Bifidobacterium bifidum is one of the most abundant members of the gut microbiota at the early stage of life. The established association of the bacterium with the human gut confers health benefits. Such successful persistence of B. bifidum necessitates metabolic adaptation to the host-derived carbohydrates, a process which is poorly understood. The current study focuses on revealing the genomic-based phylogeny (phylogenomics) of B. bifidum and utilizing comparative genomics to decipher the glycolytic abilities of bifidobacterial strains isolated from different human body niches (feces, human …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Japanese wrinkled frog (Glandirana rugosa) is unique in having both XX-XY and ZZ-ZW types of sex chromosomes within the species. The genome sequencing and comparative genomics with other frogs should be important to understand mechanisms of turnover of sex chromosomes within one species or during a short period. In this study, we analyzed the newly sequenced genome of G. rugosa using a batch-learning self-organizing map which is unsupervised artificial intelligence for oligonucleotide compositions. To clarify genome characteristics of G. rugosa, we compared its short oligonucleotide compos…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Environmental enteric dysfunction (EED) limits the Sustainable Development Goals of improved childhood growth and survival. We applied mucosal genomics to advance our understanding of EED.
METHODS: The Study of Environmental Enteropathy and Malnutrition (SEEM) followed 416 children from birth to 24 months in a rural district in Pakistan. Biomarkers were measured at 9 months and tested for association with growth at 24 months. The duodenal methylome and transcriptome were determined in 52 undernourished SEEM participants and 42 North American controls and patients with celia…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim:Enterococcus faecalis is a leading nosocomial pathogen in biofilm-associated polymicrobial infections. The study aims to understand pathogenicity and biofilm determinants of the pathogen by genome analysis. Methodology: Genome sequencing of a strong biofilm forming clinical isolate Enterococcus faecalis SK460 devoid of Fsr quorum-signaling system, was performed and comparative genomics was carried out among a set of pathogenic biofilm formers and nonpathogenic weak biofilm formers. Results: Analysis revealed a pool of virulence and adhesion related factors associated with pathogenicity. Ab…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Melanoma Genomics Managing Your Risk Study is a randomised controlled trial that aims to evaluate the efficacy of providing information on personal genomic risk of melanoma in reducing ultraviolet radiation (UV) exposure, stratified by traditional risk group (low or high phenotypic risk) in the general population. The primary outcome is objectively measured total daily Standard Erythemal Doses at 12 months. Secondary outcomes include UV exposure at specific time periods, self-reported sun protection and skin-examination behaviours, psychosocial outcomes, and ethical considerati…
Протокол клинического исследованияСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clonal diversity is a consequence of cancer cell evolution driven by Darwinian selection. Precise characterization of clonal architecture is essential to understand the evolutionary history of tumor development and its association with treatment resistance. Here, using a single-cell DNA sequencing, we report the clonal architecture and mutational histories of 123 acute myeloid leukemia (AML) patients. The single-cell data reveals cell-level mutation co-occurrence and enables reconstruction of mutational histories characterized by linear and branching patterns of clonal evolution, with the latt
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Unusually large outbreaks of mumps across the United States in 2016 and 2017 raised questions about the extent of mumps circulation and the relationship between these and prior outbreaks. We paired epidemiological data from public health investigations with analysis of mumps virus whole genome sequences from 201 infected individuals, focusing on Massachusetts university communities. Our analysis suggests continuous, undetected circulation of mumps locally and nationally, including multiple independent introductions into Massachusetts and into individual communities. Despite the presence of the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Deadly emerging infectious pathogens pose an unprecedented challenge to health systems and economies, especially across Africa, … nd rapid data generation and curation. However, the strategy to ensure capacity for high-throughput genomics at selected hubs should not overshadow the deployment of portable, field-friendly and technically less demanding genomics technologies in all affected countries. This will enhance small-scale local genomic surveillance in outbreaks, leaving validati …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing a vaccine against Treponema pallidum subspecies pallidum, the causative agent of syphilis, remains a public health priority. Syphilis vaccine design efforts have been complicated by lack of an in vitro T. pallidum culture system, prolific antigenic variation in outer membrane protein TprK, and lack of functional annotation for nearly half of the genes. Understanding the genetic basis of T. pallidum reinfection can provide insights into variation among strains that escape cross-protective immunity. Here, we present comparative genomic sequencing and deep, full-length tprK profiling o
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) originally identified ATP-binding cassette, sub-family A, member 7 (ABCA7), as a novel risk gene of A … ensive assessment of the literature on ABCA7, with a focus on AD-related human -omics studies (e.g. genomics, transcriptomics, and methylomics). In European and African American populations, indirect ABCA7 GWAS associations are explained by expansion of an ABCA7 variable number tandem repeat (VNTR), and a common premature termination codon (PTC) variant, r …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite decades of research into the human oral microbiome, many species remain uncultivated. The technique of single-cell whole-genome ampl … Tannerella sp. BU045 is more highly associated with disease than Tannerella sp. BU063. Comparative genomics shows genes and functions that are shared or unique to the different species, which may direct further research of the pathogenesis of chronic periodontitis. IMPORTANCE Periodontitis (gum disease) affects 47% of adults over 30 in the United States ( …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics : the official publication of the International Society of Psychiatric Genetics2018eng
Anorexia nervosa (AN) occurs nine times more often in females than in males. Although environmental factors likely play a role, the reasons … ales than males. Genetic correlations of BF% and FFM with the largest GWAS of AN by the Psychiatric Genomics Consortium were estimated to explore shared genomics. The genetic correlations of BF%male and BF%female with AN differed significantly from each other (p < .0001, δ = -0.17), suggesting that the female preponderance in AN may, in part, be explained …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This article reviews advancements in the genetics of malignant hyperthermia, new technologies and approaches for its diagnosis, and the existing limitations of genetic testing for malignant hyperthermia. It also reviews the various RYR1-related disorders and phenotypes, such as myopathies, exertional rhabdomyolysis, and bleeding disorders, and examines the connection between these disorders and malignant hyperthermia.
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Babesia ovata, belonging to the phylum Apicomplexa, is an infectious parasite of bovids. It is not associated with the manifesta … e anemia.
CONCLUSIONS: Taking these findings together, the differences demonstrated by comparative genomics potentially explain the evolutionary history of these parasites and the differences in their phenotypes. Besides, the draft genome provides fundamental information for further characterization and understanding of these parasites.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coral disease outbreaks contribute to the ongoing degradation of reef ecosystems, however, microbial mechanisms underlying the onset and progression of most coral diseases are poorly understood. Black band disease (BBD) manifests as a cyanobacterial-dominated microbial mat that destroys coral tissues as it rapidly spreads over coral colonies. To elucidate BBD pathogenesis, we apply a comparative metagenomic and metatranscriptomic approach to identify taxonomic and functional changes within microbial lesions during in-situ development of BBD from a comparatively benign stage termed cyanobacteri
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The anticoccidial salinomycin is a polyketide produced by Streptomyces albus, and the high-yield strain BK 3-25 produces 18.0 g/L salinomyci … sln genes as well as the yield, from 2.60 to 7.30 g/L (40% of BK 3-25). Therefore, the comparative genomics approach combined with functional experiments identified that the multiple deletions and mutations of competing gene clusters and negative regulatory genes are crucial for salinomycin overproduction, setting an example for rational titer improvement …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Research on cysticercosis has been stimulated by the rapid development of genomics, proteomics and bioinformatics and the emergence of molecular biological and immunological technologies. In this review, we attempt to discuss the research development on genomics of Taenia solium and candidate vaccines and antigens for cysticercosis. This will provide a new perspective for studying genomics of Taenia solium and for cysticercosis prevention and treatment, and provide a wealth of informative data for the development of novel and highly efficient vaccines against cysticercosis or diagnostic antige…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
APOL1 variants have been associated with renal phenotypes in blacks. To refine clinical outcomes and discover mechanisms of APOL1-associated kidney injury, we analyzed clinical and genomic datasets derived from 90 black subjects in the Nephrotic Syndrome Study Network (NEPTUNE), stratified by APOL1 risk genotype. Ninety subjects with proteinuria ≥0.5 g/d were enrolled at first biopsy for primary nephrotic syndrome and followed. Clinical outcomes were determined, and renal histomorphometry and sequencing of Mendelian nephrotic syndrome genes were performed. APOL1 variants were genotyped, and gl
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis(AS), a highly heritable complex inflammatory arthritis. Although, a handful of non-HLA risk loci have been identified, capturing the unexplained genetic contribution to AS pathogenesis remains a challenge attributed to additive, pleiotropic and epistatic-interactions at the molecular level. Here, we developed multiple integrated genomic approaches to quantify molecular convergence of non-HLA loci with global immune mediated diseases. We show that non-HLA genes are significantly sensitive to deleterious mutation accumulation in the general population compared with toleran
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования