OBJECTIVE: This study aimed to explore the effects and related mechanisms of pinoresinol diglucoside (PDG) on osteoarthritis (OA) via a combination of pharmacology and animal experiments.
METHODS: Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform (TCMSP) Drugbank, Online Mendelian Inheritance in Man, and GeneCards databases were used to predict the putative targets of PGD against OA. A protein protein interaction (PPI) network was constructed in STING database to analyze the interaction network of these targets. Enrichment analysis was performed with DAVID database. The OA model was
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Light chain amyloidosis is a medical condition characterized by the aggregation of misfolded antibody light chains into insoluble amyloid fibrils in the target organs, causing organ dysfunction, organ failure, and death. Despite extensive research to understand the factors contributing to amyloidogenesis, accurately predicting whether a given protein will form amyloids under specific conditions remains a formidable challenge. In this study, we have conducted a comprehensive analysis to understand the amyloidogenic tendencies within a dataset containing 1828 (348 amyloidogenic and 1480 non-amyl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The malaria parasite Plasmodium obligatorily infects and replicates inside hepatocytes surrounded by a parasitophorous vacuole membrane (PVM), which is decorated by the host-cell derived autophagy protein LC3. We have previously shown that the parasite-derived, PVM-resident protein UIS3 sequesters LC3 to avoid parasite elimination by autophagy from hepatocytes. Here we show that a small molecule capable of disrupting this interaction triggers parasite elimination in a host cell autophagy-dependent manner. Molecular docking analysis of more than 20 million compounds combined with a phenotypic s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An emergent problem in the study of pathogen evolution is our ability to determine the extent to which their rapidly evolving genomes recombine. Such information is necessary and essential for locating pathogenicity loci using association studies, and it also directs future screening, therapeutic and vaccination strategies. Recombination also complicates the use of phylogenetic approaches to infer evolutionary parameters including selection pressures. Reliable methods that identify the presence of regions of recombination are therefore vital. We illustrate the use of an integrated model-based
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although whole-genome sequencing has provided novel insights into Neisseria meningitidis, many open reading frames have only been annotated as hypothetical proteins with unknown biological functions. Our previous genetic analyses revealed that the hypothetical protein, NMB1345, plays a crucial role in meningococcal infection in human brain microvascular endothelial cells; however, NMB1345 has no homology to any identified protein in databases and its physiological function could not be elucidated using pre-existing methods. Among the many biological technologies to examine transient protein-pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This scoping review systematically evaluated the effects of protein supplements on the gut microbiome, metabolites, integrity, and inflammation. Studies investigating plant- or animal-based protein supplements in adults were identified from five electronic databases. Data were thematically synthesized; study quality was appraised using the Mixed Methods Appraisal Tool. Fourteen studies were included: whey protein (n = 9), pea protein (n = 3), soy protein (n = 2), and casein protein (n = 1). Doses ranged from 10-85 g/day (whey), 7.3-25 g/day or 30% of total energy (pea), and 15-40 g/day (soy).
СтатьяScoping ReviewПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV protease, an essential enzyme for viral particle maturation, is an important drug target of HIV. Its structural conformation is a key determinant of both biological function as well as efficient binding of protease inhibitor molecules. In the present study we analyzed 471 crystal structures of HIV-1 protease to understand the conformational changes induced by mutations or binding of various ligands and substrates. We performed principal component analysis on the ensembles of the HIV-1 protease structures to explore the conformational landscapes. The study identified structural differences
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuropeptides represent a unique class of signaling molecules that have garnered much attention but require special consideration when identifications are gleaned from mass spectra. With highly variable sequence lengths, neuropeptides must be analyzed in their endogenous state. Further, neuropeptides share great homology within families, differing by as little as a single amino acid residue, complicating even routine analyses and necessitating optimized computational strategies for confident and accurate identifications. We present EndoGenius, a database searching strategy designed specificall
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Intervertebral disc degeneration (IDD) is a progressive chronic condition that commonly causes low back pain. Cancer is among the primary reasons for deaths worldwide. Our purpose was to identify the characteristic genes of IDD and explore the potential association between IDD and cancer.
METHODS: Immune cell infiltration and differentially expressed analysis were conducted utilizing data from the GSE124272 database. Enrichment analysis of differentially expressed genes (DEGs) was performed to explore the possible mechanisms underlying IDD development. Moreover, weighted gene corr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orbital compartments harbor a variety of tissues that can be independently targeted in a plethora of disorders resulting in sight-threatening risks. Orbital inflammatory disorders (OID) including Graves' ophthalmopathy, sarcoidosis, IgG4 disease, granulomatosis with polyangiitis, and nonspecific orbital inflammation constitute an important cause of pain, diplopia and vision loss. Physical examination, laboratory tests, imaging, and even biopsy are not always adequate to classify orbital inflammation which is frequently deemed "nonspecific". Tear sampling and testing provide a potential "window
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Respiratory cancer database (RespCanDB) is a genomic and proteomic database of cancer of respiratory organ. It also includes the information of medicinal plants used for the treatment of various respiratory cancers with structure of its active constituents as well as pharmacological and chemical information of drug associated with various respiratory cancers.
MATERIALS AND METHODS: Data in RespCanDB has been manually collected from published research article and from other databases. Data has been integrated using MySQL an object-relational database management system. MySQL manages all
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scorpion venoms include several compounds with different pharmacological activities. Within these compounds, toxins affecting ion channels are among the most studied. They are all peptides that have been classified based on their 3D structure, chain size and function. Usually, they show a spatial arrangement characterized by the presence of a cysteine-stabilized alpha beta motif; most of them affect Na(+) and K(+) ion-channels. These features have been revised in several occasions before, but a complete phylogenetic analysis of the disulfide containing peptides is not been done. In the present
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analysed the roles and distribution of metal ions in enzymatic catalysis using available public databases and our new resource Metal-MACiE (http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/Metal_MACiE/home.html). In Metal-MACiE, a database of metal-based reaction mechanisms, 116 entries covering 21% of the metal-dependent enzymes and 70% of the types of enzyme-catalysed chemical transformations are annotated according to metal function. We used Metal-MACiE to assess the functions performed by metals in biological catalysis and the relative frequencies of different metals in different roles, whic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short-chain alcohol dehydrogenases (SCAD) constitute a large and diverse family of ancient origin. Several of its members play an important role in human physiology and disease, especially in the metabolism of steroid substrates (e.g., prostaglandins, estrogens, androgens, and corticosteroids). Their involvement in common human disorders such as endocrine-related cancer, osteoporosis, and Alzheimer disease makes them an important candidate for drug targets. Recent phylogenetic analysis of SCAD is incomplete and does not allow any conclusions on very ancient divergences or on a functional chara
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recombinant SA35 peptide has been described as an antigenic portion of a larger Cryptosporidium parvum protein. We identified and characterized the encoding Cpa135 gene and the entire protein, Cpa135. The Cpa135 gene was found to consist of a single exon of 4671 bp, and the mRNA transcribed in the sporozoites was identified. The predicted 1556 amino-acid protein showed the presence of domains which are widely conserved also in other unrelated phylogenetic groups (i.e. a ricin B and a LCCL motif). Comparison of Cpa135 sequence with genomic and protein databases revealed many related genes i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein S is a central regulator of coagulation as it critically participates in down-regulation of both extrinsic and intrinsic pathways of the coagulation cascade. In this review, we aim to provide an update on protein S and its anticoagulant functions as a central hemostatic regulator.
METHODS: Electronic databases including, Google, Google Scholar, PMC, PubMed, Science Direct, and Scopus were rigorously searched using the terms protein S, hemostasis, natural anticoagulants, regulators of coagulation, and coagulation inhibitors for the completion of this descriptive review.
RE
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanogenic archaea research is challenged by limited strain resources, fragmented genomic data, inconsistent genome quality, substantial uncultured lineages, and difficulties in laboratory culturing, hindering advances in biogas production, climate mitigation, and microbial ecology. These archaea play crucial roles in global carbon cycling and anaerobic environments, yet scattered data and unculturable strains limit systematic studies and applications. To address this, we created MethArDB (Methanogenic Archaeal Genome Database), a specialized database for methanogenic archaea, compiling 3919
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 2019 Novel Coronavirus (SARS-CoV-2) has infected millions of people worldwide and caused millions of deaths. The virus has gone numerous mutations to replicate faster, which can overwhelm the immune system of the host. Linear B-cell epitopes are becoming promising in prevention of various deadly infectious diseases, breaking the general idea of their low immunogenicity and partial protection. However, there is still no public repository to host the linear B-cell epitopes for facilitating the development vaccines against SARS-CoV-2. Therefore, we developed BCEDB, a linear B-cell epitopes da
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a genotype-phenotype analysis of a family in which a titinopathy is transmitted in an autosomal dominant pattern. In this family, following neurological history and examination, electromyogram, and muscle biopsy, the diagnosis of limb-girdle muscular dystrophy with contractures was made in an affected mother and son. Genetic testing employing the whole exome was performed and revealed two variants in the TTN gene, c.712G>C, p. Glu238Gln and c.1397A>C, p.Gln466Arg, which segregated with the disease in the affected mother-son duo but not in an unaffected sibling. Although protein model
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, firstly, the pharmacophore model was established based on LAR inhibitors. ZINC database and drug-like database were screened by Hypo-1-LAR model, and the embryonic compound ZINC71414996 was obtained. Based on this compound, we designed 9 compounds. Secondly, the synthetic route of the compound was determined by consulting Reaxys and Scifinder databases, and 9 compounds (1a-1i) were synthesized by nucleophilic substitution, Suzuki reaction and so on. Meanwhile, their structures were confirmed by 1H NMR and 13C NMR. Thirdly, the Enzymatic assays was carried out, the biological eva
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.