Whole-genome sequencing (WGS) of morphology-selected sperm pools provides an exploratory approach for investigating genomic features associated with variable sperm quality. In this study, pooled DNA from 1500 individually selected spermatozoa per sample was analyzed from paired high-quality (HQ; motile, normal morphology) and poor-quality (PQ; immotile, abnormal morphology) sperm populations obtained from the same ejaculate of six male partners undergoing infertility treatment. A multi-step filtering and annotation pipeline incorporating American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spotted fever group (SFG) Rickettsia spp. are emerging zoonotic pathogens transmitted by ixodid and argasid ticks. Despite the recognized importance of ticks as vectors in Central Asia, data on the prevalence and genetic diversity of SFG Rickettsia in Uzbekistan remain scarce. This study aimed to determine minimum infection rates (MIR) and phylogenetic relationships of SFG Rickettsia circulating in ticks parasitizing domestic animals across five regions of Uzbekistan. Ticks (n = 12,769) were collected from 8632 domestic animals (cattle, sheep, goats, horses, camels, donkeys, and poultry) betwe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation is an emerging biomarker for cervical cancer screening. This study aimed to evaluate the diagnostic performance of paired box gene 1/junctional adhesion molecule 3 (JAM3) dual-gene methylation analysis for detecting high-grade cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer, and to explore its potential utility as a triage biomarker for high-risk human papillomavirus positive women.
METHODS: A systematic search was conducted across 5 databases, including PubMed, for studies on PAX1/JAM3 methylation testing in cervical cancer screening. Following quality asse
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To investigate the distribution patterns of mosquitoes, midges and related arboviruses in Sichuan province. Methods: Blood-sucking insects were collected from houses and pens, using the ultraviolet lights. Mosquito samples were classified according to morphologic characteristics and then stored at liquid nitrogen. All samples were incubated with BHK-21 and C6/36 cells for virus isolation and then detected for their viral genes. Sequences of the virus were identified and analyzed by molecular biological software, such as BioEdit 7.0.5.3, MEGA 6.0. Results: In total, 17 019 mosquitoes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zinc is an important trace element in biology. An important pool of zinc in the brain is the one present in synaptic vesicles in a subgroup of glutamatergic neurons. In this form it can be released by electrical stimulation and may serve to modulate responses at receptors for a number of different neurotransmitters. These include both excitatory and inhibitory receptors, particularly the NMDA and GABA(A) receptors. This pool of zinc is the only form of zinc readily stained histochemically (the chelatable zinc pool), but constitutes only about 8% of the total zinc content in the brain. The rema
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophage genomes are densely packed with coding sequences and frequently encode genes of unknown function. Unbiased phage functional genomics approaches are therefore needed, particularly for large lytic phages. Here, we harness the mariner transposase to develop phage transposon mutagenesis and sequencing (phage TnSeq), which enables pooled sequencing to identify both fitness-conferring and dispensable genes. Using the Pseudomonas aeruginosa-infecting nucleus-forming jumbo phage ΦKZ (280,334 bp; 371 predicted genes), we show that ∼110 genes are fitness-conferring via phage TnSeq, identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The impact of chronic hepatic infection on antigen non-specific immune cells in circulation remains poorly understood. We reported lasting global hyperfunction of peripheral CD8 T cells in HCV-infected individuals with cirrhosis. Whether gene expression patterns in bulk CD8 T cells are associated with the severity of liver fibrosis in HCV infection is not known.
METHODS: RNA sequencing of blood CD8 T cells from treatment naïve, HCV-infected individuals with minimal (Metavir F0-1 ≤ 7.0 kPa) or advanced fibrosis or cirrhosis (F4 ≥ 12.5 kPa), before and after direct-acting antiviral
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Mutations in the gene encoding type VI collagen cause Bethlem myopathy (MIM 158810) and Ullrich congenital muscular dystrophy (MI … 1 in a pediatric patient, expanding the phenotypic spectrum of the disease and enriching the human gene pool.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylated amines (MAs) are ubiquitous in the marine environment, constituting an important part of the marine dissolved organic nitrogen pool and contributing to the formation of cloud condensation nuclei in the marine atmosphere. The aerobic trimethylamine (TMA) oxidation pathway represents the primary route for TMA utilization in marine environments and has been characterized in the model marine Roseobacter group bacterium Ruegeria pomeroyi DSS-3. However, the regulatory mechanism underlying this pathway has remained unclear. Transcriptome analysis revealed coordinated induction of the enti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA chips facilitate genomic-wide exploration of gene expression. The authors hypothesized that ischemic (IPC) and anesthetic preconditioning (APC) would differentially modulate gene expression in hearts.
METHODS: Affymetrix rat U34A gene chips were used to explore the transcriptional response to IPC and APC, sustained ischemia (110 min) without reperfusion, and time-matched perfusion in isolated rat hearts. IPC was induced by three cycles of 5 min of ischemia, and APC was induced by 1.5 minimum alveolar concentration isoflurane (110 min). For each heart, a separate chip was used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillary dysentery caused by Shigella species is a public health problem in developing countries including Bangladesh. Although, shigellae- … l virulence genes in Shigella are carried by plasmids or mobile genetic elements, the environmental gene pool may contribute to an optimum combination of genes, causing the emergence of virulent Shigella strains which is facilitated in particular by close contact of the population with surface waters in Bangladesh.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Approximately 20% of ovarian cancers are due to an underlying germline pathogenic variant. While pathogenic variants in several genes have been well-established in the development of hereditary ovarian cancer (e.g. BRCA1/2, RAD51C, RAD51D, BRIP1, mismatch repair genes), the role of partner and localizer of BRCA2 (PALB2) remains uncertain. We sought to utilize meta-analysis to evaluate the association between PALB2 germline pathogenic variants and ovarian cancer.
METHODS: We conducted a systematic review and meta-analysis. We searched key electronic databases to identify studies eva
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cells are characterized by an increased level of metabolism and are highly dependent on the correct functioning of the processes that ensure homeostasis. Reactive sulfur species (RSS) are important molecular modulators of metabolic processes in both healthy and tumor cells. The effect of RSS and, in particular, H2S, on key cellular systems, including the ubiquitin-proteasome system (UPS), which provides the destruction of most intracellular proteins, has been shown. The main components of the UPS are proteasomes, multisubunit protein complexes, within which proteolysis occurs. At the sa
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Toll-like receptor 4 (TLR4) plays a pivotal role in the innate immune response and is hyperactivated in preeclampsia (PE). Several researchers have published conflicting evidence for TLR4 rs4986790 and rs4986791 single nucleotide polymorphisms (SNPs) as risk factors for PE. The present meta-analysis was conducted to obtain a more definitive conclusion about the effects of these SNPs on PE susceptibility. MATERIAL AND METHODS To determine the correlation between rs4986790 and rs4986791 polymorphisms in the TLR4 gene and susceptibility to PE, the PubMed, Web of Science, EMBASE, Chines
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative real-time PCR (qPCR) is increasingly used to detect Pneumocystis jirovecii for the diagnosis of Pneumocystis pneumonia (PCP), but there are differences in the nucleic acids targeted, DNA only versus whole nucleic acid (WNA), and also the target genes for amplification. Through the Fungal PCR Initiative, a working group of the International Society for Human and Animal Mycology, a multicenter and monocenter evaluation of PCP qPCR assays was performed. For the multicenter study, 16 reference laboratories from eight different countries, performing 20 assays analyzed a panel consistin
Оценочное исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orientia tsutsugamushi, the causative agent of scrub typhus, is an obligate intracytosolic bacterium transmitted among humans and small mammals by some species of larval trombiculid mites (chiggers). It has been recognized as a pathogen of major public health concern in the Asia-Pacific region. As disease is considered as a neglected, there exists a gap in our knowledge of the disease with regard to the sporadic epidemiologic data in endemic areas. The purpose of the study was to find out the vector as well as pathogen distribution in rodents present in the scrub typhus-reported areas in centr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Keratoconus is a progressive disorder of the cornea that can lead to severe visual impairment or blindness. Although several genomic regions have been linked to rare familial forms of keratoconus, no genes have yet been definitively identified for common forms of the disease.
METHODS: Two genome-wide association scans were undertaken in parallel. The first used pooled DNA from an Australian cohort, followed by typing of top-ranked single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in individual DNA samples. The second was conducted in individually genotyped patients, and controls from the USA. T
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The production of clariid catfish in Thai aquaculture depends on culture of the native species (Clarias macrocephalus and C. batrachus) and … statin. Although Bayesian phylogenetics showed intermingled allelic lineages, an integrated "growth-gene pool" approach that combined Mstnb and GH1 polymorphisms resolved a robust species-level split (K = 2) and hierarchical sub-structuring (K = 6). Selection analyses identified significant adaptive diversification (ω = 1.857). Codon-level models highlighte …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The hypomorphic variant rs11209026-A in the IL23R gene provides significant protection against immune-related diseases in Europeans, notably inflammatory bowel diseases (IBD). Today, the A-allele occurs with an average frequency of 5% in Europe.
METHODS: This study comprised 251 ancient genomes from Europe spanning over 14,000 years. In these samples, the investigation focused on admixture-informed analyses and selection scans of rs11209026-A and its haplotypes.
FINDINGS: rs11209026-A was found at high frequencies in Anatolian Farmers (AF, 18%). AF later introduced the allele int
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: De novo mutations provide a fundamental source of gene pool changes, driving genomic microevolution. Charcot-Marie-Tooth disease (CMT), which is a group of genetically and clinically heterogeneous peripheral neuropathic disorders, is characterized by progressive muscle weakness, hand and foot deformities, and occasional involvement of other organs. This study conducted the first cohort study of de novo mutations in CMT patients.
METHODS: De novo mutations were examined in 151 genetically diagnosed father-mother-child trio autosomal dominant CMT families except for CMT1A.
…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.