Pseudomyxoma peritonei is a rare, heterogeneous appendiceal cancer characterized by mucus-secreting tumor cells. Evidence suggests a microbial association, though its significance remains unclear. This forum article synthesizes links among microbial communities, mucin biology, and tumor behavior, highlighting key research challenges and how spatial multiomics may clarify disease mechanisms and therapeutic opportunities.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Single-nucleus multiome assays jointly profile gene expression and chromatin accessibility, yet their analysis typically require … inference from such analyses are difficult to scale, audit, and reproduce; moreover, as a field, snMultiomics and its' toolset remains far from standardized. To address these challenges we developed FORGE, a configureable Nextflow workflow that carries paired data from raw counts and fragments through regulatory network inference with a comprehensive differ …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial biology is shifting from single-sample studies to cohort-scale analyses required for translational research, AI model development, a … suStamp™, a tissue transfer system that enables high-throughput FFPE tissue preparation for spatial multiomics. FFPE sections are first mounted on gel pads, then specific regions of interest are punched using square blades and 'stamped' onto surface-functionalized TissuGrip™ slides using a pusher block. This enables the transfer of up to 32 millimeter-scale …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in multiomics technologies have revolutionized the study of immune-driven diseases by enabling high-dimensional, single-cell resolution analyses. This chapter provides a practical guide for integrating CyTOF (mass cytometry) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data to address key challenges in this field. The integration of these modalities allows for consistent and reproducible cell type annotation, the transfer of annotations to assist in characterizing difficult-to-identify populations, and the transcriptional characterization of rare and heterogeneous subpopulations.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial-related pathways (MRPs) play a crucial role in cancer metabolism and progression; however, their prognostic value in breast cancer (BC) is still poorly understood.
METHODS: We integrated multiomics data to investigate the landscape of MRPs in BC. A mitochondria pathways-associated signature (MPAS) was established using multimachine learning framework and interpreted by SHAP analysis across independent BC cohorts. Additionally, a series of functional experiments were employed to explore the role of RNA exonuclease 2 (REXO2) in BC cells.
RESULTS: MRPs are extensively …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our study developed a multiomics-driven transformer model that combines mammography, MRI, transcriptomic and proteomic data to noninvasively predict axillary lymph node (ALN) metastasis in breast cancer. A total of 2105 patients from 10 institutions were included for model training and validation. The model achieved an AUC of 0.939 in the training cohort (n = 658) and 0.830-0.867 across three independent validation cohorts (n = 282, 971 and 194, respectively), outperforming conventional ultrasound examination. Grad-CAM visualizations highlighted the tumor edges and surrounding tissue, consiste…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide approaches have unveiled multiple aspects of primary brain and spinal cord cancers regarding oncogenic processes, the tumor micr … chromatin accessible regions) at the level of bulk tissue, sorted and single cells, and biofluids. Multiomics integration of cancer-associated molecular alterations, including mapping of long-distant DNA interactions, enables a better understanding of tumor biology, providing clues concerning patient stratification, biomarker discovery, identification of ke …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver resection and liver transplantation remain cornerstone treatments for many hepatobiliary diseases, yet postoperative infection, impair … s, synbiotics, nutritional optimization, antibiotic stewardship, bile acid modulation, and emerging multiomics strategies. We distinguish liver resection from living-donor and deceased-donor liver transplantation because the patient populations, graft or remnant anatomy, ischemia-reperfusion exposures, immune status, and outcome definitions differ. Clinical …
СтатьяVideo-Audio MediaОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) ranks among the most common causes of cancer-related deaths globally. The high incidence of HCC is largely li … ers to detect HCC at an early stage, when therapeutic intervention is more likely to be successful. Multiomics integration has emerged as a powerful strategy to uncover biomarkers and better understand the molecular underpinnings of complex diseases such as HCC. This study summarizes findings from multiple untargeted and targeted mass spectrometry-based anal …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mouse models have been used extensively to study human coronary artery disease (CAD) or atherosclerosis and to test therapeutic targets. However, whether mouse and human share similar genetic factors and pathogenic mechanisms of atherosclerosis has not been thoroughly investigated in a data-driven manner. We conducted a cross-species comparison study to better understand atherosclerosis pathogenesis between species by leveraging multiomics data. Specifically, we compared genetically driven and thus CAD-causal gene networks and pathways, by using human GWAS of CAD from the CARDIoGRAMplusC4D con…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study presents a nanotherapeutic strategy for diabetic peripheral neuropathy (DPN) by developing polyimide-coated zeolitic imidazolate … ic reprogramming while suppressing CD8+ T cell cytotoxicity. Through comprehensive evaluation using multiomics integration, biomineralization synthesis, inflammatory models, and DPN mouse experiments, the system demonstrated favorable physicochemical properties and biodistribution. Treatment with MOF@PI-IL2 significantly improved both electrophysiological pa …
Сравнительное исследованиеСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medulloblastoma (MB) is the most prevalent malignant brain tumor in children, exhibiting clinical and genomic heterogeneity. Of the four major subgroups, Group 3 tumors (MYC-MB), display high levels of MYC and metastasis rates. Despite treatment with surgery, radiation, and chemotherapy, patients with Group 3 MB are more likely to develop aggressive recurrent tumors with poor survival. To examine resistance mechanisms in this study, we perform single nuclei multiome analysis of matched primary and recurrent tumors. Therapy resistant Medulloblastoma demonstrates an expanded persistent progenito
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Alterations of the gut microbiota and host metabolic reprogramming are closely associated with the development of breast cancer a … rentially abundant metabolites and enriched metabolic pathways. In a subset of patients with paired multiomics data (BBD n=19, BC n=31, and PCBC n=34), Spearman's correlation analysis, multiomics principle component analysis (PCA)/partial least squares-discriminant analysis (PLS-DA), and random forest models were employed to integrate the microbiota and meta …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is characterized by extreme molecular heterogeneity and poor prognosis. Understanding its multiomics molecular heterogeneity may facilitate precise classification and individualized treatment.
METHODS: Transcriptomic and proteomic profiles from 140 PDAC patients were integrated using Similarity Network Fusion (SNF) to identify robust molecular subtypes. Sparse partial least-squares discriminant analysis (sPLS-DA), differential expression analysis, and network-based functional enrichment were employed to characterize subtype-specific features…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polychlorinated biphenyls (PCBs) are persistent organic pollutants with reproductive and developmental toxicity, though it remains unclear whether prenatal PCB mixture exposure can lead to neural tube defects (NTDs). We evaluate the effects of real-world PCB mixtures on NTD risk and potential mechanisms by integrating epidemiology, in vivo toxicology, and multiomics. In our case-control study (n = 482), prenatal PCB exposure was estimated from placental concentrations of 13 congeners. Multivariable logistic regression showed that higher levels of PCB-52, PCB-118, and total ΣPCBs were associate…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cachexia is a multifactorial syndrome marked by involuntary weight loss, skeletal muscle wasting, adipose tissue remodeling, and syst … ew linking exosomal miRNAs with proteomic and metabolomic signatures of cancer cachexia, offering a multiomics framework for biomarker discovery and therapeutic targeting. We highlight their potential as early biomarkers, therapeutic targets, and modulators of rehabilitation response, while outlining research gaps including limited clinical validation, inter …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal cord injury (SCI) is characterized by damage to the spinal cord caused by various reasons, and there is a lack of effective drug treatments. Apigenin, a well-known natural small molecule drug, may serve as a therapeutic agent for a variety of diseases. However, the potential mechanisms by which Apigenin exerts its effects in SCI remain unclear. By utilizing an integrative multiomics strategy that combines network pharmacology, Mendelian randomization, and single-cell transcriptomic profiling, we established a systems-level target identification framework. Mechanistic analysis revealed a…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell and spatial omics have revolutionized biomedical research by enabling high-resolution molecular profiling across cells and tissues, thereby overcoming key limitations of bulk sequencing and revealing unprecedented cellular heterogeneity and spatial organization central to development, homeostasis, and disease. Specifically, advances in high-throughput, subcellular, and multiomics profiling are promoting the field toward deeper insights. In parallel, computational progress, including generative artificial intelligence (AI) and foundation models, is developing rapidly for manipulatin…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Myocardial infarction (MI) remains a predominant contributor to global cardiovascular disease death, with apoptosis playing a pivotal yet incompletely characterized role in adverse cardiac remodeling. Despite advances in bulk RNA sequence analyses, the single-cell level analyses of apoptotic signaling of MI progression remain unclear.
METHODS: Multiomics data integration was synthesized through single-nucleus RNA-seq (snRNA-seq) (GSE270788) and bulk RNA-seq (GSE21610). Three hundred ninety-seven ARGs (apoptosis-related genes) were downloaded from GeneCards (relevance score > 7), f…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The retinal pigment epithelium (RPE) is crucial for visual function, and its dysfunction contributes to retinal diseases such as age-related macular degeneration. Despite the translational potential of iPSC-derived RPE (iPSC-RPE) in cell replacement therapy, the functional visual gains achieved to date are modest. A key challenge is that the molecular and epigenomic signatures underlying functional RPE are yet to be fully elucidated. By integrating multiomics data, we systematically benchmarked the 3D epigenomic landscapes of primary human RPE (hRPE), iPSC-RPE, and the immortalized ARPE-19 cel…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования