Organ function depends on the precise spatial organization of cells across multiple scales, from individual units to cellular communities that form local niches and, ultimately, higher-order structures. Although cell identities are increasingly well defined, the spatial arrangement and interactions among diverse cell types remain poorly understood. Here, we combine single-cell and spatial transcriptomics to map pancreatic cell populations across space and time, from embryonic development to adult homeostasis in mice. Using these maps, we resolve spatial heterogeneity among pancreatic cell type
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We recently reported that a combination of four transcription factors (Nkx2-1, Foxa1, Foxa2, and Gata6) directly reprograms mouse embryonic fibroblasts (MEFs) into differentiated self-renewable alveolar epithelial-like cells in a serum-free 3D organoid system. Here, we aimed to generate induced pulmonary epithelial-like cells in serum-containing culture (iPULsSC) using the same four transcription factors in a serum-containing 3D culture system. We found that the global gene expression profile of iPULsSC was similar to that of alveolar epithelial type II (AT2) and alveolar type I (AT1) cells. S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DBHS protein family of Nono, PSPC1, and SFPQ regulates diverse aspects of RNA metabolism. Whether these proteins share similar functions is currently unknown. In mouse embryonic fibroblasts (MEFs), we observed around 2000 circadian and non-circadian genes regulated by Nono and PSPC1, with only 35% in common. Considering specifically circadian genes, up- or downregulation by Nono and PSPC1 depends mainly on the gene phase. We postulated a regulatory role of Nono on R-loops, the class of non-B DNA structures that form during transcription. We confirmed this by showing a broad effect of Nono
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PAX6 is well known as a transcription factor that drives eye development in animals as widely divergent as flies and mammals. In addition to its localization in eyes, PAX6 expression has been reported in the central nervous system, the pancreas, testes, Merkel cells, nasal epithelium, developing cells of the inner ear, and embryonic submandibular salivary gland. Here we show that PAX6 also appears to be present in the mechanosensory neuromasts of the lateral line system in paedomorphic salamanders of the genus Eurycea. Using immunohistochemistry and confocal microscopy to examine a limited num
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global increase in invasive fungal infections and the emergence of drug-resistant strains demand the urgent development of novel antifungal drugs. In this context, synthetic polymers with diverse compositions, mimicking natural antimicrobial peptides, have shown promising potential for combating fungal infections. This study investigates how altering polymer end-groups and topology from linear to branched star-like structures affects their efficacy against Candida spp., including clinical isolates. Additionally, the polymers' biocompatibility is accessed with murine embryonic fibroblasts a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the rapid generation of spatial transcriptomics (ST) data, integrative analysis of multiple ST datasets from different conditions, technologies and developmental stages is becoming increasingly important. Here we present a graph attention neural network called STAligner for integrating and aligning ST datasets, enabling spatially aware data integration, simultaneous spatial domain identification and downstream comparative analysis. We apply STAligner to ST datasets of the human cortex slices from different samples, the mouse olfactory bulb slices generated by two profiling technologies, t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Krüppel-like factors (KLFs) are a family of transcription factors characterised by zinc-finger structures at the C-terminal. They play the key roles in cell proliferation, differentiation, and migration, as well as in embryonic development. They have been widely expressed in multiple systems in vivo, and their dysregulation is closely associated with a variety of human diseases. Glycolipid metabolism is a complex physiological process which can be regulated at the transcriptional level. Glycolipid metabolic diseases, such as obesity, non-alcoholic fatty liver disease, diabetes, and their compl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During embryonic development, epithelial cell blocks called somites are periodically formed according to the segmentation clock, becoming the foundation for the segmental pattern of the vertebral column. The process of somitogenesis has recently been recapitulated with murine and human pluripotent stem cells. However, an in vitro model for human somitogenesis coupled with the segmentation clock and epithelialization is still missing. Here, we report the generation of human somitoids, organoids that periodically form pairs of epithelial somite-like structures. Somitoids display clear oscillatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Embryonic development is dictated by tight regulation of DNA replication, cell division and differentiation. Mutations in DNA repair and replication genes disrupt this equilibrium, giving rise to neurodevelopmental disease characterized by microcephaly, short stature and chromosomal breakage. Here, we identify biallelic variants in two components of the RAD18-SLF1/2-SMC5/6 genome stability pathway, SLF2 and SMC5, in 11 patients with microcephaly, short stature, cardiac abnormalities and anemia. Patient-derived cells exhibit a unique chromosomal instability phenotype consisting of segmented and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of ductal structures during branching morphogenesis relies on signals that specify ductal progenitors to set up a pattern for the ductal network. Here, we identify cellular asymmetries defined by the F-actin cytoskeleton and the cell adhesion protein ZO-1 as the earliest determinants of duct specification in the embryonic submandibular gland (SMG). Apical polarity protein aPKCζ is then recruited to the sites of asymmetry in a ZO-1-dependent manner and collaborates with ROCK signaling to set up apical-basal polarity of ductal progenitors and further define the path of duct speci
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phakomatoses, or neurocutaneous syndromes, are a heterogeneous group of rare genetic disorders that predominantly affect structures arising from the embryonic ectoderm, namely the skin, eye globe, retina, tooth enamel, and central nervous system. Other organs are also involved in some syndromes, mainly cardiovascular, pulmonary, renal, and musculoskeletal systems. Currently, more than sixty distinct entities belonging to this category have been described in the literature. Common phakomatoses include conditions like Neurofibromatosis and Tuberous sclerosis. Several review papers have focused o
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The neural circuits regulating motivation and movement include midbrain dopaminergic neurons and associated inhibitory GABAergic and excitatory glutamatergic neurons in the anterior brainstem. Differentiation of specific subtypes of GABAergic and glutamatergic neurons in the mouse embryonic brainstem is controlled by a transcription factor Tal1. This study characterizes the behavioral and neurochemical changes caused by the absence of Tal1 function. The Tal1cko mutant mice are hyperactive, impulsive, hypersensitive to reward, have learning deficits and a habituation defect in a novel environme
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Failure of neural tube closure during embryonic development can result in anencephaly, one of the most common birth defects in humans. A family with recurrent anencephalic fetuses was investigated to understand its etiology and pathogenesis. Exome sequencing revealed a recessive germline 21-bp in-frame deletion in NUAK2 segregating with the disease. In vitro kinase assays demonstrated that the 7-amino acid truncation in NUAK2, a serine/threonine kinase, completely abrogated its catalytic activity. Patient-derived disease models including neural progenitor cells and cerebral organoids showed th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal organoid cultures provide an in vitro model system for studying pathways and mechanisms involved in epithelial damage and repair. Derived from either embryonic or induced pluripotent stem cells or adult intestinal stem cells or tissues, these self-organizing, multicellular structures contain polarized mature cells that recapitulate both the physiology and heterogeneity of the intestinal epithelium. These cultures provide a cutting-edge technology for defining regenerative pathways that are induced following radiation or chemical damage, which directly target the cycling intestinal s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lack of engineering systems able to faithfully reproduce complex kidney structures in vitro has made it difficult to efficiently model kidney diseases and development. Using polydimethylsiloxane (PDMS) scaffolds and a kidney-derived cell line we developed a system to rapidly engineer custom-made 3D tubules with typical renal epithelial properties. This system was successfully employed to engineer patient-specific tubules, to model polycystic kidney disease (PKD) and test drug efficacy, and to identify a potential new pharmacological treatment. By optimizing our system we constructed functi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impairment of autophagic and proteasomal cleansing together with changes in pigmentation has been documented in retinal pigment epithelial (RPE) cell degeneration. However, the function and co-operation of these mechanisms in melanosome-containing RPE cells is still unclear. We show that inhibition of proteasomal degradation with MG-132 or autophagy with bafilomycin A1 increased the accumulation of premelanosomes and autophagic structures in human embryonic stem cell (hESC)-derived RPE cells. Consequently, upregulation of the autophagy marker p62 (also known as sequestosome-1, SQSTM1) was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vulvar masses are rare in prepubertal girls. Lipoblastomas are benign adipose tumors that arise from embryonic white fat and occur almost exclusively in infants and children.
CASE: An 18-month-old female infant presented with a 2-cm mobile mass in the left labia majora. Imaging and examination revealed normal prepubertal gynecologic structures and a 4.5 cm fatty mass in the left labia. Surgical excision revealed a 3.8 cm well circumscribed adipose tissue mass consistent with maturing lipoblastoma on microscopic examination. Cytogenetic analysis revealed 79,XXX [7]/46,XX[13], a nea
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ovary surface epithelium (OSE) undergoes ovulatory tear and remodelling throughout life. Resident stem cells drive such tissue homeostasis in many adult epithelia, but their existence in the ovary has not been definitively proven. Lgr5 marks stem cells in multiple epithelia. Here we use reporter mice and single-molecule fluorescent in situ hybridization to document candidate Lgr5(+) stem cells in the mouse ovary and associated structures. Lgr5 is broadly expressed during ovary organogenesis, but becomes limited to the OSE in neonate life. In adults, Lgr5 expression is predominantly restric
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cranial placodes are embryonic structures essential for sensory and endocrine organ development. Human placode development has remained largely inaccessible despite the serious medical conditions caused by the dysfunction of placode-derived tissues. Here, we demonstrate the efficient derivation of cranial placodes from human pluripotent stem cells. Timed removal of the BMP inhibitor Noggin, a component of the dual-SMAD inhibition strategy of neural induction, triggers placode induction at the expense of CNS fates. Concomitant inhibition of fibroblast growth factor signaling disrupts placode de…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transcription factor TBX3 plays critical roles in development and TBX3 mutations in humans cause Ulnar-mammary syndrome. Efforts to understand how altered TBX3 dosage and function disrupt the development of numerous structures have been hampered by embryonic lethality of mice bearing presumed null alleles. We generated a novel conditional null allele of Tbx3: after Cre-mediated recombination, no mRNA or protein is detectable. In contrast, a putative null allele in which exons 1-3 are deleted produces a truncated protein that is abnormally located in the cytoplasm. Heterozygotes and homozyg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования