BACKGROUND: Over the course of the COVID-19 pandemic, laboratories worldwide have been facing an unprecedented increase in demand for PCR testing because of the high importance of diagnostics for prevention and control of virus spread. Moreover, testing demand has been varying considerably over time, depending on the epidemiological situation, rendering efficient resource allocation difficult. Here, we present a scalable workflow which we implemented in our laboratory to increase PCR testing capacity while maintaining high flexibility regarding the number of samples to be processed.
METHODS:
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio parahaemolyticus remains a major cause of seafood-associated gastroenteritis, yet routine surveillance still relies largely on the ca … cal populations showed open pan-genomes, although the non-clinical group carried a larger accessory gene pool. We identified a complete hlyCABD-like RTX operon in 10 trh-positive isolates with T3SS2-associated virulence backgrounds. These RTX-positive isolates were distributed across seven sequence types and three of five phylogenetic groups. This distribut …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Periodontitis is considered to be one of the major risk factors associated with cancers of the oral cavity. Periodontogenic pathogens such as Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Tannerella forsythia, Fusobacterium nucleatum and Aggregatibacter actinomycetemcomitans are the important pathogens associated with periodontitis. Chronic exposure to bacterial components induces changes in the nearby cells. Hence, the present study has been designed to identify the molecular mechanisms that could be associated with the two disease conditions viz., periodontitis and head and neck
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is consensus that clinically relevant antibiotic resistance genes have their origin in environmental bacteria, including the large pool of primarily benign species. Yet, for the vast majority of acquired antibiotic resistance genes, the original environmental host(s) has not been identified to date. Closing this knowledge gap could improve our understanding of how antimicrobial resistance proliferates in the bacterial domain and shed light on the crucial step of initial resistance gene mobilization in particular. Here, we combine information from publicly available long- and short-read envi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Liver macrophages are heterogeneous and play an important role in alcohol-associated liver disease (ALD) but there is limited understanding of the functions of specific macrophage subsets in the disease. We used a Western diet alcohol (WDA) mouse model of ALD to examine the hepatic myeloid cell compartment by single cell RNAseq and targeted KC ablation to understand the diversity and function of liver macrophages in ALD.
APPROACH AND RESULTS: In the WDA liver, KCs and infiltrating monocytes/macrophages each represented about 50% of the myeloid pool. Five major KC clusters
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Laboratory-generated hybrids between phage λ and related phages played a seminal role in establishment of the λ model system, which, in turn, served to develop many of the foundational concepts of molecular biology, including gene structure and control. Important λ hybrids with phages 21 and 434 were the earliest of such phages. To understand the biology of these hybrids in full detail, we determined the complete genome sequences of phages 21 and 434. Although both genomes are canonical members of the λ-like phage family, they both carry unsuspected bacterial virulence gene types not previousl
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marek's disease virus (MDV) is an important oncogenic α-herpesvirus that induces Marek's disease (MD), characterized by severe immunosuppression and rapid-onset T-cell lymphomas in its natural chicken hosts. Historically, MD is regarded as an ideal biomedical model for studying virally induced cancers. Monoclonal antibodies (mAbs) against viral or host antigenic epitopes are crucial for virology research, especially in the exploration of gene functions, clinical therapy, and the development of diagnostic reagents. Utilizing the CRISPR/Cas9-based gene-editing technology, we produced a pp38-dele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The degradation of most intracellular proteins is a dynamic and tightly regulated process performed by proteasomes. To date, different forms of proteasomes have been identified. Currently the role of non-constitutive proteasomes (immunoproteasomes (iPs) and intermediate proteasomes (intPs)) has attracted special attention. Here, using a CRISPR-Cas9 nickase technology, four cell lines: histiocytic lymphoma, colorectal adenocarcinoma, cervix adenocarcinoma, and hepatocarcinoma were modified to express proteasomes with mCherry-tagged β5i subunit, which is a catalytic subunit of iPs and intPs. Imp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclophosphamide (CP), an important alkylating agent which is used in the treatment therapy for chronic myeloid leukemia (CML). However, acquired drug resistance owing to the inactivation of its active metabolite aldophosphamide via tumoral-overexpressing aldehyde dehydrogenase (ALDH1A1) is one of the major issues with the CP therapy. However, the underlying mechanism of ALDH1A1 overexpression in cancer cells remains poorly defined. Therefore, the current study focused on analyzing the ALDH1A1-overexpressing microarray data for CP resistance and CP-sensitive CML cell lines. In this study, the
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thymoma and thymic carcinoma are thymic epithelial tumors (TETs). We performed a molecular profiling to investigate the pathogenesis of TETs and identify novel targets for therapy. We analyzed 37 thymomas (18 type A, 19 type B3) and 35 thymic carcinomas. The sequencing of 50 genes detected nonsynonymous mutations in 16 carcinomas affecting ALK, ATM, CDKN2A, ERBB4, FGFR3, KIT, NRAS and TP53. Only two B3 thymomas had a mutation in noncoding regions of the SMARCB1 and STK11 gene respectively. Three type A thymomas harbored a nonsynonymous HRAS mutation. Fluorescence in situ hybridization detected
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenic yeast Cryptococcus neoformans causes cryptococcosis, a life-threatening fungal disease. C. neoformans has multiple virulence mechanisms that are non-host specific, induce damage and interfere with immune clearance. Microarray analysis of C. neoformans strains serially passaged in mice associated a small gene (CNAG_02591) with virulence. This gene, hereafter identified as HVA1 (hypervirulence-associated protein 1), encodes a protein that has homologs of unknown function in plant and animal fungi, consistent with a conserved mechanism. Expression of HVA1 was negatively correlated
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The generation of functionally distinct neuronal subtypes within the vertebrate central nervous system (CNS) requires the precise regulation of progenitor gene expression in specific neuronal territories during early embryogenesis. Accumulating evidence has implicated histone deacetylase (HDAC) proteins in cell specification, proliferation, and differentiation in diverse embryonic and adult tissues. However, although HDAC proteins have shown to be expressed in the developing vertebrate neural tube, their specific role in CNS neural progenitor fate specification remains unclear. Prior work from
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The skin is essential for survival and protects our body against biological attacks, physical stress, chemical injury, water loss, ultraviolet radiation and immunological impairment. The epidermal barrier constitutes the primordial frontline of this defense established during terminal differentiation. During this complex process proliferating basal keratinocytes become suprabasally mitotically inactive and move through four epidermal layers (basal, spinous, granular and layer, stratum corneum) constantly adapting to the needs of the respective cell layer. As a result, squamous keratinocytes co
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, we demonstrated rapid dissemination of different methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) clones at the Institute for Microbiology at the University of Magdeburg (B. Ghebremedhin, W. König, and B. König, Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 24:388-398, 2005). The majority of them harbored the readily transmissible mec cassette type IV. Thus, theoretically, methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) might capture the mecA gene from circulating MRSA, or MRSA strains might catch mobile toxin genes from MSSA. Therefore, we characterized MSSA strains circulating at th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is a gram-positive, food-borne microorganism responsible for invasive infections with a high overall mortality. L. mo … the previously sequenced L. monocytogenes F2365 serotype 4b strain, suggesting heterogeneity in the gene pool required for intracellular survival of L. monocytogenes in host cells. Overall, our study provides crucial insights into the strategy of intracellular survival and measures taken by L. monocytogenes to escape the host cell responses.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genomes of pathogenic Haemophilus influenzae strains are larger than that of Rd KW20 (Rd), the nonpathogenic laboratory strain whose genome has been sequenced. To identify potential virulence genes, we examined genes possessed by Int1, an invasive nonencapsulated isolate from a meningitis patient, but absent from Rd. Int1 was found to have a novel gene termed lav, predicted to encode a member of the AIDA-I/VirG/PerT family of virulence-associated autotransporters (ATs). Associated with lav are multiple repeats of the tetranucleotide GCAA, implicated in translational phase variation of surf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the molecular characterization of an ethyl methanesulfonate (EMS)-induced mutation that causes albinism and lethality at the seedling stage in Arabidopsis thaliana. We identified the mutation using a mapping-by-sequencing approach that uses Fisher's exact tests to detect changes in allele frequencies among the seedlings of an F2 mapping population, which had been pooled according to their phenotypes (wild-type or mutant). After purifying genomic DNA from the plants of both pools, the two samples were sequenced using the Illumina HiSeq 2500 next-generation sequencing platform. The bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alopecia areata (AA) is a common hair loss disorder, which is thought to be a tissue-specific autoimmune disease. Previous research has identified a few AA susceptibility genes, most of which are implicated in autoimmunity. To identify new genetic variants and further elucidate the genetic basis of AA, we performed a genome-wide association study using the strategy of pooled DNA genotyping (729 cases, 656 controls). The strongest association was for variants in the HLA region, which confirms the validity of the pooling strategy. The selected top 61 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Phlebotomine sandflies are vectors of several pathogens with significant impact for public health. This study was conducted to investigate and characterize phlebovirus and Leishmania infections in vector sandflies collected in the eastern Thrace region in Turkey and Northern Cyprus, where previous data indicate activity of these agents.
METHODS: Field sampling of sandflies was performed at 4 locations in Edirne and Tekirdag provinces of eastern Thrace and at 17 locations in Lefkosa, Girne, Magosa and Guzelyurt provinces of northern Cyprus. In sandfly pools, phlebovirus RNA and Lei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND OBJECTIVE: Mutations in the GBA1 gene, particularly the severe L444P variant, are among the strongest known genetic risk factors for Parkinson's disease (PD). Prior meta-analyses published before 2018 included fewer studies and often pooled multiple mutations, prompting this updated, mutation-specific systematic review and meta-analysis.
METHODS: Standard systematic review and meta-analytic methods were used, including predefined eligibility criteria, literature search, and pooled analysis of odds ratios (ORs) for PD in GBA1 L444P carriers versus non-carriers.
RESULTS: We in
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования