BACKGROUND: Fibroblastic foci (FF) are characteristic features of usual interstitial pneumonia (UIP)/idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) and … elucidate similarities and differences as well as shared pathomechanisms. For this purpose, we used laser capture microdissection, mRNA and protein expression analysis. Biological pathway analysis was performed using two different gene expression databases. As control samples, we used healthy lung tissue that was donated but not used for lung transplantation.
RESULTS: Based o …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lumbar spinal stenosis (LSS) is a common reason for spine surgery in which ligamentum flavum is resected. Transthyretin (TTR) am … was evaluated by Congo Red staining and in those with amyloid, precursor protein was determined by laser capture microdissection coupled to mass spectrometry (LCM-MS). The phenotype was assessed by disease-specific questionnaires (Swiss Spinal Stenosis Questionnaire and Kansas City Cardiomyopathy Questionnaire) and the 36-question short-form health survey, as well as biochemi …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric vagal afferent (GVA) sensing of food-related mechanical stimuli is a crucial mechanism in the control of feeding behavior and gastri … VA cell bodies was determined in 8-wk-old male C57BL/6 mice using quantitative RT-PCR combined with laser capture microdissection. The mechanosensitivity of GVAs was determined in the absence and presence of stress hormones using an in vitro single-fiber recording preparation. NR3C1 and CRHR2 (mRNA isoforms of glucocorticoid receptor and CRF2 receptor, respectively) were expre …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are multiple Henneguya spp. (Myxozoa: Myxobolidae) endemic to North American catfish aquaculture that affect the gills of channel catf … itis, and rare cartilage lysis, suggesting impaired gill function. Mature plasmodia were excised by laser capture microdissection from ethanol-fixed, hematoxylin and eosin-stained histologic sections for molecular analysis. Fragments (700 bp) of a highly variable region of the 18S rRNA gene, diagnostic for the Myxobolidae, were 100% similar at the nucleotide level to Henneguya …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rare neural cell adhesion molecule (NCAM) positive cells have been previously described within the normal human adult kidney interstitium, s … ls measured by qRT-PCR were different. Applying qRT-PCR on pure NCAM+ cells population, obtained by laser capture microdissection, significant mRNA over-expression of NCAM140kD isoform was found in NCAM+ cells within incipient IRF (p = 0.004), while NCAM120kD and NCAM180kD isoforms were not changed significantly (p = 0.750; p = 0.704; respectively). Simultaneously, qRT-PCR als …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: There is an unmet clinical need for biomarkers to identify breast cancer patients at an increased risk of developing brain metastases. The objective is to identify gene signatures and biological pathways associated with human epidermal growth factor receptor 2-positive (HER2+) brain metastasis.
METHODS: We combined laser capture microdissection and gene expression microarrays to analyze malignant epithelium from HER2+ breast cancer brain metastases with that from HER2+ nonmetastatic primary tumors. Differential gene expression was performed including gene set enrichment analysis…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Similar to the pancreatic intraepithelial neoplasia (PanIN)-pancreatic carcinoma sequence model, intrahepatic cholangiocarcinoma … and GNAS mutations at codon 201 were analyzed using genomic DNA extracted from isolated lesions by laser capture microdissection [corrected]. Immunohistochemical expression of p53 also was evaluated in BilIN lesions, ICCs, and extrahepatic cholangiocarcinomas (ExCCs).
RESULTS: A prevalence of KRAS mutations was identified in patients with ICC (31.5%), BilIN-3 (30%), and BilI …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loss of heterozygosity of 1p35-pter, 4q, and 18q is frequent in gastric carcinoma, suggesting that these regions harbor tumor suppressor genes. However, the differences in these genetic alterations between adenocarcinoma of the gastric cardia and adenocarcinoma of the distal stomach remain unclear. In this study, loss of heterozygosity at chromosomes 1p35-pter, 4q, and 18q were analyzed in adenocarcinoma of the gastric cardia and adenocarcinoma of the distal stomach samples acquired by laser capture microdissection. The expression of several tumor suppressor gene proteins, runt-related transcr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology and significance of cardia intestinal metaplasia (CIM) is disputed. CIM may represent a form of Barrett's esophagus due to reflux or could reflect generalized gastric intestinal metaplasia due to Helicobacter pylori. The aim of this study was to utilize gene expression data to compare CIM to Barrett's and gastric intestinal metaplasia. Endoscopic biopsies were classified by endoscopic and histologic criteria as CIM (n= 33), Barrett's (n= 25), or gastric intestinal metaplasia of the antrum or body (n= 18). The squamocolumnar and gastroesophageal junctions were aligned in CIM patien
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European journal of pediatric surgery : official journal of Austrian Association of Pediatric Surgery ... [et al] = Zeitschrift fur Kinderchirurgie2011eng
INTRODUCTION: The nitrofen model of congenital diaphragmatic hernia (CDH) creates a Bochdalek-type diaphragmatic defect and has been widely … tion (D9). Fetuses were sacrificed on D13, D18 or D21. The PPF was dissected from D13 fetuses using laser capture microdissection. Diaphragms were dissected from D18 and D21 fetuses under the dissection microscope. The relative mRNA expression levels of COUP-TFII were determined using real-time PCR. Immunohistochemistry was performed to evaluate diaphragmatic protein expressio …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The expression of NKX3.1, a transcriptional regulator and tumor suppressor gene in prostate cancer, is downregulated during early stages of prostate tumorigenesis. However, little is known of the alterations in gene expression that occur as a result of this event. We combined laser capture microdissection and gene expression profiling to analyse the molecular consequences of Nkx3.1 loss during prostate cancer initiation using Nkx3.1-deficient mice. This analysis identified a cohort of genes (loss-of-Nkx3.1 signature) that are aberrantly overexpressed during loss-of-Nkx3.1-driven tumor initiati…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extramedullary hematopoiesis (EMH) in the spleen is a characteristic feature of the chronic myeloproliferative disorders (CMPDs) and various other neoplastic or reactive myeloid conditions. However, the origin of these hematopoietic precursor cells and the molecular mechanisms underlying their development in the spleen is uncertain. The V617F mutation in the Janus Kinase 2 gene (JAK2(V617F)) was recently shown to be frequently and preferentially present in the peripheral blood and bone marrow cells of CMPD patients, and the resulting dysregulation of its downstream targets is important to CMPD
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cytokine mRNA profiles of primary (arising from inhaled bacilli) and secondary (arising from hematogenous reseeding of the lung) granulomas from the lung lobes of bacillus Calmette-Guérin (BCG)-vaccinated and unimmunized guinea pigs challenged with virulent Mycobacterium tuberculosis by the pulmonary route were assessed in situ using laser capture microdissection (LCM) at 6 weeks after infection. The challenge dose chosen was so low that some lung lobes did not receive an implant from the airway. In unimmunized guinea pigs, some lobes contained either large, necrotic primary lesions or sma…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To detect the alterations of mitochondrial 12S rRNA in patients with gastric cancer, and further evaluate their effects on development of gastric carcinomas.
METHODS: Mitochondrial 12S rRNA of 22 samples of gastric cancer tissues and 22 corresponding normal gastric mucosa taken from the distal portion of surgical specimens were PCR amplified, followed by direct DNA sequencing. Laser capture microdissection technique (LCM) was used to isolate cancerous cells and dysplastic cells from patients with specific mutations. Denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC) plus all…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The elastolytic enzyme matrix metalloproteinase (MMP)-12 has been implicated in the development of airway inflammation and remodeling. We investigated whether human airway smooth muscle cells could express and secrete MMP-12, thereby participating in the pathogenesis of airway inflammatory diseases.
METHODS: Laser capture microdissection was used to collect smooth muscle cells from human bronchial biopsy sections. MMP-12 mRNA expression was analysed by quantitative real-time RT-PCR. MMP-12 protein expression and secretion from cultured primary airway smooth muscle cells was furthe…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Antibody-mediated rejection (AMR) is the main driver of late kidney allograft loss. Anti-HLA donor-specific antibodies (DSA) are strongly associated with AMR. However, 30-60% of DSA+ patients do not develop AMR, raising the possibility of local tissue adaptations to DSA.
METHODS: We performed unbiased proteomic analysis on glomeruli and tubulointerstitium isolated using laser-capture microdissection from the kidney biopsies of 116 DSA+ kidney transplant recipients with Banff-classified active AMR, chronic active AMR, mixed AMR or no rejection. The 'Significant Latent factor Intera
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Placental DNA methylation varies across gestation and is associated with obstetrical complications. Cell-free DNA (cfDNA) from maternal plas … ell types including spiral arteries (n = 3) and endometrial epithelium (n = 3), were isolated using laser capture microdissection. Differentially methylated regions (DMRs) identified in cfDNA from pregnant compared to non-pregnant women (n = 6) ranged from 798 to 2163 in first and third trimesters, respectively. Gradual DNA methylation changes were observed across gestation in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In celiac disease (CeD), interleukin 15 (IL-15) affects the epithelial barrier by acting on intraepithelial lymphocytes, promoting interfero … Additionally, the surface epithelium compartment of ex vivo cultured biopsy samples was isolated by laser capture microdissection (LCM). RNA from each LCM sample was extracted and the relative expression of IFN-γ was evaluated by quantitative reverse transcriptase-PCR (qRT-PCR). Biopsies cultured with the aIL-15 antibody showed a reduction in Fas, HLA-E and perforin epithelial …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preeclampsia is a multifaceted pregnancy-associated hypertensive disorder that poses a major threat to maternal and fetal health. Though the etiology is not fully understood, syncytiotrophoblast stress is postulated to be a major driver of maternal symptomology. We previously demonstrated that regulator of G protein signaling-2 (RGS2) expression decreases in human preeclamptic placenta and has a transcriptional dependence on histone deacetylase 9 (HDAC9) in trophoblast cells. Furthermore, experimental reductions of Rgs2 expression in the mouse fetoplacental unit are sufficient to induce preecl
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal disease affects over 1 billion people globally. This study investigated how periodontitis affects the protein profile of the periodontal ligament (PDL) in rats. Eight Holtzman rats were divided into control and experimental periodontitis groups. The PDL was isolated using laser capture microdissection and protein extracts were analyzed by mass spectrometry. Data analysis utilized specialized software, and Gene Ontology enrichment analysis identified significant protein functions. The data are available via ProteomeXchange with identifier PXD055817. Proteins such as SerpinB1, C5, an…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.