Common genetic variants are associated with risk of lung and autoimmune diseases. However, we have a limited understanding of the pathological effects of these disease variants, specifically in tissue-resident immune cells at the frontier of infection and disease in the lung. To address this, we performed single-cell expression quantitative trait locus (eQTL) analysis across 29 distinct immune cell subsets isolated from lung tissue. Colocalization analysis of lung immune cell eQTLs with genome-wide association study (GWAS) signals from lung diseases, and infectious and autoimmune diseases, imp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Barley (Hordeum vulgare L.) is a major cereal in Kazakhstan, where diverse breeding material supports crop improvement. We characterized 86 two-row spring barley accessions from six breeding organizations using the Illumina Infinium 50K Barley SNP Array. Analysis of 29,920 high-quality SNPs revealed moderate diversity (He = 0.346, PIC = 0.278, Shannon = 0.752), with 80.84% of molecular variation occurring within and 19.16% among breeding organizations. A minor allele frequency-free (MAF-free) analysis showed that 95.61% of marker-allele combinations at polymorphic loci were shared by at least
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) help to identify disease-linked genetic variants, but pinpointing the most likely causal genes in GWAS loci remains challenging. Existing GWAS gene prioritization tools are powerful but often use complex black box models trained on datasets containing biases. Here, we used a data-driven approach to construct a truth set of causal genes in 200 GWAS loci. We found that a simple logistic regression model performed as well as a more complex XGBoost model, and that many commonly-used gene prioritization features could be removed without meaningfully affecting
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extensive selection for yield and disease resistance during tomato crop improvement has led to flavor loss in modern commercial tomatoes in comparison with heirloom varieties. To investigate the chemical and genetic architecture of tomato flavor through both domestication and improvement, we analyzed flavor-related chemicals across 558 globally collected accessions comprising wild relatives, semidomesticated and domesticated populations, including uncharacterized Latin American accessions. Key flavor volatiles exhibit major differences across accessions. A genome-wide association study was use
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vertcillium wilt (VW), a soil-borne disease causing cotton yield loss and fiber quality reduction, is a major stumbling block in cotton production. It is a challenging job to detect key genes associated with major quantitative trait loci (QTL) that can be used to develop VW-resistant varieties. In this study, several genome regions associated with major QTL controlling VW resistance were fine mapped by constructing the high-density genetic map of major QTL regions using Kompetitive Allele-Specific PCR (KASP) markers. Candidate genes were subsequently identified by combining gene annotation, ge…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Delirium is an acute neuropsychiatric syndrome characterized by disrupted attention and cognition, often triggered by systemic inflammation and physiological stress. Elevated serum ferritin is frequently observed in patients with delirium. Since ferritin couples iron handling to inflammatory signaling during acute-phase responses, it remains unclear whether genetically influenced baseline serum ferritin is a modifiable causal risk factor for delirium, or whether ferritin elevations observed during illness mainly reflect downstream systemic states leading to brain network failure. W
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This research explored the genetic basis of adaptation for soybean to the low-latitude but high-elevation production regions in Rwanda. Soybean [Glycine max (L.) Merrill] is an increasingly important crop in Rwanda; however, production remains constrained by limited availability of high-yielding, locally adapted cultivars. The varieties introduced through Rwanda's Crop Intensification Program were developed for other regions of sub-Saharan Africa and exhibit poor adaptation, delayed maturity and low productivity in Rwanda. This study evaluated diverse germplasm to support development of a nati
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Excessive abdominal fat deposition reduces production efficiency and metabolic health, whereas yolk lipid content is directly linked to egg quality and reproductive output. These two fat-related traits are often in conflict from a breeding perspective, yet whether they share common genetic and molecular determinants-and whether such sharing could inform divergent selection for lean abdomen with lipid‑rich yolk-remains unclear. Here, we analyzed 22 fat deposition-related traits in a population of 248 laying hens, together with genome-wide genotyping data, transcriptomic data from 10 tissues. Ou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Primary open-angle glaucoma (POAG) is a common eye disorder that can lead to irreversible vision loss. Although genome-wide association studies (GWAS) have identified several genetic loci associated with POAG risk, the specific causative genes and mechanisms remain unclear.
METHODS: This study utilized the Unified Test for Molecular Signature (UTMOST) for cross-tissue analysis, along with Functional Summary-based Imputation (FUSION) and Fine-mapping of Causal Gene Sets (FOCUS) for single-tissue validation, analyzing a POAG GWAS dataset comprising 192,702 subjects (15,229 cases and 17
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lewy body dementia (LBD) is a complex neurodegenerative disorder marked by α-synuclein aggregation and dual impairment of cognitive and motor function.While genome-wide association studies have identified risk loci, the cellular mechanisms linking genetic variation to disease susceptibility remain largely unexplored.
METHODS: We performed single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization using brain cell-type-specific eQTLs across eight major cell types. Genetic associations were evaluated using inverse-variance weighted models, followed by Bayesian colocalization analysis. R
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Female reproductive disorders (FRDs), including polycystic ovary syndrome, endometriosis, uterine leiomyomata, and infertility, have been epidemiologically associated with impaired pulmonary function. However, it remains unclear whether this cross-organ link reflects shared genetic etiology and, if so, which cellular mechanisms mediate it. We performed a systematic genome-wide cross-trait analysis of three FRDs and lung function traits (FEV₁, FVC, FEV₁/FVC) using GWAS summary statistics from individuals of European ancestry, integrating genetic correlation, bidirectional causal inference, plei
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Exposure to Benzo[a]pyrene (BaP) is linked to multiple autoimmune diseases. This study aims to identify the key genes associated with BaP exposure and primary biliary cholangitis (PBC), shedding light on the underlying molecular mechanisms. METHODS: Comparative toxicogenomics was employed to identify genes shared between BaP targets and PBC. Quantitative trait loci data for methylation, gene expression, and proteins, as well as genome-wide association study data for PBC, were collected. Subsequently, Summary Data-based Mendelian Randomization (SMR) was utilized for analysis. Molecu…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate the association between purine metabolism-related genes and trigeminal neuralgia (TN) using multiomics approaches.
METHODS: A multiomics summary-data-based Mendelian randomization (SMR) approach was applied to investigate associations between purine metabolism-related genes and TN. Genome-wide association study (GWAS) data from FinnGen R10 were integrated with blood-derived DNA methylation quantitative trait loci (mQTL), expression quantitative trait loci (eQTL), and protein quantitative trait loci (pQTL) datasets. Associations were evaluated by colocalization and repl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dementia is clinically and biologically heterogeneous, and genetically supported plasma protein associations across dementia subtypes remain incompletely characterized. We aimed to genetically prioritize plasma proteins associated with overall dementia and major dementia subtypes using proteome-wide Mendelian randomization (MR) and Bayesian colocalization. We used the UK Biobank Pharma Proteomics Project (UKB-PPP) as a harmonized source of cis-protein quantitative trait loci (cis-pQTLs) for 2,941 Olink-measured plasma analytes. The European-ancestry discovery cis-pQTL analysis included up to 3…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The infection by Haemonchus contortus is a significant challenge to sheep production in tropical regions, particularly in developing countri … Ensembl BioMart tool and the Panther Classification System, respectively, along with alignments of quantitative trait loci (QTL). BCS was found to be the best indirect trait correlated with parasitological traits, and selection intensity analysis showed that natural selection contributed 76%, compared to 24% from artificial selection. Traits such as BW, PCV, and TPP exh …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroinflammation in multiple sclerosis (MS) is driven by the infiltration of myelin-reactive T cells into the central nervous system (CNS). … nce of this signature, we cross-referenced the 43-gene signature with publicly available expression quantitative trait loci (eQTL) datasets to determine whether these genes could be influenced by known MS-associated risk variants highlighting Interferon-Induced Transmembrane Protein 3 (IFITM3) as a candidate molecular mediator of MS. This integrative approach provides ne …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC) is a highly heterogeneous gastrointestinal malignancy associated with poor prognosis. A comprehensive understanding of its molecular mechanisms is crucial for identifying novel therapeutic targets. This study employed a multi-omics Mendelian randomization (MR) approach to investigate the causal associations among gene expression, protein expression levels, and immune cells in GC risk.
METHODS: Expression and protein quantitative trait loci (eQTL and pQTL) datasets were analyzed to determine the causal relationships between gene/protein expression, and GC risk u…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies have established a connection between circadian rhythm disruption and the development of type 2 diabetes mellitus (T2DM), yet the underlying genetic mechanisms remain inadequately understood. This research aims to elucidate the causal relationships between circadian rhythm-related genes and T2DM by utilising a multi-omics approach.
METHODS: The study employed the GeneCards database to identify genes associated with circadian rhythms. Integration of quantitative trait loci (QTL) data for gene expression (eQTLs), DNA methylation (mQTLs), and protein expression (pQTLs)…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/OBJECTIVES: Enhancers are key drivers of tissue-specific gene expression and can contain variants associated with pancreatic dise … ee approaches to predict gene-regulatory regions overlapping with fine-mapped pancreatic expression quantitative trait loci (eQTLs) from GTEx (V8). At the eQTL-colocalized and fine-mapped chronic pancreatitis risk locus CTRC we exemplarily evaluated predicted enhancer-promoter interactions. Finally, we provide a genome-wide unified caABC dataset of pancreatic enhancers a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biological mechanisms through which most nonprotein-coding genetic variants affect disease risk are unknown. To investigate gene-regulatory mechanisms, we mapped blood gene expression and splicing quantitative trait loci (QTLs) through bulk RNA sequencing in 4,732 participants and integrated protein, metabolite and lipid data from the same individuals. We identified cis-QTLs for the expression of 17,233 genes and 29,514 splicing events (in 6,853 genes). Colocalization analyses revealed 3,430 proteomic and metabolomic traits with a shared association signal with either gene expression or sp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования