The infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) used to be one of the largest loss factors in Atlantic salmon farming. Since 2009, marker-assisted selection for resistance to IPN, targeting a single major quantitative trait locus (QTL), has led to a ten-fold decrease in the number of IPN outbreaks in Norway. However, some IPN-related problems remain, due to isolates of the virus which seem to bypass the resistance mechanism of the QTL. We comparatively characterized a classical isolate affected by the IPN-QTL (cIPNV) and an isolate that circumvents the QTL-based protection (rIPNV). Using both
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endoplasmic Reticulum (ER) stress is implicated in Alzheimer's disease (AD) development. This study aims to identify ER stress-related genes associated with AD risk.
METHODS: This study used a multi-omics framework based on Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) to investigate associations between ER stress-related genes and AD. Blood-derived quantitative trait loci (QTL) datasets, including methylation (mQTL), expression (eQTL), and protein (pQTL) data, were integrated with AD genome-wide association study (GWAS) results from FinnGen R12 (discovery) and GCST90027158 (va…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune-related genes (IRGs) have been implicated in autoimmune diseases, but their causal role in GD remains unclear. We conducted a multi-omics Mendelian randomization (MR) analysis integrating genome-wide association study (GWAS) data from GD patients with blood-based methylation quantitative trait loci(mQTLs), expression QTLs(eQTLs), and protein QTLs(pQTLs). SMR analysis was performed to assess the causal associations between IRGs and GD, followed by HEIDI tests to screen for pleiotropy. Colocalization analysis identified shared genetic determinants. We further validated the findings in Fin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Obesity has a high heritability and frequently co-occurs with metabolic disorders, indicating shared genetic susceptibility. The underlying causative genes and biological mechanisms of obesity and metabolic disorders remain predominantly elusive.
METHODS: The FinnGen R11 dataset, including over 450,000 subjects, was employed in conjunction with the Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) v8 eQTls dataset to conduct cross-tissue transcriptome association studies, Functional Summary-based Imputation in single tissues, and Gene Analysis combined with Multimarker Analysis of Genomic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study explored the genetics of the levels of stress hormones (cortisol, cortisone, DHEA, and DHEA-S) in hair of 863 clinically healthy Yorkshire × Landrace male pigs at ∼40 days of age and evaluated their potential as biomarkers of innate stress response by estimating genetic correlations with responses to a 30 s backtest performed at ∼27 days of age. Backtest responses included the number and intensity of vocalizations (VN and VI) and struggles (SN and SI). With pigs genotyped using a 50 K single nucleotide polymorphism (SNP) panel that was imputed to 650 K SNPs, heritability estimates f
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to identify genetic targets linked to prostate cancer risk using advanced genetic analysis techniques.
OBJECTIVE: The goal was to conduct a comprehensive analysis using Mendelian Randomization (MR), colocalization, and single-cell RNA sequencing to identify druggable genes as potential therapeutic targets or diagnostic markers.
METHODS: The study involved selecting 2608 druggable genes by intersecting expression Quantitative Trait Loci (eQTLs) with druggable genome databases. MR analysis using prostate cancer GWAS data identified genes with causal associations to pr…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PCa) lacks precise diagnostic tools, necessitating noninvasive biomarkers. MicroRNAs (miRNAs) show promise due to fluid stability and oncogenic regulation. Using 2-sample Mendelian randomization (MR), we analyzed plasma miRNA expression quantitative trait loci (eQTLs) from discovery and validation cohorts. Cis-acting eQTLs served as instrumental variables, with causal effects assessed via inverse-variance weighted (IVW) and MR-Egger regression. Functional and survival analyses leveraged The Cancer Genome Atlas (TCGA)-PRAD data and bioinformatics tools. Five miRNAs (hsa-miR-127…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Graves' Ophthalmopathy (GO) is classified as an autoimmune condition that involves inflammation and structural changes within th … transcriptome-wide association study (TWAS) that merged GWAS findings related to GO with expression quantitative trait loci (eQTL) data obtained from thyroid tissues featured in the Genotype-Tissue Expression Version 8 (GTEx V8) dataset. The validation of significant genes was carried out using three complementary methodologies: FUSION, FOCUS, and Multi-marker Analysis o …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify key genes and potential drug targets for ovarian-related diseases through genome-wide Mendelian randomization (MR) and colocalization analyses.
DESIGN: We conducted a comprehensive two-sample MR analysis to estimate the causal effects of blood expression quantitative trait loci (eQTLs) on ovarian-related diseases, followed by colocalization analyses to verify the robustness of the expression instrumental variables (IVs). Phenome-wide association studies (PheWAS) were also performed to evaluate the horizontal pleiotropy of potential drug targets and possible side effects…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although previous studies have suggested that genetic risk factors can contribute to the development of prurigo nodularis (PN), … re validated by using the Michigan Genomics Initiative. Data from regulatory regions and expression quantitative trait loci were applied to investigate genetic mechanisms.
RESULTS: We identified a genome-wide significant genetic signal for PN (P = 7.5 × 10-13; odds ratio = 1.17) at the IL31 locus, which has also been associated with psoriasis, atopic dermatitis, and 2 s …
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite lacking a genetic explanation for the causal link between multiple sclerosis (MS) and neuropathic bladder (NPB), our study aims to e … t analysis on instrumental SNPs and applied summary-data-based MR (SMR) with protein and expression quantitative trait loci. Candidate susceptibility genes were further examined through colocalization analysis and differential expression studies. Our analyses indicate a substantial genetic contribution to both MS and NPB phenotypes. MR analysis revealed that MS progressi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer is the most common malignant tumor of the uterus, but the underlying genetic mechanisms of EC remain unclear. To identify candidate genes and investigate genetic mechanisms for endometrial cancer, we utilized the summary-data-based Mendelian randomization (SMR) method to investigate causal associations between genetic variants, gene expression, DNA methylation, and endometrial cancer. Three main analyses were conducted utilizing cis-expression and methylation quantitative trait loci (eQTLs and mQTLs) as instrumental variables to examine causal relationships with endometrial …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic kidney disease (CKD) is a progressive disease for which there is no effective cure. We aimed to identify potential drug targets for CKD and kidney function by integrating plasma proteome and transcriptome.
METHODS: We designed a comprehensive analysis pipeline involving two-sample Mendelian randomization (MR) (for proteins), summary-based MR (SMR) (for mRNA), and colocalization (for coding genes) to identify potential multi-omics biomarkers for CKD and combined the protein-protein interaction, Gene Ontology (GO), and single-cell annotation to explore the potential biologic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Chronic venous insufficiency (CVI), a chronic vascular dysfunction, is a common health problem that causes serious complications such as painful varicose veins and even skin ulcers. Identifying the underlying genetic and epigenetic factors is important for improving the quality of life of individuals with CVI. In the literature, many genes, variants, and miRNAs associated with CVI have been identified through genomic and transcriptomic studies. Despite molecular pathogenesis studies, how the genes associated with CVI are regulated by miRNAs and the effect of variants in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A-to-I RNA editing diversifies human transcriptome to confer its functional effects on the downstream genes or regulations, potentially invo … rogression Markers Initiative. The large-scale and genome-wide identification of 95 198 RNA editing quantitative trait loci revealed the preferred genetic effects on adjacent editing events. Furthermore, to explore the underlying mechanisms of the genetic controls of A-to-I RNA editing, several top RNA-binding proteins were pointed out, such as EIF4A3, U2AF2, NOP58, FBL, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acne vulgaris is a highly heritable skin disorder that primarily impacts facial skin. Severely inflamed lesions may leave permanent scars that have been associated with long-term psychosocial consequences. Here, we perform a GWAS meta-analysis comprising 20,165 individuals with acne from nine independent European ancestry cohorts. We identify 29 novel genome-wide significant loci and replicate 14 of the 17 previously identified risk loci, bringing the total number of reported acne risk loci to 46. Using fine-mapping and eQTL colocalisation approaches, we identify putative causal genes at sever
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptomics data have been integrated with genome-wide association studies (GWASs) to help understand disease/trait molecular mechanisms. The utility of metabolomics, integrated with transcriptomics and disease GWASs, to understand molecular mechanisms for metabolite levels or diseases has not been thoroughly evaluated. We performed probabilistic transcriptome-wide association and locus-level colocalization analyses to integrate transcriptomics results for 49 tissues in 706 individuals from the GTEx project, metabolomics results for 1,391 plasma metabolites in 6,136 Finnish men from the ME
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcal disease is estimated to affect nearly a quarter of a million people annually. Environmental isolates of Cryptococcus deneoformans, which make up 15 to 30% of clinical infections in temperate climates such as Europe, vary in their pathogenicity, ranging from benign to hyper-virulent. Key traits that contribute to virulence, such as the production of the pigment melanin, an extracellular polysaccharide capsule, and the ability to grow at human body temperature have been identified, yet little is known about the genetic basis of variation in such traits. Here we investigate the genet
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) provide an unbiased first look at genetic loci involved in aging and noise-induced sensorineural hearing loss and tinnitus. The hearing phenotype, whether audiogram-based or self-report, is regressed against genotyped information at representative single nucleotide polymorphisms (SNPs) across the genome. Findings include the fact that both hearing loss and tinnitus are polygenic disorders, with up to thousands of genes, each of effect size of < 0.02. Smaller human GWAS' were able to use objective measures and identified a few loci; however, hundreds of th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abnormal DNA methylation has been described in human inflammatory conditions of the gastrointestinal tract, such as inflammatory bowel disease (IBD). As other complex diseases, IBD results from the balance between genetic predisposition and environmental exposures. As such, DNA methylation may be the consequence (and potential effector) of both, genetic susceptibility variants and/or environmental signals such as cytokine exposure. We attempted to discern between these two non-excluding possibilities by performing a combined analysis of published DNA methylation data in intestinal mucosal cell
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования