In this study, oversized microplastics (OMPs) were intentionally introduced into soil containing manure-borne doxycycline (DOX). This strategic approach was used to systematically examine the effects of combined OMP and DOX pollution on the growth of pak choi, analyze alterations in soil environmental metabolites, and explore the potential migration of antibiotic resistance genes (ARGs). The results revealed a more pronounced impact of DOX than of OMPs. Slender-fiber OMPs (SF OMPs) had a more substantial influence on the growth of pak choi than did coarse-fiber OMPs (CF OMPs). Conversely, CF O
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eggs are nutritious and highly valued by consumers. However, egg flavor varies greatly among different hen breeds. The present study used gas chromatography-olfactometry-mass spectrometry-based volatilomics to identify and compare volatile compounds in Taihe black-boned silky fowl (TS) and Hy-line Brown (HL) egg yolks. In addition, the relationships between the levels of different metabolites and lipids and flavor-associated differences were investigated using multiomics. Twenty-eight odorants in total were identified; among them, the levels of 3-methyl-butanal, 1-octen-3-ol, 2-pentylfuran, an…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell multiomic technology makes it possible to profile both the transcriptome and epigenome within individual cells. The detection of rare cell states from such data is crucial for exploring novel disease biomarkers with clinical potential. However, existing methods typically focus on the gene and peak counts while ignoring the underlying genomic sequence at accessible sites. Here, we propose ComicGTN, an innovative computational framework that integrates single-cell multiomic data with DNA sequence information via enhanced graph transformer networks to accurately identify rare cell clu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite striking successes in identifying novel biomarkers for improved patient stratification and predicting disease progression, numerous … challenges remaining in the development and application of the latest bioinformatics approaches to multiomics data integration. ASCVD remains the leading cause of death globally. Disease aetiology, progression, and therapy outcome depend on a complex interplay of genetic, environmental, and lifestyle factors. Integrating these diverse data types effectively …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Heat stress (HS) can impair boar testicular function, leading to reproductive issues. However, chlorogenic acid (CGA) has been s … the HS-induced reduction in T-AOC content in testicular tissue and sperm density. Mechanistically, multiomics analysis revealed that the genes differentially expressed by CGA and HS were predominantly associated with the glutathione metabolism pathway. The combined analysis of transcriptomics and proteomics revealed that only BLVRA was affected by both HS a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental exposures are upstream determinants of molecular variation, yet exposure-to-biomarker gradients remain insufficiently quantified in harmonized multiomics cancer cohorts. Using TCGA lung adenocarcinoma as a model, we evaluated cumulative tobacco exposure and smoking history as determinants of variant-derived biomarkers and tested whether integrating clinical, genomic, transcriptomic, and proteomic data improves identification of high tumor mutational burden (TMB). This secondary analysis used public cBioPortal-linked TCGA data. Among 522 patients with clinical and molecular annota…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advanced Glycation Endproducts (AGEs) arise from the reaction of proteins with highly reactive dicarbonyl compounds such as methylglyoxal (MGO), glyoxal (GO) and 3-deoxyglucosone (3-DG), which have been implicated in inflammation and carcinogenesis. How dicarbonyls and AGEs are distributed across tumor tissue and surrogate specimens, and how they relate to systemic metabolism, AGE-related pathways, and alterations in gut microbiota in colon cancer, remains poorly understood. An integrative multi-specimen analysis of MGO, GO, 3-DG and major AGEs was performed using targeted tandem mass spectrom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classifying heterogeneous human B cells into discrete subsets based on surface phenotype alone remains a major challenge. We discovered a mouse splenic IgM+IgDlow/- B-cell subset (BDL) that induces proliferation of CD4+Foxp3+ T regulatory cells, making them a therapeutic target for autoimmunity. Because they are rare and lack sufficient cell surface markers, a multiomics strategy is required to identify and track them in humans. The lack of correlation between mRNA expression levels and cell surface expression is a drawback to a transcriptome-only single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) approac…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteogenic differentiation is crucial in normal bone formation and pathological calcification, such as calcific aortic valve disease (CAVD). Understanding the proteomic and transcriptomic landscapes underlying this differentiation can unveil potential therapeutic targets for CAVD. In this study, we employed RNA sequencing transcriptomics and proteomics on a timsTOF Pro platform to explore the multiomics profiles of valve interstitial cells (VICs) and osteoblasts during osteogenic differentiation. For proteomics, we utilized 3 data acquisition/analysis techniques: data-dependent acquisition (DD…
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated muscle quality differences between wild-type (WT) and yellow-mutant (YM) Triplophysa siluroides. Texture analysis showed WT T. siluroides had significantly greater hardness, gumminess, and resilience than YM. Histological and biochemical analyses ruled out myofiber diameter/density as drivers, instead identifying reduced collagen in YM as key, as confirmed by Picrosirius red staining, collagen quantification, and transmission electron microscopy. Transcriptomic and proteomic analyses revealed that TGF-β/BMP pathway suppression in YM resulted in downregulation of core mo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fasting hypoglycemic effect of casein hydrolysate (CH) was investigated in db/db diabetic-like mice using a multiomics integrated analysis of peptidome, transcriptome, and metabolome. Results showed that the oral administration of CH at a dose of 600 mg/kg/day for 4 weeks reduced the fasting blood glucose levels by 14.73 ± 9.77%, alleviated insulin resistance (HOMA-IR index) by 36.91 ± 22.62%, and mitigated hepatic damage in db/db diabetic-like mice. Hepatic differential metabolites after CH treatment were enriched in Glu-related metabolites, which acted as substrates for the TCA cycle, en…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polygonatum sibiricum polysaccharides protect against obesity and NAFLD. However, the potential effects of PS rhizome aqueous ex … gavage of orlistat and PSRwe for an additional eight-week period. Integrative analysis encompassing multiomics, physiological and histopathological, and biochemical indexes was employed.
METHODS: Body weight (BW); liver, fat and Lee's indexes; TC, TG, LDL-C, HDL-C, AST, ALT, FFA, leptin, and adiponectin in the liver and blood; TNFα, IL-6, and LPS in the col …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute pancreatitis and non-alcoholic fatty liver disease are both serious diseases in the digestive system. The pathogenesis of … flammatory cells, and 91 inflammatory proteins (pqtls). It explains the causal relationship between multiomics, LDL- cholesterol, acute pancreatitis, and non-alcoholic fatty liver disease.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: <p>Introduction: We recently proposed SARIFA (Stroma AReactive Invasion Front Areas), defined as direct tumour-adipocyte interaction, as an H&E-based histopathologic biomarker in gastrointestinal cancers, particularly gastric cancer (GC) and colorectal cancer (CRC). Despite SARIFA's well-validated prognostic value, its mechanistic underpinnings remain unclear. We hypothesized that extracellular matrix remodelling, specifically the plasmin/plasminogen activator system, may contribute to SARIFA formation.
METHODS: To test this, we compared the prognostic value of H&E-based SARIFA st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As cannabis use continues to rise among people with HIV (PWH), understanding its impact on immune function in this population is becoming increasingly important. To provide new insights on how cannabis modulates immune function, we analyzed single-nucleus multi-omic profiles of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from PWH to characterize the changes in gene expression and chromatin accessibility associated with chronic cannabis exposure. We identified numerous differentially expressed genes (DEGs) between cannabis users and non-users in each cell type, approximately half of which were u
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prediction in medicine remains limited. Previously, by using our "comparative spectral decompositions" of two matrices and, separately, two third-order tensors, we demonstrated accurate, precise, actionable, and interpretable tumor whole-genome and, separately, whole-transcriptome predictors-of patients' survival, treatment responses, and drug targets-in different cancers. Here, we introduce a unified framework that generalizes these exact and structure-preserving algorithms to multiple tensors of any order to model real-world data that measure multiple aspects of interrelated phenomena. We pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic systemic autoimmune disease in which pain remains the most prominent and burdensome symptom from the patient's perspective. Despite effective control of peripheral inflammation with biological and targeted synthetic disease-modifying antirheumatic drugs, an estimated 20-30% of patients continue to experience persistent moderate-to-severe pain after achieving clinical remission. This therapeutic gap reflects the evolution of pain mechanisms from peripheral nociception towards central sensitisation and nociplastic pain, creating a need for int
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to screen and identify osteoarthritis (OA)-related core immune genes, elucidate the mechanism underlying the temporal activation of key signaling pathways mediated by these genes, and screen potential therapeutic compounds, thereby providing a theoretical basis for the precision diagnosis and targeted intervention of OA.
METHODS: Four sets of OA cartilage transcriptomic datasets with normal controls (NCs) were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. After batch correction, a training set and two independent validation sets were constructed to sc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pituitary neuroendocrine tumors (PitNET) represent the vast majority of sellar masses. Some behave aggressively, growing rapidly and invading surrounding tissues, with high rates of recurrence and resistance to therapy. Our aim was to establish patterns of genomic, transcriptomic and methylomic evolution throughout time in primary and recurrent tumors from the same patient. Therefore, we performed transcriptome- and exome-sequencing and methylome microarrays of aggressive, primary, and recurrent PitNET from the same patient. Primary and recurrent tumors showed a similar exome profile, potentia
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dynein axonemal heavy chain 5 (DNAH5) is the most mutated gene in primary ciliary dyskinesia (PCD), leading to abnormal cilia ultrastructure … ssion of inflammatory cytokines. Taken together, these results demonstrated that the combination of multiomics analysis and organoid modelling could reveal the close connection between the immune response and the DNAH5 gene.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования