Neurodegeneration is the progressive loss of structure or function of neurons leading to neuronal death, usually associated with ageing. Some of the common neurodegenerative disorders include Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Creutzfeldt-Jakob disease, and Huntington's disease. Due to recent advancements in highthroughput technologies in various disciplines such as genomics, epigenomics, metabolomics and proteomics, there has been a great demand for detection of specific macromolecules such as hormones, drug residues, miRNA, DNA, antibodies, peptides, proteins, pathogens and xenobiotic…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coordinated changes in gene expression, epigenetic regulation, protein and metabolic activities together drive disease progression and determine clinical outcomes. While spatially resolved transcriptomics has been widely adopted across biomedical fields, it offers an incomplete picture limited to transcriptomic levels. Here, we survey the latest developments in spatial multiomics technologies, with particular emphasis on platforms that extend beyond conventional transcriptomics and profile genomics, epigenomics, proteomics, or metabolomics within intact tissues. These approaches are rapidly be…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is the predominant risk factor for neurodegenerative diseases, yet the mechanisms linking biological aging to selective neuronal degeneration remain incompletely understood. Accumulating evidence indicates that aging progressively disrupts epigenetic regulation, manifested as increased epigenetic noise in DNA methylation, histone modifications, and chromatin accessibility, which undermines transcriptional precision and the stability of neuronal identity. Recent advances in single-cell and spatial epigenomics further suggest that these age-associated epigenetic alterations are not merely …
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injuries are often devastating and result in severe functional limitations. Our review breaks down the pathophysiology, molecular mechanisms, and omics approaches regarding spinal cord injuries. The pathophysiology can be divided into two main phases, with the secondary phase being of greater interest. Understanding the underlying mechanisms behind these phases allows for targeted approaches to be developed. Advancements in omics technologies (genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics) are excellent tools in creating tailored spinal cord injury treatment …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cocaine self-administration induces neurobiological adaptations in brain circuits involved in encoding reward-associated context. The dorsal hippocampus, particularly the dorsal dentate gyrus, plays a critical role in the precise encoding of spatial and contextual information. We hypothesized that the dentate gyrus is uniquely positioned to undergo epigenomic and transcriptomic changes because of the convergence of the contextual features of reward and cocaine-enhanced dopamine and norepinephrine signals during volitional drug-taking. We report that cocaine self-administration produces signifi
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The maintenance of local immunity requires stable tissue adaptation, implying that persistent environmental cues must continuously reinforce … e studies should integrate causal microbial genetics, longitudinal metabolomics, cell-type-resolved epigenomics, and human validation to distinguish causal mechanisms from associative findings and enable safe tissue- and patient-specific therapeutic translation. This review therefore outlines the microbiota-metabolite-epigenome axis as a unifying framework fo …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) is a persistent environmental pollutant widely present in ecosystems and humans, linked to numerous diseases, including cancers, due to its potent toxicity. Despite its harmful effects, effective strategies for mitigating PFOS-induced toxicity remain undeveloped or at best underdeveloped. In this effort, we explore the concept of toxicity reversal by loci-specific DNA methylation editing to reverse PFOS-induced toxicity, whereby key cellular processes such as proliferation, migration, and apoptosis are restored. To demonstrate our concept, we employed CRISPR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetics refers to how gene expression and function are modulated without modifying the DNA sequence but through subtle molecular changes or interactions with it. As spermatogenesis progresses, male germ cells suffer plenty of epigenetic modifications, resulting in the definitive epigenome of spermatozoa conditioning its functionality, and this process can be altered by several internal and external factors. The paternal epigenome is crucial for sperm function, fertilization, embryo development, and offspring's health, and altered epigenetic states are associated with male infertility with
ОбзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: We present a current perspective of epigenetic alterations that can lead to cardiovascular disease (CVD) and the potential of dietary factors to counteract their actions. In addition, we discuss the challenges and opportunities of dietary treatments as epigenetic modifiers for disease prevention and therapy.
RECENT FINDINGS: Recent epigenome-wide association studies along with candidate gene approaches and functional studies in cell culture and animal models have delineated mechanisms through which nutrients, food compounds and dietary patterns may affect the epigenome. Sev
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several studies suggest that individual variability is a critical component underlying drug addiction as not all members of a population who use addictive substance become addicted. There is evidence that the overall epigenetic status of a cell (epigenome) can be modulated by a variety of environmental factors, such as nutrients and chemicals. Based on these data, our aim was to investigate whether environmental factors like S-adenosylmethionine (SAM) via affecting epigenome could alter cocaine-induced gene expression and locomotor sensitization in mice. Our results demonstrate that repeated S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone-marrow mesenchymal stem cell (BM-MSC) proliferation and lineage commitment are under the coordinated control of metabolism and epigenetics; the MSC niche contains low oxygen, which is an important determinant of the cellular metabolic state. In turn, metabolism drives stem cell fate decisions via alterations of the chromatin landscape. Due to the fundamental role of BM-MSCs in the development of adipose tissue, bones and cartilage, age-associated changes in metabolism and the epigenome perturb the balance between stem cell proliferation and differentiation leading to stem cell depletion,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG) is the leading cause of brain tumor-related death in children, with median survival of less than one year. Despite decades of clinical trials, there has been no improvement in prognosis since the introduction of radiotherapy over thirty years ago.
OBJECTIVE: To review the clinical features and current treatment challenges of DIPG, and discuss emerging insights into the unique genomic and epigenomic mechanisms driving DIPG pathogenesis that present new opportunities for the identification of therapeutic targets.
CONCLUSION: In recent years,
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Aluminum (Al) toxicity in acidic soils is a major constraint to rice production worldwide. However, the epigenetic mechanisms underlying genotypic differences in Al tolerance remain largely unexplored.
METHODS: We integrated whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) and RNA sequencing (RNA-seq) to characterize DNA methylation dynamics and their relationship with gene expression in two contrasting Oryza sativa genotypes, Al-tolerant Azucena and Al-susceptible BGI, exposed to prolonged Al stress (10 days).
RESULTS: Genome-wide analysis revealed pronounced context-specific methylat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Though open chromatin may promote active transcription, gene expression responses may not be directly coordinated with changes in chromatin accessibility. Most existing methods for single-cell multi-omics data focus only on learning stationary, shared information among these modalities, overlooking modality-specific information delineating cellular states and dynamics resulting from causal relations among modalities. To address this, the epigenome-transcriptome relationship can be characterized in relation to time as coupled (changing dependently) or decoupled (changing independently). We prop
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hematopoietic stem cell (HSC) aging underlies age-related immune decline, anemia and increased risk of hematologic malignancies, including clonal hematopoiesis and leukemia. Many available microarray and bulk RNA sequencing studies have elucidated conserved transcriptional hallmarks, such as myeloid bias, inflammation dysregulation, and self-renewal reinforcement in aged HSCs across mouse and human models. Here, we review key publicly available transcriptome and epigenome datasets from landmark studies, highlighting their contributions to defining HSC molecular aging signatures. We also summar
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: We generated 64 epigenomic datasets using chromatin immunoprecipitation with sequencing and assay for transposase-accessible chr … cinogen glucuronidation pathways were enriched in luminal sites. Integrating germline variation and epigenomics through a cistrome-wide association study identified a new bladder cancer risk locus upstream of SPINK1 and linked 10 of 19 bladder cancer risk loci to regulatory elements from a 350,000-sample genome-wide association study.
IMPLICATIONS: Overall, …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Choroid plexus tumors (CPTs) are intraventricular tumors derived from the choroid plexus epithelium and occur frequently in children. The aim of this study was to investigate the genomic and epigenomic characteristics of CPT and identify the differences between choroid plexus papilloma (CPP) and choroid plexus carcinoma (CPC). We conducted multiomics analyses of 20 CPT patients including CPP and CPC. Multiomics analysis included whole-genome sequencing, whole-transcriptome sequencing, and methylation sequencing. Mutually exclusive TP53 and EPHA7 point mutations, coupled with the amplification
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The search for aetiology of Mendelian disorders is traditionally based on the observation of clinical phenotypes and molecular screening of … features, we confirmed the NEDSDV diagnosis. Our findings show that the combination of genomic and epigenomics strategies, along with a deeper analysis of clinical phenotype, may provide a significant improvement in the diagnostic protocols for rare genetic disorders and help resolve long-time misdiagnosed and unsolved case.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During preimplantation development, a wave of genome-wide DNA demethylation occurs to acquire a hypomethylated genome of the blastocyst. As an essential epigenomic event, postfertilization DNA demethylation is critical to establish full developmental potential. Despite its importance, this process is prone to be disrupted due to environmental perturbations such as manipulation and culture of embryos during in vitro fertilization (IVF), and thus leading to epigenetic errors. However, since the first case of aberrant DNA demethylation reported in IVF embryos, its underlying mechanism remains unc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is growing evidence linking epigenetic mutations to neurologic disorders such as epilepsy. The effect of the medications primarily used to treat neurologic disorders has recently been studied, including research on epilepsy and the epigenetic process. The impact of the widely used medication diazepam on epigenomics, microRNA levels, the ensuing genetic exposure and potential clinical effects was reviewed. The action of diazepam, particularly in altering the synthesis of enzyme 5' adenosine monophosphate activated protein kinase (AMPK) was found to affect many enzymes, which changes or mo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.