Huntington disease (HD) is an autosomal inherited disorder that causes the deterioration of brain cells. The polyglutamine (polyQ) expansion of huntingtin (Htt) is implicated in the pathogenesis of HD via interaction with an RNA splicing factor, Htt yeast two-hybrid protein A/forming-binding protein 11 (HYPA/FBP11). Besides the pathogenic polyQ expansion, Htt also contains a proline-rich region (PRR) located exactly in the C terminus to the polyQ tract. However, how the polyQ expansion influences the PRR-mediated protein interaction and how this abnormal interaction leads to the biological con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary cerebral hemorrhage with amyloidosis, Dutch type (HCHWA-D) (or familial cerebral amyloid angiopathy) and familial Alzheimer's disease (FAD) share several properties. Both are autosomal dominant forms of cerebral amyloidosis characterized by beta-amyloid (A beta) deposition. In HCHWA-D the A beta is predominantly found in blood vessels and in early parenchymal plaques, whereas in AD parenchymal A beta deposits in the form of senile plaques and neurofibrillary tangles are a more prominent finding. Point mutations in the amyloid precursor protein (APP) have recently been described, in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Influenza A virus (IAV) generates three closely related RNA species: viral RNA (vRNA), complementary RNA (cRNA), and messenger RNA (mRNA), whose strand-specific quantification remains limited by sensitivity and quantitative dynamic range, particularly at low RNA abundance. Here, we developed Flu-Stranded CRISPR-Cas12a, a strand-specific detection platform integrating tagged reverse transcription, segment-specific PCR, and Cas12a collateral cleavage to support quantitative analysis of all three RNA species across a broad dynamic range. The assay enables reliable detection down to 10
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Estrogen receptor α (ERα) is a key regulator of reproductive function, particularly in ovarian development and function, yet the specifics of its role at the molecular level remain unclear.
AIMS: The study aims to elucidate the molecular mechanisms of ERα-regulated transcriptional dynamics in ovarian cells using ERα knockout (αERKO) mice created via CRISPR/Cas9.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was used to compare transcriptomes from individual ovarian cells in both wild type and αERKO mice. Bioinformatics analyses identified distinct cell populations and their transc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a highly specialized process of cell proliferation and differentiation leading to the production of spermatozoa from spermatogonial stem cells. Due to its testicular anatomy, Scyliorhinus canicula is an interesting model to explore stage-based changes in proteins during spermatogenesis. The proteomes of four testicular zones corresponding to the germinative niche and to spermatocysts (cysts) with spermatogonia (zone A), cysts with spermatocytes (zone B), cysts with young spermatids (zone C), and cysts with late spermatids (zone D) have been analyzed by nanoLC-ESI-MS/MS. Gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study, IL (interleukin)-1beta increased GM-CSF (granulocyte/macrophage colony-stimulating factor) expression from pulmonary A549 cells and primary HBE (human bronchial epithelial) cells. These responses were repressed by the glucocorticoid dexamethasone, allowing the use of A549 cells as a relevant model. IL-1beta induced GM-CSF release into the culture medium by 6 h and in cell lysates (cytosolic) at 2 h. These effects were profoundly inhibited by dexamethasone, yet IL-1beta-induced GM-CSF mRNA and unspliced nRNA (nuclear RNA; a surrogate of transcription rate) were modestly in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanopore technology offers real-time sequencing opportunities, providing rapid access to sequenced data and allowing researchers to manage the sequencing process efficiently, resulting in cost-effective strategies. Here, we present focused case studies demonstrating the versatility of real-time transcriptomics analysis in rapid quality control for long-read RNA-seq. We illustrate its utility through four experimental setups: (1) transcriptome profiling of distinct human cellular populations, (2) identification of experimentally enriched transcripts, (3) transcriptional analysis of cells under
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) regulates many aspects of RNA metabolism and is involved in learning and memory processes. Yet, the impact of a dysregulation of post-transcriptional m6A editing on synaptic impairments in neurodegenerative disorders remains unknown. Here we investigated the m6A methylation pattern in the hippocampus of Huntington's disease (HD) mice and the potential role of the m6A RNA modification in HD cognitive symptomatology. m6A modifications were evaluated in HD mice subjected to a hippocampal cognitive training task through m6A immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq) and th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microglial polarization is one of the most promising therapeutic targets for multiple central nervous system (CNS) disorders, including ischemic stroke. However, detailed transcriptional alteration of microglia following cerebral ischemic stroke remains largely unclear.
METHODS: Focal cerebral ischemia was induced by transient middle cerebral artery occlusion (tMCAO) for 60 min in mice. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed using ischemic brain tissues from tMCAO and sham mice 3 days after surgery. Ch25h-/- mice were used to investigate the role of specific microgli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tea flowers comprise anatomically and functionally specialized tissues, yet the transcriptional and post-transcriptional programs that distinguish these tissues remain poorly characterized.
METHODS: In this study, flower buds of Camellia sinensis cv. 'Fudingdabaicha' at the bud-white stage were dissected into seven tissues: ovary, outer green petal, inner white petal, filament, sepal, anther, and style. RNA-seq and small RNA-seq libraries were prepared from the same 21 biological samples, enabling direct comparison and integration of mRNA and miRNA expression profiles.
RESULTS:
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein (IGF2BP) family, comprises highly conserved RNA-binding proteins that play crucial roles in post-transcriptional gene regulation. Recent evidence suggests that IGF2BP proteins contribute to the pathogenesis and progression of multiple cancers and also participate in the regulation of viral infections and virus-associated tumors. This review provides a systematic synthesis of the biological functions of the IGF2BP family and its regulatory roles in viral life cycles. Particular emphasis is placed on oncogenic viruses, including hepatitis B a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With changes in lifestyle, sedentary behavior or lack of physical exercise increases the risk of various glycolipid metabolic disorders. Glycolipid metabolic dysregulation refers to abnormalities in the metabolism of carbohydrates and lipids, including diseases such as diabetes, obesity, and metabolic syndrome. In-depth research into the molecular mechanisms of glycolipid metabolic dysregulation can help develop more effective treatment strategies and preventive measures to prevent the occurrence of long-term complications such as cardiovascular diseases. Alternative polyadenylation (APA) is a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
microRNAs (also known as miRNAs or miRs) are a class of small non-coding RNAs that play a critical role in post-transcriptional gene regulation as negative gene regulators by binding complementary sequences in the 3'-UTR of target messenger RNAs (mRNAs) leading to translational repression and/or target degradation a wide range of genes and biological processes, including cell proliferation, invasion, migration, and apoptosis. The development and progression of cancer have been linked to the anomalous expression of miRNAs. According to recent studies, miRNAs have been found to regulate the expr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are non-coding small RNAs that regulate gene expression at the post-transcriptional level. Several miRNAs are exclusively expressed in skeletal muscle and participate in the regulation of muscle differentiation by interacting with myogenic factors. These miRNAs can be found at high levels in the serum of patients and animal models for Duchenne muscular dystrophy, which is expected to be useful as biomarkers for their clinical conditions. By miRNA microarray analysis, we identified miR-188 as a novel miRNA that is elevated in the serum of the muscular dystrophy dog model, CXM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD), an uncurable neurodegenerative disorder, is caused by CAG repeat expansion in the HD gene encoding mutant huntingtin protein. DNA damage response is implicated in HD pathogenesis. We used multiple approaches to assess normal and mutant HTT interactomes in the context of genotoxic stress. We show that double-strand break (DSB) repair response is impaired in HD neurons, which are more vulnerable to DSB-induced stress. We found that S1181 phosphorylation of HTT is regulated by DSB, and can be carried out by DNA-PK. Functional interaction of HTT with a major DSB kinase D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBPalpha) and C/EBPbeta are intronless, yet can create various N-terminally truncated protein products with distinct DNA binding and transactivation potentials. These proteins can be generated via two distinct mechanisms, one translational and the other post-translational. In the translational mechanism, there is alternative translational start site selection of the different AUG codons present in the single messenger RNA (mRNA) species via a process of leaky ribosome scanning. Additionally, a post-translational method of isoform formation, through
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conserved herpesvirus protein kinases (CHPK) are conserved among the Orthoherpesviridae. Marek's disease virus (MDV) CHPK is dispensable for replication in chicken splenocytes but essential for replication in epithelial skin cells, where the virus is shed. We hypothesized that 1) MDV alters cellular gene expression in both tissues, 2) the responses differ between the spleen and skin, and 3) CHPK regulates these responses. To test these hypotheses, we collected spleen and epithelial skin tissues from chickens infected with wild-type MDV (vCHPKwt) or a CHPK-null MDV (vΔCHPK). RNA sequencing reve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epitranscriptomics, the study of dynamic chemical modifications on RNA molecules, has emerged as a pivotal layer of gene expression regulation with profound implications for cancer biology. This review centers on three well-characterized RNA modifications, N6-methyladenosine (m6A), pseudouridine (Ψ), and 5-methylcytosine (m5C), and highlights their diverse roles in the pathogenesis of breast cancer. These modifications modulate critical post-transcriptional processes such as RNA splicing, stability, translation, and degradation, thereby influencing tumor initiation, progression, metastasis, th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nuclear clearance and cytoplasmic accumulations of the RNA-binding protein TDP-43 are pathological hallmarks in almost all patients with amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and up to 50% of patients with frontotemporal dementia (FTD) and Alzheimer's disease. In Alzheimer's disease, TDP-43 pathology is predominantly observed in the limbic system and correlates with cognitive decline and reduced hippocampal volume. Disruption of nuclear TDP-43 function leads to abnormal RNA splicing and incorporation of erroneous cryptic exons in numerous transcripts including Stathmin-2 (STMN2, also known as SC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In male animals, spermatogonia in testes differentiate into sperm, one of the most diverse cell types across species. Despite the evolutionary retention of key genes essential for spermatogenesis, the extent of their conservation remains unclear. To explore the genetic basis of spermatogenesis under strong selective pressure, we compare single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets from the testes of humans, mice, and fruit flies. Our analysis identifies conserved genes involved in key molecular programs, such as post-transcriptional regulation, meiosis, and energy metabolism. We perform gen
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.