UNLABELLED: Methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-susceptible (MSSA) Staphylococcus aureus are major causes of hospital-acquired infections worldwide. However, their genomic features remain underexplored in many regions, particularly in low- and middle-income countries (LMICs). Here, we investigated the genomic diversity, antibiotic resistance, and virulence traits of methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-susceptible (MSSA) Staphylococcus aureus isolates from three tertiary care hospitals in Mexico City. A total of 101 isolates collected between 2006 and 2019 from newborns and ad
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Radiotherapy outcomes are determined by the balance between tumor control and normal tissue toxicity, both of which exhibit significant interpatient variability. While radiogenomic and molecular approaches have identified determinants of radiosensitivity, their predictive performance remains limited when used in isolation. Methods: This review provides a comprehensive synthesis of functional assays, genomic biomarkers, and integrative models used to assess radiosensitivity, including radiation-induced lymphocyte apoptosis (RILA), chromosomal radiosensitivity assays, micronucleus fo
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: DNA methylation is an important epigenetic feature associated with genetic regulation, gene expression, and phenotypic variation. However, the genetic architecture, regulatory organization, and trait relevance of the porcine skeletal muscle methylome remain poorly characterized.
OBJECTIVES: This study aimed to characterize the genetic regulation of DNA methylation in porcine skeletal muscle and identify genetically supported relationships among genotype, methylation, gene expression, and complex traits.
METHODS: We integrated 185 whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) dataset
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fermented vegetables in Yunnan Province, China, harbor abundant microbial diversity. However, the development of indigenous starter cultures remains under-utilized. Genomic information regarding Leuconostoc (L.) mesenteroides isolates from this region is particularly scarce. To assess the genomic characteristics of eight L. mesenteroides isolates from traditional Yunnan fermented vegetables, we performed whole-genome sequencing and conducted a comparative analysis with 21 publicly available vegetable-derived genomes. Comparative genomic analysis revealed marked variation in genome size and pla
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomics is increasingly influencing psychiatric practice as evidence links genetic variation with neurodevelopmental disorders, treatment response, and complex psychiatric presentations. Psychiatric nurse practitioners are well positioned to incorporate genomics into patient assessment and management; however, familiarity with testing options and clinical indications remains limited. This column reviews key genomic considerations for psychiatric practice, including pharmacogenomics, chromosomal microarray analysis, and exome or genome sequencing. Clinical "red flags," such as developmental de…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastrochilus (Orchidaceae) is a genus of epiphytic orchids valued for horticultural and medicinal purposes. However, the structural and evolutionary features of its plastid genomes have not been systematically examined. Here, we characterize the complete plastid genomes of 23 Gastrochilus species, elucidating structural features and key variations to provide new insights into their evolutionary significance.
RESULTS: The plastid genomes showed a typical quadripartite structure, ranging from 146,183 to 148,666 bp in length. Each genome encodes 120 genes, comprising 74 protein-codin
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To examine the educational and practice gaps that limit genomic competency among oncology nurses and to propose strategies to st … Based on the literature review, despite more than two decades of national initiatives to integrate genomics into nursing education, genomic content remains inconsistently embedded in both prelicensure and graduate curricula. Faculty often report limited readiness to teach this rapidly evolving science, while licensure and certification examinations rarely …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biosynthetic gene clusters (BGCs) are important for plant specialized metabolism, but remain poorly characterized in coffee. Given Brazil's importance in coffee production, we performed a comparative genomic analysis of BGCs across the allotetraploid Coffea arabica and its diploid progenitors C. eugenioides and C. canephora. Using standardized genome filtering, annotation, orthogroup inference, and cluster classification, we identified 472 BGCs comprising 3,118 biosynthetic genes, which were grouped into 194 cluster families and integrated with 28,280 orthogroups. Of these, 7,091 orthogroups w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colletotrichum spp. are widespread fungal pathogens that cause anthracnose in numerous economically important crops and, exhibiting extensive taxonomic, host plant, and lifestyle diversity. Here, we analyzed the genome sequences of 150 strains representing 97 species across 15 species complexes and four singletons, including and integrating both newly assembled and publicly available genomes. Phylogenomic investigation clarified the taxonomy of Colletotrichum and resolved misidentifications. We identified variations in genome architecture contributed by phylogenetic lineages, host types, and l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Veronica L. is one of the most species-rich genera in Plantaginaceae and several species have medicinal, horticultural, or ecological value.
METHODS: In this study, the complete chloroplast genomes of three Veronica species were assembled and annotated using Illumina sequencing data.
RESULTS: The plastomes exhibited a typical quadripartite structures, with total lengths of 150,202 bp for Veronica biloba L., 151,159 bp for Veronica ciliata Fisch. and 151,098 bp for Veronica vandellioides Maxim. Each genome contained 130-132 unique genes, including 86-87 protein-coding genes, 36-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) is a leading cause of disability, yet there are no approved disease-modifying therapies (DMOADs) capable of halting its progression. While genome-wide association studies (GWAS) have robustly linked the 3q21 locus to OA, the causal effector gene and its underlying mechanism have remained elusive, hindering translational progress. METHODS: We implemented a multi-tiered, systematic integrative genomics strategy to proceed from genetic association to causal mechanism. By integrating summary statistics from large-scale OA GWAS with multi-tissue molecular quantitativ…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Global warming poses a critical threat to wheat (Triticum aestivum L.) production, particularly during sensitive reproductive stages. This review synthesizes current understanding of how heat stress affects wheat and the adaptive mechanisms that confer tolerance, with emphasis on recent advances in genomics and biotechnology. Heat stress impairs morphological, physiological, biochemical, and molecular processes, reducing photosynthetic efficiency, accelerating senescence, disrupting assimilate partitioning, and damaging cellular structures. Adaptive responses include optimized water relations,…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA extraction with an alkaline buffer system called 'HotSHOT' is widely used for barcoding because it is rapid, inexpensive, and voucher preserving, but it remains unclear whether sufficient genomic DNA (gDNA) remains in small vouchers for downstream use in genomics. We here evaluate gDNA quality and quantity before and after HotSHOT treatment of 11 insect families representing six orders. Some specimens were flash frozen immediately after collection, while others were kept for 1 week at tropical temperatures in ethanol to mimic Malaise trap conditions. Encouragingly, we show that gDNA of suf…
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how selection acts on individual genotypes often requires genotyping at different life stages and tracking their survival under experimental conditions. However, in mollusks, such as the Eastern oyster (Crassostrea virginica), collecting sufficient high-quality DNA without causing mortality remains challenging. While prior studies have explored different noninvasive genotyping methods, an optimal method hasn't been identified. Here, we tested different techniques by combining two minimally invasive accession techniques (relaxation, shell notching), four types of cell sampling (sw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human gut microbiome comprises a diverse community of bacteria whose interactions with the host range from beneficial mutualism to opportunistic pathogenicity. These interactions are shaped by genomic plasticity and ecological pressures that influence whether microbes support host health, remain conditionally harmless, or contribute to disease. Understanding the mechanisms underlying these shifts is essential for clarifying the balance between cooperation and pathogenicity within the gut ecosystem. This review explores the genomic and evolutionary mechanisms that shape microbial adaptation
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrated chem-bio characterization of microbial strain libraries can streamline natural product discovery by prioritizing candidate producers. Here, we employ language- and transformer-based models to extract actionable insights from linked mass spectrometry (MS)-genome datasets. Our framework enables ranking of microbial producers to prioritise high-potential candidates for targeted validation. Across three representative case studies, this approach prioritized producers of diverse natural products with 75-100% precision. These findings demonstrate the transformative potential of AI-enabled
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Orthocoronavirinae virus subfamily (CoV) poses a continuous global health threat. Seven CoV species are known to infect huma … MERS-CoV, HCoV-OC43 and HCoV-HKU1. CONCLUSIONS: Our study demonstrates the potential of comparative genomics for developing broad-spectrum antiviral siRNAs. We identified a lead siRNA, si117m, which combines a favorable safety profile with cross-species activity against five human CoVs, supporting its potential for clinical translation and future pandemic …
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Advanced maternal age (AMA) and assisted reproductive technologies (ART) are becoming more common and are linked with higher obstetric and perinatal risks. Genomic tools and real-world data (RWD) are transforming risk prediction and care strategies, yet their application to the AMA + ART setting remains uneven.
OBJECTIVE: To synthesize recent evidence on risks associated with AMA and ART, incorporate insights from reproductive genomics and RWD, and discuss their implications for clinical care and guideline development.
METHODS: Narrative review of cohort studies, systematic rev…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.