Y-box binding protein 1 (YB-1) acts as a key oncoprotein, with its highly conserved cold shock domain (CSD) driving core nucleic acid-binding functions in cancer progression. Despite its therapeutic relevance, the CSD is considered "undruggable" due to the lack of a well-defined hydrophobic pocket. To overcome the limitations of rigid docking in this transient pocket, here, we present a computational ligand-prioritization workflow designed to generate experimentally testable hypotheses for this challenging target. We applied the 5D-ElectroShape formalism combined with our in-house MolPrism clu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs), serving as diverse functional regulators, are abundantly expressed in the testis. However, many testis-specific or preferentially expressed lncRNAs remain uncharacterized. Here, we report a testis-specific lncRNA, 1700052I22Rik, which exhibits a dynamic expression pattern during spermatogenesis. Our findings demonstrate that knockout of 1700052I22Rik in mice leads to reduced sperm counts and subfertility in males, as well as defective spermatid chromatin condensation. We further elucidate the underlying mechanism by which 1700052I22Rik modulates the translation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previously, we demonstrated the therapeutic effects of intranasal administration of human HSP70 and YB-1 proteins in various models of AD, including olfactory bulbectomized (OBX) mice. Herein, we investigated the effect of these two stress proteins on transcription in the hippocampus and cortex of OBX mice. Despite different structures, both proteins frequently caused pronounced normalizing changes in the transcription of the same genes. Thus, the genes that normalized their expression due to the action of recHSP70 or recYB-1 coincide by 61%. More than 60% of these common target genes exhibite
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously reported that translation of acetylcholine receptor α-subunit (AChR α) mRNA in skeletal muscle cells is regulated by Y-box binding protein 1 (YB-1) in response to neural activity, and that in the postnatal mouse developmental changes in the amount of YB-1 mRNA are similar to those of AChR α mRNA, which is known to be regulated by myogenic transcription factors. Here, we examined transcriptional regulation of the YB-1 gene in mouse skeletal muscle and differentiating C2C12 myocytes. Although neither YB-1 nor AChR α was detected at either the mRNA or protein level in adult hin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancers and malignant pleural mesothelioma (MPM) have some of the worst 5-year survival rates of all cancer types, primarily due to a lack of effective treatment options for most patients. Targeted therapies have shown some promise in thoracic cancers, although efficacy is limited only to patients harboring specific mutations or target expression. Although a number of actionable mutations have now been identified, a large population of thoracic cancer patients have no therapeutic options outside of first-line chemotherapy. It is therefore crucial to identify alternative targets that might
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The cold-shock domain protein YB-1 is overexpressed in pleural mesothelioma (PM) and was shown to contribute to increased cell migration and platinum resistance.
METHODS: Phosphorylation of YB-1 at position serine 102 was analysed by immunohistochemistry, immunofluorescence and immunoblotting in PM tissue specimens and cell lines. Intracellular localisation experiments involved immunoblotting, transfection of fluorescent protein-tagged YB-1 and confocal imaging. YB-1 phosphorylation was inhibited with the RSK inhibitors BI-D1870 and LJH685. Effects of inhibition alone and in combi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syndecan binding protein (SDCBP) has been shown to be upregulated in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) and predicts poor prognosis in our previous research. SDCBP stimulated the proliferation and tumor formation and may be a target for ESCC. However, the participation of SDCBP in epithelial-mesenchymal transition (EMT) and ESCC metastasis is unclear. In this study, we found that SDCBP promoted the EMT process of ESCC cells and facilitated ESCC metastasis both in vitro and in vivo. Mechanically, SDCBP was found to influence the activation of the Wnt-β-catenin pathway. β-catenin expressi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is a malignant tumor in nasopharynx tissues and lacks effective treatment strategies. Dysregulation of distal-less homeobox 4 (DLX4) participates in the development of tumors. Understanding the regulatory mechanism of DLX4 in NPC progression may address this issue. Here, we first identified an up-regulation of DLX4 in NPC cell lines compared to normal epithelial cells. Data from colony formation and transwell assays showed that knockdown of DLX4 inhibited cell proliferation and invasion of NPC, respectively. Moreover, DLX4 knockdown blocked the cell cycle of NPC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorders (ASDs) are neurodevelopmental in origin, affecting an estimated 1 in 88 children in the United States. We previously described ASD-specific maternal autoantibodies that recognize fetal brain antigens. Herein, we demonstrate that lactate dehydrogenase A and B (LDH), cypin, stress-induced phosphoprotein 1 (STIP1), collapsin response mediator proteins 1 and 2 (CRMP1, CRMP2) and Y-box-binding protein to comprise the seven primary antigens of maternal autoantibody-related (MAR) autism. Exclusive reactivity to specific antigen combinations was noted in 23% of mothers of ASD
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial dysfunction and cell senescence are triggered by reactive oxygen species (ROS) in granulosa cells (GCs), leading to premature ovarian insufficiency (POI). Human umbilical cord mesenchymal stem cell-derived exosome (HuMSCs-Ex, H-Ex)-based treatments have been shown to alleviate ROS-induced POI, but knowledge about the underlying therapeutic mechanisms is limited. Here, we observed that the 5-methylcytosine (m5C) RNA methyltransferase tRNA aspartic acid methyltransferase 1 (TRDMT1) promoted the translation of COX subunit 5B (COX5B) in a manner dependent on its catalytic activity an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pleural mesothelioma (PM) is characterized by rapid growth, local invasion, and limited therapeutic options. The multifunctional oncoprotein Y-box-binding protein-1 (YB-1) is frequently overexpressed in cancer and its inhibition reduces aggressive behavior in multiple tumor types. Here, we investigated the effects of YB-1 on target gene regulation and PM cell behavior. Whereas siRNA-mediated YB-1 knockdown reduced cell motility, YB-1 overexpression resulted in scattering, increased migration, and intravasation in vitro. Furthermore, YB-1 stimulated PM cell spreading in zebrafish. Combined knoc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Axonal regeneration in the mature CNS is limited by extracellular inhibitory factors. Triple knockout mice lacking the major myelin-associat … lapse and inhibited neurite outgrowth. Histones mediate inhibition through the transcription factor Y-box-binding protein 1 and Toll-like receptor 2, and these effects are independent of the Nogo receptor. Histone-mediated inhibition can be reversed by the addition of activated protein C in vitro, and activated protein C treatment promotes axonal regeneration in the crus …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a complex process that is required for sperm production. Multiple RNA-binding proteins participate in regulating spermatogenesis. Y-box-binding protein 1 (YBX1) is involved in transcriptional regulation, mRNA stabilization, and translational repression. However, its specific role in spermatogenesis remains unclear. This study investigated the role of YBX1 in spermatogenesis using a Ybx1 conditional knockout (Ybx1 cKO) mouse model. By analyzing the phenotype of Ybx1 cKO mice, we investigated the role of YBX1 in spermatogenesis and male fertility. The morphology and weight of …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Y-box binding protein (YB-1), known as a multifunctional cellular protein in various biological processes, was recently reported to be associated with liver fibrosis. The critical role of TGF-β/Smad signaling pathway in stimulating the transcription of fibrotic genes in fibroblasts have already been identified, however, whether and how YB-1 modulated liver fibrosis via TGF-β/Smad signaling pathway remains largely unknown. In our previous study, we proved that ectopic TGF-β was associated with YB-1 expression. Herein, by combining in vitro experiments in LX2 human hepatic stellate cells and in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deregulated proliferation is key to tumor progression. Although unrestricted proliferation of solid tumor cells correlates with the cold-shock protein Y-box (YB)-binding protein-1 accumulation in the nuclei, little is known about its expression and function in hematopoietic malignancies, such as T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Here we show that YB-1 protein is highly enriched in the nuclei of activated T cells and malignant human T-ALL cell lines but not in resting T cells. YB-1 S102 mutations that either mimic (S102D) or prevent phosphorylation (S102N) led to accumulation of YB-1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic scar (HS) represents the most prevalent form of skin fibrosis, significantly impacting the quality of life. Despite this, the m … bited the transcription of Peroxisome Proliferator-Activated Receptors (PPARs) via interaction with Y-box-binding protein 1 (YBX1). This interaction promoted cell proliferation, migration, and collagen production in hypertrophic scar fibroblasts (HSFs). In vivo studies further confirmed that CILP1 knockdown markedly reduced HS formation, whereas administration of recombi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Impaired osteogenic differentiation of periodontal ligament stem cells (PDLSCs) is a key factor in the failure of alveolar bone repair. Ferroptosis, a form of regulated cell death, has been implicated in osteogenic dysfunction. Wilms' tumor 1-associated protein (WTAP) regulates RNA fate through m6A modification; however, whether WTAP modulates ferroptosis in PDLSCs remains unknown. This study aims to investigate the role of WTAP in LPS-induced ferroptosis in PDLSCs. LPS-treated hPDLSCs were used as cell models. Osteogenic differentiation and inflammation of hPDLSCs, ferroptosis biomarkers, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is a major global health concern, as its prevention and treatment remain significant challenges. The 8-oxoguanine (o8G) modification of circRNAs, alongside their capacity to orchestrate liquid-liquid phase separation (LLPS) and autophagy, plays a pivotal role in driving tumor progression and determining therapeutic outcomes. Here, we identified the downregulation of circMTUS1 in GC and elucidated the upstream and downstream mechanisms governing its role in tumor progression and chemoresistance. We demonstrated that YBX1 induces o8G modification, which reduces circMTUS1 stab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral submucous fibrosis (OSF) has been recognized as a precancerous disorder in the oral cavity. Great effort has been made to inhibit the malignant progression of OSF over the past decades, but the cure of this fibrosis disease has not been discovered. In the present study, we found that a long noncoding RNA, LINC00312, was upregulated in OSF tissues, and positively associated with several fibrosis factors, such as α-SMA, type I collagen, and fibronectin. As such, we sought to investigate the role of LINC00312 in OSF progression and identify its interacting factor that mediated oral fibrogene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Perineural invasion (PNI) is a biological characteristic commonly observed in pancreatic cancer. Although PNI plays a key role in pancreatic cancer metastasis, recurrence, and poor postoperative survival, its mechanism is largely unclarified. Clinical sample analysis and endoscopic ultrasonographic elasticity scoring indicated that cancer-associated fibroblasts (CAFs) were closely related to the occurrence of PNI. Furthermore, CAF-derived extracellular vesicles (EVs) were involved in PNI in dorsal root ganglion coculture and mouse sciatic nerve models. Next, we demonstrated that CAFs promoted
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования