Considering that the final protection of the DNA against major assaults in terms of chromatin condensation is finalized in the epididymis, it is not known how sperm production of reactive oxygen species (ROS) and inflammatory processes can contribute to protamine deficiency that is predetermined in the testes. Therefore, this study aimed at investigating relationships between poor chromatin condensation, morphology, ROS production, DNA damage and the impact of the presence of leucocytes. In 70 patients, sperm DNA status was determined using TUNEL and chromomycin A(3) (CMA(3)) assays, and ROS-p…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic mechanisms refer to the complex and interrelated molecular processes that dynamically modulate gene expression and function withi … sms (including DNA methylation, histone code modifications, nucleosome remodeling, and higher-order chromatin formation) and highlight the emerging roles each of these processes play in the pathobiology of stroke. We suggest that understanding these mechanisms may be important for discovering more sensitive and specific biomarkers for risk, onset, and progr …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic instability and alterations in gene expression are hallmarks of eukaryotic aging. The yeast histone deacetylase Sir2 silences transc … s age-dependent transcriptional changes. Thus, DNA damage-induced redistribution of SIRT1 and other chromatin-modifying proteins may be a conserved mechanism of aging in eukaryotes.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The highest rates of cervical cancer are found in developing countries. Frontline monitoring has reduced these rates in develope … ractions identified multiple candidates that influence regulation of cellular transcription through chromatin remodelling (SMARCC1, NCOR1, MRFAP1 and MORF4L2). Further, these expression events are focused at the critical junction in disease development of moderate dysplasia (CIN II) indicating a role for chromatin remodelling as part of cervical cancer deve …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To overcome the problem of antibody availability, often encountered during chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays, nickel agarose-based chromatin enrichment (NACE) was developed. Based on the affinity of (His)-6-tagged proteins for the nickel ion, this modified form of ChIP allows the isolation of chromatin in the absence of specific antibodies.
METHODS: Nonpigmented ciliary epithelium cells were transfected with (His)-6-tagged FOXC1. FOXC1-enriched chromatin complexes were isolated by using the tight electrostatic interaction between histidine residues of the recombinant FOXC1 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We identified a subset of genes involved in chromatin remodeling whose mRNA expression changes in differentiating mouse erythroleukemia (MEL) cells. We furthermore tested their mRNA expression patterns in normal and malignant CD34+ bone marrow cells. SMARCA5, imitation switch gene homologue, was rapidly silenced during in vitro erythroid differentiation of MEL cells whereas it was up-regulated in CD34+ hematopoietic progenitors of acute myeloid leukemia (AML) patients. Moreover, SMARCA5 mRNA levels decreased in AML CD34+ progenitors after the patients achieved complete hematologic remission. W…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A case of abnormal chromatin clumping (ACC) which arose during the course of a myelodysplastic/myeloproliferative syndrome is described in a 61 year old woman who died of haemorrhage 43 months after diagnosis. Mature granulocytes exhibited the same nuclear abnormality described in other patients reported. Unusually, she presented with advanced splenomegaly and lymphadenopathy. This case was the third example of ACC in lymphocytes, the first with clinically confirmed lymphadenopathy. Diagnosis of this subset can be based on: older age; short duration of symptoms; no specific karyotypic damage; …
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum (XP) is a hereditary disease characterized by a defect in the excision-repair mode of ultraviolet light damage and a high incidence of skin tumors. Cultured fibroblasts from normal and XP cells at low population doubling times were compared by induction of mild spreading of their nuclear constituents in a highly alkaline solution containing detergent and formaldehyde. In each XP culture a certain fraction (10-80%) of the nuclei were abnormal (50-80% in cell lines from children with XP-C disorders and 10-35% from embryonic and adult XP cells). Although their chromatin thre…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A human Burkitt's lymphoma cell line (Raji-HN2) made resistant to nitrogen mustard, a bifunctional alkylating agent, was used to study the m … cin, teniposide); (5) similar amounts of topoisomerase I were found in both cell lines; and (6) the chromatin of Raji-HN2 but not of Raji cells, was hypersensitive to DNase I digestion. The relationship between DNA repair, topoisomerase II activity, chromatin structure and drug resistance is discussed.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell identity is regulated by chromatin states that encode gene regulatory memory and shape responses to new inputs. To investigate how chromatin context influences inducibility in differentiated cells, we employed engineered synthetic reader-actuators (SRAs), fusion proteins containing the polycomb chromodomain (PCD) that binds H3K27me3. In MCF7 breast cancer cells, we mapped PCD-fusion occupancy by ChIP-seq and used RNA-seq to identify temporally resolved gene activation patterns. ChIP-seq profiling and machine learning models (MLM) demonstrated that PCD-fusion binding was predicted primaril…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic pain is sustained by durable yet dynamic changes in gene regulation across sensory neurons, spinal circuits, glial and immune cells, and higher brain regions. This review critically evaluates three related but conceptually distinct regulatory layers: chromatin-associated epigenetic mechanisms, including DNA methylation and hydroxymethylation, histone modifications, and chromatin accessibility; non-coding RNAs that directly interface with chromatin-regulatory machinery; and RNA N6-methyladenosine (m6A), an epitranscriptomic mechanism that acts primarily at the RNA level. Across pain mod…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistent infection with high-risk human papillomavirus (HPV) is the principal etiologic driver of cervical cancer. However, HPV status and E6/E7-mediated disruption of the p53/RB axis do not fully explain why HPV-associated lesions differ in persistence, malignant progression, therapeutic response, and relapse. This review examines how host chromatin architecture and related transcriptional programs may contribute to the stabilization of malignant cell states following HPV-mediated checkpoint disruption. We discuss evidence linking HPV persistence and integration to epigenetic permissiveness…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The potential yield and establishment of maize are severely restricted by early developmental drought. Although NAC transcription factors ar … ance in maize seedlings and identify a candidate ZmNAC110-ZmNAC20-YIGE1 regulatory module linked to chromatin-associated drought responses. Because the genetic requirement for YIGE1 was not tested, YIGE1 is presented here as a strong candidate downstream component rather than a confirmed one.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: DNMT3B is frequently overexpressed in molecular subsets of acute myeloid leukemia (AML) and is associated with poor prognosis. U … uitry, and apoptotic dependencies. Results: DNMT3B overexpression was linked to enhancer-associated chromatin activation rather than recurrent genetic mutation, particularly in CEBPA- and NPM1-mutant AML. NanA exposure produced focal epigenomic remodeling, including 6900 differentially methylated CpGs, with 268 CpGs located within regions of altered chromat …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how chromatin folds in three dimensions remains challenging because most experimental assays capture low-dimensional projections of an underlying, highly heterogeneous polymer. Here we present an ensemble-based interpretive framework built on the previously introduced Self-Returning Excluded Volume (SR-EV) model, a minimal generator of nucleosome-resolution chromatin conformations based on stochastic return rules and excluded-volume geometry. Despite its simplicity, SR-EV reproduces key experimental signatures across scales: heterogeneous nanoscale packing domains resembling Chro…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three-dimensional genome organization shapes gene regulation during normal B-cell development, and its disruption contributes to the initiation and progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia. Through multi-omic studies, Ghebrechristos and colleagues revealed that transcription factors, including ERG in ETV6::RUNX1 leukemia, remodel chromatin interactions to sustain oncogenic gene expression programs, identifying genome architecture as both a driver of leukemogenesis and a potential therapeutic vulnerability. See related article by Ghebrechristos et al., p. 586.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and objectives: The PWWP domain of lens epithelium-derived growth factor p75 (LEDGF/p75) mediates chromatin engagement through recognition of histone H3 lysine 36 di- and trimethylation (H3K36me2/3) and nucleosomal DNA. LEDGF/p75 plays a role in multiple human diseases. In particular, its interaction with HIV-1 integrase enables viral genome integration. However, the LEDGF PWWP domain remains difficult to target with small molecules as it lacks optimally shaped binding pockets. Here, we report the generation of high-affinity nanobodies (Nbs) to investigate the structure and function…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone acetylation depends on acetyl-CoA, a central metabolic intermediate linking nutrient availability to chromatin regulation. Beyond bulk acetyl-CoA abundance, accumulating evidence indicates that chromatin-proximal acetyl-CoA production and acetate recycling provide spatial control over histone acetylation. In budding yeast, acetyl-CoA synthetase Acs2 supports nucleocytosolic acetyl-CoA production and associates with chromatin during transcriptional transitions, enabling local acetyl-CoA generation for histone acetyltransferases. Its mammalian ortholog, ACSS2, can accumulate in the nucle…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The INO80 chromatin-remodeling complex is a multi-subunit regulator of DNA-templated processes, yet the mechanisms that control remodeler function in vivo are not completely known. In this study, we report that the Ies6 subunit of the INO80 complex encodes a prion-like domain (PLD) within a larger region of predicted disorder. After transient inducible overexpression, both full-length Ies6 and the PLD domain alone aggregate in a manner that evades proteasome-mediated degradation, suggestive of prion-like behavior. Cytosolic aggregates are also visible with fluorescent microscopy following expr…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования