MOTIVATION: Phylogenetic trees describe the evolutionary history among biological species based on their genomic data. Maximum likelihood (ML) based phylogenetic inference tools search for the tree and evolutionary model that best explain the observed genomic data. Given the independence of likelihood score calculations between different genomic sites, parallel computation is commonly deployed. This is followed by a parallel summation over the per-site scores to obtain the overall likelihood score of the tree. However, basic arithmetic operations on IEEE 754 floating-point numbers, such as add
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Psoriasis is a chronic, immune-mediated inflammatory skin disorder that frequently exhibits spontaneous clinical remission during pregnancy. However, the underlying cell-type-specific transcriptomic alterations-particularly the involvement of dermal fibroblasts and hormone receptor signaling-remain poorly understood. Methods: We established an imiquimod (IMQ)-induced psoriasis-like dermatitis model in BALB/c mice comparing pregnant and non-pregnant cohorts. Multi-omics profiling combing bulk and single-cell RNA sequencing was integrated with computational intercellular communicatio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal cord injury (SCI) causes permanent neurological deficits and is associated with complex pathological processes such as angiogenesis and programmed cell death (PCD). However, the crosstalk between angiogenesis and PCD in SCI remains unclear. METHODS: We integrated angiogenesis-related and PCD-related datasets to identify angiogenesis- and PCD-associated differentially expressed genes (ARPRDEGs). Weighted gene coexpression network analysis (WGCNA), protein–protein interaction (PPI), and machine learning were used to screen hub genes, followed by time-course qRT-PCR and Western
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Stroke-related damage to structural pathways and functional connections disrupts neural network communication, contributing to behavioral deficits. A critical next step is to determine whether observed relationships between connectivity and behavior align with established neurobiological frameworks. This involves investigating structural-functional relationships as structural connectivity provides the scaffold for functional communication. Prior work primarily explored structural-functional relationships at rest, particularly between structural measures and cortico-cortical funct
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Case managers for persons with dementia not only coordinate patient care but also provide family caregivers with educational material and available support services. Taiwan uses a government-based information system for monitoring the provision of health care services. Unfortunately, scheduling patient care and providing information to family caregivers continues to be paper-based, which results in a duplication of patient assessments, complicates scheduling of follow-ups, and hinders communication with caregivers, which limits the ability of case managers to provide cohesive, qual
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Upon environmental stimuli, ribosomes are surmised to undergo compositional rearrangements due to abundance changes among proteins assembled into the complex, leading to modulated structural and functional characteristics. Here, we present the ComplexOme-Structural Network Interpreter ( COSNet i ), a computational method to allow testing whether ribosomal proteins (rProteins) that exhibit abundance changes under specific conditions are spatially confined to particular regions within the large ribosomal complex.
RESULTS: COSNet i translates experimentally determined structur
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The inclusion of diffusion-weighted magnetic resonance imaging (DW-MRI) in major national studies has allowed for quantification and characterization of white matter macrostructure and microstructure in cases of disease and disorder. Diffusion tensor imaging (DTI) yields 3D scalar maps to summarize the DW-MRI signal with quantitative metrics. Fractional anisotropy (FA) is a DTI metric that describes the degree of anisotropy within diffusion and is frequently used to interpret white matter integrity, but it exhibits high sensitivity in pathological interpretation. These properties of F
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnosis of rib fractures plays an important role in identifying trauma severity. However, quickly and precisely identifying the rib fractures in a large number of CT images with increasing number of patients is a tough task, which is also subject to the qualification of radiologist. We aim at a clinically applicable automatic system for rib fracture detection and segmentation from CT scans.
METHODS: A total of 7,473 annotated traumatic rib fractures from 900 patients in a single center were enrolled into our dataset, named RibFrac Dataset, which were annotated with a human-in-th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Speech, as the core of advanced human cognition, is fundamental to social interaction and daily life. Electroencephalogram (EEG)-based speech brain-computer interface (BCI) offers a novel communication pathway for patients with speech disorders, where deep learning has demonstrated significant advantages. Given the established dominance of the left hemisphere in speech processing, exploring methods to extract speech-related neural features fully is crucial for enhancing decoding performance.
APPROACH: In this study, EEG signals were recorded during a silent speech task involving th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flexible electronic sensors hold great promise in the fields of wearable health monitoring and human-computer interaction. However, existing hydrogel systems generally suffer from insufficient mechanical strength and limited multifunctional integration. To address these bottlenecks, a self-assembly strategy was employed to fabricate a supramolecular ionic hydrogel based on lignosulfonate (SL) and polyvinyl alcohol (PVA), exploiting the coordination interactions of Zn2+ to construct a PVA/SL/ZnCl2 hydrogel sensor. Owing to the dual network structure of PVA/SL and Zn2+/SL within the supramolecul
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aeration-reflux coupling can establish functional zonation in integrated upflow anaerobic sludge blanket (UASB) reactors, but the hydrodynamic basis remains insufficiently quantified. This study integrated computational fluid dynamics (CFD) with metagenome-derived KO-genus profiling based on the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) from vertically resolved samples to link hydrodynamic characteristics with microbial functions. CFD analysis showed that aeration established an oxygen-exposed zone in the upper reactor, whereas internal reflux regulated downward bubble entrainment and gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Visium HD spatial transcriptomics platform enables transcriptome-wide profiling at near-single-cell resolution. However, accurate segmentation of cells to define spatial boundaries relies heavily on histological images. Previous approaches struggle to define cells when the tissues have high cell density, are inflamed, or are mineralized, leading to transcriptomic bleed-through and inaccurate clustering. To address this, we developed TENGU (Transcript-signal Enrichment and Grouping Unit), a comprehensive end-to-end bioinformatic software package. Unlike existing tools, TENGU employs a trans
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrophic fracture nonunion is a clinically challenging form of failed bone repair, particularly under inflammatory conditions, but the cell-intrinsic programs that impair the function of skeletal stem/progenitor cells (SSPCs) remain incompletely defined. Here, we integrated public and in-house single-cell RNA sequencing datasets from mouse periosteum, normal fracture healing, and inflammation-associated fracture nonunion models to characterize stromal cell fate changes. Trajectory inference, transcription factor network analysis, and intercellular communication modeling were combined with in v
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mental health workforce research treats South Asian Americans as a single group, yet they speak many mutually unintelligible languages, and language concordance shapes whether people with limited English proficiency (LEP) reach and stay in care. We measured the availability, geographic concentration, and affordability of psychotherapists listing eight South Asian languages. We analyzed 347,464 Psychology Today directory profiles (2025), identified providers listing Hindi, Urdu, Punjabi, Gujarati, Bengali, Tamil, Telugu, or Nepali, and linked counts to American Community Survey (2019-2023) spea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The comprehension-production vocabulary gap is a well-documented hallmark of language development; however, anecdotal evidence suggests that this asymmetry may be reduced in children with Williams syndrome (WS). Here, we use empirical data to characterise the comprehension-production gap and computational modelling to investigate potential mechanisms underlying this distinctive linguistic profile, focusing on children aged 7 months to 6 years. Using parental reports (Communicative Development Inventories), we measured the receptive and expressive vocabularies of children with WS (n = 67) and c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The exponential growth of multimedia data transmission has intensified the demand for advanced image encryption systems capable of resisting contemporary cryptanalytic attacks while maintaining computational efficiency. Conventional encryption schemes often fail to provide sufficient confusion and diffusion when applied to high-dimensional color images. To overcome these challenges, this paper proposes a novel Substitution-Permutation Network (SPN)-based RGB image encryption algorithm constructed over the residue classes of quaternion integers (RQCI's) [Formula: see text] The method specifical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related macular degeneration (AMD) and Parkinson's disease (PD) are prevalent and debilitating conditions that lead to irreversible blindness and dyskinesia, respectively. Emerging evidences imply that retinal abnormalities may serve as early indicators for monitoring PD. This study endeavors to explore the complex interactions and focus on their shared molecular and pathological mechanisms. We employed a comprehensive approach by integrating single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets, obtained from dry AMD retinas and PD brain tissues, along with Weighted Gene Co-expression Network A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The Northern Ireland Cohort for the Longitudinal Study of Ageing (NICOLA) study is the largest study of ageing in Northern Ireland (NI). The Harmonised Cognitive Assessment Protocol (HCAP) is a substudy of NICOLA designed to assess cognitive impairment and dementia in individuals aged 65 and over. The NICOLA-HCAP substudy is funded by the National Institute on Aging as part of a network for enhancing cross-national research within a worldwide group of population-based, longitudinal studies of ageing, all of which are centred around the US-based Health and Retirement Study.
METHO
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autonomic, pain, limbic, and sensory processes are mainly governed by the central nervous system, with brainstem nuclei as relay centers for these crucial functions. Yet, the structural connectivity of brainstem nuclei in living humans remains understudied. These tiny structures are difficult to locate using conventional in vivo MRI, and ex vivo brainstem nuclei atlases lack precise and automatic transformability to in vivo images. To fill this gap, we mapped our recently developed probabilistic brainstem nuclei atlas developed in living humans to high-spatial resolution (1.7 mm isotropic) and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We evaluated the diagnostic performance of a clinically available deep learning-based computer-assisted diagnosis software for detecting unruptured aneurysms (UANs) using magnetic resonance angiography and assessed the functionality of the convolutional neural network (CNN) final layer score for distinguishing between UAN and infundibular dilatation (ID).
MATERIALS AND METHODS: EIRL brain aneurysm (EIRL_BA) was used in this study. The subjects were 117 UAN and/or ID cases including 100 UAN lesions (average sizes of 2.56 ± 1.45 mm) and 40 ID lesions (average sizes of 1.75 ± 0.41 mm) i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования