BACKGROUND: CircLRIG1 has been demonstrated to inhibit the progression of bladder cancer. However, the expression profile and function of circLRIG1 in colorectal cancer (CRC), the third most prevalent malignancy globally, remain to be explored.
METHODS: CircLRIG1 (circBase ID: hsa_circ_0003266) expression was first analyzed in the GSE142837 dataset and subsequently validated in CRC tissues and cell lines. HT-29 and LoVo cells were subjected to gain- and loss-of-function manipulations to delineate the impact of circLRIG1 on the proliferation, migration, and apoptosis of CRC cells. RNA-binding
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer remains a leading cause of cancer-related mortality worldwide, with triple-negative breast cancer (TNBC) representing a particularly aggressive subtype lacking targeted therapies. Inducing copper-mediated cell death stands as a significant therapeutic approach for tumors; however, research into non-coding RNA regulation of copper-mediated cell death in TNBC remains relatively scarce. This study analyses transcriptomic data from TNBC patients to identify long non-coding RNAs (lncRNAs) associated with copper-mediated cell death, aiming to uncover potential therapeutic t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the diplogonadic human tapeworm, Diplogonoporus grandis, has long been considered to be a synonym of the whale tapeworm, Diplogonoporus balaenopterae, the identity of the both species at the complete mitochondrial genomes and nuclear DNA levels has been not sufficiently undertaken to date. In the present study, to clarify the taxonomic relationships between D. balaenopterae and D. grandis at the molecular level, the complete mitochondrial genomes of both species were sequenced and compared. In addition, the genetic variation in the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 gene (co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spermatogenesis is a tightly coordinated differentiation program that sustains male fertility while transmitting genetic and epigenetic information to the next generation. This review consolidates mechanistic evidence showing how RNA-centered regulation integrates with the epitranscriptome and three-dimensional (3D) genome architecture to orchestrate germ-cell fate transitions from spermatogonial stem cells through meiosis and spermiogenesis. Recent literature is critically surveyed and synthesized, with particular emphasis on human and primate data and on stage-resolved maps generated by sing
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic genomes are colonized by various transposons including short interspersed elements (SINEs). The 5' region (head) of the majority of SINEs is derived from one of the three types of RNA genes--7SL RNA, transfer RNA (tRNA), or 5S ribosomal RNA (rRNA)--and the internal promoter inside the head promotes the transcription of the entire SINEs. Here I report a new group of SINEs whose heads originate from either the U1 or U2 small nuclear RNA gene. These SINEs, named SINEU, are distributed among crocodilians and classified into three families. The structures of the SINEU-1 subfamilies indic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microglia, the resident macrophages of the central nervous system (CNS), serve as the primary reservoir of HIV-1 in the brain and play a crucial role in the development of HIV-1-associated neurocognitive disorders (HAND). While long non-coding RNAs (lncRNAs) have emerged as essential regulators of HIV-1 replication in T cells and macrophages, their role in microglia remains poorly understood. Here, we performed RNA sequencing of polyadenylated transcripts from a human microglial cell line exposed to HIV-1 infection or TNF-α stimulation to investigate transcriptional responses and identify lncR
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is the most common form of adult-onset motor neuron disease, characterised by the degeneration of upper and lower motor neurons. The cytoplasmic aggregation of TDP-43 (TAR DNA-binding protein 43), an RNA-binding protein, is considered a hallmark of ALS pathology, found in nearly all postmortem cases of ALS. TDP-43 is normally primarily nuclear, where it has a widespread role in gene regulation. Mutations, extrinsic stressors, and alterations in RNA homeostasis in ALS lead to nuclear depletion of TDP-43 and the formation of cytosolic TDP-43 aggregates. This c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis treatments commonly mitigate bone loss but rarely restore lost bone mass. Yes-associated protein (Yap) nuclear translocation is crucial for the osteogenic differentiation of bone marrow stromal cells (BMSCs), but is disrupted by many factors under osteoporotic conditions. Long non-coding RNAs (lncRNAs) regulate BMSCs differentiation and Yap localization across diseases, exhibiting tissue- and cell-specific effects. However, their role in aberrant Yap signaling within BMSCs under osteoporosis remains unclear. Here, we identify small nucleolar RNA host gene 18 (lnc-Snhg18), a functi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs (circRNAs) are a class of covalently closed single-stranded RNA molecules. Four types of circRNAs have been reported in animal cells, and they have typical characteristics in their biogenesis, nuclear export and degradation. Advances in our understanding of the molecular functions of circRNAs in sponging microRNAs, modulating transcription, regulating RNA-binding proteins, as well as encoding proteins have been made very recently. Dysregulated circRNAs are associated with human diseases such as acute myeloid leukemia (AML). In this review, we focus on the recently described mecha
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nuclei RNA sequencing remains a challenge for many human tissues, as incomplete removal of background signal masks cell-type-specific signals and interferes with downstream analyses. Here, we present Quality Clustering (QClus), a droplet filtering algorithm targeted toward challenging samples. QClus uses additional metrics, such as cell-type-specific marker gene expression, to cluster nuclei and filter empty and highly contaminated droplets, providing reliable filtering of samples with varying number of nuclei and contamination levels. In a benchmarking analysis against seven alternativ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues constitute a vast and valuable patient material bank for clinical history and follow-up data. It is still challenging to achieve single cell/nucleus RNA (sc/snRNA) profile in FFPE tissues. Here, we develop a droplet-based snRNA sequencing technology (snRandom-seq) for FFPE tissues by capturing full-length total RNAs with random primers. snRandom-seq shows a minor doublet rate (0.3%), a much higher RNA coverage, and detects more non-coding RNAs and nascent RNAs, compared with state-of-art high-throughput scRNA-seq technologies. snRandom-seq detect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza C virus is an important respiratory pathogen not only infecting people, but also pigs, dogs, and other animals. Polymerase is central to the replication of influenza C virus and is an important target for studying the mechanism of viral replication. However, there is no commercial monoclonal antibody (MAb) targeting influenza C virus polymerase, which hampers the development of relevant research to some extent. In order to prepare MAb targeting the polymerase basic protein 2 (PB2) of influenza C virus, influenza C virus RNA-dependent RNA polymerase (RdRp, consists of PB1, PB2 and P3)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hybridization chain reaction RNA-fluorescent in situ hybridization (HCR RNA-FISH) is a powerful and increasingly used method for visualizing gene expression in cells and tissues. A probe set against polyadenylated RNA (poly(A)) is often used as a positive control for RNA integrity and staining quality. While optimizing this technique in the ovary of the brown anole lizard (Anolis sagrei), we found that the poly(A) probe produced a strikingly specific and intense signal in pyriform cells, a specialized lizard-specific nurse cell type. This staining pattern was found in both whole-mount samples
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs (circRNAs) are emerging regulators in cancer biology, yet the mechanisms underlying their biogenesis remain incompletely defined. RBM10, a splicing regulator frequently mutated in lung adenocarcinoma (LUAD), modulates RNA processing, but its involvement in circRNA regulation has not yet been addressed. Transcriptomic profiling of RBM10-restored LUAD cells, followed by RT-qPCR validation, identified circHIPK3 and circSMARCA5 as consistently RBM10-dependent circRNAs. Subcellular fractionation confirmed nuclear confinement of RBM10 and cytoplasmic enrichment of circRNAs, supporting
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The HPV-16 virus is well described as a causative agent in cervical cancer.
AIMS: To individually analyse the transcription profile of the HPV-16 viral genes in patient biopsies of varying grades of cervical dysplasia by a chromogenic in situ hybridisation technique.
METHODS: 19 formalin fixed, paraffin embedded (FFPE) biopsies of cervical dysplasia were analysed by a chromogenic in situ hybridisation protocol using novel long single stranded digoxigenin labelled DNA probes targeted to the individual HPV-16 gene RNAs.
RESULTS: A transcription pattern for all the HPV-16 genes tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In glomerular diseases associated with antibody- and complement-mediated injury to endothelial and mesangial cells, cell proliferation is an important early response that precedes matrix accumulation and glomerulosclerosis. In contrast, in diseases in which the visceral glomerular epithelial cell (vGEC) is the principal target of injury, cell proliferation is not a recognized consequence, although vGECs respond in vitro to a variety of growth factors and inflammatory mediators. To explore the possibility that low levels of vGEC proliferation may occur and participate in such diseases, serial s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral proteins typically exist in the context of complex virions or in the even more complex host cells in which they replicate. Hence, meaningful insights into virus protein structure often need to account for this context. Various flavors of in situ cryo-electron microscopy (cryo-EM), such as cryo-electron tomography, are key methods for the contextual study of virus protein structure in pleomorphic virions and host cells. Here, we review recent in situ cryo-EM work on three selected phenomena in RNA virus replication: the maturation and nuclear entry of HIV-1, the membrane-bound replication
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyltransferase-like 3 (METTL3), a component of the RNA N6-methyladenosine (m6A) modification with a specific catalytic capacity, controls gene expression by actively regulating RNA splicing, nuclear export, stability, and translation, determines the fate of RNAs and assists in regulating biological processes. Studies conducted in recent decades have demonstrated the pivotal regulatory role of METTL3 in liver disorders, including hepatic lipid metabolism disorders, liver fibrosis, nonalcoholic steatohepatitis, and liver cancer. Although METTL3's roles in these diseases have been extensively
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The deregulation of cellular long non-coding RNA (lncRNA) expression during a human adenovirus infection was studied by deep sequencing. Expression of lncRNAs increased substantially following the progression of the infection. Among 645 significantly expressed lncRNAs, the expression of 398 was changed more than 2-fold. More than 80% of them were up-regulated and 80% of them were detected during the late phase. Based on the genomic locations of the deregulated lncRNAs in relation to known mRNAs and miRNAs, they were predicted to be involved in growth, structure, apoptosis and wound healing in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Novel classes of small and long non-coding RNAs (ncRNAs) are increasingly becoming apparent, being engaged in diverse structural, functional and regulatory activities. They take part in target gene silencing, play roles in transcriptional, post-transcriptional and epigenetic processes, such as chromatin remodeling, nuclear reorganization with the formation of silent compartments and fine-tuning of gene recruitment into them. Among their functions, non-coding RNAs are thought to act either as guide or scaffold for epigenetic modifiers that write, erase, and read the epigenetic signature over th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования