscopic sleeve gastroplasty (ESG) can lead to significant and sustained weight loss, with heterogeneous response. We previously reported a machine-learning (ML) assisted genetic risk score (GRS) for calories to satiation that predicts response to anti-obesity medications. Here, we evaluated the performance of novel GRSs for emotional hunger (EH), and calories to satiation (CTS, also high or low CTSGRS) to predict weight loss after ESG.
METHODS: Individuals treated with ESG at two separate endo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently, common genetic risk factors for intracranial aneurysm (IA) and aneurysmal subarachnoid hemorrhage (ASAH) were found to explain a large amount of disease heritability and therefore have potential to be used for genetic risk prediction. We constructed a genetic risk score to (1) predict ASAH incidence and IA presence (combined set of unruptured IA and ASAH) and (2) assess its association with patient characteristics.
METHODS: A genetic risk score incorporating genetic association data for IA and 17 traits related to IA (so-called metaGRS) was created using 1161 IA cases an…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Attention deficit hyperactive disorder (ADHD) is a highly heritable neurodevelopmental disorder, and excessive daytime sleepiness is frequently observed in ADHD patients. Excessive daytime sleepiness is also a core symptom of narcolepsy and essential hypersomnia (EHS), which are also heritable conditions. Psychostimulants are effective for the symptomatic control of ADHD (primary recommended intervention) and the two sleep disorders (frequent off-label use). However, the common biological mechanism for these disorders has not been well understood. Using a previously collected genome-wide assoc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Genetic variants associated with primary open-angle glaucoma (POAG) are known to influence disease risk. However, the clinical effect of associated variants individually or in aggregate is not known. Genetic risk scores (GRS) examine the cumulative genetic load by combining individual genetic variants into a single measure, which is assumed to have a larger effect and increased power to detect relevant disease-related associations.
OBJECTIVE: To investigate if a GRS that comprised 12 POAG genetic risk variants is associated with age at disease diagnosis.
DESIGN, SETTING, AND PART…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Integrating genetic and lifestyle information has the potential to greatly improve the prediction of colorectal cancer (CRC) risk. However, racial and ethnic minorities are generally underrepresented in gene-environment studies of CRC risk.
METHODS: We investigated the interplay of genetics and lifestyle on CRC risk in a prospective analysis of 68 397 African American, Japanese American, Latino, Native Hawaiian, and White individuals from the Multiethnic Cohort Study. Genetic predisposition was assessed using a 205-variant polygenic risk score. Lifestyle was assessed using a lifes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several genetic variants have been associated with the susceptibility to allergic disease in adults, but it remains unclear whether these genetic variants are also associated with the onset of allergic disease early in life. The aim of this study was to develop a genetic risk score (GRS) for allergy based on findings in adults and study its predictive capacity for allergy in children.
METHODS: A GRS was constructed based on 10 SNPs previously associated with allergies in adults. The GRS was tested in children who participated in a population-based newborn cohort (WHISTLER) and wer…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atopic dermatitis (AD) is a chronic inflammatory skin disease with high heritability, yet its genetic basis, especially in non-European populations, is not fully elucidated. To identify genetic variants associated with AD and to evaluate polygenic risk scores (PRS) for predicting AD risk, severity, and serum IgE levels in a Taiwanese Han population. We conducted a genome-wide association study (GWAS) using data from the China Medical University Hospital Biobank (1031 AD cases, 2106 controls). Two PRS models were developed: PRS_AD (AD risk) and PRS_IgE (IgE levels). The cohort was split into di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.