BACKGROUND: The Advanced Plant Experiment-04 - Epigenetic Expression (APEX-04-EpEx) experiment onboard the International Space Station exami … fic changes over large regions of spaceflight related genes. To date, tools of multiplexed targeted DNA methylation sequencing remain limited for plant genomes.
RESULTS: To provide methylation data at single-molecule resolution, Flap-enabled next-generation capture (FENGC), a novel targeted multiplexed DNA capture and enrichment technique allowing cleavage at an …
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pleural mesothelioma (PM) is a rare and aggressive cancer type, typically diagnosed at advanced stages. Distinguishing PM from other lung diseases is often challenging. There is an urgent need for biomarkers that can enable early detection. Interest in the field of epigenetics has increased, particularly in the context of tumour development and biomarker discovery. This study aims to identify specific changes in DNA methylation from healthy pleural tissue to PM and to compare these methylation patterns with those found in other lung diseases.
RESULTS: EPIC methylation array data (…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To determine whether DNA methylation patterns in genes coding for selected T-lymphocyte proteins are associated with perinatal psychiatric distress or with complications of pregnancy.
METHODS: T lymphocyte DNA was obtained from pregnant women across three time points in pregnancy and the postpartum period and epigenetic patterns were assessed using Illumina 450 K Methylation Beadchips. Seven selected genes critical for T cell function were analyzed for methylation changes during pregnancy and for associations of methylation patterns with psychiatric distress or with pregnancy com…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington disease (HD) is an autosomal dominantly inherited disease that exhibits genetic anticipation of affected progeny due to expansion … uals in the same family. Rescue of DNA repair gene expression by 5-azacytidine treatment identified DNA methylation as a mediator of DNA repair gene expression deficiency. Bisulfite sequencing confirmed hypermethylation of the APEX1 promoter region in HD cells relative to control, as well as 5-azacytidine-induced hypomethylation. 5-Azacytidine treatments also res …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a fundamental epigenetic modification that regulates gene expression, maintains genomic integrity and defines cellular identity. Conventional bulk sequencing methods, such as reduced-representation bisulfite sequencing (RRBS), have elucidated genome-wide methylation landscapes but do not reveal cell-to-cell variation, limiting insights into methylation heterogeneity during development, differentiation and disease. Here, we present multiplexed single-cell RRBS (Msc-RRBS), a streamlined and scalable protocol for parallel DNA methylation profiling of hundreds of individual cell…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beauvericin (BEA) is an emerging mycotoxin with various reported toxic effects. Since BEA is considered non-genotoxic, epigenetic mechanisms may contribute to its toxicity. This study investigated the effects of BEA on global DNA methylation (5-mC) and hydroxymethylation (5-hmC), the expression of genes involved in these processes, and the modulatory potential of curcumin (CUR). After 24 h of BEA exposure, the IC50 values were 15.93 μM in HepG2 cells and 16.57 μM in HCT116 cells, decreasing to 0.98 μM and 0.30 μM after 48 h. Co-treatment with 5 μM CUR significantly restored cell viability. BEA…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sexual size dimorphism (SSD) refers to the differences in body size between males and females. Epigenetic mechanisms, such as DNA methylation, can shape phenotypes; however, their role in SSD remains unclear. Here, we used Cynoglossus semilaevis, a species with larger females (female-biased SSD), as a model to investigate the role of methylation in the emergence and regulation of SSD. Methylomes and transcriptomes were constructed in four tissues (brain, liver, muscle, and gonad) from three key life stages: juveniles (3 months post-fertilization), male mature stage (1 year post-fertilization; …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Chinese Hamster Ovary (CHO) cells are widely used for the production of recombinant therapeutics due to their ability to carry out human-like post-translational modifications. Media adaptation represents a key step in large-scale production to ensure optimal safety and cost efficiency. As DNA methylation is a central epigenetic mechanism underlying adaptive modulation of gene expression, we report here, for the first time, the use of high-coverage whole-genome bisulfite sequencing to generate single-base-resolution maps of CHO cells at different phases of growth in a fed-batch cu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation alterations play a crucial role in rectal cancer development. This study identifies and characterizes DNA methylation-driven genes in the TCGA-READ cohort, constructs a prognostic model, and validates its robustness and biological relevance in independent external cohorts. METHODS: Using TCGA-READ (n = 160) as the discovery cohort, we identified 490 methylation-driven genes via MethylMix analysis. A LASSO-derived prognostic model was constructed integrating expression of CCNI2, LINC00899, and ST6GALNAC1. Model performance was assessed by Kaplan–Meier analysis, time-…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate detection of MET amplification is essential for guiding targeted therapy in lung adenocarcinoma (LUAD). Conventional methods such as FISH are limited by tissue availability, and ctDNA-based liquid biopsy shows limited sensitivity for amplification detection. DNA methylation profiling offers a promising alternative.
OBJECTIVES: To identify MET amplification-associated DNA methylation features and develop a diagnostic model for MET amplification detection in LUAD.
DESIGN: A retrospective cohort study.
METHODS: Targeted DNA methylation sequencing (Illumina TruSeq Methyl Ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: DNA methylation is an important epigenetic feature associated with genetic regulation, gene expression, and phenotypic variation. However, the genetic architecture, regulatory organization, and trait relevance of the porcine skeletal muscle methylome remain poorly characterized.
OBJECTIVES: This study aimed to characterize the genetic regulation of DNA methylation in porcine skeletal muscle and identify genetically supported relationships among genotype, methylation, gene expression, and complex traits.
METHODS: We integrated 185 whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) dataset…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pituitary neuroendocrine tumours (PitNETs) range from slow-growing to highly aggressive tumours; however, traditional prognostic markers often fail to predict clinical outcomes reliably. DNA methylation has recently emerged as a promising biomarker for assessing tumour behaviour. This systematic review evaluates its predictive value in PitNETs. To systematically assess the clinical applicability of DNA methylation profiles in predicting behaviour of PitNETs. Systematic review. A comprehensive search was conducted in Medline, Embase, Web of Science, and Cochrane CENTRAL on December 13, 2024, wi…
Систематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bipolar disorder (BD) is a major mood disorder influenced by both genetic and environmental factors. While DNA methylation from peripheral tissues can reflect both genetic and environmental influences and reveal insights into disease biology, it remains understudied in BD. DNA methylation signatures may complement polygenic scores (PGS) and hold potential as biomarkers. Here, we conducted the largest epigenome-wide association study (EWAS) of BD to date and evaluated the predictive value of polymethylation scores (PMS) in classifying case-control status.
METHODS: DNA methylation f…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Heart failure (HF) is a syndrome of heterogeneous aetiology and multiple exposomal causes. The role of DNA methylation (DNAm) changes in symptomatic HF and its phenotypes is unclear. This work addresses global and regional DNAm patterns and epigenetic ageing in HF.
METHODS: Patients with HF were included from the MyoVasc Study, an investigator-initiated prospective cohort study. Individuals without HF were included from a population-based Gutenberg Health Study. DNAm was measured using the Illumina Infinium MethylationEPIC assay. Epigenetic ageing was calculated using GrimAge and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Low birth weight (LBW) is a significant global health issue associated with an increased risk of long-term chronic diseases, yet its underlying molecular mechanisms remain unclear. DNA methylation serves as a crucial epigenetic mechanism for investigating these associations. Our study employed a unique model of birth weight-discordant monozygotic (MZ) twin neonates and a multi-level validation strategy to elucidate the mechanisms by which LBW affects immune function through DNA methylation at birth.
METHODS: We performed genome-wide DNA methylation profiling using methylated DNA i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As the most aggressive form of breast cancer, triple-negative breast cancer (TNBC) is associated with poor prognosis and a lack … activity, metabolite levels, protein stability assays, transcriptional analysis, and assessment of DNA methylation status.
RESULTS: Our results revealed that high level of GALNT6 were associated with poor clinical outcomes in TNBC. GALNT6 knockdown inhibited glycolytic and enhanced α-KG accumulation. Mechanistically, GALNT6 stabilizes HIF-1α through O-glycosyla …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dietary and lifestyle factors can influence DNA methylation patterns. We previously reported epigenetic age attenuation following a controlled study using an 8-week polyphenol-dense, DNA methylation-targeted diet and lifestyle intervention in healthy males (Methylation Diet and Lifestyle Study), with phytonutrient/polyphenol-rich foods (green tea, oolong tea, curcumin, garlic, and berries) being most predictive of this effect.
METHODS: Here we conducted an epigenome-wide association study (EWAS) in 38 participants from the Methylation Diet and Lifestyle Study. The intervention inc…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to assess psychological and lifestyle risk factors for premature ovarian insufficiency (POI) and their association with DNA methylation.
METHODS: A case-control study was conducted in Shanghai (2017-2022), including 304 controls and 160 newly diagnosed cases with POI (diagnosed within the past 6 months). Cumulative adverse life events were assessed using the life event scale (LES), and genome-wide DNA methylation was evaluated in whole blood-derived DNA obtained from a sub-sample.
RESULTS: The median total event score for POI patients and control individuals was 4…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrogen sulfide (H2S) is a gasotransmitter that contributes to plant stress responses. In this study, we investigated the mechanisms underl … methylation. These findings indicate that H2S primes drought tolerance through metabolic control of DNA methylation, linking sulfur signaling to epigenetic regulation.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования