BACKGROUND: Reference materials are essential for the validation, verification, and implementation of clinical assays. Seracare has developed the Seraseq line-commercial reference standards for non-invasive prenatal testing (NIPT)-which are designed to simulate maternal plasma containing cell-free DNA (cfDNA).
OBJECTIVE: This study aims to evaluate the performance of Seraseq reference materials compared to natural maternal plasma, particularly assessing their quality and reliability as reference standards in NIPT workflows, both with and without size selection to enrich fetal fraction.
METHO
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We previously proposed two cell-free (cf) DNA-based scores (genome-wide Z-score and nucleosome score) as candidate non-invasive biomarkers to further improve the presurgical diagnosis of ovarian malignancy. We aimed to investigate the added value of these cfDNA-based scores in combination with the clinical and ultrasound predictors of the Assessment of Different NEoplasias in the adneXa (ADNEX) model to estimate the risk of ovarian malignancy.
METHODS: In this prospective cohort study, 526 patients with an adnexal mass scheduled for surgery were recruited consecutively in three onc
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing prevalence of breast cancer presents a significant global health challenge, highlighting the urgent need for improved diagnostic and treatment monitoring methods. The non-invasive nature of cell-free circulating epigenomic biomarkers, such as methylated DNA (metDNA) and microRNAs (miRNAs), offers a reassuring approach to identifying breast cancer patients in the early stages and assessing their response to therapy. This approach holds great promise for diagnosis and treatment evaluation, prioritizing patient comfort and well-being. Cell-free circulating metDNA and miRNAs are rel
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: An inverse relationship has been identified between tacrolimus serum concentrations and donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) levels after lung transplant, but limited data exists on this relationship in the kidney transplant population. Project Aim: The purpose of this evaluation was to examine the relationship between high tacrolimus variability and elevated dd-cfDNA levels in kidney and simultaneous pancreas-kidney transplant recipients at a single center. Design: Single-center, retrospective, descriptive comparative evaluation of kidney and pancreas-kidney transplant recipie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hemolytic disease of the fetus and newborn (HDFN) is caused by maternal alloantibody-mediated destruction of fetal/neonatal red blood cells (RBCs). While the pathophysiology has been well-characterized, the clinical and laboratory monitoring practices are inconsistent.
METHODS: We surveyed 103 US institutions to characterize laboratory testing practices for individuals with fetuses at risk of HDFN. Questions included antibody testing and titration methodologies, the use of critical titers, paternal and cell-free fetal DNA testing, and result reporting and documentation practices.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the diagnostic value of 5-hydroxymethylcytosines (5hmC) in circulating cell-free DNA (cfDNA) for nasopharyngeal carcinoma (NPC) and to develop a diagnostic model.
METHODS: Genome-wide 5hmC profiles in cfDNA from 174 NPC patients and 146 non-cancer individuals were analyzed using the 5hmC-Seal technique. A cfDNA 5hmC-based diagnostic model to identify NPC patients was developed using least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) logistic regression, and performance was evaluated with receiver operating characteristic (ROC) curves and confusion matrices.
RESULT
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cell-free DNA (cfDNA) analysis offers an attractive noninvasive means of detecting and monitoring diseases. cfDNA cleavage patterns within a short range (e.g., 11 nucleotides) have been reported to correlate with cytosine-phosphate-guanine (CpG) methylation, allowing fragmentomics-based methylation analysis (FRAGMA). Here, we adopted FRAGMA to the extended region harboring multiple nucleosomes, termed FRAGMAXR.
METHODS: We profiled cfDNA nucleosomal patterns over the genomic regions from -800 to 800 bp surrounding differentially methylated CpG sites, harboring approximately 8 nucl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The association between neutrophil extracellular traps (NETs) and the requirement for vasopressor and inotropic support in vasoplegic shock is unclear. This study aimed to investigate the dynamics of plasma levels of NETs and cell-free DNA (cfDNA) up to 48 h after the admission to the intensive care unit (ICU) for management of vasoplegic shock of infectious (SEPSIS) or noninfectious (following cardiac surgery, CARDIAC) origin. Methods: This is a prospective, observational study of NETs and cfDNA plasma levels at 0H (admission) and then at 12H, 24H, and 48H in SEPSIS and CARDIAC pa
СтатьяНаблюдательное исследованиеСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 15,267 pregnancies were tested by NIPT in this study. Grey zone (z score: 2.58 ∼ 4 and -4∼-2.58) was set for screening out aneuploidy 21, 18 and 13. Cases with z score located in the grey zone were retested starting from DNA extraction. The chi-squared test and/or the Fisher's exact test were used to compare variables. One hundred and eight screening-positive samples in the first run of NIPT were common trisomies 21 (N = 83), trisomies18 (N = 13) or trisomies 13 (N = 12), with PPVs of 87.18%, 76.92%, and 30% respectively. For the cases in the grey zone, most of them (67.15%, 184/274
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA cytosine nucleotide methylation (epigenomics and epigenetics) is an important mechanism for controlling gene expression in cardiac development. Combined artificial intelligence and whole-genome epigenomic analysis of circulating cell-free DNA in maternal blood has the potential for the detection of fetal congenital heart defects.
OBJECTIVE: This study aimed to use genome-wide DNA cytosine methylation and artificial intelligence analyses of circulating cell-free DNA for the minimally invasive detection of fetal congenital heart defects.
STUDY DESIGN: In this prospective study,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To assess the performance of a non-invasive prenatal screening test (NIPT) for a panel of dominant single-gene disorders (SGD) with a combined population incidence of 1 in 600.
METHODS: Cell-free fetal DNA isolated from maternal plasma samples accessioned from 14 April 2017 to 27 November 2019 was analyzed by next-generation sequencing, targeting 30 genes, to look for pathogenic or likely pathogenic variants implicated in 25 dominant conditions. The conditions included Noonan spectrum disorders, skeletal disorders, craniosynostosis syndromes, Cornelia de Lange syndrome, Alagille sy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons2022eng
The Molecular Microscope Diagnostic System (MMDx) analyzes RNA transcripts of transplanted heart tissue to differentiate among T cell-mediated rejection (TCMR), antibody-mediated rejection (AMR), injury, and healthy tissue. However, little is known about its performance in relation to other modalities in a real-world heart transplant population. We evaluated whether MMDx performs in agreement with other validated modalities. Two hundred and twenty-eight corresponding endomyocardial biopsies (EMBx) and MMDx specimens from 135 adult heart transplant patients were retrospectively reviewed with co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cell-free DNA (cfDNA) is a noninvasive marker of cellular injury. Its significance in pulmonary arterial hypertension (PAH) is unknown.
METHODS: Plasma cfDNA was measured in 2 PAH cohorts (A, n=48; B, n=161) and controls (n=48). Data were collected for REVEAL 2.0 (Registry to Evaluate Early and Long-Term PAH Disease Management) scores and outcome determinations. Patients were divided into the following REVEAL risk groups: low (≤6), medium (7-8), and high (≥9). Total cfDNA concentrations were compared among controls and PAH risk groups by 1-way analysis of variance. Log-rank tests
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis (OP) is a multifactorial disorder in which environmental factors along with genetic variants and epigenetic mechanisms have been implicated. Long non-coding RNAs (lncRNAs) have recently emerged as important regulators of bone metabolism and OP aetiology. In this study, we analyzed the expression level and the genetic association of lncRNA GAS5 in OP patients compared to controls. Quantitative RT-PCR analysis of GAS5 was performed on the serum of 56 OP patients and 28 healthy individuals. OP subjects were divided into three groups of analysis: 29 with fragility fractures of lumbar
Клиническое исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute rejection (AR) of a kidney graft in renal transplant recipients is associated with microvascular injury in graft dysfunction and, ultimately, graft failure. Circulating long noncoding RNAs (lncRNAs) may be suitable markers for vascular injury in the context of AR. Here, we first investigated the effect of AR after kidney transplantation on local vascular integrity and demonstrated that the capillary density markedly decreased in AR kidney biopsies compared to pre-transplant biopsies. Subsequently, we assessed the circulating levels of four lncRNAs (LNC-RPS24, LNC-EPHA6, MALAT1, and LIPCA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New diagnostics are needed to improve clinicians' ability to detect tuberculosis (TB) disease in key populations such as children and persons living with HIV and to rapidly detect drug resistance. Circulating cell-free DNA (ccfDNA) in plasma is a diagnostic target in new obstetric and oncologic applications, but its utility for diagnosing TB is not known. Here we show that Mycobacterium tuberculosis complex DNA can be detected in plasma of persons with sputum smear-positive TB, even in the absence of mycobacteremia. Among 40 participants with bacteriologically-confirmed smear-positive TB disea
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) encompasses tumors arising from several locations (oral and nasal cavities, paranasal sinuses, salivary glands, pharynx, and larynx) and currently stands as the sixth most common cancer worldwide. The most important risk factors identified so far are tobacco and alcohol consumption, and, for a subgroup of HNSCCs, infection with high-risk types of human papillomavirus (HPV). Despite several improvements in the treatment of these tumors in the last decades, overall survival rates have only improved marginally, mainly due to the advanced clinical stag
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: Homocysteine (HCY) metabolism is regulated by the methionine cycle, which is essential for DNA methylation and is associated with the folate cycle. This study examines the alterations in DNA methylation signature including epigenetic age changes, measure cell-free DNA (cfDNA), and HCY concentrations, and identifies genetic markers that may influence homocysteine response following folic acid (FA) supplementation in individuals with hyperhomocysteinemia (HHC). Methods: Blood samples were obtained from 43 HHC patients undergoing FA supplementation. We quantified FA and HCY levels, separ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutrophil extracellular traps (NETs) are web-like structures comprising chromatin scaffolds decorated with cytotoxic granule proteins released during a specialized form of neutrophil cell death termed NETosis. Although NETs function as a critical antimicrobial defense mechanism, their dysregulation contributes significantly to the pathogenesis of systemic lupus erythematosus (SLE). In SLE patients, both excessive NET formation by proinflammatory low-density granulocytes (LDGs) and impaired NET clearance due to reduced or acquired DNase1/DNase1L3 activity create a pathogenic cycle that amplifi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The management of metastatic breast cancer (mBC) relies on tissue-based immunohistochemical subtypes. However, biopsies are invasive and may not capture metastatic heterogeneity, and subtypes can change over time under treatment pressure. In this study, we developed cell-free DNA (cfDNA) methylation signatures for minimally invasive breast cancer detection, distinction, and estrogen receptor (ER) status classification. Peripheral blood plasma methylomes were analyzed from 79 patients with mBC spanning ER+/human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)- (n = 45), HER2+ (n = 13), an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования