Estimating microbial dose-response is an important aspect of a food safety risk assessment. In recent years, there has been considerable interest to advance these models with potential incorporation of gene expression data. The aim of this study was to develop a novel machine learning model that considers the weights of expression of Salmonella genes that could be associated with illness, given exposure, in hosts. Here, an elastic net-based weighted Poisson regression method was proposed to identify Salmonella enterica genes that could be significantly associated with the illness response, irr
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microbial biocenosis in highly saline fluids produced from the cold well of a deep geothermal heat store located in the North German Basin was characterized during regular plant operation and immediately after plant downtime phases. Genetic fingerprinting revealed the dominance of sulfate-reducing bacteria (SRB) and fermentative Halanaerobiaceae during regular plant operation, whereas after shutdown phases, sequences of sulfur-oxidizing bacteria (SOB) were also detected. The detection of SOB indicated oxygen ingress into the well during the downtime phase. High 16S ribosomal RNA (rRNA) and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A general consensus supports fundamental roles for both genetic and environmental, mainly microbial, factors in the development of autoimmune diseases. One form of autoimmune rheumatic diseases is confined to a group of nonpyogenic conditions which are usually preceded by or associated with either explicit or occult infections. A previous history of clinical pharyngitis, gastroenteritis/urethritis, or tick-borne skin manifestation can be obtained from patients with rheumatic fever, reactive arthritis, or Lyme disease, respectively, whilst, other rheumatic diseases like rheumatoid arthritis (RA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we compared genetically resistant C57BL/6 and susceptible A/J mice for their resistance to Listeria monocytogenes infection during pregnancy. Intragastric infection with modest numbers of bacterial cells (10(5) CFU) caused reproducible fetal infection and abortion in both mouse strains. Bioluminescence imaging demonstrated dissemination of L. monocytogenes cells from maternal to fetal organs within 3 days of intragastric infection. Although non-pregnant C57BL/6 mice were significantly more resistant to infection than non-pregnant A/J mice, C57BL/6 and A/J mice had similar microb
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontitis and atherosclerosis have complex etiologies, genetic and gender predispositions, and potentially share many risk factors-the most significant of which may be smoking status. These diseases also have many pathogenic mechanisms in common. It is becoming increasingly clear that infections and chronic inflammatory conditions such as periodontitis may influence the atherosclerotic process. The severity and chronicity of periodontal disease provides a rich source of subgingival microbial and host response products and effects over a long time period. The objective of this review is to
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies have demonstrated that vitamin D (VD) influences gut microbiota (GM) by regulating epithelial barrier function and immune responses, thereby affecting microbial composition and diversity. Additionally, host genetic factors, particularly single-nucleotide variants (SNVs) in genes related to VD metabolism, may influence GM composition. Postmenopausal women are a particularly relevant population to assess the impact of these SNVs, as this group experiences reduced hormonal variability and a higher burden of vitamin D deficiency (VDD), enabling clearer evaluation of the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Stunting is known to be heavily influenced by environmental factors, so the genetic contribution has received little attention. Here we report an exploration of genetic influences in stunted Zambian children with environmental enteropathy.
METHOD: Children with stunting (LAZ < -2) were enrolled and given nutritional therapy. Those that were non-responsive to therapy were designated as cases, and children with good growth (LAZ > -1) from the same community as controls. Blood and stool samples were taken to measure biomarkers of intestinal inflammation, epithelial damage, and microbial
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmids are mobile genetic elements with autonomous replication, whose ecology extends beyond individual bacterial hosts. As molecular symbionts, they have the potential to traverse bacterial taxa and environments, disseminating adaptive genes and shaping microbial community structure through dynamics that are likely decoupled from host taxonomy. Plasmidomics - the omics discipline dedicated to the study of plasmids - has revealed that plasmid diversity and distribution respond to environmental gradients independently of their hosts, underscoring their roles as ecological entities. However, t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human microbiota consists of trillions of microbial cells dominated by bacteria, which live in the human body, while the term microbiome refers to the collective genetic material of microorganisms. Among them, the gut microbiota has emerged as pivotal, producing its own metabolites, neurotransmitter precursors, and immune mediators that affect brain development and function. These signals function via the complex, bidirectional Gut-Brain Axis (GBA). This is a communication network that connects the gastrointestinal tract to the central nervous system. This axis plays an important role in the r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microalgae represent a crucial, multifunctional microbial cell factory platform for renewable energy and climate change mitigation. Their notably high lipid content (often exceeding 70% DCW) and rapid growth rates, which significantly surpass those of traditional terrestrial crops, making them an ideal feedstock for diverse bioenergy applications. This review critically evaluates advanced conversion pathways for biofuels such as biodiesel and bioethanol, as well as biohydrogen production and bioelectricity generation via microbial fuel cell technology. It further explores key technical paradig
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiota plays a vital role in intestinal homeostasis and the regulation of the immune system, thereby influencing overall well-being. Disruption of this microbial ecosystem, termed dysbiosis, has been implicated in the aetiology of a large number of human diseases, including inflammatory bowel diseases (IBD). IBD is classified into Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Several factors, such as genetic predisposition and gut microbiota, cause IBD. It has been suggested that there is a significant correlation between the development of IBD and alterations in the gut microb
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal mucosa employs a diverse set of defense mechanisms-from mucosal barrier regulation to immunoregulatory pathways-to maintain homeostasis despite constant exposure to microbial and dietary antigens. Failure to establish immune tolerance to food antigens can lead to pathological conditions such as celiac disease (CeD) and food allergies. This review provides an overview of the sequential processes that support tolerance to food antigens and examines how gene-environment interactions contribute to the pathogenesis of CeD and food allergies. Although the exact nature of the environme
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The review summarizes existing knowledge on the relationship between certain diseases and alteration (degeneration) of the intestinal microbiome. We consider major microbial metabolites firmly recognized as signaling molecules acting in communication between the microbiome and the host organism. These include short-chain fatty acids, bile acids, amines, amino acids, and their metabolites. Special attention is paid to metabolomic studies of the microbiome in chronic kidney diseases, in particular, immunoglobulin A nephropathy. The arguments supporting a concept of the microbiome of blood, previ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonalcoholic fatty liver disease, recently re-named metabolic dysfunction-associated steatotic fatty liver disease, is considered the most prevalent liver disease worldwide. Its molecular initiation events are multiple and not always well-defined, comprising insulin resistance, chronic low-grade inflammation, gut dysbiosis, and mitochondrial dysfunction, all of them acting on genetic and epigenetic grounds. Nowadays, there is a growing public health threat, which is antibiotic excessive use and misuse. This widespread use of antibiotics not only in humans, but also in animals has led to the pr
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial carbonic anhydrases (BCAs, EC 4.2.1.1) are indispensable enzymes in microbial physiology because they facilitate the hydration of carbon dioxide (CO2) to bicarbonate ions (HCO3-) and protons (H+), which are crucial for various metabolic processes and cellular homeostasis. Their involvement spans from metabolic pathways, such as photosynthesis, respiration, to organic compounds production, which are pivotal for bacterial growth and survival. This chapter elucidates the diversity of BCA genetic families, categorized into four distinct classes (α, β, γ, and ι), which may reflect bacteri
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiome can affect drug metabolism considerably, leading to modified drug response. However, quantitative estimation of host vs. microbial contributions in a living host-gut microbiome system has been challenging. Using the interspecies system of Caenorhabditis elegans and gut bacteria, we developed a real-time approach for monitoring their metabolic interaction in vivo during anticancer drug 5-fluorouracil (5-FU) metabolism. The fluorine NMR-based approach yielded the quantitative contributions to the host 5-FU metabolism made by human gut-microbial species of variable genetic backgrou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As antibiotic and heavy metals are over used in the livestock industry, animal manure is a reservoir of antibiotic resistance genes (ARGs). Anaerobic digestion has been reported to have the potential to reduce ARGs. However, few studies investigated whether reduction of ARGs would be affected by different external pressures including antibiotics and heavy metals during anaerobic digestion. The purpose of this study was thus to investigate effects of both chlortetracycline (CTC) and Cu on reduction of ARGs, heavy metal resistance genes (HMRGs) and mobile genetic elements (MGEs) during the swine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Periodontal diseases comprise a wide range of inflammatory conditions that affect the supporting structures of the teeth (the gingiva, bone and periodontal ligament), which could lead to tooth loss and contribute to systemic inflammation. Chronic periodontitis predominantly affects adults, but aggressive periodontitis may occasionally occur in children. Periodontal disease initiation and propagation is through a dysbiosis of the commensal oral microbiota (dental plaque), which then interacts with the immune defences of the host, leading to inflammation and disease. This pathophysiological situ
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asthma and allergies are among the most frequent chronic diseases in childhood. Their prevalence has increased during the second half of the twentieth century but seem to stabilize in recent years in many Western European countries such as Switzerland. Although the genetic background is known to have a strong impact on an individual's risk to develop asthma or allergy it seems likely that environmental factors are mostly responsible for the increase in prevalence over time. Much research has been devoted to environmental risk factors promoting the development of asthma and allergies. Yet, ther
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Detection of antigen-specific T cells at the single-cell level by ELISpot or flow cytometry techniques employing intracellular cytokine staining (ICS) is now an indispensable tool in many areas of immunology. When precisely mapped, optimal MHC-binding peptide epitopes are unknown, these assays use antigen in a variety of forms, including recombinant proteins, overlapping peptide sets representing one or more target protein sequences, microbial lysates, lysates of microbially-infected cells, or gene delivery vectors such as DNA expression plasmids or recombinant vaccinia or adenoviruses express
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования