Kidney transplantation has become a routine procedure in the treatment of patients with kidney failure, and requires collaboration of expert … improvement of long-term function remains a challenge. New developments in molecular immunology and computational biology have increased precision of donor and recipient matching of HLA and non-HLA compatibility. Individual omics-wide molecular diagnostics, extracorporeal therapies, and drug developments allow for precise individual decision making and treatment. Toler …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Most respiratory diseases are considered complex diseases as their susceptibility and outcomes are determined by the interaction between host-dependent factors (genetic factors, comorbidities, etc.) and environmental factors (exposure to microorganisms or allergens, treatments received, etc.) The reductionist approach in the study of diseases has been of fundamental importance for the understanding of the different components of a system. Systems biology or systems medicine is a complementary approach aimed at analyzing the interactions between the different components within one organizationa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stressed cells coordinate a multi-faceted response spanning many levels of physiology. Yet knowledge of the complete stress-activated regulatory network as well as design principles for signal integration remains incomplete. We developed an experimental and computational approach to integrate available protein interaction data with gene fitness contributions, mutant transcriptome profiles, and phospho-proteome changes in cells responding to salt stress, to infer the salt-responsive signaling network in yeast. The inferred subnetwork presented many novel predictions by implicating new regulator
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac myosin binding protein-C (cMyBP-C) is a multi-domain (C0-C10) protein that regulates heart muscle contraction through interaction with myosin, actin and other sarcomeric proteins. Several mutations of this protein cause familial hypertrophic cardiomyopathy (HCM). Domain C1 of cMyBP-C plays a central role in protein interactions with actin and myosin. Here, we studied structure-function relationship of three disease causing mutations, Arg177His, Ala216Thr and Glu258Lys of the domain C1 using computational biology techniques with its available X-ray crystal structure. The results suggest…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fontan's visionary operation and its modifications over the ensuing decades have re-established nonturbulent flow and substantially reduced cyanosis for patients with severe hypoplasia of one ventricle. However, a long list of largely unexpected sequelae has emerged over the last 40 years. Although it is not difficult to understand how care providers could become discouraged, a number of myths have arisen, which we will attempt to dispel with real-world counterexamples as well as with lessons learned from other disciplines: evolutionary, developmental, and computational biology. We argue that …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Intraluminal thrombus (ILT) is increasingly recognized as a dynamic factor in abdominal aortic aneurysm (AAA) progression. It can play a dual role-providing mechanical cushioning while simultaneously destabilizing the aortic wall through its biochemical activity. Fissuring and bleeding within the ILT remain underinvestigated but may serve as early indicators of wall failure, independent of aneurysm size. Our aim was to propose a novel biology-driven framework-the PACS-ILT classification (Proteolytic Activity and Clinical Stability of Intraluminal Thrombus)-to refine the assessment o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Spatial computational models such as agent-based models (ABMs) offer powerful in silico tools to study tumor dynamics, yet imaging data are still rarely used to inform these models directly.
RESULTS: We present an ABM optimization framework that leverages convolutional encoders to compare spatial patterns between experimental imaging data and ABM-generated outputs within a shared latent space. This quantitative comparison was used to estimate ABM parameters across three datasets, ranging from synthetic data to 3D tumoroid-T cell co-culture microscopy and histopathology images from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AIMS: Hepatocellular carcinoma (HCC) remains among the most lethal cancers worldwide, yet few tools exist to characterize HCC biology and stratify patient risk at the point of care. We developed TESERA (Tissue Encoded Subtype Elucidation and Risk Assessment), a computational pathology framework that derives both unsupervised subtypes and a prognostic index directly from hematoxylin and eosin (H&E) whole-slide images (WSIs).
APPROACH RESULTS: Applied to The Cancer Genome Atlas Liver Hepatocellular Carcinoma (TCGA-LIHC) cohort, unsupervised clustering of TESERA embeddings grouped tum
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Gene regulatory networks (GRNs) provide a graphical representation of the regulatory interactions between transcription factors ( … atory mechanisms and identifying therapeutic targets, making it a promising tool for advancing both computational biology and translational medicine.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: This study is aimed at comprehensively evaluating the real-world safety profile and underlying molecular mechanisms of the AKT inhibitor capivasertib by integrating pharmacovigilance data, computational biology, and multiomics analyses.
METHODS: Adverse event (AE) reports from the FAERS database were analyzed using disproportionality algorithms (ROR, PRR, BCPNN, EBGM) to detect significant safety signals. To elucidate potential toxicological mechanisms, we employed network toxicology and molecular docking, further validated by 100 ns molecular dynamics (MD) simulatio…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein folding is a fundamental process ensuring that polypeptide chains acquire the correct three-dimensional structures required for biological function. This complex journey from nascent polypeptides to mature proteins is tightly regulated by the cellular proteostasis network-an integrated system of molecular chaperones, folding enzymes, and degradation machineries. Disruptions in this network lead to dysproteostasis, a pathological state implicated in a growing list of human diseases, including neurodegenerative disorders, metabolic syndromes, and cancer. In this review, we provide a comp
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Basic and clinical scientific research at the University of South Florida (USF) have intersected to support a multi-faceted appr … earchers focused on molecular and cellular biology, public health/global health, genetics/genomics, computational biology, bioinformatics, biomolecular science, bioengineering, and computer science, as well as guest speakers from the American Porphyria Foundation (APF) and Friedreich's Ataxia Research Alliance (FARA) to inform participants as to the human impact of the …
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the past four decades, there has been an increase in the incidence rate of male reproductive disorders in some, but not all, Western countries. The observed increase in the prevalence of male reproductive disorders is suspected to be ascribable to environmental factors as the increase has been too rapid to be explained by genetics alone. To study the association between complex chemical exposures of humans and congenital cryptorchidism, the most common malformation of the male genitalia, we measured 121 environmental chemicals with suspected or known endocrine disrupting properties in 1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
What do we mean when we say 'gene expression'? In the decades following Crick's 1958 central dogma of molecular biology, whereby genetic information flows from DNA (genes) to RNA (transcripts) to protein (products), we have learned a great deal about DNA, RNA, proteins, and the ensuing phenotypic changes. With the advent of high-throughput technologies (1990s), molecular biologists and computer scientists forged critical collaborations to understand the vast amount of data being generated, rapidly escalating gene expression research to the 'omics' level: entire sets of genes (genomes), transcr
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal masses are a common incidental finding in abdominal imaging. They typically are benign cysts but sometimes are kidney cancers-most frequently renal cell carcinoma (RCC) in adults. Alongside noncontrast computed tomography images, multiphase contrast-enhanced computed tomography (CECT) supports rapid, accurate differentiation of renal cysts from potential kidney cancers and can help with lesion characterization, staging, and surgical planning. CECT also can help physicians assess RCC histology or tumor subtype. This article discusses the biology, genetics, diagnostic imaging, classificati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid emergence and global dissemination of antimicrobial resistance (AMR), coupled with the limited development of new antimicrobial agents, have intensified concerns regarding a major global public health crisis. Although antibiotic resistance is primarily driven by microbial mechanisms, host immune and inflammatory responses also play critical roles in determining infection outcomes, pathogen persistence, and treatment efficacy. In this context, host-directed therapies (HDTs) have emerged as a promising complementary strategy by modulating host pathways to enhance antimicrobial immunity
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) remains a leading infectious cause of morbidity and mortality worldwide, and major diagnostic and therapeutic challenges persist despite advances in microbiologic and molecular testing. Over the past decade, molecular imaging, especially with FDG PET/CT, has transformed our understanding of TB pathogenesis, the spectrum of early and subclinical disease, mechanisms of dissemination, and treatment response. This review synthesizes key recent developments in TB imaging, focusing on studies published since prior Seminars in Nuclear Medicine reviews. New non-human primate and huma
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiple system atrophy (MSA) and Parkinson's disease (PD) are caused by misfolded α-synuclein spreading throughout the central nervous system. While familial PD is linked to several α-synuclein mutations, no mutations are associated with MSA. We previously showed that the familial PD mutation E46K inhibits replication of MSA prions both in vitro and in vivo, providing key evidence to support the hypothesis that α-synuclein adopts unique strains in patients.
OBJECTIVE: Here we sought to further interrogate α-synuclein misfolding to identify the structural determinants that contrib
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Receptor tyrosine kinases (RTKs) are cell membrane proteins that provide cells with the ability to sense proteins in their environments. Many RTKs are essential to development and organ growth. Derangement of RTKs-by mutation or by overexpression-is central to several developmental and adult disorders including cancer, short stature, and vascular pathologies. The mechanism of action of RTKs is complex and is regulated by contextual components, including the existence of multiple competing ligands and receptors in many families, the intracellular location of the RTK, the dynamic and cell-specif
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Nonlinear small datasets, which are characterized by low numbers of samples and very high numbers of measures, occur frequently in computational biology, and pose problems in their investigation. Unsupervised hybrid-two-phase (H2P) procedures-specifically dimension reduction (DR), coupled with clustering-provide valuable assistance, not only for unsupervised data classification, but also for visualization of the patterns hidden in high-dimensional feature space.
METHODS: 'Minimum Curvilinearity' (MC) is a principle that-for small datasets-suggests the approximation of curvilinear …
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования