Eukaryotic DNA transpososomes assemble as nucleoprotein complexes containing multiple identical transposase protomers. We determined the str … ration at the intended sequence in a plasmid-based assay, validating the viability of heterodimeric transposases for genomic applications.
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic complementation in many bacteria is commonly achieved by reintroducing functional copies of the mutated or deleted genes on a recombinant plasmid. Chromosomal integration systems using the Tn7 transposon have the advantage of providing a stable single-copy integration that does not require selective pressure. Previous Tn7 systems have been developed, although none have been shown to work effectively in a variety of enterobacteria. We have developed several mini-Tn7 and transposase vectors to provide a more versatile system. Transposition of Tn7 at the chromosomal attTn7 site was achiev
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Chlamydia trachomatis is a prolific human pathogen that can cause serious long-term conditions if left untreated. Recent developments in Chlamydia genetics have opened the door to conducting targeted and random mutagenesis experiments to identify gene function. In the present study, an inducible transposon mutagenesis approach was developed for C. trachomatis using a self-replicating vector to deliver the transposon-transposase cassette - a significant step towards our ultimate aim of achieving saturation mutagenesis of the Chlamydia genome. Methods: The low transformation efficien
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia suis is a swine pathogen that has also recently been found to cause zoonotic infections of the human eye, pharynx, and gastrointes … urified by a harvest assay derived from the classic plaque assay. C. suis strain Rogers132, lacking transposases IS200 and IS605, was the most efficient donor, producing two unique recombinants detected in three of the 56 (5.4%) clones screened. Recombinants were found to have a minimal inhibitory concentration (MIC) of 8-16 μg/mL for tetracycline. Resistance …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transposons are among the most abundant mobile genetic elements in nature. IStrons are a unique class of transposons, encoding a transposase for transposon mobility, an RNA-guided nuclease for maintenance, and a self-splicing group I intron for element removal from host mRNA. However, it is unclear how a single polynucleotide sequence balances these distinct biochemical functions. Here, we employed pooled library mutagenesis coupled with high-throughput sequencing to systematically dissect the molecular determinants of IStron transposition, RNA-guided DNA cleavage, and self-splicing. We found
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin accessibility plays essential roles in transcription, DNA repair, and chromosome segregation. Hyper-accessible regions usually correlate with active promoters and enhancers, facilitating transcription factor binding and regulatory activity. The assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) enables genome-wide profiling of chromatin accessibility with very few cells. However, its implementation in Caenorhabditis elegans is limited by the nematode's rich collagen cuticle that complicates cell dissociation. Here, we present an optimized protocol for performing A
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Borrelia includes the causative agents of Lyme disease and relapsing fever. An unusual feature of these bacteria is a segmented genome consisting mostly of a number of linear DNA molecules with covalently closed hairpin ends or telomeres. In this study we show that the BBB03 locus encodes the B. burgdorferi telomere resolvase, ResT. The purified protein catalyzes telomere resolution in vitro through a unique reaction: breakage of two phosphodiester bonds in a single DNA duplex (one on each strand) and joining of each end with the opposite DNA strand to form covalently closed hairpin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To more effectively study the genetic basis of Legionnaires' disease, we characterized a system for mini-Tn10 mutagenesis in Legionella pneumophila. The mini-transposons were first electroporated into Legionella on counterselectable vectors expressing altered target site transposases. Then, by simultaneously selecting for the kanamycin-resistance gene within the transposon and counterselecting against the maintenance of the plasmid, we directly and readily isolated strains bearing single chromosomal insertions. Southern hybridization analysis further demonstrated that the insertions were rando…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Здесь мы представляем Multisite Assembly of Gateway Inductioned Cloons (MAGIC), которая использует основанные на Gateway рекомбинаторные технологии клонирования для быстрой, модульной сборки плазмидов, чтобы облегчить трансгенез в клетках и позвоночных моделях животных. В коллекции плазмидов MAGIC используется целый ряд инструментов in vitro и in vivo, от инструментов оптического и химического генного экспрессии до одновременного выражения микроРНК и флуоресцирующих репортеров, до набора отдельных субклеточных люминесцентных репортеров, до Cre и Dre, зависящих от рекомбиназы. Компоненты систем
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome editing technologies have advanced from nuclease-based reagents that generate programmed DNA double-strand breaks, which can cause de … ally occurring enzymes with novel biochemical and functional properties, including recombinases and transposases capable of large-scale modifications. Moreover, directed evolution, rational engineering and expanded homologue discovery are enabling the repurposing and optimization of these systems for genome engineering. Here we review recent technology develop …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aedes aegypti is the key vector of both the Yellow Fever and Dengue Fever viruses throughout many parts of the world. Low and variable transgene expression levels due to position effect and position effect variegation are problematic to efforts to create transgenic laboratory strains refractory to these viruses. Transformation efficiencies are also less than optimal, likely due to failure to detect expression from all integrated transgenes and potentially due to limited expression of the transposase required for transgene integration.
RESULTS: Expression plasmids utilizing three h
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia species represent a paradigm for understanding successful obligate intracellular parasitism. Despite limited genetic malleability, development of genetic tools has facilitated the elucidation of molecular mechanisms governing infectivity. Random mutagenesis approaches provide one of the most powerful strategies available to accomplish untargeted elucidation of gene function. Unfortunately, initial progress in transposon-mediated mutagenesis of Chlamydia has been challenging. To increase efficiency, we developed a plasmid-based system that couples conditional plasmid maintenance with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 2-week-old girl presented with bilateral congenital corneal opacities. Additional systemic manifestations included microcephaly, patent foramen ovale, and poor feeding. Patient and parents underwent whole exome sequencing trio analysis that revealed a de novo pathogenic variant in POGZ (p.Val1150GlyfsX8), which is causative of the White-Sutton syndrome. This rare genetic condition is usually associated with intellectual and developmental delay, facial dysmorphism, strabismus, refractive error, and retinal changes. To our knowledge, this is the first reported case of White-Sutton syndrome pre
Клинический случайПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
POGZ is a heterochromatin protein 1 α-binding protein and regulates gene expression. On the other hand, accumulating pieces of evidence indicate that the POGZ gene abnormalities are involved in various neurodevelopmental disorders. In this study, we prepared a specific antibody against POGZ, anti-POGZ, and carried out biochemical and morphological characterization with mouse brain tissues. Western blotting analyses revealed that POGZ is expressed strongly at embryonic day 13 and then gradually decreased throughout the brain development process. In immunohistochemical analyses, POGZ was found t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sleeping Beauty transposons have the potential for use as chromosome-integrating vectors for non-viral gene therapy. Recent preclinical data from mouse models for human genetic disorders have shown efficacy for the Sleeping Beauty transposon system in the treatment of hemophilia, tyrosinemia type I, junctional epidermolysis bullosa and type 1 diabetes. Methods have also been developed to deliver Sleeping Beauty transposons to the lung, liver and tumors for treatments for cystic fibrosis, cardiovascular and metabolic diseases, and cancer. Recent studies characterizing site selection for integra
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analysis of ISCR8 (ISPps1) revealed that this group of insertion elements has to be subdivided into three subgroups: ISCR8, ISCR22, and ISCR23. The distinction of three subgroups is supported by phylogenetic analysis of the transposase open reading frames (ORFs). Comparison of over 20 complete and partial ISCR8/22/23 elements identified oriIS candidate sequences for all groups and a terIS candidate sequence for ISCR8. The oriIS sequences, their distance to the transposase ORFs, and the sequence of this intervening region are group specific, further supporting the definition of two new ISCR ele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Paracoccidioides brasiliensis (Eukaryota, Fungi, Ascomycota) is a thermodimorphic fungus, the etiological agent of paracoccidioi … r elements. They are flanked by 2-bp TA target site duplications and different termini. Encoded DDD-transposases, some of which have complete ORFs, indicated that they could be functionally active. The distribution of Trem elements varied between the genomic sequences characterized as belonging to P. brasiliensis (S1 and PS2) and P. lutzii. TremC and H element …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria contain a large number of transposable elements that can be categorized in four major groups according to their mechanisms of transposition. These are: class I: insertion sequences (IS) and compound transposons (with IS sequences at their termini) which usually require only one protein for transposition to occur (e.g. Tn10); class II: complex transposons and insertion sequences with short inverted repeats in which transposition is replicative and requires two gene products (e.g. Tn3); class III: transposable bacteriophage (e.g. Mu). The fourth group consists of the transposons and IS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Fontan operation is the current standard of care for single-ventricle congenital heart disease. Almost all patients with Fontan operation develop liver fibrosis at a young age, known as Fontan-associated liver disease (FALD). The pathogenesis and mechanisms underlying FALD remain little understood, and there are no effective therapies. We aimed to present a comprehensive multiomic analysis of human FALD, revealing the fundamental biology and pathogenesis of FALD.
METHODS AND RESULTS: We recently generated a single-cell transcriptomic and epigenomic atlas of human FALD using si
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to identify the genetic environment of optrA gene in linezolid (LZD)-resistant Enterococcus faecalis from chicken meat and to describe the probable mechanism of dissemination of the optrA gene through plasmid or chromosomal integration. Whole genome sequencing and analysis revealed that all 3 E. faecalis isolates confirmed as LZD- and chloramphenicol-resistant carried fexA adjacent to the optrA gene as well as a variety of resistance genes for macrolides, tetracyclines, and aminoglycosides, simultaneously. But, the other genes conferring LZD resistance, cfr and po
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования