The nuclease ARTEMIS is an essential factor of V(D)J recombination during lymphocyte development and in the repair of DNA double-strand breaks (DSB) by the nonhomologous end joining (NHEJ) pathway. Patients with mutations in the DCLRE1C gene, which encodes ARTEMIS, suffer from radiosensitive B(-/low) T(-/low) severe combined immunodeficiency (SCID) or radiosensitive Omenn syndrome. To date, causative DCLRE1C mutations inherited as a recessive trait have been reported in 49 patients. In this study, molecular diagnoses of 29 novel patients presenting with the phenotype of B(-/low) SCID revealed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Childhood cancer radiation therapy (RT) increases subsequent neoplasm risk. Radiation dose may modulate DNA damage responses, but the small sample sizes of prior human studies of homologous recombination repair hampered dose-specific investigations. We pooled data for 12 180 survivors (8339 from the Childhood Cancer Survivor Study and 3841 from the St Jude Lifetime Cohort) to estimate associations between deleterious homologous recombination repair variants and RT-related subsequent neoplasms (most commonly breast cancer, meningioma, thyroid cancer, and sarcoma) using conditional logistic regr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Banana streak OL virus (BSOLV) is the primary species of banana streak virus (BSV) affecting banana production in South China. Reverse genetics is a powerful method for studying viral pathogenicity and the interactions between viruses and their hosts; however, no infectious clone of BSOLV has been reported until now. In this study, the BSOLV genome was amplified in overlapping segments to assemble 1.3 times full-length sequence. The resulting construct was then cloned into the yeast-Escherichia. Coli-Agrobacterium shuttle vector pCB301 via yeast homologous recombination, yielding the infectiou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a pathogen of globally significance in cattle that has two biotypes: non-cytopathogenic (non-cp) and cytopathogenic (cp). The cp biotype arises from the non-cp through genome rearrangements, which frequently involve the insertion of host cellular RNA sequences, often accompanied by viral genome duplications. Here, we performed a systematic analysis of insertions across all complete BVDV genomes available in GenBank. Despite a 10-fold increase in available sequences over the past 10 years (from 59 to 670), the repertoire of known rearrangements associated w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate prediction of Homologous Recombination Deficiency (HRD) is vital for personalized cancer therapy, yet genomic assays are often costly and complex. Predicting HRD from Hematoxylin and Eosin (H&E) stained whole-slide images (WSIs) via deep learning offers an alternative, but model generalization across diverse cancer types remains challenging. We developed a three-stage transfer learning framework to improve HRD prediction across cancer types. After establishing baseline models on data from eight cancer types, the TCGA-BRCA model was selected as a pretrained model for transfer learning
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SETD2-mediated H3K36me3 reprogramming is involved in homologous recombination (HR) repair; however, the dynamics of this repair process remain unclear. Here, we report that the scaffold protein menin, encoded by the Men1 gene, plays a crucial bridging role in H3K36-mediated HR repair. Genetic ablation of Men1 resulted in spontaneous lung carcinogenesis and was accompanied by severe genomic instability. Mechanistically, menin directly recognizes histone H2A.X via its Val371-Gln400 motif, and DNA damage markedly promotes the specific interaction between menin and γH2A.X. Subsequently, SETD2 is r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination deficiency (HRD) is a major genomic feature of several malignancies and provides a therapeutic rationale for DNA-damaging agents and PARP inhibitors. Beyond its role in genome instability, accumulating evidence suggests that HRD also reshapes the tumor microenvironment (TME). However, the immune consequences of HRD are not uniformly stimulatory. HRD-associated tumors may exhibit DNA damage-driven innate immune activation, increased interferon signaling, and enhanced antigen presentation, while simultaneously developing adaptive immune-evasive programs, including T-cell
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Along with BRCA mutation status, homologous recombination deficiency (HRD) testing is a prognostic and predictive biomarker for poly-ADP-ribose polymerase (PARP) inhibitor therapy indication in high-grade epithelial ovarian, fallopian tube, or peritoneal cancer. Approximately 50% of high-grade serous ovarian cancers exhibit HRD, even in the absence of germline or somatic BRCA1/2 loss-of-function mutations. In this scenario, access to a validated diagnostic HRD test can optimize treatment selection and increase the effectiveness of the intervention.
OBJECTIVE: To technically valida
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Knowing the homologous recombination deficiency (HRD) status in advanced epithelial ovarian cancer (EOC) is vital for patient management. HRD is determined by BRCA1/BRCA2 pathogenic variants or genomic instability. However, tumor DNA analysis is inconclusive in 15-19% of cases. Peritoneal fluid, available in > 95% of advanced EOC cases, could serve as an alternative source of cell-free tumor DNA (cftDNA) for HRD testing. Limited data show the feasibility of cancer panel gene testing on ascites cfDNA but no study, to date, has investigated HRD testing.
METHODS: We collected ascites
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin regulates spatiotemporal gene expression during neurodevelopment, but it also mediates DNA damage repair essential to proliferating neural progenitor cells (NPCs). Here, we uncover molecularly dissociable roles for nucleosome remodeler Ino80 in chromatin-mediated transcriptional regulation and genome maintenance in corticogenesis. We find that conditional Ino80 deletion from cortical NPCs impairs DNA double-strand break (DSB) repair, triggering p53-dependent apoptosis and microcephaly. Using an in vivo DSB repair pathway assay, we find that Ino80 is selectively required for homologou
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During somatic hypermutation (SHM) of Ig genes in germinal center B cells, lesions introduced by activation-induced cytidine deaminase are processed by multiple error-prone repair pathways. Although error-free repair by homologous recombination (HR) is crucial to prevent excessive DNA strand breakage at activation-induced cytidine deaminase off-target genes, its role at the hypermutating Ig locus in the germinal center is unexplored. Using B cell-specific inactivation of the critical HR factor Brca2, we detected decreased proliferation, survival, and thereby class switching of ex vivo-activate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Muir-Torre syndrome (MTS) is characterized by sebaceous neoplasms with internal malignancies and regarded as a variant of hereditary nonpolyposis colorectal cancer (HNPCC). Pathogenic variations of MTS have been identified in the MSH2, MLH1, and MSH6 genes, with the majority of variations located in MSH2.
OBJECTIVES: To present an MTS patient who was the only individual with skin malignancies within a cancer-prone pedigree and to show the usefulness of RNA-based genetic analysis in the investigation of MTS.
MATERIALS & METHODS: A 77-year-old man who had operated X-ray equipment a
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Resistance to adjuvant radiotherapy is a major cause of treatment failure in patients with glioblastoma (GBM). Autophagy inhibitors have been shown to enhance the efficacy of radiotherapy for certain solid tumors. However, current inhibitors do not penetrate the blood-brain-barrier (BBB). Here, we assessed the radiosensitivity effects of the antipsychotic drug trifluoperazine (TFP) on GBM in vitro and in vivo.
METHODS: U251 and U87 GBM cell lines as well as GBM cells from a primary human biopsy (P3), were used in vitro and in vivo to evaluate the efficacy of TFP treatment. Viabili
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinoblastoma is a childhood ocular tumor caused by the inactivation of both alleles of the retinoblastoma gene (Rb1). Without Rb1 gene function, chromosomal aberrations are observed in retinoblastoma cells. The instability of the genome is closely associated with the repair of DNA double-strand breaks (DSBs). However, the precise molecular mechanism of action of Rb1 in DNA DSB repair remains unclear. Thus, in this study, we aimed to investigate whether the Rb1 gene affects DNA stability by assaying DNA DSB repair and also whether it regulates the proliferation of retinoblastoma cells. Rb1 im
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitotic recombination is believed to play an important role in the development of many cancers. An improved system has been developed to detect reversion of an intragenic DNA duplication, as a model for intrachromosomal homologous recombination. The 'LNtd' strain of human fibroblasts, derived from a Lesch-Nyhan donor, produces no detectable hypoxanthine phosphoribosyltransferase (HPRT) activity due to a 13.7-kilobase-pair DNA insertion duplicating exons 2 and 3 of the HPRT locus. These cells are therefore sensitive to selection in HAT medium, against cells lacking functional HPRT enzyme. Clona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microplastics (MPs) alone or carrying organic contaminants (OCs) have been proven to exhibit a wide range of toxic effects on aquatic animals. Nevertheless, the impacts and mechanisms for co-exposure to MPs and OCs on vertebrate animals remain obscure. This study investigated the impact of clean and phthalate esters (PAEs)-spiked MPs on chicken by observing the egg-laying behavior, analyzing the levels of PAEs and their metabolites in eggs, as well as exploring the gene expression in ovaries. Results showed that 16 eggs were collected from the 10 %-spiked MPs group during depuration period tho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homologous recombination (HR) is crucial for maintaining genomic integrity and is tightly regulated, yet the role of ubiquitin-dependent degradation in HR proteins remains poorly understood. Through high-throughput screening for compounds that modulate the DNA replication stress response, we identify ML367 and its derivative, UNI418. Kinase profiling and detail molecular analyses reveal that UNI418 inhibits PIKfyve and PIP5K1C, reducing inositol hexaphosphate (IP6) levels and triggering Cul4A-dependent degradation of RAD51, CtIP, and CHK1. Further analysis identifies WDR5 as a DCAF protein tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cisplatin resistance remains a major limitation in the treatment of cervical cancer, with enhanced DNA damage repair contributing to reduced therapeutic sensitivity. The role of STAT5A in coordinating DNA double-strand break repair under therapeutic stress remains unclear. Here, we investigated the role of STAT5A in cisplatin responsiveness using clinical tissue analysis, CRISPR/Cas9-based genetic models, DNA repair assays, and xenograft models. STAT5A depletion sensitized cervical cancer cells to cisplatin, whereas STAT5A overexpression reduced cisplatin sensitivity. Mechanistically, STAT5A s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammation exerts context-dependent influences on tumor progression and therapeutic response. Although chemotherapy remains a cornerstone of cancer treatment, its functional interplay with inflammatory signaling is still incompletely understood. Here, we identify TANK-binding kinase 1 (TBK1) as a critical modulator of chemotherapeutic efficacy through its impact on DNA damage repair. TBK1 activation potentiates cancer-cell death induced by chemotherapeutic agents by promoting DNA damage and impairing homologous recombination (HR) repair. This effect occurs independently of canonical inflamma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA double-strand break repair via homologous recombination is critical for maintaining genomic integrity and requires proper DNA end resection. Here, we identify GNL3, a nucleolar GTP-binding protein, as a key regulator of homologous recombination in human cells via SUMOylation-dependent control of DNA end resection. Expression of wild-type GNL3, but not the SUMO-defective K196R mutant, abolished DNA damage induced by knockdown of endogenous GNL3. GNL3 interacts with the BLM-DNA2 helicase-nuclease complex, promoting DNA end resection and subsequent RPA and RAD51 loading. This interaction requ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования