Coccidioides immitis/Coccidioides posadasii are common causes of pulmonary infection in certain geographic areas, and are highly infectious when working with culture isolates in the laboratory. Rapid techniques to accurately identify this pathogen in tissues may be of benefit for diagnosis and in limiting the exposure of laboratory personnel to this agent. Locked nucleic acids (LNA) are modified nucleotides in which a ribonucleoside is linked between the 2'-oxygen and the 4'-carbon atoms with a methylene unit. LNA oligonucleotides exhibit increased thermal stability and make excellent probes f
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sabin type 3 polio vaccine virus is the most common cause of poliovaccine associated paralytic poliomyelitis. Vaccine associated paralytic poliomyelitis cases have been associated with Sabin type 3 revertants containing a single U to C substitution at bp 472 of Sabin type 3. A rapid method of identification of Sabin type 3 bp 472 mutants is described. An enterovirus group-specific probe for use in a chemiluminescent dot blot hybridization assay was developed to identify enterovirus positive viral lysates. A reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assay producing a 319 bp PCR p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid probes are very useful tools in biological and medical science. However, the essential sensing mechanism of nucleic acid probes was prone to the interference of surrounding sequences. Especially when the target sequences formed secondary structures such as hairpin or quadruplex, the nucleic acid probes were hindered from hybridizing with target strands, greatly disabled the function of probes. Herein, we have established an Open strand based strategy for eliminating the influence of secondary structures on the performance of nucleic acid probes. The strategy was general toward dif…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human genome's nucleotide sequence variation, such as single nucleotide mutations, can cause numerous genetic diseases. However, detecting nucleic acids accurately and rapidly in complex biological samples remains a major challenge. While natural deoxyribonucleic acid (DNA) has been used as biorecognition probes, it has limitations like poor specificity, reproducibility, nuclease-induced enzymatic degradation, and reduced bioactivity on solid surfaces. To address these issues, we introduce a stable and reliable biosensor called graphene oxide (GO)- threose nucleic acid (TNA). It comprises
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ward et al developed biotinylated probes to hasten virus nucleic acid detection. We used these probes to trace SV 40 and JC virus nucleic acids in PML brain. This procedure visualizes the hybridization of viral sequences by affinity cytochemistry with avidin-biotin peroxidase complexes and diaminobenzidine. In the PML frozen white matter numerous oligodendroglial nuclei hybridized with JC virus biotinylated and tritium labelled probes in areas adjacent to active demyelination. Although tritium labeled probes was most sensitive and gave lowest background this biotinylated method showed be usefu
Клинический случайАннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We constructed a measles virus genomic recombinant DNA library, and used clones coding for portions of the viral P, M and H proteins to probe for measles virus nucleic acid sequences in post-mortem multiple sclerosis, SSPE and control brains. By dot blot hybridization, the probes detected measles virus nucleic acid sequences in as little as 3 nanograms of total RNA extracted from measles virus-infected cells and also in highly diluted RNA extracted from SSPE brain, but did not detect measles virus sequences in RNA extracted from 11 multiple sclerosis or 8 control brains, even at a 1 000-fold h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid sequences specific for human cytomegalovirus (CMV) were found in samples of pancreatic tissue from patients with non-insulin-dependent (type 2) diabetes mellitus. RNA extracted from paraffin-embedded or fresh-frozen specimens from 14 of 32 (44%) diabetic patients but from none of 49 non-diabetic controls reacted with 10 kb (pJN201) or 6.6 kb (pCM3) probes of human CMV immediate-early or late gene products, respectively. The RNA from the 32 diabetic patients did not react with nucleic acid probes for mumps, rubella, or coxsackie B viruses. In-situ nucleic acid hybridisation on tiss…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, single particle inductively coupled plasma mass spectrometry (SP-ICP-MS) has become a powerful tool for biological quantitative analysis. Homogeneous analysis method requires no separation and washing steps, which is suited for the analysis of highly infectious pathogens, so as to reduce the risk of infection during the operation. SARS-CoV-2 spreads all over the world, and its early infection symptoms are similar to influenza, which brings inconvenience to triage. Therefore, developing novel analytical method for simultaneous detection of multiple viral nucleic acids is essent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complementarity between nucleic acids via Watson-Crick base pairing formulates the basic principle for designing hybridization probes but often suffers low sequence selectivity against single nucleotide mutations. Herein, we report mismatch-exchange as a new design principle that allows the highly sensitive and robust discrimination of single nucleotide polymorphisms (SNPs) by simply manipulating the number and position of mismatches in both probes and the reaction products. Leveraging mismatches to drive the strand-exchange and finetuning the specificity, mismatch-exchange is particularly adv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To detect contagious viral nucleic acids, traditional biosensors often require target amplification steps or use fluorescence and Raman probes tagged on nucleic acids, which are time-consuming, complex, and expensive. Recently, the CRISPR/Cas12a has received the attraction for development of nucleic acid biosensors, beyond its conventional role-like gene editing, but the enhancement of the sensitivity of CRISPR/Cas-based biosensors is still required to simplify the biosensing steps. Here, we develop a CRISPR/Cas12a-based electrochemical biosensor for the detection of viral nucleic acids in a s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid exposure to radiation and chemical insults leads to damage and disease. Thus, detection and understanding DNA damage is important for elucidating molecular mechanisms of disease. However, current methods of DNA damage detection are either time-consuming, destroy the sample, or are too specific to be used for generic detection of damage. In this paper, we develop a fluorescence sensor of 2-aminopurine (2AP), a fluorescent analogue of adenine, incorporated in the loop of a hairpin probe for the quantification of ultraviolet (UV) C-induced nucleic acid damage. Our results show that t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural nucleosides are nonfluorescent and do not have intrinsic labels that can be readily utilized for analyzing nucleic acid structure and recognition. In this regard, researchers typically use the so-called "one-label, one-technique" approach to study nucleic acids. However, we envisioned that a responsive dual-app nucleoside system that harnesses the power of two complementing biophysical techniques namely, fluorescence and 19F NMR, will allow the investigation of nucleic acid conformations more comprehensively than before. We recently introduced a nucleoside analogue by tagging trifluoro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida dubliniensis is an opportunistic fungal pathogen that has been linked to oral candidiasis in AIDS patients, although it has recently … y fluoresce when they are bound to their targets and have a significant advantage over conventional nucleic acid probes because they exhibit a higher degree of specificity with better signal-to-noise ratios. When applied to an unknown collection of 23 strains that largely contained C. albicans and a smaller amount of C. dubliniensis, the species-specific probes were …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the development of chemically modified peptide nucleic acids (PNAs) as probes for qualitative and quantitative detection of DNA. The remarkable stability of PNAs toward enzymatic degradation makes this class of molecules ideal to develop as part of a diagnostic device that can be used outside of a laboratory setting. Using an enzyme-linked reporter assay, we demonstrate that excellent levels of detection and accuracy for anthrax DNA can be achieved using PNA probes with suitable chemical components designed into the probe. In addition, we report on DNA-templated cross-linking of PNA
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three nucleic acid hybridization probes were derived from DNA clones of the poliovirus type 1 genome. Used in dot hybridization experiments, the probes successfully detected members of each of the major enteroviral subgroups. The hybridization patterns obtained with the three probes suggested that a highly conserved nucleotide sequence existed among the enteroviruses tested, mapping between bases 220 and 1809 in the poliovirus genome. Two new antiviral agents capable of inhibiting enterovirus replication in tissue culture were used to demonstrate the specificity of the probes for viral RNA.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-based nucleic acid detection technologies have revolutionized infectious disease detection and environmental monitoring by leveraging RNA-DNA complementarity to enable rapid, precise, and cost-effective detection of targets. However, achieving multitarget detection in one tube still presents challenges that necessitate further research. Here, we develop a nucleic acid detection module based on the CRISPR-Cas12i system. Importantly, we find that Cas12i and AapCas12b exhibit opposite trans-cleavage preferences for asymmetrically phosphorothioate-modified single-strand DNA probes, enabling
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A synthetic deoxyribonucleotide probe for virulent Listeria monocytogenes, designated ADO7, was evaluated for its ability to identify restriction fragments of L. monocytogenes with nucleic acid sequences homologous with the beta-hemolysin gene by Southern blot hybridization of clinical and food isolates. The synthetic probe hybridized with three restriction fragments (approximately 1.1, 0.86, and 0.76 kb) of the serotype 1/2A isolates. Southern blot hybridization of the serogroup 4B isolates indicated that the nucleic acid sequences homologous with the beta-hemolysin gene probe were limited to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleic acid sequence-based amplification, NASBA, is an isothermal amplification technique for nucleic acids and was used for typing a collection of 24 Mycoplasma pneumoniae strains. A set of primers was chosen from the 16S rRNA sequence alignment of Mycoplasma species. The nucleotide sequences of the (-)RNA amplicons were determined for M. pneumoniae strains M15/83 (type 1) and FH (type 2), and revealed a one-point difference at the 16S rRNA level between the two types. Based on this result, two type-specific probes were constructed. The probes were hybridized in solution with the amplified n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Routine patient testing for viral infections is critical to identify infected individuals for treatment and to prevent spreading of infections to others. Developing robust and reliable diagnostic tools to detect nucleic acids of viruses at the point-of-care could greatly assist the clinical management of viral infections. The remarkable stability and high binding affinity of peptide nucleic acids (PNAs) to target nucleic acids could make PNA-based biosensors an excellent starting point to develop new nucleic acid detection technologies. We report the application of cyclopentane-modified PNAs t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the complexity of compositions and low abundance of target in clinical sample, nucleic acids detection often suffers from false positives caused by nonspecific amplification. In in vitro diagnosis (IVD), PCR usually employ TaqMan probe to report specific signals and block false positive signals. However, nucleic acid isothermal amplifications, such as loop-mediated isothermal amplification (LAMP), lack of mature specific signal output mechanism, which prevents them from being used for IVD and point-of-care testing (POCT). In this work, we constructed a specific signal extract-to-output
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования