Quantitative polymerase chain reactions (qPCR) based on real-time PCR constitute a powerful and sensitive method for the analysis of nucleic acids. However, in qPCR, the ability to multiplex targets using differently colored fluorescent probes is typically limited to 4-fold by the spectral overlap of the fluorophores. Furthermore, multiplexing qPCR assays requires expensive instrumentation and most often lengthy assay development cycles. Digital PCR (dPCR), which is based on the amplification of single target DNA molecules in many separate reactions, is an attractive alternative to qPCR. Here
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel reverse transcription-multiplex polymerase chain reaction assay was developed to detect Aichi virus, human parechovirus, enteroviruses, and human bocavirus. A mixture of four pairs of published specific primers, 6261 and 6779, ev22(+) and ev22(-), F1 and R1, 188F and 542R, was used to amplify the viral genomes and specifically generate four different amplicon sizes of 519, 270, 440, and 354 bp for Aichi virus, human parechovirus, enteroviruses, and human bocavirus, respectively. A total of 247 fecal specimens previously screened for rotavirus, adenovirus, norovirus, sapovirus, and astr…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few population genetics studies have been carried out on major locust species. In particular, an understanding of the population genetic structure of the Australian plague locust, Chortoicetes terminifera, is lacking. We isolated and characterized eight polymorphic microsatellite loci in C. terminifera, and described experimental conditions for polymerase chain reaction multiplexing and genotyping these loci. The number of alleles per locus ranged from 11 to 29 and the expected heterozygosity ranged from 0.797 to 0.977. One locus was found to be X-linked. Results of cross-taxon amplification t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of tick-borne infections has been steadily increasing in both number and geographic distribution in the United States and abroad. This increase, in conjunction with the continued recognition of novel pathogens transmitted by ticks, has made accurate diagnosis of these infections challenging. Mainstay serologic tests are insensitive during the acute phase of infection and are often cross-reactive with similar pathogenic and nonpathogenic organisms. Further, they are unable to reliably differentiate active versus past infection which can lead to misdiagnosis and incorrect understa
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dermatophytes are the most common cause of superficial mycosis, estimated to affect 20% to 25% of the general population. We assessed the performance of a novel real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) multiplex assay for diagnosis of dermatophytosis. To evaluate sensitivity and specificity, 10 known bacteria and 10 known fungi commonly found on skin, as well as 105 samples with culture confirmed dermatophytosis were tested using Dermatophyte and Fungi assay (AusDiagnostics, Sydney, Australia), a novel multiplex assay for diagnosis of dermatophytosis in skin and nail. This was followed by
Сравнительное исследованиеСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An experimental design is presented that simulates an accelerated process of DNA degradation in human bone tissues and thus provides a possibility for a systematic investigation of factors hampering DNA extraction and amplification. Equal sized slices of human femoral bones were incubated in 90 degrees C water for 2 h up to 30 days. DNA was extracted and subjected to a human specific Duplex polymerase chain reaction (PCR) and also to a Multiplex short tandem repeat (STR) PCR. Additionally 24 ancient bones representing different age periods were investigated in the same way. The results were co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Paratyphi A is a causative agent of paratyphoid fever. The clinical syndrome caused by paratyphoid fever overlaps with other febrile illnesses and cannot be distinguished from typhoid fever. Conventional methods used for diagnosis are time consuming, costly, and labor-intensive. We evaluated the specificity, sensitivity, and application of a multiplex polymerase chain reaction (PCR) previously developed by the method (Ou, H.Y., Teh, C.S.J., Thong, K.L., et al., J. Mol. Diagn., 9, 624-630, 2007) using 6 S. Paratyphi A, 22 S. Typhi, and 85 other Salmonella serovars as…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolation and identification of Taylorella equigenitalis, the causative agent of contagious equine metritis, by bacteriology is laborious and does not permit differentiation from the other member of the genus, Taylorella asinigenitalis. Moreover, other organisms such as Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa can also cause endometritis in mares and warrant diagnostic detection. Our objectives were to develop a rapid preparation method for field swab samples and to validate this protocol using new multiplex real-time polymerase chain reaction (rtPCR) detection tools for identification
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR), especially the multiplex PCR assay, enables simultaneous detection of multiple genes and is highly effective for diagnostic applications. The CRISPR-associated (Cas) system consists of several genes, and complete gene clusters are essential for its activity; multiplex PCR is an excellent method for detecting these multiple genes. This study focuses on the development and validation of a multiplex PCR protocol for the specific detection of CRISPR-Cas subtypes I-F1 and I-F2 found in A. baumannii, which is classified as a critical ESKAPE pathogen. The multiplex PC
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Evidence on the comparative impact of laboratory markers on multiple respiratory viruses is scarce. This study aimed to evaluate the comparative impact of multiple respiratory viruses among symptomatic children on laboratory markers, including C-reactive protein (CRP) levels.
METHODS: This was a retrospective observational study between April 2018 and August 2024 for children aged 15 years or younger who received a blood and multiplex polymerase chain reaction (PCR) tests from a nasopharyngeal swab. Children with fever or respiratory symptoms underwent multiplex PCR, irrespective …
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The aim of this study was to determine the prevalence of human papillomavirus (HPV) and 15 species that cause sexually transmitted infections (STIs) in negative cytology. In addition, we compared the diagnostic performance of multiplex polymerase chain reaction (PCR) with widely available techniques used to detect HPV.
METHODS: We recruited 235 women of reproductive age who had negative cytology findings in a liquid-based cervical smear. STIs were identified by multiplex PCR, and HPV genotypes by multiplex PCR, hybrid capture 2, and DNA microaray; discordant results were analyzed …
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foot-and-mouth disease virus (FMDV) causes a highly contagious and economically important vesicular disease in cloven-hoofed animals that is clinically indistinguishable from symptoms caused by Seneca Valley virus 1 (SVV-1). To differentiate SVV-1 from FMDV infections, we developed a SVV-1 real-time RT-PCR (RT-qPCR) assay and multiplexed with published FMDV assays. Two published FMDV assays (Journal of the American Veterinary Medical Association, 220, 2002, 1636; Journal of Virological Methods, 236, 2016, 258) targeting the 3D polymerase (3D) region were selected and multiplexed with the SVV-1
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hemoglobin (Hb) Bart's hydrops fetalis is a major public health concern in Southeast Asia, particularly in Thailand. Current screening strategies target the two most common α0 -thalassemia deletions (--SEA and --THAI).
METHOD: In this study, we developed a single-tube multiplex real-time PCR assay for the simultaneous detection of four clinically relevant α0-thalassemia deletions (--SEA, --THAI, --CR, and --SA). The assay was validated using 538 clinical samples with diverse thalassemia genotypes and compared against conventional gap-PCR as the reference method. Analytical perform
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory viruses are a primary cause of pneumonia in both children and adults, particularly in cases of severe acute respirat … (LRT) and upper respiratory tract (URT) samples collected between 2014 and 2022 and analyzed using multiplex polymerase chain reaction (PCR) assays for respiratory virus detection. Viral detection rates, concordance, and discordance were compared across sample types and viruses, as were quantification cycle values obtained by real-time PCR assay (as a proxy for viral load).
RESULT …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial vaginosis (BV) is a common dysbiotic condition associated with adverse pregnancy outcomes, including preterm delivery, and its diagnosis remains challenging due to limitations of conventional methods and the lack of standardized molecular criteria. In this cross-sectional study, we evaluated the diagnostic performance of the Allplex™ Bacterial Vaginosis Plus assay, a multiplex real-time quantification polymerase chain reaction (qPCR), compared with Gram stain using the Ison-Hay criteria in a population of pregnant female, and explored optimal quantitative cut-off values for BV-associ
СтатьяОценочное исследованиеСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Clinically, timely diagnosis and effective treatment of Candida bloodstream infections rely on rapid and sensitive detection methods. However, the long turn-around time and low detection rate of blood culture (the gold standard) make rapid diagnosis of Candida challenging. This study develops a novel molecular assay (M1-mRAP) designed for the rapid and sensitive detection of three Candida species in blood samples: Candida albicans(CA), Candida tropicalis(CT), and Candida glabrata(CG).
METHODS: We used the M1-mRAP method aimed at detecting Candida DNA in blood samples, in which w
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To establish a specific and sensitive TaqMan multiplex real-time quantitative PCR (RT-qPCR) assay to rapidly detect Mucorales.
METHODS: Customized oligonucleotide primers and corresponding detection probes were developed using the 18S ribosomal RNA gene sequences of Rhizomucor spp., Lichtheimia spp., and Mucor spp./Rhizopus spp. A multiplex RT-qPCR assay was established using TaqMan fluorescent probes, and its specificity, repeatability, and sensitivity were evaluated. The method was also used for the detection of simulated Mucorales-positive clinical samples and on samples from clin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aves polyomavirus 1, psittacine beak and feather disease virus, and psittacid herpesvirus 1 are important pathogens of psittacine birds with the potential to cause substantial morbidity and mortality. Using publically available nucleotide sequences, we developed and validated a triplex real-time PCR (rtPCR) assay to rapidly detect these 3 viruses. The assay had high analytical sensitivity, detecting <6 copies of viral DNA per reaction, and 100% analytical specificity, showing no cross-reactivity with 59 other animal pathogens. Archived formalin-fixed, paraffin-embedded tissues from psittacine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To develop a probe-based triplex quantitative real-time PCR assay to simultaneously detect the upregulation of the efflux pumps AmrAB-OprA, BpeAB-OprB and BpeEF-OprC in Burkholderia pseudomallei strains exhibiting increased minimum inhibitory concentrations toward meropenem, doxycycline or trimethoprim-sulfamethoxazole.
METHODS: The triplex assay was developed and subsequently tested on RNA isolated from eight clinical and eight laboratory-generated B. pseudomallei mutants harboring efflux pump regulator mutations.
RESULTS: The triplex assay accurately detected efflux pump upregulation
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) and chikungunya virus (CHIKV) are important human pathogens and mosquito-borne arboviruses, which have resembling history, common vectors, circulating regions, and indistinguishable clinical symptoms. Wide geographical range that is suitable for ZIKV and CHIKV transmission underlines the concern about the impact of epidemic and endemic infections on burden of public health. In the present study, a highly sensitive and specific one-step multiplex real-time RT-PCR assay was developed and evaluated for simultaneous detection and quantification of ZIKV and CHIKV. The single react
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования