OBJECTIVES: Current multiplex assays cannot detect all four World Health Organization priority pathogens for meningitis diagnosis (Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, and Streptococcus agalactiae). This work developed a novel real-time polymerase chain reaction (PCR) assay capable of simultaneously detecting these pathogens.
METHODS: Forty-four DNA samples, including type cultures (NCTC and ATCC), were tested. Specific primers and probes targeting sodC, to detect N. meningitidis, dmsA for H. influenzae, SP2020 for S. pneumoniae, and cfb for S. agalactiae
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid detection and quantification of epidemiologically important Salmonella enterica serovars are critical for poultry surveillance, food safety monitoring, and risk-based intervention strategies. This study performed comprehensive analytical validation together with a preliminary field-based diagnostic performance evaluation of GenoPATHX™, a multiplex probe-based qPCR platform designed for the simultaneous detection and quantification of priority Salmonella serovars in poultry-associated matrices. The platform consists of two multiplex panels, designated the Chicken Key Performance Indicator
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mayaro virus (MAYV) is a mosquito-borne alphavirus that is widespread in the Amazon basin, where it co-circulates with the closely related chikungunya virus (CHIKV). Due to the limited surveillance and technical limitations of diagnostic assays (scarcity of commercial assays, serology cross-reactivity), the true burden of MAYV is uncertain. We designed a new RT-qPCR assay targeting the nsp1 gene for MAYV detection, which can be used in monoplex or duplex format. In the duplex format, the new MAYV assay is combined with a CHIKV assay and a second MAYV assay, both previously published. The lower
СтатьяОценочное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since May 2022, the multi-country outbreak of monkeypox (mpox) has raised a great concern worldwide. Early detection of mpox virus infection is recognized as an efficient way to prevent mpox transmission. Mpox specific detection methods reported up to now are based on the SNPs among mpox virus and other orthopoxviruses. We have therefore developed a real-time PCR based mpox detection method targeting mpox virus specific sequences (N3R and B18Rplus). We have also optimized an orthopoxvirus detection system which targets the highly conserved E9L and D6R genes. The mpox and orthopoxvirus real-tim
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial commensals of the human genitourinary tract, Mycoplasma hominis and Ureaplasma species (parvum and urealyticum) can be sexually transmitted, and may cause nongonococcal urethritis, pelvic inflammatory disease, and infertility. Mycoplasma hominis and Ureaplasma species may also cause severe invasive infections in immunocompromised patients. Current culture-based methods for Mycoplasma/Ureaplasma identification are costly and laborious, with a turnaround time between 1 and 2 weeks. We developed a high-throughput, real-time multiplex PCR assay for the rapid detection of M. hominis and U
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Children are the most vulnerable group affected by malaria and other tropical, vector-borne diseases in low-resource countries. Infants presenting with acute onset fever represent a major sector of outpatient care in the Lake Victoria region. Misclassification and overuse of antibiotics and anti-malarial medications are consistent problems. Identifying the prevalent mosquito-borne pathogens in the region will reduce the prescription of non-indicated medicines.
METHODS: The literature was reviewed focusing on the mosquito-borne pathogens most prevalent in sub-Saharan Africa. Accord
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study describes the analytical performance of the QuantideX qPCR BCR-ABL IS Kit, the first Food and Drug Administration-cleared assay designed to monitor breakpoint cluster region-Abelson tyrosine-protein kinase 1 (BCR-ABL1) fusion transcripts isolated from peripheral blood specimens from patients with chronic myeloid leukemia. This multiplex real-time quantitative RT-PCR assay amplifies both e13a2 and e14a2 Major BCR-ABL1 transcripts and the reference target ABL1. The test results are provided in international scale (IS) values by incorporating armored RNA-based calibrators that have def
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foodborne parasites (FBP) are of major public health importance and warrant appropriate detection and control strategies. Most of the FBP considered for risk-ranking by a panel of experts are potentially transmitted via consumption of contaminated fresh produce, including berries. In this study we focused on the potential of three FBP, namely Echinococcus multilocularis, Toxoplamsa gondii, and Cyclospora cayetanensis, as contaminants of berries. Surveys to assess these parasites as contaminants of fresh produce in general, and berries in particular, are scanty or non-existent mainly due to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: Juvenile nephronophthisis (NPHP) is an autosomal recessive cystic disease of the kidney. It represents the most frequent genetic cause of chronic renal failure in children. Methods: we investigated clinical and molecular features in two children with Juvenile nephronophthisis using firstly Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) and secondly multiplex PCR. Results: we report a homozygous NPHP1 deletion in two children. Conclusion: NPHP1 deletion analysis using diagnostic methods (e.g. MLPA, Multiplex PCR) should always be considered in patients with nephronophthisis,
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several commercial PCR kits are available for detection of herpes simplex virus (HSV) and varicella zoster virus (VZV), but the test performance of one CE-marked in vitro diagnostic kit-RealStar® alpha Herpesvirus PCR Kit-has not been well studied. This study evaluated the performance of RealStar® alpha Herpesvirus PCR Kit 1.0 on the LightCycler® 480 Instrument II for detection and differentiation of HSV-1, HSV-2, and VZV in human clinical specimens. We evaluated the analytical sensitivity of the RealStar® and in-house multiplex real-time PCR assays using serial dilutions of nucleic acids extr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine the prevalence of exposure to Rickettsia massiliae/Bar29 and Rickettsia conorii in wild red foxes, we collected blood samples and ticks from 135 foxes shot in different game reserve areas in Catalonia. To detect SFG rickettsia in Rhipicephalus sanguineus complex ticks collected from the foxes, we used real-time polymerase chain reaction (PCR) to screen for ompA gene and a tick-borne bacteria flow chip technique based on multiplex PCR. Serum samples were positive for antibodies against spotted fever group (SFG) rickettsiae in 68 (50.3%). Molecular techniques identified R. massiliae
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cross-sectional study was carried out to determine the prevalence and diagnostic performance of microscopy and real time PCR (RT-PCR) for 14 intestinal parasites in a Venezuelan rural community with a long history of persistent intestinal parasitic infections despite the implementation of regular anthelminthic treatments. A total of 228 participants were included in this study. A multiplex RT-PCR was used for the detection of Dientamoeba fragilis, Giardia intestinalis, Cryptosporidium sp. and a monoplex RT-PCR for Entamoeba histolytica. Furthermore, a multiplex PCR was performed for detectio
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The aim of the study was to develop a multiplex real-time PCR method to identify Campylobacter jejuni containing mutations commonly associated with macrolide resistance.
METHODS AND RESULTS: A multiplex fluorescence real-time PCR assay was developed based on TaqMan minor groove binder (MGB) probes. The VS1-MGB probe was designed based on the VS1 gene and was used to identify Camp. jejuni. The 23S rDNA-MGB probe was designed to distinguish macrolide resistance mutations in 23S rDNA, while 57D-MGB and 74D-MGB were designed to detect resistance mutations in ribosomal protein L4. The specif
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnostic tests for respiratory viral infections use traditionally either nasopharyngeal washes or swabs. Sputum is representative of the lower respiratory tract but is used rarely for viral testing. The aim of this study was to compare the detection rates of respiratory viruses from nasopharyngeal swabs and sputum using a multiplex real-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Adults who were admitted or presented to the clinics of Gil Medical Center with acute respiratory symptoms were recruited from 1 November 2012 to 31 March 2013. Paired specimens of nasopharyngeal
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We compared the performance of 2 multiplex assays (Focus Simplexa and Quidel Lyra) to individual real-time PCR for the detection of herpes simplex virus-1 (HSV-1), HSV-2, and Varicella zoster virus (VZV) from clinical specimens. Results were compared to a consensus standard, defined as the result obtained by at least 2 of the 3 molecular methods. The sensitivity of the Quidel assay ranged from 92.0% for HSV-1 to 97.7% for HSV-2, while the specificity for all targets was 100%. The Focus assay demonstrated 100% sensitivity for all targets, and the percent specificity ranged from 96.8% for HSV-1
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the etiology of reported sporadic suspected mumps cases with a negative RT-PCR result for the mumps virus in the Barcelona-South region in 2007-2011. Samples from mumps virus-negative patients presenting unilateral or bilateral parotitis or other salivary gland swelling were tested for Epstein-Barr virus (EBV) by real-time PCR and for respiratory viruses by two multiplex-PCR-based assays to detect parainfluenza virus (PIV) 1-4, influenza virus (InV) A, B and C, respiratory syncytial virus (RSV), enterovirus, coronavirus 229E, coronavirus OC43, and rhinovirus. 101 samples were a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Celiac disease (CD) is an inflammatory disorder of the small intestine induced by gluten ingestion. CD has a strong genetic association with human leukocyte antigen (HLA)-DQ2.5 and HLA-DQ8. The absence of HLA-DQ2.5 and HLA-DQ8 has a strong negative predictive value for CD. Genetic screening of HLA-DQ2.5 and HLA-DQ8 in patients at risk is of great value.
METHODS: We designed, developed, and validated a multiplex assay based on multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) technology, allowing the simultaneous detection of DQA1*05-DQB1*02, encoding HLA-DQ2.5, and DQA1*03-D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the Global Program for the Elimination of Lymphatic Filariasis continuing to make strides towards disease eradication, many locations endemic for the causative parasites of lymphatic filariasis are realizing a substantial decrease in levels of infection and rates of disease transmission. However, with measures of disease continuing to decline, the need for time-saving and economical molecular diagnostic assays capable of detecting low levels of parasite presence is increasing. This need is greatest in locations co-endemic for both Wuchereria bancrofti and Brugia parasites because testing
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel multiplex real-time PCR assay for concurrent detection of hepatitis viruses was evaluated for its clinical performance in screening patients with acute hepatitis. A total of 648 serum samples were collected from patients with acute symptoms of hepatitis. Concurrent detection of nucleic acids of HAV, HBV and HCV was performed using the Magicplex™ HepaTrio Real-time Detection test. Serum nucleic acid levels of HBV and HCV were also quantified by the Cobas® AmpliPrep/Cobas® TaqMan® (CAP/CTM) HBV and HCV tests. Patients' medical records were also reviewed. Concordance rates between the res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies of human genetic variation predominantly use short tandem repeats (STRs) and single nucleotide polymorphisms (SNPs) but Insertion deletion polymorphisms (Indels) are being increasingly explored. They combine desirable characteristics of other genetic markers, especially the possibility of being analysed using short amplicon strategies, which increases the ease of analysis, contributing to justify their interest in population and forensic genetics. After the advent of autosomal and uniparental genomes (mtDNA and Y chromosome), these fields of research are also focusing on the X chromoso
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования