In the present study, we examine whether selected genetic polymorphisms contribute to the development of cerebral palsy (CP) in very preterm infants. Subjects were 96 singleton infants with later-diagnosed CP and 119 control children, white non-Hispanic (n for CP=74, controls=88) or white Hispanic (CP=22, controls=31), born <32 wk gestation. Presence of CP was identified through state service agencies, with review of medical records. DNA extracted from archived neonatal blood was genotyped using multi-locus polymerase chain reaction amplification and immobilized sequence-specific oligonucleoti
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We previously demonstrated in an immunohistochemical study that reduced expression of O(6)-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) correlated with a poorer prognosis in patients with biliary tract cancers. The purpose of this study was to clarify how MGMT deficiency leads to a poor outcome in biliary tract cancer. Thus, we examined epigenetic (promoter methylation) and genetic (gene mutation) alterations in biliary tract cancer.
METHODS: We examined 37 biliary tract cancer specimens from patients who underwent surgical resection. Promoter methylation was determined by one-step
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study screened hospital sewage for the presence of blaNDM.
METHODS: Colonies grown from plates containing meropenem streaked with hospital sewage were screened for blaNDM by PCR. Species identification was performed by sequencing 16S rRNA genes. Clonal relatedness of isolates was determined by Enterobacterial repetitive intergenic consensus sequence-PCR, sequencing recA and PFGE. Mating was attempted to obtain self-transmissible plasmids carrying blaNDM. The genetic context of blaNDM was investigated by PCR mapping using pNDM-BJ01, a blaNDM-1-carrying plasmid from Acinetobact
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to investigate the antibiotic susceptibility profiles and the presence of extended-spectrum-β-lactamases (ESBLs) in Pseudomonas fluorescens isolates from coastal waters of the Kaštela Bay, Croatia. Twenty-two water samples were collected during 2009. Isolates were tested for susceptibilities to 13 antibiotics by Etest. ESBL production was confirmed by double-disk synergy test carried out on Mueller-Hinton agar plates containing efflux pump inhibitor Phe-Arg-β-naphthylamide dihydrochloride. PCR and DNA sequencing analysis were used to identify ESBL-encoding genes. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To determine the phylogenetic group and the production of different virulence factors (VFs) of a collection of Escherichia coli strains overproducing their chromosomal AmpC cephalosporinase.
METHODS: Fifty-five E. coli strains, isolated over a 12 year period, and previously identified as AmpC overproducers by increased MICs of third-generation cephalosporins without extended-spectrum beta-lactamase production (negative double-disc synergy test), were phylogrouped by multiplex PCR. As a comparison, 100 E. coli clinical isolates, susceptible to all beta-lactams, were also tested by
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study a total of 200 Klebsiella pneumoniae isolates were collected from patients with urinary tract infections (UTIs) in Tehran, Iran. Antibiotic resistance was determined by disk diffusion and broth dilution methods. Detection of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) and AmpCs was performed using phenotypic tests. Polymerase chain reaction (PCR) was applied to detect the ESBL, AmpC, and integron genes. Analysis of AmpC and cassette arrays of integron genes was performed using DNA sequencing. Plasmids were analyzed by PCR-based replicon typing and conjugation. Pulsed-field gel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastrointestinal bacteria are essential for host health, and only viable microorganisms contribute to gastrointestinal functions. When evaluating the gut microbiota by next generation sequencing method, dead bacteria, which compose a proportion of gut bacteria, may distort analysis of the live gut microbiota. We collected stomach, jejunum, ileum, cecum, and colon contents from Rex rabbits. A modified propidium monoazide (PMA) treatment protocol was used to exclude DNA from dead bacteria. Analysis of untreated samples yielded total bacteria, and analysis of PMA-treated samples yielded live bact
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Giardia lamblia (G. lamblia) is the most worldwide prevailing intestinal parasite, notorious for its broad range of seasonal and age-related prevalence. The potentially lethal nature of giardiasis makes it essential that the seasonality, the groups at risk, and other potential risk factors are identified. The present molecular epidemiological study was designed to determine the genetic diversity of G. lamblia infection, taking into account seasonal peaks, age distribution, and associated symptoms in a cohort of Egyptian diarrheic patients. Stool samples were collected from 1187 diarrheic patie
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scrub typhus, caused by infection with Orientia tsutsugamushi, is probably the most common severe rickettsial disease. Early diagnosis followed by treatment with antibiotics such as doxycycline or chloramphenicol usually quickly decreases fever in patients, and they often recover well from other symptoms of the disease. However, poorly responsive cases have been reported from northern Thailand and southern India. In order to identify protein factors that may be partially responsible for differential drug sensitivity of isolates of Orientia, we compared the protein profiles of doxycycline sensi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in gene expression are commonly assessed relative to the expression of housekeeping genes, which are assumed to remain unchanged. We tested this assumption in cerebral arteries obtained from dogs 4 and 7 days after subarachnoid hemorrhage (SAH) had been created using the double hemorrhage model. Basilar arteries were removed and examined for expression of messenger ribonucleic acid (mRNA) levels using quantitative real-time polymerase chain reaction. Cross-sections of basilar arteries were stained immunohistochemically for proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and 4',6-diamidino-2-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The epidemiological distribution of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) types in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae was evaluated in various hospitals in Spain and compared with previous studies.
METHODS: A total of 11 Spanish hospitals participated in this study. Each center collected the first 15 isolates of E. coli and the first 5 of K. pneumoniae suspected of being ESBL-producers and isolated during the first quarter of 2004. Clonal study was done by PFGE after total DNA digestion with XbaI and by ERIC-PCR (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Sequence
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The purpose of this study was to examine the presence of bacteria in synovial fluids from patients with temporomandibular joint disorder (TMD) by polymerase chain reaction (PCR) targeting the 16S ribosomal RNA (rRNA) gene, followed by cloning and sequencing.
STUDY DESIGN: Universal bacterial primers were used to amplify 16S rRNA genes in 28 synovial fluid samples from 27 patients with TMD (TMD group) as well as control subjects: 5 patients with dislocation of TMJ (non-TMD group). Subsequently, PCR amplicons were purified and cloned. Partial 16S rRNA sequences of the cloned insert w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The transmission of information about the photic environment to the circadian clock involves a complex array of neurotransmitters, receptors, and second messenger systems. Exposure of an animal to light during the subjective night initiates rapid transcription of a number of immediate-early genes in the suprachiasmatic nucleus of the hypothalamus. Some of these genes have known roles in entraining the circadian clock, while others have unknown functions. Using laser capture microscopy, microarray analysis, and quantitative real-time PCR, we performed a comprehensive screen for chan
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adrenergic receptors (ARs) are involved in regulating saliva secretion and composition in salivary glands. Nine AR subtypes, including three alpha1-ARs (alpha1a-, alpha1b- and alpha1d-ARs), three alpha2-ARs (alpha2A-, alpha2B- and alpha2C-ARs) and three beta-ARs (beta1,beta2- and beta3-ARs), have been identified through molecular cloning. The five subtype genes, alpha1a-, alpha1b-, alpha2A-, beta1-, and beta2-ARs, were expressed in rat submandibular glands. In contrast, the other four subtype mRNAs, alpha1d-, alpha2B-, alpha2C- and beta3-ARs, were not detected by reverse transcription-polymera
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate for the presence of subclinical human papillomavirus (HPV) in cases of suspected sexual abuse in children.
DESIGN: Prospective data collection via interviews, physical examination, colposcopic examination, and tissue sampling by a surface swab technique.
SETTING: A total of 40 pediatric patients ranging in age from 1 to 16 years who were referred to the Special Assessment and Management Clinic at Cardinal Glennon Children's Hospital, St Louis, MO, for probable or confirmed sexual abuse.
INTERVENTIONS: In addition to colposcopic examination for physical signs of abuse,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the molecular mechanism of gastric carcinogenesis, we analyzed genetic instability and p53 gene mutations in 40 primary gastric carcinomas. Tumor samples were from untreated patients with no family history suggestive of genetic predisposition to cancer. We screened six microsatellite loci by the polymerase chain reaction (PCR) method, and exons 5-8 of the p53 gene by the PCR-based denaturing gradient gel electrophoresis and sequencing techniques. Microsatellite instability was detected in 32.5% (13/40), and gene mutations in 40% (16/40), of the tumors analyzed. No statistically
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two hundred fifty-seven nalidixic acid-resistant enterobacterial isolates were collected in a Brazilian community from January 2000 to May 2005 to determine the prevalence of plasmid-encoded extended-spectrum beta-lactamases. The bla(CTX-M) genetic environment was determined by polymerase chain reaction and sequencing. Eleven isolates (4.2%) harbored a bla(CTX-M-2) gene, 3 isolates bla(CTX-M-9), 2 isolates bla(CTX-M-8), and 6 isolates bla(SHV-5). Two novel bla(CTX-M-2) variants, namely, bla(CTX-M-74) and bla(CTX-M-75), were identified.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The BIOMED-2 Concerted Action BMH4-CT98-3936 on 'Polymerase chain reaction (PCR)-based clonality studies for early diagnosis of lymphoproliferative disorders' developed standardized PCR protocols for detection of immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TCR) rearrangements, including TCR beta (TCRB). As no comparable TCRB PCR method pre-existed and only a limited number of samples was tested within the BIOMED-2 study, we initiated this study for further validation of the newly developed TCRB PCR approach by comparing PCR data with previously generated Southern blot (SB) data in a series of 66
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella pneumoniae K6 (ATCC 700603), a clinical isolate, is resistant to ceftazidime and other oxyimino-beta-lactams. A consistent reduction in the MICs of oxyimino-beta-lactams by at least 3 twofold dilutions in the presence of clavulanic acid confirmed the utility of K. pneumoniae K6 as a quality control strain for extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) detection. Isoelectric-focusing analysis of crude lysates of K6 demonstrated a single beta-lactamase with a pI of 7.8 and a substrate profile showing preferential hydrolysis of cefotaxime compared to ceftazidime. PCR analysis of total bac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A structural or functional cervix problem prevents a woman from carrying a full-term pregnancy, which leads to the disease known as cervical insufficiency. Cervical insufficiency is partially inherited, and in certain situations, variations in genes related to connective tissue metabolism may be involved. The main objective of this investigation was to describe the collagen type I alpha 1 chain (COL1A1) gene rs1800012 polymorphism and the transforming growth factor beta 1 (TGFB1) gene rs1800471 polymorphism in a cohort of patients suffering from cervical insufficiency. Polymerase chain reactio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.